MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004631	TGG	2	6	69131	69136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140602
1502	NC_004631	AGA	2	6	69183	69188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140602
1503	NC_004631	T	7	7	69196	69202	0 %	100 %	0 %	0 %	29140602
1504	NC_004631	ACCG	2	8	69208	69215	25 %	0 %	25 %	50 %	29140602
1505	NC_004631	GAC	2	6	69337	69342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140602
1506	NC_004631	GATC	2	8	69354	69361	25 %	25 %	25 %	25 %	29140602
1507	NC_004631	GTC	2	6	69511	69516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140602
1508	NC_004631	ACGGC	2	10	69539	69548	20 %	0 %	40 %	40 %	29140602
1509	NC_004631	GC	3	6	69605	69610	0 %	0 %	50 %	50 %	29140602
1510	NC_004631	CTG	2	6	69617	69622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140602
1511	NC_004631	GCC	2	6	69649	69654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140602
1512	NC_004631	AC	3	6	69657	69662	50 %	0 %	0 %	50 %	29140602
1513	NC_004631	GGCA	2	8	69728	69735	25 %	0 %	50 %	25 %	29140603
1514	NC_004631	TGA	2	6	69754	69759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140603
1515	NC_004631	TCCA	2	8	69770	69777	25 %	25 %	0 %	50 %	29140603
1516	NC_004631	AG	3	6	69803	69808	50 %	0 %	50 %	0 %	29140603
1517	NC_004631	AGC	2	6	69817	69822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140603
1518	NC_004631	GCG	2	6	69831	69836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140603
1519	NC_004631	GGT	2	6	69845	69850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140603
1520	NC_004631	CG	3	6	69882	69887	0 %	0 %	50 %	50 %	29140603
1521	NC_004631	GC	3	6	69910	69915	0 %	0 %	50 %	50 %	29140603
1522	NC_004631	GGC	3	9	69944	69952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140603
1523	NC_004631	TCG	2	6	70003	70008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140604
1524	NC_004631	TGT	2	6	70014	70019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140604
1525	NC_004631	AGA	2	6	70093	70098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140604
1526	NC_004631	GTG	2	6	70184	70189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140604
1527	NC_004631	CGT	2	6	70237	70242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140604
1528	NC_004631	GTG	2	6	70245	70250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140604
1529	NC_004631	GCTGGA	2	12	70297	70308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29140604
1530	NC_004631	GGC	2	6	70369	70374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140604
1531	NC_004631	TGG	2	6	70434	70439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140604
1532	NC_004631	GGC	2	6	70450	70455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140604
1533	NC_004631	TGC	2	6	70527	70532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140604
1534	NC_004631	GCG	2	6	70535	70540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140604
1535	NC_004631	CG	3	6	70539	70544	0 %	0 %	50 %	50 %	29140604
1536	NC_004631	GCC	2	6	70556	70561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140604
1537	NC_004631	ATG	2	6	70563	70568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140604
1538	NC_004631	AAT	2	6	70586	70591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140604
1539	NC_004631	GAA	2	6	70592	70597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140604
1540	NC_004631	GAAG	2	8	70606	70613	50 %	0 %	50 %	0 %	29140604
1541	NC_004631	AAG	2	6	70707	70712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140604
1542	NC_004631	GCC	2	6	70736	70741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140604
1543	NC_004631	CGT	2	6	70771	70776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140604
1544	NC_004631	CG	3	6	70819	70824	0 %	0 %	50 %	50 %	29140604
1545	NC_004631	GTG	2	6	70829	70834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140604
1546	NC_004631	AAGG	2	8	70863	70870	50 %	0 %	50 %	0 %	29140604
1547	NC_004631	CGT	2	6	71025	71030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140605
1548	NC_004631	CCA	2	6	71063	71068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140605
1549	NC_004631	GTG	2	6	71077	71082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140605
1550	NC_004631	GTG	2	6	71205	71210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140605
1551	NC_004631	CGG	2	6	71300	71305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140605
1552	NC_004631	CGTGC	2	10	71360	71369	0 %	20 %	40 %	40 %	29140605
1553	NC_004631	CGA	2	6	71372	71377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140605
1554	NC_004631	TG	3	6	71460	71465	0 %	50 %	50 %	0 %	29140605
1555	NC_004631	CTGA	2	8	71472	71479	25 %	25 %	25 %	25 %	29140605
1556	NC_004631	TTGAT	2	10	71530	71539	20 %	60 %	20 %	0 %	29140605
1557	NC_004631	A	6	6	71569	71574	100 %	0 %	0 %	0 %	29140605
1558	NC_004631	GGC	2	6	71633	71638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140605
1559	NC_004631	TGG	2	6	71794	71799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140605
1560	NC_004631	GCT	2	6	71828	71833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140605
1561	NC_004631	CAT	2	6	71886	71891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140605
