MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004631	CCG	2	6	511974	511979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_004631	CCT	2	6	511984	511989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_004631	GTG	2	6	512067	512072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_004631	TGA	2	6	512075	512080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_004631	CCG	2	6	512091	512096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_004631	CCT	2	6	512101	512106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_004631	CGG	2	6	512166	512171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_004631	AGT	2	6	512183	512188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_004631	TGG	2	6	512189	512194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004631	TGA	2	6	512196	512201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_004631	CCG	2	6	512212	512217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_004631	CCT	2	6	512222	512227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_004631	TG	3	6	512269	512274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_004631	TGTT	2	8	512328	512335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_004631	CGT	2	6	512336	512341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_004631	CGG	2	6	512573	512578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140965
11017	NC_004631	CG	3	6	512579	512584	0 %	0 %	50 %	50 %	29140965
11018	NC_004631	CAC	2	6	512616	512621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140965
11019	NC_004631	TGC	2	6	512635	512640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11020	NC_004631	CAT	2	6	512690	512695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140965
11021	NC_004631	CAT	2	6	512913	512918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140965
11022	NC_004631	CGA	2	6	512921	512926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11023	NC_004631	GTG	2	6	512937	512942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140965
11024	NC_004631	TGA	2	6	512978	512983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140965
11025	NC_004631	TCG	2	6	513038	513043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11026	NC_004631	TG	3	6	513072	513077	0 %	50 %	50 %	0 %	29140965
11027	NC_004631	GTG	3	9	513075	513083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140965
11028	NC_004631	GAC	2	6	513084	513089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11029	NC_004631	CAA	2	6	513134	513139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140965
11030	NC_004631	GAT	2	6	513206	513211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140965
11031	NC_004631	CGA	2	6	513218	513223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11032	NC_004631	CGGTG	2	10	513248	513257	0 %	20 %	60 %	20 %	29140965
11033	NC_004631	GCG	2	6	513334	513339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140965
11034	NC_004631	GAT	2	6	513365	513370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140965
11035	NC_004631	CGGTG	2	10	513386	513395	0 %	20 %	60 %	20 %	29140965
11036	NC_004631	CTG	2	6	513429	513434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11037	NC_004631	ACC	2	6	513442	513447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140965
11038	NC_004631	GCG	2	6	513645	513650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140965
11039	NC_004631	A	6	6	513651	513656	100 %	0 %	0 %	0 %	29140965
11040	NC_004631	GTG	2	6	513690	513695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140965
11041	NC_004631	CAG	2	6	513727	513732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11042	NC_004631	CCA	2	6	513740	513745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140965
11043	NC_004631	CGG	2	6	513760	513765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140965
11044	NC_004631	GCA	2	6	513877	513882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11045	NC_004631	CAA	2	6	513893	513898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140965
11046	NC_004631	CAG	2	6	513930	513935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140965
11047	NC_004631	GGCAG	2	10	513961	513970	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11048	NC_004631	TAT	2	6	513983	513988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_004631	TTCCTG	2	12	514067	514078	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	29140966
11050	NC_004631	AAT	2	6	514103	514108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140966
11051	NC_004631	GCAG	2	8	514176	514183	25 %	0 %	50 %	25 %	29140966
11052	NC_004631	GTT	2	6	514291	514296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140966
11053	NC_004631	CAGC	2	8	514342	514349	25 %	0 %	25 %	50 %	29140966
11054	NC_004631	ATT	2	6	514385	514390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140966
11055	NC_004631	CACG	2	8	514436	514443	25 %	0 %	25 %	50 %	29140967
11056	NC_004631	GA	3	6	514446	514451	50 %	0 %	50 %	0 %	29140967
11057	NC_004631	AGC	2	6	514501	514506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140967
11058	NC_004631	AT	3	6	514579	514584	50 %	50 %	0 %	0 %	29140967
11059	NC_004631	CTT	2	6	514661	514666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140967
11060	NC_004631	TTC	2	6	514719	514724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140967
11061	NC_004631	ACT	2	6	514828	514833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_004631	ATG	2	6	514933	514938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_004631	GCATG	2	10	514999	515008	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11064	NC_004631	CCA	2	6	515040	515045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_004631	GCATG	2	10	515117	515126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11066	NC_004631	CCA	2	6	515158	515163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_004631	CGTT	2	8	515243	515250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11068	NC_004631	GCT	2	6	515255	515260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_004631	TTA	2	6	515311	515316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_004631	TA	3	6	515328	515333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_004631	ATG	2	6	515334	515339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_004631	A	6	6	515377	515382	100 %	0 %	0 %	0 %	29140968
