MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004631	TTA	2	6	163384	163389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140683
3502	NC_004631	GCG	2	6	163436	163441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140683
3503	NC_004631	GCC	2	6	163466	163471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140683
3504	NC_004631	CAG	2	6	163573	163578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3505	NC_004631	GCA	2	6	163709	163714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3506	NC_004631	TCT	2	6	163718	163723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140683
3507	NC_004631	CGA	2	6	163773	163778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3508	NC_004631	TCT	2	6	163973	163978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140683
3509	NC_004631	TCG	2	6	164136	164141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3510	NC_004631	CGA	2	6	164159	164164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3511	NC_004631	CATA	2	8	164208	164215	50 %	25 %	0 %	25 %	29140683
3512	NC_004631	GTC	2	6	164281	164286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140683
3513	NC_004631	GGCA	2	8	164405	164412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_004631	GGCT	2	8	164467	164474	0 %	25 %	50 %	25 %	29140684
3515	NC_004631	TAA	2	6	164475	164480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140684
3516	NC_004631	ATG	2	6	164487	164492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140684
3517	NC_004631	GCG	2	6	164552	164557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140684
3518	NC_004631	GGA	2	6	164605	164610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140684
3519	NC_004631	ATT	2	6	164626	164631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140684
3520	NC_004631	GAACC	2	10	164632	164641	40 %	0 %	20 %	40 %	29140684
3521	NC_004631	TGA	2	6	164713	164718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140684
3522	NC_004631	TGCC	2	8	164731	164738	0 %	25 %	25 %	50 %	29140684
3523	NC_004631	CGG	2	6	164787	164792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140684
3524	NC_004631	AACG	2	8	164891	164898	50 %	0 %	25 %	25 %	29140684
3525	NC_004631	CGC	2	6	165018	165023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140684
3526	NC_004631	TCA	2	6	165039	165044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140684
3527	NC_004631	TC	3	6	165172	165177	0 %	50 %	0 %	50 %	29140684
3528	NC_004631	CGC	2	6	165178	165183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140684
3529	NC_004631	GAG	2	6	165266	165271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140684
3530	NC_004631	CTGC	2	8	165275	165282	0 %	25 %	25 %	50 %	29140684
3531	NC_004631	TAT	2	6	165302	165307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140684
3532	NC_004631	CG	3	6	165314	165319	0 %	0 %	50 %	50 %	29140684
3533	NC_004631	TATT	2	8	165342	165349	25 %	75 %	0 %	0 %	29140684
3534	NC_004631	ATT	2	6	165351	165356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140684
3535	NC_004631	GTC	2	6	165418	165423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140685
3536	NC_004631	CGC	2	6	165438	165443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140685
3537	NC_004631	CGG	2	6	165465	165470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140685
3538	NC_004631	C	6	6	165534	165539	0 %	0 %	0 %	100 %	29140685
3539	NC_004631	GAC	2	6	165541	165546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140685
3540	NC_004631	ACG	2	6	165572	165577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140685
3541	NC_004631	GCA	2	6	165741	165746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3542	NC_004631	CGT	2	6	165753	165758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3543	NC_004631	GATCA	2	10	165820	165829	40 %	20 %	20 %	20 %	29140686
3544	NC_004631	TGT	2	6	165905	165910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140686
3545	NC_004631	GCC	2	6	165955	165960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140686
3546	NC_004631	GCT	2	6	166011	166016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3547	NC_004631	CCG	2	6	166050	166055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140686
3548	NC_004631	CTG	2	6	166063	166068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3549	NC_004631	GCT	2	6	166131	166136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3550	NC_004631	CAG	2	6	166153	166158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140686
3551	NC_004631	A	6	6	166214	166219	100 %	0 %	0 %	0 %	29140686
3552	NC_004631	TCT	2	6	166302	166307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140686
3553	NC_004631	TTA	2	6	166438	166443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140687
3554	NC_004631	GC	3	6	166470	166475	0 %	0 %	50 %	50 %	29140687
3555	NC_004631	CG	3	6	166517	166522	0 %	0 %	50 %	50 %	29140687
3556	NC_004631	CAT	2	6	166526	166531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140687
3557	NC_004631	ACC	2	6	166576	166581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140687
3558	NC_004631	CAG	2	6	166620	166625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140687
3559	NC_004631	CTG	2	6	166683	166688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140687
3560	NC_004631	TTC	2	6	166725	166730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140687
3561	NC_004631	A	6	6	166739	166744	100 %	0 %	0 %	0 %	29140687
3562	NC_004631	CGG	2	6	166781	166786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140687
3563	NC_004631	GGGC	2	8	166826	166833	0 %	0 %	75 %	25 %	29140687
3564	NC_004631	GC	3	6	166854	166859	0 %	0 %	50 %	50 %	29140687
3565	NC_004631	ATA	2	6	166861	166866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140687
3566	NC_004631	CCG	2	6	166936	166941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140687
3567	NC_004631	CTA	2	6	167047	167052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_004631	A	7	7	167084	167090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004631	GAA	2	6	167199	167204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140688
3570	NC_004631	A	6	6	167521	167526	100 %	0 %	0 %	0 %	29140688
3571	NC_004631	TCG	2	6	167611	167616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140688
3572	NC_004631	ACG	2	6	167748	167753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140688
3573	NC_004631	CGG	2	6	167788	167793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3574	NC_004631	GGC	2	6	167826	167831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3575	NC_004631	GGC	2	6	167847	167852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3576	NC_004631	CGG	3	9	167885	167893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3577	NC_004631	AG	3	6	167936	167941	50 %	0 %	50 %	0 %	29140688
3578	NC_004631	CGG	2	6	167942	167947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3579	NC_004631	AGA	2	6	167957	167962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140688