1562	NC_004631	CAAT	2	8	71906	71913	50 %	25 %	0 %	25 %	29140605
1563	NC_004631	GC	3	6	71971	71976	0 %	0 %	50 %	50 %	29140605
1564	NC_004631	TGA	2	6	72007	72012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140605
1565	NC_004631	TG	3	6	72031	72036	0 %	50 %	50 %	0 %	29140605
1566	NC_004631	GGC	2	6	72045	72050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140605
1567	NC_004631	GCA	2	6	72063	72068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140605
1568	NC_004631	ATT	2	6	72084	72089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140605
1569	NC_004631	ACCGC	2	10	72090	72099	20 %	0 %	20 %	60 %	29140605
1570	NC_004631	TGC	2	6	72236	72241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140605
1571	NC_004631	TGA	2	6	72253	72258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140605
1572	NC_004631	AAC	2	6	72265	72270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140605
1573	NC_004631	GC	3	6	72278	72283	0 %	0 %	50 %	50 %	29140605
1574	NC_004631	GTG	2	6	72330	72335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140605
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1577	NC_004631	GGA	2	6	72439	72444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140606
1578	NC_004631	GC	3	6	72455	72460	0 %	0 %	50 %	50 %	29140606
1579	NC_004631	GCC	2	6	72470	72475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140606
1580	NC_004631	GGC	2	6	72564	72569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140606
1581	NC_004631	ATGG	2	8	72670	72677	25 %	25 %	50 %	0 %	29140606
1582	NC_004631	GGC	2	6	72747	72752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140606
1583	NC_004631	ATT	2	6	72767	72772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140606
1584	NC_004631	CAG	2	6	72839	72844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140606
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1588	NC_004631	GCT	2	6	73010	73015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140607
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1590	NC_004631	TGGA	2	8	73128	73135	25 %	25 %	50 %	0 %	29140607
1591	NC_004631	T	6	6	73140	73145	0 %	100 %	0 %	0 %	29140607
1592	NC_004631	CAA	2	6	73154	73159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140607
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1594	NC_004631	GGC	2	6	73172	73177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140607
1595	NC_004631	TGC	2	6	73195	73200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140607
1596	NC_004631	CTG	2	6	73287	73292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140607
1597	NC_004631	CG	3	6	73316	73321	0 %	0 %	50 %	50 %	29140607
1598	NC_004631	TTG	2	6	73381	73386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140607
1599	NC_004631	GC	3	6	73462	73467	0 %	0 %	50 %	50 %	29140607
1600	NC_004631	CTG	2	6	73563	73568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140607
1601	NC_004631	TTG	2	6	73575	73580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140607
1602	NC_004631	ATG	2	6	73597	73602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140607
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1605	NC_004631	TTG	2	6	73668	73673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140607
1606	NC_004631	G	6	6	73697	73702	0 %	0 %	100 %	0 %	29140607
1607	NC_004631	GAT	2	6	73725	73730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140607
1608	NC_004631	TCT	2	6	73838	73843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_004631	TC	3	6	73849	73854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_004631	GGC	2	6	73946	73951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_004631	GC	3	6	73958	73963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_004631	GCC	2	6	74081	74086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140608
1613	NC_004631	GGCGGG	2	12	74167	74178	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	29140608
1614	NC_004631	AGC	2	6	74201	74206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140608
1615	NC_004631	GAT	2	6	74222	74227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140608
1616	NC_004631	GCC	2	6	74286	74291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140608
1617	NC_004631	TAC	2	6	74317	74322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140608
1618	NC_004631	GAC	2	6	74330	74335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140608
1619	NC_004631	CGC	2	6	74386	74391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140608
1620	NC_004631	GCT	2	6	74425	74430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140608
1621	NC_004631	ATT	2	6	74474	74479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140608
1622	NC_004631	CAC	2	6	74486	74491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140608
1623	NC_004631	CGGG	2	8	74645	74652	0 %	0 %	75 %	25 %	29140608
1624	NC_004631	TCG	2	6	74658	74663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140608
1625	NC_004631	GAA	2	6	74779	74784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140608
1626	NC_004631	TAT	2	6	74826	74831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140608
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