MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004631	GTG	2	6	254631	254636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_004631	AGA	2	6	254652	254657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_004631	GCG	2	6	254676	254681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_004631	GCA	2	6	254764	254769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5505	NC_004631	GTG	2	6	254778	254783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140760
5506	NC_004631	TGG	2	6	254818	254823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140760
5507	NC_004631	CGC	2	6	254869	254874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140760
5508	NC_004631	AAT	2	6	254918	254923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140760
5509	NC_004631	CAG	2	6	254928	254933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5510	NC_004631	CAG	2	6	254964	254969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5511	NC_004631	GGC	2	6	254984	254989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140760
5512	NC_004631	TGA	2	6	254993	254998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140760
5513	NC_004631	GGC	2	6	255014	255019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140760
5514	NC_004631	GGC	2	6	255053	255058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140760
5515	NC_004631	CTG	2	6	255081	255086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5516	NC_004631	GCGG	2	8	255112	255119	0 %	0 %	75 %	25 %	29140760
5517	NC_004631	GCA	2	6	255142	255147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5518	NC_004631	TGG	2	6	255278	255283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140760
5519	NC_004631	GTC	2	6	255340	255345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5520	NC_004631	CCA	2	6	255388	255393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140760
5521	NC_004631	TGA	2	6	255394	255399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140760
5522	NC_004631	ATCC	2	8	255468	255475	25 %	25 %	0 %	50 %	29140760
5523	NC_004631	TCAT	2	8	255484	255491	25 %	50 %	0 %	25 %	29140760
5524	NC_004631	ATGGC	2	10	255570	255579	20 %	20 %	40 %	20 %	29140760
5525	NC_004631	GC	3	6	255598	255603	0 %	0 %	50 %	50 %	29140760
5526	NC_004631	GC	3	6	255628	255633	0 %	0 %	50 %	50 %	29140760
5527	NC_004631	GC	3	6	255643	255648	0 %	0 %	50 %	50 %	29140760
5528	NC_004631	GGC	2	6	255707	255712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140760
5529	NC_004631	ACG	2	6	255714	255719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140760
5530	NC_004631	GGAT	2	8	255817	255824	25 %	25 %	50 %	0 %	29140760
5531	NC_004631	TGA	2	6	255845	255850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140760
5532	NC_004631	CG	3	6	255872	255877	0 %	0 %	50 %	50 %	29140760
5533	NC_004631	AGA	2	6	255933	255938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_004631	T	6	6	256005	256010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_004631	T	6	6	256040	256045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_004631	A	6	6	256218	256223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_004631	TGT	2	6	256231	256236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140761
5538	NC_004631	ATGG	2	8	256299	256306	25 %	25 %	50 %	0 %	29140761
5539	NC_004631	GTCC	2	8	256370	256377	0 %	25 %	25 %	50 %	29140761
5540	NC_004631	TGC	2	6	256394	256399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140761
5541	NC_004631	TAG	2	6	256436	256441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140761
5542	NC_004631	TG	3	6	256493	256498	0 %	50 %	50 %	0 %	29140761
5543	NC_004631	TAT	2	6	256550	256555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140761
5544	NC_004631	ATA	2	6	256624	256629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140761
5545	NC_004631	CGG	2	6	256661	256666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140761
5546	NC_004631	TGC	2	6	256723	256728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140761
5547	NC_004631	TGA	2	6	256742	256747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140761
5548	NC_004631	AG	3	6	256748	256753	50 %	0 %	50 %	0 %	29140761
5549	NC_004631	ACTTT	2	10	256865	256874	20 %	60 %	0 %	20 %	29140761
5550	NC_004631	CGT	2	6	256947	256952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140761
5551	NC_004631	CGG	2	6	256955	256960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140761
5552	NC_004631	TGA	2	6	256973	256978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140761
5553	NC_004631	T	7	7	257059	257065	0 %	100 %	0 %	0 %	29140762
5554	NC_004631	GCC	2	6	257069	257074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140762
5555	NC_004631	ATT	2	6	257088	257093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140762
5556	NC_004631	CGC	2	6	257147	257152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140762
5557	NC_004631	TGGC	2	8	257169	257176	0 %	25 %	50 %	25 %	29140762
5558	NC_004631	TG	3	6	257182	257187	0 %	50 %	50 %	0 %	29140762
5559	NC_004631	TTG	2	6	257214	257219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140762
5560	NC_004631	ATC	2	6	257227	257232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140762
5561	NC_004631	ACA	2	6	257233	257238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140762
5562	NC_004631	TGG	2	6	257283	257288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140762
5563	NC_004631	CTG	2	6	257301	257306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140762
5564	NC_004631	CGG	2	6	257326	257331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140762
5565	NC_004631	GC	3	6	257414	257419	0 %	0 %	50 %	50 %	29140762
5566	NC_004631	CGG	2	6	257582	257587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140762
5567	NC_004631	TGG	2	6	257674	257679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140762
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5571	NC_004631	CGT	2	6	258017	258022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140763
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5574	NC_004631	CGT	2	6	258122	258127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140763
