MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 1429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	28894914
2	NC_004606	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	28894915
3	NC_004606	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	28894916
4	NC_004606	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	28894918
5	NC_004606	ATTAA	2	10	11997	12006	60 %	40 %	0 %	0 %	28894923
6	NC_004606	TACAC	2	10	15945	15954	40 %	20 %	0 %	40 %	28894926
7	NC_004606	TAAAT	2	10	15955	15964	60 %	40 %	0 %	0 %	28894926
8	NC_004606	ACATT	2	10	16522	16531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004606	TCGTG	2	10	18141	18150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004606	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004606	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004606	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004606	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004606	TTCTT	2	10	23969	23978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004606	CTTTT	2	10	24075	24084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004606	TATAA	2	10	26511	26520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004606	AGTGA	2	10	27258	27267	40 %	20 %	40 %	0 %	28894928
18	NC_004606	ATTTT	2	10	27957	27966	20 %	80 %	0 %	0 %	28894929
19	NC_004606	TTGAT	2	10	28146	28155	20 %	60 %	20 %	0 %	28894929
20	NC_004606	AGCGA	2	10	34637	34646	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004606	AGCAG	2	10	37553	37562	40 %	0 %	40 %	20 %	28894936
22	NC_004606	GGTCA	2	10	37917	37926	20 %	20 %	40 %	20 %	28894936
23	NC_004606	TTGGG	2	10	38313	38322	0 %	40 %	60 %	0 %	28894937
24	NC_004606	GCAGG	2	10	42396	42405	20 %	0 %	60 %	20 %	28894939
25	NC_004606	CTGCC	2	10	43360	43369	0 %	20 %	20 %	60 %	28894941
26	NC_004606	CTCAG	2	10	43753	43762	20 %	20 %	20 %	40 %	28894941
27	NC_004606	TACTA	2	10	45391	45400	40 %	40 %	0 %	20 %	28894942
28	NC_004606	AAATT	2	10	45684	45693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004606	CAAAT	2	10	45898	45907	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004606	TGTAT	2	10	48221	48230	20 %	60 %	20 %	0 %	28894944
31	NC_004606	TATTT	2	10	48300	48309	20 %	80 %	0 %	0 %	28894944
32	NC_004606	TCGGA	2	10	48649	48658	20 %	20 %	40 %	20 %	28894945
33	NC_004606	GCTTT	2	10	51394	51403	0 %	60 %	20 %	20 %	28894948
34	NC_004606	TTTTC	2	10	51592	51601	0 %	80 %	0 %	20 %	28894948
35	NC_004606	AAACC	2	10	51657	51666	60 %	0 %	0 %	40 %	28894948
36	NC_004606	ATTCA	2	10	54114	54123	40 %	40 %	0 %	20 %	28894949
37	NC_004606	ATTTT	2	10	55379	55388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004606	AAATA	2	10	56647	56656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004606	TATAT	2	10	56732	56741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	TTTTA	2	10	57886	57895	20 %	80 %	0 %	0 %	28894951
41	NC_004606	AAAGC	2	10	58079	58088	60 %	0 %	20 %	20 %	28894951
42	NC_004606	TTTGG	2	10	62073	62082	0 %	60 %	40 %	0 %	28894959
43	NC_004606	TTCAC	2	10	62429	62438	20 %	40 %	0 %	40 %	161486359
44	NC_004606	GAAAT	2	10	63510	63519	60 %	20 %	20 %	0 %	28894962
45	NC_004606	AAGGA	2	10	64590	64599	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004606	TCCAA	2	10	69211	69220	40 %	20 %	0 %	40 %	28894974