11073	NC_004631	CTGGC	2	10	515483	515492	0 %	20 %	40 %	40 %	29140968
11074	NC_004631	GCC	2	6	515532	515537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140968
11075	NC_004631	ATG	2	6	515564	515569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140968
11076	NC_004631	AATG	2	8	515576	515583	50 %	25 %	25 %	0 %	29140968
11077	NC_004631	TGC	2	6	515616	515621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11078	NC_004631	GC	4	8	515679	515686	0 %	0 %	50 %	50 %	29140968
11079	NC_004631	CCAA	2	8	515703	515710	50 %	0 %	0 %	50 %	29140968
11080	NC_004631	CTT	2	6	515818	515823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140968
11081	NC_004631	GGCACC	2	12	515825	515836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29140968
11082	NC_004631	TAT	2	6	515903	515908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140968
11083	NC_004631	TTTG	2	8	516261	516268	0 %	75 %	25 %	0 %	29140968
11084	NC_004631	GC	4	8	516364	516371	0 %	0 %	50 %	50 %	29140968
11085	NC_004631	GT	3	6	516407	516412	0 %	50 %	50 %	0 %	29140968
11086	NC_004631	GCT	3	9	516508	516516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11087	NC_004631	ATT	2	6	516553	516558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140968
11088	NC_004631	AT	3	6	516598	516603	50 %	50 %	0 %	0 %	29140968
11089	NC_004631	TAA	2	6	516616	516621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140968
11090	NC_004631	GCTG	2	8	516729	516736	0 %	25 %	50 %	25 %	29140968
11091	NC_004631	GAC	2	6	516805	516810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11092	NC_004631	TGC	2	6	516819	516824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11093	NC_004631	GCGCG	2	10	516853	516862	0 %	0 %	60 %	40 %	29140968
11094	NC_004631	CGA	2	6	516937	516942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11095	NC_004631	ATG	2	6	516950	516955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140968
11096	NC_004631	CGG	2	6	517056	517061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140968
11097	NC_004631	GCT	2	6	517102	517107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11098	NC_004631	TCA	2	6	517173	517178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140968
11099	NC_004631	GAA	2	6	517190	517195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140968
11100	NC_004631	TC	3	6	517203	517208	0 %	50 %	0 %	50 %	29140968
11101	NC_004631	TGA	2	6	517270	517275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140968
11102	NC_004631	CAT	2	6	517327	517332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140968
11103	NC_004631	GTT	2	6	517344	517349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140968
11104	NC_004631	GAT	2	6	517384	517389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140968
11105	NC_004631	AGCGAA	2	12	517411	517422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29140968
11106	NC_004631	CGT	2	6	517432	517437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140968
11107	NC_004631	TTG	2	6	517446	517451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140968
11108	NC_004631	GCC	2	6	517518	517523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140968
11109	NC_004631	A	7	7	517551	517557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_004631	AAT	2	6	517722	517727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140969
11111	NC_004631	GA	3	6	517790	517795	50 %	0 %	50 %	0 %	29140969
11112	NC_004631	CAT	2	6	517821	517826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140969
11113	NC_004631	AGA	2	6	517922	517927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140969
11114	NC_004631	AACC	2	8	517966	517973	50 %	0 %	0 %	50 %	29140969
11115	NC_004631	CGC	2	6	518034	518039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140969
11116	NC_004631	GAT	2	6	518040	518045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140969
11117	NC_004631	GAA	2	6	518091	518096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140969
11118	NC_004631	TTC	2	6	518133	518138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140969
11119	NC_004631	GAA	3	9	518526	518534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140969
11120	NC_004631	GAA	2	6	518658	518663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140969
11121	NC_004631	T	7	7	518717	518723	0 %	100 %	0 %	0 %	29140969
11122	NC_004631	GCT	2	6	518730	518735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140969
11123	NC_004631	CAG	2	6	518739	518744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140969
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11126	NC_004631	TAA	2	6	518883	518888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_004631	TACTG	2	10	518933	518942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11128	NC_004631	ATGAAA	2	12	518946	518957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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11233	NC_004631	CG	3	6	523873	523878	0 %	0 %	50 %	50 %	29140974
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11370	NC_004631	AGA	2	6	530288	530293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11371	NC_004631	CAT	2	6	530327	530332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11373	NC_004631	TCA	2	6	530378	530383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11494	NC_004631	ATG	2	6	536273	536278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140982
11495	NC_004631	TGAT	2	8	536294	536301	25 %	50 %	25 %	0 %	29140983
11496	NC_004631	GCAG	2	8	536343	536350	25 %	0 %	50 %	25 %	29140983
11497	NC_004631	CGTG	2	8	536358	536365	0 %	25 %	50 %	25 %	29140983
11498	NC_004631	TG	3	6	536433	536438	0 %	50 %	50 %	0 %	29140983
11499	NC_004631	TCA	2	6	536478	536483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140983
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