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5577	NC_004631	CTGG	2	8	258217	258224	0 %	25 %	50 %	25 %	29140763
5578	NC_004631	ATC	2	6	258230	258235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140763
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5582	NC_004631	TCT	2	6	258500	258505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140763
5583	NC_004631	CGTTAG	2	12	258681	258692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29140763
5584	NC_004631	GTG	2	6	258779	258784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140763
5585	NC_004631	ATT	2	6	258791	258796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140763
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5589	NC_004631	CTG	2	6	259085	259090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140763
5590	NC_004631	GGGC	2	8	259114	259121	0 %	0 %	75 %	25 %	29140763
5591	NC_004631	GTT	2	6	259177	259182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140763
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5593	NC_004631	AG	3	6	259222	259227	50 %	0 %	50 %	0 %	29140763
5594	NC_004631	TTAG	2	8	259228	259235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_004631	GAA	2	6	259236	259241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_004631	ATA	2	6	259245	259250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_004631	GCT	2	6	259283	259288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140764
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5599	NC_004631	CATT	2	8	259337	259344	25 %	50 %	0 %	25 %	29140764
5600	NC_004631	CTC	2	6	259380	259385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140764
5601	NC_004631	ATG	2	6	259417	259422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140764
5602	NC_004631	CAC	2	6	259634	259639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140764
5603	NC_004631	GTC	2	6	259713	259718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140764
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5607	NC_004631	GAA	2	6	259824	259829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140764
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5609	NC_004631	CGT	2	6	259874	259879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140764
5610	NC_004631	GGCG	2	8	259910	259917	0 %	0 %	75 %	25 %	29140764
5611	NC_004631	CTA	2	6	259937	259942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140764
5612	NC_004631	CG	3	6	259958	259963	0 %	0 %	50 %	50 %	29140764
5613	NC_004631	CG	3	6	260212	260217	0 %	0 %	50 %	50 %	29140764
5614	NC_004631	CTT	2	6	260432	260437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140764
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5616	NC_004631	GCG	2	6	260560	260565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140764
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5620	NC_004631	GAT	2	6	260742	260747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140764
5621	NC_004631	CAA	2	6	260768	260773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140764
5622	NC_004631	TACGG	2	10	260778	260787	20 %	20 %	40 %	20 %	29140764
5623	NC_004631	ACA	2	6	260818	260823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140764
5624	NC_004631	GAC	2	6	260940	260945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140764
5625	NC_004631	GACG	2	8	260999	261006	25 %	0 %	50 %	25 %	29140764
5626	NC_004631	TAC	2	6	261060	261065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140764
5627	NC_004631	GTGG	2	8	261116	261123	0 %	25 %	75 %	0 %	29140764
5628	NC_004631	GGC	2	6	261162	261167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140764
5629	NC_004631	GGT	2	6	261201	261206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140764
5630	NC_004631	CGTG	2	8	261215	261222	0 %	25 %	50 %	25 %	29140764
5631	NC_004631	GAT	4	12	261288	261299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140764
5632	NC_004631	GAT	2	6	261336	261341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140764
5633	NC_004631	GGT	2	6	261348	261353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140764
5634	NC_004631	TTA	2	6	261382	261387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140764
5635	NC_004631	TCA	2	6	261400	261405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140764
5636	NC_004631	CCT	2	6	261433	261438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140764
5637	NC_004631	TCT	2	6	261439	261444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140764
5638	NC_004631	TCT	2	6	261583	261588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140764
5639	NC_004631	TTA	2	6	261800	261805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140765
5640	NC_004631	GCT	2	6	261845	261850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140765
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5642	NC_004631	A	6	6	261960	261965	100 %	0 %	0 %	0 %	29140765
5643	NC_004631	TCG	2	6	262105	262110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140765
5644	NC_004631	GAA	2	6	262118	262123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140765
5645	NC_004631	CAA	2	6	262126	262131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140765
5646	NC_004631	A	6	6	262160	262165	100 %	0 %	0 %	0 %	29140765
5647	NC_004631	TGG	2	6	262191	262196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140765
5648	NC_004631	ACA	2	6	262218	262223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140765
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5650	NC_004631	CAA	2	6	262377	262382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140766
5651	NC_004631	GCG	2	6	262490	262495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140766
5652	NC_004631	CG	3	6	262525	262530	0 %	0 %	50 %	50 %	29140766
5653	NC_004631	TAC	2	6	262549	262554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140766
5654	NC_004631	TGAT	2	8	262590	262597	25 %	50 %	25 %	0 %	29140766
5655	NC_004631	TCG	2	6	262698	262703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140766
5656	NC_004631	A	6	6	262705	262710	100 %	0 %	0 %	0 %	29140766
5657	NC_004631	TCCAG	2	10	262791	262800	20 %	20 %	20 %	40 %	29140766