47	NC_004606	GTTTC	2	10	71860	71869	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004606	TCGTG	2	10	75120	75129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004606	GTTAA	2	10	76017	76026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004606	GGGAG	2	10	76536	76545	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004606	AGGGA	2	10	78747	78756	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004606	GCTTA	2	10	79113	79122	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004606	ATTAT	2	10	79403	79412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004606	TATAT	2	10	79486	79495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004606	CTTGG	2	10	83422	83431	0 %	40 %	40 %	20 %	28894984
56	NC_004606	TCTTA	2	10	83840	83849	20 %	60 %	0 %	20 %	28894984
57	NC_004606	AGCTC	2	10	84404	84413	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_004606	CACTC	2	10	85390	85399	20 %	20 %	0 %	60 %	28894986
59	NC_004606	GATTG	2	10	87651	87660	20 %	40 %	40 %	0 %	28894987
60	NC_004606	TTGAT	2	10	97792	97801	20 %	60 %	20 %	0 %	28894992
61	NC_004606	AAATC	2	10	97960	97969	60 %	20 %	0 %	20 %	28894992
62	NC_004606	TGAAG	2	10	103290	103299	40 %	20 %	40 %	0 %	28895001
63	NC_004606	TTTAG	2	10	105000	105009	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004606	TTTAG	2	10	105149	105158	20 %	60 %	20 %	0 %	28895004
65	NC_004606	GTGTT	2	10	109553	109562	0 %	60 %	40 %	0 %	28895010
66	NC_004606	TTGAA	2	10	109842	109851	40 %	40 %	20 %	0 %	28895011
67	NC_004606	TTTAG	2	10	111717	111726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004606	TTTAA	2	10	112042	112051	40 %	60 %	0 %	0 %	28895012
69	NC_004606	AACAG	2	10	114781	114790	60 %	0 %	20 %	20 %	28895014
70	NC_004606	AGGAG	2	10	119047	119056	40 %	0 %	60 %	0 %	28895018
71	NC_004606	TAATT	2	10	119874	119883	40 %	60 %	0 %	0 %	28895018
72	NC_004606	TCAGG	2	10	120337	120346	20 %	20 %	40 %	20 %	28895018
73	NC_004606	TTTTA	2	10	122219	122228	20 %	80 %	0 %	0 %	28895020
74	NC_004606	GCTTT	3	15	122795	122809	0 %	60 %	20 %	20 %	28895020
75	NC_004606	GTCAT	2	10	123114	123123	20 %	40 %	20 %	20 %	28895020
76	NC_004606	TAGTG	2	10	124059	124068	20 %	40 %	40 %	0 %	28895021
77	NC_004606	GTTAA	2	10	124462	124471	40 %	40 %	20 %	0 %	28895021
78	NC_004606	AATAA	2	10	124491	124500	80 %	20 %	0 %	0 %	28895021
79	NC_004606	TTGAT	2	10	125578	125587	20 %	60 %	20 %	0 %	28895022
80	NC_004606	TTGAC	2	10	126800	126809	20 %	40 %	20 %	20 %	28895024
81	NC_004606	TACCT	2	10	126981	126990	20 %	40 %	0 %	40 %	28895024
82	NC_004606	AATCA	2	10	127760	127769	60 %	20 %	0 %	20 %	28895025
83	NC_004606	TCATG	2	10	128367	128376	20 %	40 %	20 %	20 %	28895026
84	NC_004606	AACAA	2	10	129513	129522	80 %	0 %	0 %	20 %	28895027
85	NC_004606	TTGGC	2	10	129598	129607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_004606	CTTAA	2	10	129797	129806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004606	GCAAA	2	10	130729	130738	60 %	0 %	20 %	20 %	28895029
88	NC_004606	TTTTA	2	10	131803	131812	20 %	80 %	0 %	0 %	28895029
89	NC_004606	AAAGC	2	10	132992	133001	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004606	AGTTC	2	10	133242	133251	20 %	40 %	20 %	20 %	28895031
91	NC_004606	GCTGA	2	10	133262	133271	20 %	20 %	40 %	20 %	28895031
92	NC_004606	ATCGC	2	10	136636	136645	20 %	20 %	20 %	40 %	161486358
93	NC_004606	TTGGG	2	10	138039	138048	0 %	40 %	60 %	0 %	28895035
94	NC_004606	GAAAA	2	10	143349	143358	80 %	0 %	20 %	0 %	28895040
95	NC_004606	GGATT	2	10	143466	143475	20 %	40 %	40 %	0 %	28895040
96	NC_004606	TTTTG	2	10	143986	143995	0 %	80 %	20 %	0 %	28895040
97	NC_004606	TCATG	2	10	145491	145500	20 %	40 %	20 %	20 %	28895042
98	NC_004606	GATGT	2	10	146125	146134	20 %	40 %	40 %	0 %	28895042
99	NC_004606	GTATC	2	10	146752	146761	20 %	40 %	20 %	20 %	28895043
100	NC_004606	GTCGC	2	10	147191	147200	0 %	20 %	40 %	40 %	28895044