3580	NC_004631	CGG	2	6	168026	168031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140688
3581	NC_004631	CG	3	6	168045	168050	0 %	0 %	50 %	50 %	29140688
3582	NC_004631	CCGC	2	8	168100	168107	0 %	0 %	25 %	75 %	29140688
3583	NC_004631	CAC	2	6	168179	168184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140688
3584	NC_004631	CTGG	2	8	168238	168245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_004631	ATCCC	2	10	168266	168275	20 %	20 %	0 %	60 %	29140689
3586	NC_004631	CCA	3	9	168317	168325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140689
3587	NC_004631	TGA	2	6	168347	168352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140689
3588	NC_004631	GCCAGC	2	12	168391	168402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29140689
3589	NC_004631	GCA	2	6	168434	168439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140689
3590	NC_004631	T	6	6	168511	168516	0 %	100 %	0 %	0 %	29140689
3591	NC_004631	GAA	2	6	168623	168628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140689
3592	NC_004631	AGA	2	6	168724	168729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140689
3593	NC_004631	CGCTGC	2	12	168730	168741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	29140689
3594	NC_004631	ATA	2	6	168847	168852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140689
3595	NC_004631	AGA	2	6	168862	168867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140689
3596	NC_004631	GGC	2	6	168897	168902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140689
3597	NC_004631	GCA	2	6	168923	168928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140689
3598	NC_004631	GGC	2	6	168945	168950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140689
3599	NC_004631	AAT	2	6	168960	168965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140689
3600	NC_004631	AGCGC	2	10	168974	168983	20 %	0 %	40 %	40 %	29140689
3601	NC_004631	AGC	2	6	169040	169045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140689
3602	NC_004631	ATC	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140689
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3604	NC_004631	ATGA	2	8	169251	169258	50 %	25 %	25 %	0 %	29140689
3605	NC_004631	TGA	2	6	169270	169275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140689
3606	NC_004631	CTT	2	6	169295	169300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140689
3607	NC_004631	GCG	2	6	169309	169314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140689
3608	NC_004631	TGA	2	6	169367	169372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140689
3609	NC_004631	CTG	2	6	169561	169566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140690
3610	NC_004631	TGCC	2	8	169696	169703	0 %	25 %	25 %	50 %	29140690
3611	NC_004631	GC	3	6	169713	169718	0 %	0 %	50 %	50 %	29140690
3612	NC_004631	CAC	2	6	169741	169746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140690
3613	NC_004631	ACC	2	6	169805	169810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140690
3614	NC_004631	ATC	2	6	169829	169834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140690
3615	NC_004631	TGC	2	6	169853	169858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140690
3616	NC_004631	TGG	2	6	169878	169883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140690
3617	NC_004631	GCC	2	6	169925	169930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140690
3618	NC_004631	ATG	3	9	169976	169984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140690
3619	NC_004631	GC	4	8	170004	170011	0 %	0 %	50 %	50 %	29140690
3620	NC_004631	GGAT	2	8	170042	170049	25 %	25 %	50 %	0 %	29140690
3621	NC_004631	GC	3	6	170136	170141	0 %	0 %	50 %	50 %	29140690
3622	NC_004631	CAA	2	6	170287	170292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140690
3623	NC_004631	GAC	2	6	170299	170304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140690
3624	NC_004631	CTT	2	6	170313	170318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140690
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3733	NC_004631	T	6	6	176543	176548	0 %	100 %	0 %	0 %	29140697
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3872	NC_004631	CCG	2	6	182281	182286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140700
3873	NC_004631	AGA	2	6	182318	182323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140700
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3893	NC_004631	GCT	2	6	183180	183185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140700
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3903	NC_004631	TGG	2	6	183568	183573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140700
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3911	NC_004631	TTTC	2	8	183847	183854	0 %	75 %	0 %	25 %	29140700
3912	NC_004631	ACC	2	6	183856	183861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140700
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3958	NC_004631	TCA	2	6	185798	185803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3960	NC_004631	AT	3	6	185855	185860	50 %	50 %	0 %	0 %	29140702
3961	NC_004631	GGCAT	2	10	185907	185916	20 %	20 %	40 %	20 %	29140702
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3975	NC_004631	GTAA	2	8	186528	186535	50 %	25 %	25 %	0 %	29140703
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3982	NC_004631	GCC	2	6	186810	186815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140703
3983	NC_004631	CGTTT	2	10	186844	186853	0 %	60 %	20 %	20 %	29140703
3984	NC_004631	T	6	6	186851	186856	0 %	100 %	0 %	0 %	29140703
3985	NC_004631	CCG	2	6	186864	186869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140703
3986	NC_004631	GGC	2	6	186883	186888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140703
3987	NC_004631	GGGGA	2	10	186896	186905	20 %	0 %	80 %	0 %	29140703
3988	NC_004631	ATG	2	6	187003	187008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140704
3989	NC_004631	CG	3	6	187025	187030	0 %	0 %	50 %	50 %	29140704
3990	NC_004631	GCG	3	9	187028	187036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140704
3991	NC_004631	GCT	2	6	187167	187172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
3992	NC_004631	GGCG	2	8	187197	187204	0 %	0 %	75 %	25 %	29140704
3993	NC_004631	TC	3	6	187208	187213	0 %	50 %	0 %	50 %	29140704
3994	NC_004631	TGT	2	6	187217	187222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140704
3995	NC_004631	TGC	2	6	187232	187237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
3996	NC_004631	TGC	3	9	187265	187273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
3997	NC_004631	GTG	2	6	187274	187279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140704
3998	NC_004631	CTG	2	6	187294	187299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
3999	NC_004631	CGC	2	6	187300	187305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140704
4000	NC_004631	CGA	2	6	187310	187315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140704

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