5658	NC_004631	ATT	2	6	262880	262885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140766
5659	NC_004631	ACC	2	6	262913	262918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140766
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5661	NC_004631	ATT	2	6	262964	262969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140766
5662	NC_004631	CGT	2	6	262996	263001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140766
5663	NC_004631	GGC	2	6	263078	263083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140766
5664	NC_004631	CTC	2	6	263179	263184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140766
5665	NC_004631	CAA	2	6	263203	263208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140766
5666	NC_004631	CTG	2	6	263223	263228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140766
5667	NC_004631	TGA	2	6	263235	263240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140766
5668	NC_004631	TGA	2	6	263245	263250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140766
5669	NC_004631	CAA	2	6	263291	263296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140766
5670	NC_004631	TTA	2	6	263368	263373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5671	NC_004631	ACT	2	6	263411	263416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140767
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5673	NC_004631	TGCG	2	8	263520	263527	0 %	25 %	50 %	25 %	29140767
5674	NC_004631	TAT	2	6	263678	263683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140767
5675	NC_004631	TGA	2	6	263695	263700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140767
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5677	NC_004631	GGT	2	6	263719	263724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140767
5678	NC_004631	GAT	2	6	263737	263742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140767
5679	NC_004631	TG	3	6	263818	263823	0 %	50 %	50 %	0 %	29140767
5680	NC_004631	ATG	2	6	263834	263839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140767
5681	NC_004631	TG	3	6	263838	263843	0 %	50 %	50 %	0 %	29140767
5682	NC_004631	TGAT	2	8	263868	263875	25 %	50 %	25 %	0 %	29140768
5683	NC_004631	TTG	2	6	263958	263963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140768
5684	NC_004631	GTGAA	2	10	264072	264081	40 %	20 %	40 %	0 %	29140768
5685	NC_004631	CTG	2	6	264212	264217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140768
5686	NC_004631	GGTA	2	8	264250	264257	25 %	25 %	50 %	0 %	29140768
5687	NC_004631	CAA	2	6	264274	264279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140768
5688	NC_004631	GAT	2	6	264308	264313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140768
5689	NC_004631	ATC	2	6	264320	264325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140768
5690	NC_004631	TCA	2	6	264343	264348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140768
5691	NC_004631	CGG	2	6	264379	264384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140768
5692	NC_004631	TGG	2	6	264501	264506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140768
5693	NC_004631	TGT	2	6	264528	264533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140768
5694	NC_004631	CGA	2	6	264553	264558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140768
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5696	NC_004631	GGC	2	6	264657	264662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140769
5697	NC_004631	GC	3	6	264745	264750	0 %	0 %	50 %	50 %	29140769
5698	NC_004631	TTG	2	6	264848	264853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140769
5699	NC_004631	TTG	2	6	264877	264882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140769
5700	NC_004631	CCG	2	6	264903	264908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140769
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5702	NC_004631	CATT	2	8	265005	265012	25 %	50 %	0 %	25 %	29140769
5703	NC_004631	CCGT	2	8	265021	265028	0 %	25 %	25 %	50 %	29140769
5704	NC_004631	ATGCC	2	10	265163	265172	20 %	20 %	20 %	40 %	29140769
5705	NC_004631	GCG	2	6	265192	265197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140769
5706	NC_004631	CG	3	6	265196	265201	0 %	0 %	50 %	50 %	29140769
5707	NC_004631	TGC	2	6	265307	265312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140769
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5709	NC_004631	A	6	6	265379	265384	100 %	0 %	0 %	0 %	29140769
5710	NC_004631	GC	3	6	265435	265440	0 %	0 %	50 %	50 %	29140769
5711	NC_004631	GAT	2	6	265446	265451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140769
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5714	NC_004631	CTG	2	6	265603	265608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140769
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5718	NC_004631	TGG	2	6	265867	265872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140770
5719	NC_004631	CCG	3	9	265885	265893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140770
5720	NC_004631	TCG	2	6	265918	265923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140770
5721	NC_004631	A	6	6	265938	265943	100 %	0 %	0 %	0 %	29140770
5722	NC_004631	CGT	2	6	265956	265961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140770
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5739	NC_004631	AAG	2	6	266793	266798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140771
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5741	NC_004631	TGG	2	6	266868	266873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140771
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5743	NC_004631	GCTG	2	8	266980	266987	0 %	25 %	50 %	25 %	29140771
5744	NC_004631	GAT	2	6	267041	267046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140771
5745	NC_004631	ACG	2	6	267078	267083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140771
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5998	NC_004631	TGC	2	6	279849	279854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140781
5999	NC_004631	CACT	2	8	279961	279968	25 %	25 %	0 %	50 %	29140781
6000	NC_004631	AATA	2	8	279969	279976	75 %	25 %	0 %	0 %	29140781

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