101	NC_004606	ATTAT	2	10	149271	149280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004606	ATATT	2	10	149285	149294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004606	CTTGT	2	10	151881	151890	0 %	60 %	20 %	20 %	28895048
104	NC_004606	GCAAC	2	10	152814	152823	40 %	0 %	20 %	40 %	28895049
105	NC_004606	AAGGT	2	10	154496	154505	40 %	20 %	40 %	0 %	28895049
106	NC_004606	CGTCA	2	10	154693	154702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_004606	TTGAA	2	10	155195	155204	40 %	40 %	20 %	0 %	28895050
108	NC_004606	AACAA	2	10	156432	156441	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004606	ATTTG	2	10	160780	160789	20 %	60 %	20 %	0 %	28895057
110	NC_004606	CAAGA	2	10	162702	162711	60 %	0 %	20 %	20 %	28895058
111	NC_004606	TTTGG	2	10	163870	163879	0 %	60 %	40 %	0 %	28895059
112	NC_004606	TGGAT	2	10	164819	164828	20 %	40 %	40 %	0 %	28895060
113	NC_004606	TTGCC	2	10	165194	165203	0 %	40 %	20 %	40 %	28895060
114	NC_004606	ACCTA	2	10	165891	165900	40 %	20 %	0 %	40 %	28895060
115	NC_004606	GGAAA	2	10	170930	170939	60 %	0 %	40 %	0 %	28895064
116	NC_004606	TAATC	2	10	173756	173765	40 %	40 %	0 %	20 %	28895068
117	NC_004606	TCTAA	2	10	177039	177048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004606	TTTAC	2	10	177889	177898	20 %	60 %	0 %	20 %	28895073
119	NC_004606	TCCCC	2	10	178152	178161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_004606	CAAAC	2	10	180413	180422	60 %	0 %	0 %	40 %	28895075
121	NC_004606	AGATA	2	10	180527	180536	60 %	20 %	20 %	0 %	28895075
122	NC_004606	ATATA	2	10	181316	181325	60 %	40 %	0 %	0 %	28895075
123	NC_004606	TTAAA	2	10	181826	181835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004606	AGTAT	2	10	183052	183061	40 %	40 %	20 %	0 %	28895077
125	NC_004606	GTTTT	2	10	183272	183281	0 %	80 %	20 %	0 %	28895078
126	NC_004606	TTTTG	2	10	185202	185211	0 %	80 %	20 %	0 %	28895079
127	NC_004606	ATCGC	2	10	186520	186529	20 %	20 %	20 %	40 %	28895082
128	NC_004606	TTTTA	2	10	187688	187697	20 %	80 %	0 %	0 %	28895083
129	NC_004606	CTAAT	2	10	187926	187935	40 %	40 %	0 %	20 %	28895083
130	NC_004606	GAATG	2	10	188449	188458	40 %	20 %	40 %	0 %	28895083
131	NC_004606	TGTCT	2	10	190943	190952	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004606	TAAGA	2	10	192461	192470	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004606	CCTTC	2	10	192876	192885	0 %	40 %	0 %	60 %	28895087
134	NC_004606	GCTAA	2	10	192919	192928	40 %	20 %	20 %	20 %	28895087
135	NC_004606	TGGAT	2	10	195011	195020	20 %	40 %	40 %	0 %	28895089
136	NC_004606	CTTTT	2	10	195181	195190	0 %	80 %	0 %	20 %	28895089
137	NC_004606	GTAAA	2	10	195604	195613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004606	GAGAA	2	10	196552	196561	60 %	0 %	40 %	0 %	28895090
139	NC_004606	GTTAT	2	10	197577	197586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004606	AAGAT	2	10	197663	197672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004606	AAATG	2	10	199207	199216	60 %	20 %	20 %	0 %	28895091
142	NC_004606	CAAAT	2	10	200352	200361	60 %	20 %	0 %	20 %	28895093
143	NC_004606	CCTTT	2	10	204719	204728	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_004606	CTCAT	2	10	204797	204806	20 %	40 %	0 %	40 %	28895099
145	NC_004606	TTTTC	2	10	205017	205026	0 %	80 %	0 %	20 %	28895099
146	NC_004606	TTGTC	2	10	206757	206766	0 %	60 %	20 %	20 %	28895101
147	NC_004606	GCAGC	2	10	211013	211022	20 %	0 %	40 %	40 %	28895105
148	NC_004606	AATAA	2	10	211786	211795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004606	ATTCC	2	10	212318	212327	20 %	40 %	0 %	40 %	28895107
