MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 2013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	28894913
2	NC_004606	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	28894913
3	NC_004606	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004606	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004606	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	28894914
6	NC_004606	GC	3	6	7039	7044	0 %	0 %	50 %	50 %	28894918
7	NC_004606	AC	3	6	10307	10312	50 %	0 %	0 %	50 %	28894922
8	NC_004606	AT	3	6	11812	11817	50 %	50 %	0 %	0 %	28894923
9	NC_004606	TA	5	10	12846	12855	50 %	50 %	0 %	0 %	28894925
10	NC_004606	CA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	0 %	50 %	28894925
11	NC_004606	TC	3	6	14489	14494	0 %	50 %	0 %	50 %	28894925
12	NC_004606	TA	3	6	15911	15916	50 %	50 %	0 %	0 %	28894926
13	NC_004606	AT	3	6	16690	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004606	AG	3	6	16843	16848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	AC	3	6	16858	16863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004606	AG	3	6	17070	17075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004606	AG	3	6	17245	17250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004606	AT	3	6	17774	17779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004606	CT	3	6	17805	17810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004606	AC	3	6	18295	18300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004606	AC	3	6	18464	18469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004606	TG	3	6	18819	18824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004606	CA	3	6	18830	18835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004606	TA	3	6	18894	18899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004606	AG	3	6	19388	19393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004606	CT	3	6	19502	19507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004606	TC	3	6	19880	19885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004606	TG	3	6	20270	20275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004606	GA	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004606	TA	3	6	20475	20480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004606	GA	3	6	20717	20722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004606	CT	3	6	20832	20837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004606	GA	3	6	21039	21044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004606	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004606	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004606	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004606	AT	3	6	25042	25047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004606	AG	3	6	26484	26489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004606	TA	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	AT	3	6	26546	26551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	GA	3	6	30497	30502	50 %	0 %	50 %	0 %	28894932
42	NC_004606	CA	3	6	31553	31558	50 %	0 %	0 %	50 %	28894933
43	NC_004606	AT	3	6	31636	31641	50 %	50 %	0 %	0 %	28894933
44	NC_004606	TC	4	8	33301	33308	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
45	NC_004606	CT	3	6	34188	34193	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
46	NC_004606	GT	3	6	36076	36081	0 %	50 %	50 %	0 %	28894934
47	NC_004606	TC	3	6	36111	36116	0 %	50 %	0 %	50 %	28894934
48	NC_004606	TA	3	6	36297	36302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	TG	3	6	36578	36583	0 %	50 %	50 %	0 %	28894935
50	NC_004606	CA	3	6	38772	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
51	NC_004606	TC	3	6	42341	42346	0 %	50 %	0 %	50 %	28894939
52	NC_004606	TC	3	6	43164	43169	0 %	50 %	0 %	50 %	28894940
53	NC_004606	CT	3	6	43977	43982	0 %	50 %	0 %	50 %	28894941
54	NC_004606	TG	3	6	44575	44580	0 %	50 %	50 %	0 %	28894942
55	NC_004606	TA	4	8	44785	44792	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
56	NC_004606	TA	3	6	45017	45022	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
57	NC_004606	AT	3	6	45462	45467	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
58	NC_004606	TA	3	6	45481	45486	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
59	NC_004606	AG	3	6	45698	45703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004606	GC	3	6	46890	46895	0 %	0 %	50 %	50 %	28894943
61	NC_004606	GA	3	6	47463	47468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004606	TG	3	6	47540	47545	0 %	50 %	50 %	0 %	28894944
63	NC_004606	AT	3	6	48008	48013	50 %	50 %	0 %	0 %	28894944
64	NC_004606	AG	3	6	48042	48047	50 %	0 %	50 %	0 %	28894944
65	NC_004606	CT	3	6	48574	48579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004606	AT	3	6	48684	48689	50 %	50 %	0 %	0 %	28894945
67	NC_004606	TA	3	6	48971	48976	50 %	50 %	0 %	0 %	28894945
68	NC_004606	TA	3	6	50492	50497	50 %	50 %	0 %	0 %	28894947
69	NC_004606	GT	3	6	50534	50539	0 %	50 %	50 %	0 %	28894947
70	NC_004606	TA	3	6	51492	51497	50 %	50 %	0 %	0 %	28894948
71	NC_004606	AT	3	6	52511	52516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004606	TG	3	6	53201	53206	0 %	50 %	50 %	0 %	28894949
73	NC_004606	AC	3	6	54683	54688	50 %	0 %	0 %	50 %	28894949
74	NC_004606	AT	3	6	55393	55398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004606	AT	3	6	56984	56989	50 %	50 %	0 %	0 %	28894951
76	NC_004606	GT	3	6	57570	57575	0 %	50 %	50 %	0 %	28894951
