MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_004606	TTGG	2	8	46115	46122	0 %	50 %	50 %	0 %	28894943
1003	NC_004606	AGG	2	6	46174	46179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28894943
1004	NC_004606	TGG	2	6	46258	46263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894943
1005	NC_004606	GAG	2	6	46296	46301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28894943
1006	NC_004606	GTG	2	6	46338	46343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894943
1007	NC_004606	CAAG	2	8	46367	46374	50 %	0 %	25 %	25 %	28894943
1008	NC_004606	CAT	2	6	46451	46456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894943
1009	NC_004606	TGC	2	6	46559	46564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894943
1010	NC_004606	TTC	2	6	46687	46692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894943
1011	NC_004606	AAC	2	6	46789	46794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894943
1012	NC_004606	GAA	2	6	46803	46808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894943
1013	NC_004606	GC	3	6	46890	46895	0 %	0 %	50 %	50 %	28894943
1014	NC_004606	TCA	2	6	46965	46970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894943
1015	NC_004606	ATC	2	6	46980	46985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894943
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1017	NC_004606	ATG	2	6	47070	47075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894943
1018	NC_004606	ATTG	2	8	47129	47136	25 %	50 %	25 %	0 %	28894943
1019	NC_004606	GAA	2	6	47154	47159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894943
1020	NC_004606	AGA	3	9	47228	47236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894943
1021	NC_004606	AAG	2	6	47263	47268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894943
1022	NC_004606	TGA	2	6	47273	47278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894943
1023	NC_004606	TTA	2	6	47294	47299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894943
1024	NC_004606	TGA	2	6	47312	47317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894943
1025	NC_004606	A	8	8	47346	47353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004606	CTT	2	6	47366	47371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1028	NC_004606	A	6	6	47380	47385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_004606	ATA	2	6	47441	47446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004606	GTT	2	6	47456	47461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004606	GA	3	6	47463	47468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004606	TGG	2	6	47487	47492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894944
1033	NC_004606	AAAAGT	2	12	47493	47504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	28894944
1034	NC_004606	TG	3	6	47540	47545	0 %	50 %	50 %	0 %	28894944
1035	NC_004606	TAAG	2	8	47612	47619	50 %	25 %	25 %	0 %	28894944
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1039	NC_004606	ATCT	2	8	47931	47938	25 %	50 %	0 %	25 %	28894944
1040	NC_004606	ATT	2	6	47952	47957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894944
1041	NC_004606	ATT	2	6	47977	47982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894944
1042	NC_004606	GAT	2	6	48004	48009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894944
1043	NC_004606	AT	3	6	48008	48013	50 %	50 %	0 %	0 %	28894944
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1049	NC_004606	AAT	2	6	48097	48102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894944
1050	NC_004606	TTA	2	6	48106	48111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894944
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1054	NC_004606	T	6	6	48251	48256	0 %	100 %	0 %	0 %	28894944
1055	NC_004606	TATTT	2	10	48300	48309	20 %	80 %	0 %	0 %	28894944
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1057	NC_004606	TTTA	2	8	48413	48420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004606	ATA	2	6	48451	48456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_004606	A	7	7	48480	48486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004606	AGT	2	6	48513	48518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004606	TGG	2	6	48556	48561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004606	CT	3	6	48574	48579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1068	NC_004606	AT	3	6	48684	48689	50 %	50 %	0 %	0 %	28894945
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1075	NC_004606	GTA	2	6	49031	49036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894945
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1087	NC_004606	GATT	2	8	49683	49690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004606	ATA	2	6	49717	49722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_004606	GT	3	6	50534	50539	0 %	50 %	50 %	0 %	28894947
1103	NC_004606	AAT	2	6	50551	50556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894947
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1109	NC_004606	T	6	6	50786	50791	0 %	100 %	0 %	0 %	28894948
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1123	NC_004606	GCTTT	2	10	51394	51403	0 %	60 %	20 %	20 %	28894948
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1127	NC_004606	TTTTC	2	10	51592	51601	0 %	80 %	0 %	20 %	28894948
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1386	NC_004606	GCA	2	6	63432	63437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894962
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