MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004606	CAC	2	6	184408	184413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28895079
4002	NC_004606	CAGCTC	2	12	184423	184434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28895079
4003	NC_004606	GCT	2	6	184569	184574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895079
4004	NC_004606	AAT	2	6	184625	184630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895079
4005	NC_004606	AGT	2	6	184690	184695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895079
4006	NC_004606	TGA	2	6	184753	184758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895079
4007	NC_004606	TTC	2	6	184781	184786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895079
4008	NC_004606	TCT	3	9	184842	184850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895079
4009	NC_004606	GCAT	2	8	184899	184906	25 %	25 %	25 %	25 %	28895079
4010	NC_004606	ACT	2	6	184911	184916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895079
4011	NC_004606	GGC	2	6	184931	184936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28895079
4012	NC_004606	CAA	2	6	184975	184980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895079
4013	NC_004606	AGT	2	6	185062	185067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895079
4014	NC_004606	TTTTG	2	10	185202	185211	0 %	80 %	20 %	0 %	28895079
4015	NC_004606	TAT	2	6	185246	185251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004606	TAA	2	6	185300	185305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895080
4017	NC_004606	AG	3	6	185316	185321	50 %	0 %	50 %	0 %	28895080
4018	NC_004606	TAA	2	6	185332	185337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895080
4019	NC_004606	TGT	2	6	185338	185343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895080
4020	NC_004606	TAA	2	6	185345	185350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895080
4021	NC_004606	TCA	2	6	185354	185359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895080
4022	NC_004606	TGT	2	6	185367	185372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895080
4023	NC_004606	AGG	2	6	185501	185506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_004606	TGA	2	6	185569	185574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895081
4025	NC_004606	A	7	7	185581	185587	100 %	0 %	0 %	0 %	28895081
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4031	NC_004606	T	6	6	185860	185865	0 %	100 %	0 %	0 %	28895081
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4033	NC_004606	A	6	6	185900	185905	100 %	0 %	0 %	0 %	28895081
4034	NC_004606	T	6	6	186003	186008	0 %	100 %	0 %	0 %	28895082
4035	NC_004606	GTT	2	6	186021	186026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895082
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4042	NC_004606	ATCA	2	8	186303	186310	50 %	25 %	0 %	25 %	28895082
4043	NC_004606	ATG	3	9	186327	186335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895082
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4046	NC_004606	TTG	2	6	186421	186426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895082
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4048	NC_004606	ATCGC	2	10	186520	186529	20 %	20 %	20 %	40 %	28895082
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4052	NC_004606	ATT	2	6	186801	186806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895082
4053	NC_004606	TGGT	2	8	186808	186815	0 %	50 %	50 %	0 %	28895082
4054	NC_004606	GAA	2	6	186912	186917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895082
4055	NC_004606	ATG	3	9	186967	186975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895082
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4059	NC_004606	GTA	2	6	187339	187344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895082
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4065	NC_004606	A	6	6	187516	187521	100 %	0 %	0 %	0 %	28895082
4066	NC_004606	AC	3	6	187587	187592	50 %	0 %	0 %	50 %	28895082
4067	NC_004606	TGG	2	6	187600	187605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895082
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4070	NC_004606	TGA	2	6	187662	187667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895083
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4077	NC_004606	AT	3	6	187934	187939	50 %	50 %	0 %	0 %	28895083
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4089	NC_004606	TTA	2	6	188463	188468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895083
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4104	NC_004606	CAAT	2	8	189427	189434	50 %	25 %	0 %	25 %	28895083
4105	NC_004606	T	6	6	189477	189482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_004606	CTTT	2	8	189505	189512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_004606	AGCA	2	8	189529	189536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_004606	A	6	6	189541	189546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004606	TGAT	2	8	189567	189574	25 %	50 %	25 %	0 %	28895084
4110	NC_004606	CTG	2	6	189694	189699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895084
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4112	NC_004606	AGA	3	9	189919	189927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895084
4113	NC_004606	ACT	2	6	190011	190016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895084
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4118	NC_004606	TGC	2	6	190207	190212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895084
4119	NC_004606	A	6	6	190244	190249	100 %	0 %	0 %	0 %	28895084
4120	NC_004606	T	6	6	190371	190376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004606	TAA	2	6	190400	190405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_004606	TAC	2	6	190495	190500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895085
4123	NC_004606	GAC	2	6	190511	190516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895085
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4373	NC_004606	GTTT	2	8	201931	201938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4376	NC_004606	GA	4	8	202043	202050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4378	NC_004606	GTA	2	6	202108	202113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_004606	GAG	2	6	202165	202170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_004606	CGT	2	6	202210	202215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895095
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