77	NC_004606	TC	3	6	58225	58230	0 %	50 %	0 %	50 %	28894951
78	NC_004606	AC	3	6	58673	58678	50 %	0 %	0 %	50 %	28894952
79	NC_004606	CA	3	6	60395	60400	50 %	0 %	0 %	50 %	28894956
80	NC_004606	CA	3	6	63100	63105	50 %	0 %	0 %	50 %	28894961
81	NC_004606	GT	3	6	65683	65688	0 %	50 %	50 %	0 %	28894968
82	NC_004606	CA	3	6	65986	65991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_004606	CT	3	6	66807	66812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_004606	AT	3	6	68713	68718	50 %	50 %	0 %	0 %	28894974
85	NC_004606	AT	3	6	69520	69525	50 %	50 %	0 %	0 %	28894974
86	NC_004606	CA	3	6	71509	71514	50 %	0 %	0 %	50 %	28894979
87	NC_004606	GA	3	6	73264	73269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004606	AG	3	6	73822	73827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004606	AC	3	6	73837	73842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004606	AG	3	6	74049	74054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004606	AG	3	6	74224	74229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004606	AT	3	6	74753	74758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004606	CT	3	6	74784	74789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004606	AC	3	6	75274	75279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004606	AC	3	6	75443	75448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004606	TG	3	6	75798	75803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004606	CA	3	6	75809	75814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004606	TA	3	6	75873	75878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004606	AG	3	6	76367	76372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004606	CT	3	6	76481	76486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004606	TC	3	6	76859	76864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004606	TG	3	6	77249	77254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004606	GA	3	6	77400	77405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004606	TA	3	6	77454	77459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004606	GA	3	6	77696	77701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004606	CT	3	6	77811	77816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004606	GA	3	6	78018	78023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004606	GA	3	6	78833	78838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004606	AC	3	6	79126	79131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004606	CT	3	6	79853	79858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004606	GA	3	6	81080	81085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004606	TG	3	6	81177	81182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004606	TG	3	6	81351	81356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004606	TC	3	6	82445	82450	0 %	50 %	0 %	50 %	28894983
115	NC_004606	AG	4	8	86840	86847	50 %	0 %	50 %	0 %	28894987
116	NC_004606	AT	3	6	87461	87466	50 %	50 %	0 %	0 %	28894987
117	NC_004606	AC	3	6	89358	89363	50 %	0 %	0 %	50 %	28894988
118	NC_004606	TG	4	8	93334	93341	0 %	50 %	50 %	0 %	28894989
119	NC_004606	AC	3	6	94551	94556	50 %	0 %	0 %	50 %	28894989
120	NC_004606	GC	3	6	95549	95554	0 %	0 %	50 %	50 %	28894989
121	NC_004606	AG	3	6	99775	99780	50 %	0 %	50 %	0 %	28894997
122	NC_004606	AT	3	6	99895	99900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004606	AT	3	6	100036	100041	50 %	50 %	0 %	0 %	28894998
124	NC_004606	AG	3	6	100956	100961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004606	TG	3	6	101395	101400	0 %	50 %	50 %	0 %	28894999
126	NC_004606	CG	3	6	102129	102134	0 %	0 %	50 %	50 %	28894999
127	NC_004606	GT	3	6	104327	104332	0 %	50 %	50 %	0 %	28895002
128	NC_004606	TA	3	6	105267	105272	50 %	50 %	0 %	0 %	28895004
129	NC_004606	TC	3	6	106584	106589	0 %	50 %	0 %	50 %	28895007
130	NC_004606	GA	3	6	106830	106835	50 %	0 %	50 %	0 %	28895007
131	NC_004606	AT	3	6	106939	106944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004606	GA	3	6	107266	107271	50 %	0 %	50 %	0 %	28895008
133	NC_004606	AT	3	6	109830	109835	50 %	50 %	0 %	0 %	28895011
134	NC_004606	TA	3	6	110810	110815	50 %	50 %	0 %	0 %	28895011
135	NC_004606	CT	3	6	111322	111327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004606	AT	3	6	111740	111745	50 %	50 %	0 %	0 %	28895012
137	NC_004606	AT	3	6	112178	112183	50 %	50 %	0 %	0 %	28895012
138	NC_004606	GA	3	6	112691	112696	50 %	0 %	50 %	0 %	28895012
139	NC_004606	GA	4	8	114506	114513	50 %	0 %	50 %	0 %	28895014
140	NC_004606	CT	3	6	115933	115938	0 %	50 %	0 %	50 %	28895015
141	NC_004606	AG	3	6	116044	116049	50 %	0 %	50 %	0 %	28895015
142	NC_004606	AG	4	8	116432	116439	50 %	0 %	50 %	0 %	28895016
143	NC_004606	CA	3	6	116915	116920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_004606	TG	3	6	117838	117843	0 %	50 %	50 %	0 %	28895017
145	NC_004606	CT	4	8	118385	118392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004606	GA	4	8	118634	118641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004606	TA	3	6	119483	119488	50 %	50 %	0 %	0 %	28895018
148	NC_004606	AC	3	6	120473	120478	50 %	0 %	0 %	50 %	28895018
149	NC_004606	GT	3	6	121269	121274	0 %	50 %	50 %	0 %	28895019
150	NC_004606	AT	3	6	121809	121814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_004606	GA	3	6	123687	123692	50 %	0 %	50 %	0 %	28895021
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