MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004631	TCC	2	6	279977	279982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_004631	CT	3	6	280019	280024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_004631	TTAC	2	8	280078	280085	25 %	50 %	0 %	25 %	29140782
6004	NC_004631	ACT	2	6	280279	280284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140782
6005	NC_004631	AC	3	6	280314	280319	50 %	0 %	0 %	50 %	29140782
6006	NC_004631	CGG	2	6	280327	280332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140782
6007	NC_004631	CA	3	6	280401	280406	50 %	0 %	0 %	50 %	29140782
6008	NC_004631	TGC	2	6	280419	280424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140782
6009	NC_004631	TC	3	6	280440	280445	0 %	50 %	0 %	50 %	29140782
6010	NC_004631	TTG	2	6	280557	280562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_004631	TAA	2	6	280615	280620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004631	CAA	2	6	280741	280746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_004631	ACG	2	6	280824	280829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6014	NC_004631	TCG	2	6	280846	280851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6015	NC_004631	GC	4	8	280967	280974	0 %	0 %	50 %	50 %	29140783
6016	NC_004631	AGC	2	6	281144	281149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6017	NC_004631	CAA	2	6	281321	281326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140783
6018	NC_004631	AGT	2	6	281363	281368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140783
6019	NC_004631	GGC	2	6	281409	281414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140783
6020	NC_004631	CGAT	2	8	281422	281429	25 %	25 %	25 %	25 %	29140783
6021	NC_004631	ATTA	2	8	281478	281485	50 %	50 %	0 %	0 %	29140783
6022	NC_004631	TCT	2	6	281497	281502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140783
6023	NC_004631	TTCA	2	8	281556	281563	25 %	50 %	0 %	25 %	29140783
6024	NC_004631	CGC	2	6	281573	281578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140783
6025	NC_004631	CAG	2	6	281583	281588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6026	NC_004631	CCA	2	6	281591	281596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140783
6027	NC_004631	CAG	2	6	281628	281633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6028	NC_004631	T	6	6	281645	281650	0 %	100 %	0 %	0 %	29140783
6029	NC_004631	CCA	2	6	281672	281677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140783
6030	NC_004631	CGC	2	6	281730	281735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140783
6031	NC_004631	GC	3	6	281737	281742	0 %	0 %	50 %	50 %	29140783
6032	NC_004631	GCG	2	6	281750	281755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140783
6033	NC_004631	CGC	2	6	281822	281827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140783
6034	NC_004631	GCC	2	6	281862	281867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140783
6035	NC_004631	CG	3	6	281892	281897	0 %	0 %	50 %	50 %	29140783
6036	NC_004631	TCA	2	6	282002	282007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140783
6037	NC_004631	CG	3	6	282014	282019	0 %	0 %	50 %	50 %	29140783
6038	NC_004631	TCA	2	6	282049	282054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140783
6039	NC_004631	GAA	2	6	282075	282080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140783
6040	NC_004631	CTT	2	6	282137	282142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140783
6041	NC_004631	GCA	2	6	282191	282196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140783
6042	NC_004631	CT	3	6	282226	282231	0 %	50 %	0 %	50 %	29140783
6043	NC_004631	GGCT	2	8	282243	282250	0 %	25 %	50 %	25 %	29140783
6044	NC_004631	GTT	2	6	282285	282290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140783
6045	NC_004631	CACG	2	8	282299	282306	25 %	0 %	25 %	50 %	29140783
6046	NC_004631	T	6	6	282318	282323	0 %	100 %	0 %	0 %	29140783
6047	NC_004631	TA	3	6	282353	282358	50 %	50 %	0 %	0 %	29140783
6048	NC_004631	ATC	2	6	282379	282384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140783
6049	NC_004631	GC	3	6	282388	282393	0 %	0 %	50 %	50 %	29140783
6050	NC_004631	TGG	2	6	282403	282408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140783
6051	NC_004631	TGT	2	6	282473	282478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140783
6052	NC_004631	A	7	7	282526	282532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_004631	AAAT	2	8	282730	282737	75 %	25 %	0 %	0 %	29140784
6054	NC_004631	CGT	2	6	282767	282772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140784
6055	NC_004631	GGC	3	9	282842	282850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140784
6056	NC_004631	CCA	2	6	282892	282897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140784
6057	NC_004631	CCA	2	6	282910	282915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140784
6058	NC_004631	CT	3	6	282945	282950	0 %	50 %	0 %	50 %	29140784
6059	NC_004631	GCC	2	6	283075	283080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140784
6060	NC_004631	GCC	2	6	283082	283087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140784
6061	NC_004631	TGA	2	6	283098	283103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140784
6062	NC_004631	CGC	2	6	283189	283194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140784
