MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004631	GCA	2	6	420521	420526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9002	NC_004631	TGCT	2	8	420540	420547	0 %	50 %	25 %	25 %	29140882
9003	NC_004631	TCT	2	6	420549	420554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140882
9004	NC_004631	GGC	2	6	420635	420640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140882
9005	NC_004631	C	6	6	420654	420659	0 %	0 %	0 %	100 %	29140882
9006	NC_004631	TGT	2	6	420693	420698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140882
9007	NC_004631	ATT	2	6	420736	420741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9008	NC_004631	TTG	2	6	420768	420773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140882
9009	NC_004631	AGCC	2	8	420790	420797	25 %	0 %	25 %	50 %	29140882
9010	NC_004631	ATTA	2	8	420833	420840	50 %	50 %	0 %	0 %	29140882
9011	NC_004631	TAT	2	6	420889	420894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9012	NC_004631	TAT	2	6	420929	420934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9013	NC_004631	A	6	6	420971	420976	100 %	0 %	0 %	0 %	29140882
9014	NC_004631	TGGC	2	8	420989	420996	0 %	25 %	50 %	25 %	29140882
9015	NC_004631	ATA	2	6	421041	421046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140882
9016	NC_004631	TTA	2	6	421079	421084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9017	NC_004631	CGT	2	6	421147	421152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9018	NC_004631	ATT	2	6	421170	421175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9019	NC_004631	T	6	6	421245	421250	0 %	100 %	0 %	0 %	29140882
9020	NC_004631	AGTG	2	8	421297	421304	25 %	25 %	50 %	0 %	29140882
9021	NC_004631	CGG	2	6	421313	421318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140882
9022	NC_004631	CG	3	6	421370	421375	0 %	0 %	50 %	50 %	29140882
9023	NC_004631	T	6	6	421405	421410	0 %	100 %	0 %	0 %	29140882
9024	NC_004631	CT	3	6	421481	421486	0 %	50 %	0 %	50 %	29140882
9025	NC_004631	TGC	2	6	421551	421556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140882
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9027	NC_004631	GCC	2	6	421648	421653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140882
9028	NC_004631	CTG	2	6	421669	421674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9029	NC_004631	CTG	2	6	421703	421708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9030	NC_004631	GAC	2	6	421744	421749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9031	NC_004631	GGA	2	6	421759	421764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140882
9032	NC_004631	GCG	2	6	421771	421776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140882
9033	NC_004631	GAT	2	6	421819	421824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140882
9034	NC_004631	T	6	6	421858	421863	0 %	100 %	0 %	0 %	29140882
9035	NC_004631	T	6	6	421963	421968	0 %	100 %	0 %	0 %	29140882
9036	NC_004631	GTTTG	2	10	421984	421993	0 %	60 %	40 %	0 %	29140882
9037	NC_004631	GGC	2	6	422041	422046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140882
9038	NC_004631	AT	3	6	422056	422061	50 %	50 %	0 %	0 %	29140882
9039	NC_004631	AGC	2	6	422133	422138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9040	NC_004631	CT	3	6	422197	422202	0 %	50 %	0 %	50 %	29140882
9041	NC_004631	CAG	2	6	422243	422248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140882
9042	NC_004631	TGA	2	6	422269	422274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140882
9043	NC_004631	GTC	2	6	422432	422437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140882
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9045	NC_004631	TAT	2	6	422529	422534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140882
9046	NC_004631	CGC	2	6	422556	422561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9047	NC_004631	GCG	2	6	422565	422570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_004631	TTC	2	6	422608	422613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140883
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9050	NC_004631	CTG	2	6	422653	422658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140883
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9052	NC_004631	TGG	2	6	422766	422771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140883
9053	NC_004631	GTT	2	6	422785	422790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140883
9054	NC_004631	T	6	6	422836	422841	0 %	100 %	0 %	0 %	29140883
9055	NC_004631	ATC	2	6	422866	422871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140883
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9057	NC_004631	CAT	3	9	422911	422919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140883
9058	NC_004631	TGC	2	6	422921	422926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140883
9059	NC_004631	GCA	2	6	423018	423023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140883
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9063	NC_004631	TGT	2	6	423144	423149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140883
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9077	NC_004631	ACGTA	2	10	423847	423856	40 %	20 %	20 %	20 %	29140883
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