150	NC_004606	AATCA	2	10	216861	216870	60 %	20 %	0 %	20 %	28895112
151	NC_004606	AGCTA	2	10	220533	220542	40 %	20 %	20 %	20 %	28895114
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158	NC_004606	TGGTT	2	10	233551	233560	0 %	60 %	40 %	0 %	28895125
159	NC_004606	TTTGC	2	10	234816	234825	0 %	60 %	20 %	20 %	28895126
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161	NC_004606	TGATT	2	10	235959	235968	20 %	60 %	20 %	0 %	28895127
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163	NC_004606	GTGAT	2	10	237813	237822	20 %	40 %	40 %	0 %	28895129
164	NC_004606	GGTTC	2	10	241911	241920	0 %	40 %	40 %	20 %	28895132
165	NC_004606	ATAGT	2	10	242031	242040	40 %	40 %	20 %	0 %	28895132
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167	NC_004606	CAAAA	2	10	243724	243733	80 %	0 %	0 %	20 %	28895133
168	NC_004606	TTGTA	2	10	249163	249172	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004606	TCGTG	2	10	251175	251184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_004606	GTTAA	2	10	252072	252081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_004606	AGGGA	2	10	254802	254811	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
173	NC_004606	AAAAG	2	10	255478	255487	80 %	0 %	20 %	0 %	28895138
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184	NC_004606	ATCAA	2	10	265961	265970	60 %	20 %	0 %	20 %	28895149
185	NC_004606	ATAGA	2	10	266509	266518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_004606	AAACC	2	10	266665	266674	60 %	0 %	0 %	40 %	28895150
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189	NC_004606	TAAAT	2	10	270254	270263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_004606	GTCAT	2	10	286223	286232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_004606	TTAAT	2	10	288010	288019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_004606	GCCTT	2	10	289528	289537	0 %	40 %	20 %	40 %	28895176
201	NC_004606	AAATT	2	10	291823	291832	60 %	40 %	0 %	0 %	28895177
202	NC_004606	TTATA	2	10	292082	292091	40 %	60 %	0 %	0 %	28895178
203	NC_004606	AGACA	2	10	293335	293344	60 %	0 %	20 %	20 %	28895178
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205	NC_004606	TTATC	2	10	295038	295047	20 %	60 %	0 %	20 %	28895180
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209	NC_004606	TACGG	2	10	299501	299510	20 %	20 %	40 %	20 %	28895183
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220	NC_004606	AAAAG	2	10	312853	312862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
221	NC_004606	TTTTG	2	10	313167	313176	0 %	80 %	20 %	0 %	28895196
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256	NC_004606	ATCAA	2	10	361211	361220	60 %	20 %	0 %	20 %	161486356
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259	NC_004606	AGTTT	2	10	364426	364435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_004606	ATCAA	2	10	373053	373062	60 %	20 %	0 %	20 %	28895247
261	NC_004606	TATGG	2	10	373311	373320	20 %	40 %	40 %	0 %	28895247
262	NC_004606	AAGAT	2	10	373525	373534	60 %	20 %	20 %	0 %	28895247
263	NC_004606	ATCAA	2	10	374265	374274	60 %	20 %	0 %	20 %	28895247
264	NC_004606	GGAGC	2	10	375082	375091	20 %	0 %	60 %	20 %	28895248
265	NC_004606	TTGAT	2	10	376244	376253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_004606	AGTAA	2	10	387692	387701	60 %	20 %	20 %	0 %	28895262
271	NC_004606	GTAAT	2	10	390215	390224	40 %	40 %	20 %	0 %	28895265
272	NC_004606	AGCCC	2	10	391445	391454	20 %	0 %	20 %	60 %	28895266
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