6063	NC_004631	GACCA	2	10	283205	283214	40 %	0 %	20 %	40 %	29140784
6064	NC_004631	GCT	2	6	283283	283288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140784
6065	NC_004631	AGC	2	6	283338	283343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140785
6066	NC_004631	GCA	2	6	283374	283379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140785
6067	NC_004631	GC	3	6	283426	283431	0 %	0 %	50 %	50 %	29140785
6068	NC_004631	CGC	2	6	283479	283484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140785
6069	NC_004631	AAC	2	6	283644	283649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140785
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6071	NC_004631	AATG	2	8	283704	283711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_004631	AAT	2	6	283777	283782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_004631	CGC	2	6	283828	283833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140786
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6075	NC_004631	T	6	6	283892	283897	0 %	100 %	0 %	0 %	29140786
6076	NC_004631	CTGG	2	8	284003	284010	0 %	25 %	50 %	25 %	29140786
6077	NC_004631	TGA	2	6	284023	284028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140786
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6079	NC_004631	CAA	2	6	284086	284091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140786
6080	NC_004631	CGA	2	6	284113	284118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140786
6081	NC_004631	GCA	4	12	284179	284190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140786
6082	NC_004631	GGTCG	2	10	284207	284216	0 %	20 %	60 %	20 %	29140786
6083	NC_004631	GATTT	2	10	284259	284268	20 %	60 %	20 %	0 %	29140786
6084	NC_004631	T	7	7	284266	284272	0 %	100 %	0 %	0 %	29140786
6085	NC_004631	TTTC	2	8	284461	284468	0 %	75 %	0 %	25 %	29140786
6086	NC_004631	TGC	2	6	284496	284501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140786
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6088	NC_004631	TGTGT	2	10	284649	284658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004631	TAAA	2	8	284713	284720	75 %	25 %	0 %	0 %	409994451
6090	NC_004631	TCA	2	6	284751	284756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994451
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6092	NC_004631	GCC	2	6	284824	284829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994451
6093	NC_004631	ACCAG	2	10	284879	284888	40 %	0 %	20 %	40 %	409994451
6094	NC_004631	GCG	2	6	284928	284933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994451
6095	NC_004631	TCGC	2	8	284943	284950	0 %	25 %	25 %	50 %	409994451
6096	NC_004631	AAC	2	6	284981	284986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409994451
6097	NC_004631	GGCGC	2	10	285014	285023	0 %	0 %	60 %	40 %	409994451
6098	NC_004631	ATT	2	6	285074	285079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409994451
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6100	NC_004631	GAT	2	6	285109	285114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409994451
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6102	NC_004631	AG	3	6	285148	285153	50 %	0 %	50 %	0 %	409994451
6103	NC_004631	GAA	2	6	285241	285246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409994451
6104	NC_004631	CAT	2	6	285301	285306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994451
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6106	NC_004631	TG	3	6	285384	285389	0 %	50 %	50 %	0 %	29140788
6107	NC_004631	CCGC	2	8	285426	285433	0 %	0 %	25 %	75 %	29140788
6108	NC_004631	ATA	2	6	285453	285458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140788
6109	NC_004631	ACG	2	6	285476	285481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140788
6110	NC_004631	CG	3	6	285480	285485	0 %	0 %	50 %	50 %	29140788
6111	NC_004631	AGC	2	6	285495	285500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140788
6112	NC_004631	GCA	2	6	285535	285540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140788
6113	NC_004631	GCG	2	6	285637	285642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140788
6114	NC_004631	TGA	2	6	285700	285705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140788
6115	NC_004631	GAC	2	6	285775	285780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140788
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6119	NC_004631	CG	3	6	285881	285886	0 %	0 %	50 %	50 %	29140788
6120	NC_004631	CCG	2	6	285912	285917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140788
6121	NC_004631	CAG	2	6	285968	285973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140788
6122	NC_004631	GT	3	6	286006	286011	0 %	50 %	50 %	0 %	29140788
6123	NC_004631	AG	3	6	286058	286063	50 %	0 %	50 %	0 %	29140788
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6242	NC_004631	GT	3	6	292802	292807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_004631	AGCGC	2	10	292835	292844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6244	NC_004631	CCG	2	6	292861	292866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6245	NC_004631	ACCC	2	8	292948	292955	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6246	NC_004631	TA	3	6	292990	292995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_004631	T	6	6	305123	305128	0 %	100 %	0 %	0 %	29140801

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