MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 40307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004606	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004606	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_004606	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004606	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004606	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_004606	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004606	C	6	6	21806	21811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_004606	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004606	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004606	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_004606	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_004606	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_004606	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_004606	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004606	T	6	6	22338	22343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004606	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_004606	T	6	6	22776	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004606	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_004606	CGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_004606	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004606	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004606	GGA	2	6	23137	23142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004606	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_004606	TCC	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_004606	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_004606	GTT	2	6	23324	23329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004606	CGG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004606	TGT	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004606	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004606	GGT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004606	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004606	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004606	AGA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004606	T	11	11	23778	23788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004606	ATT	2	6	23830	23835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004606	ACT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_004606	GTT	2	6	23908	23913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_004606	TTCTT	2	10	23969	23978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_004606	AAT	2	6	24038	24043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004606	CTTTT	2	10	24075	24084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
541	NC_004606	GTTA	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004606	TAT	2	6	24126	24131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004606	TGA	2	6	24132	24137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004606	TAG	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004606	TAA	2	6	24348	24353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004606	GAT	2	6	24488	24493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004606	A	7	7	24720	24726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004606	TAA	2	6	24749	24754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004606	A	6	6	24765	24770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004606	ATA	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004606	TTA	2	6	24861	24866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004606	ATTC	2	8	24889	24896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_004606	AAG	2	6	24898	24903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004606	TTA	2	6	24951	24956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004606	AT	3	6	25042	25047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004606	GCT	2	6	25055	25060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_004606	TTA	2	6	25099	25104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004606	T	10	10	25139	25148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004606	AGT	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004606	T	7	7	25184	25190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004606	A	7	7	25197	25203	100 %	0 %	0 %	0 %	28894927
562	NC_004606	CAG	2	6	25213	25218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894927
563	NC_004606	GTG	2	6	25228	25233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894927
564	NC_004606	AGC	2	6	25244	25249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894927
565	NC_004606	GGA	2	6	25265	25270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28894927
566	NC_004606	TAT	2	6	25301	25306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894927
567	NC_004606	AAGT	2	8	25366	25373	50 %	25 %	25 %	0 %	28894927
568	NC_004606	TTG	2	6	25474	25479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894927
569	NC_004606	A	6	6	25496	25501	100 %	0 %	0 %	0 %	28894927
570	NC_004606	TGT	2	6	25580	25585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894927
571	NC_004606	TAG	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894927
572	NC_004606	AAC	2	6	25639	25644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894927
573	NC_004606	GAA	2	6	25668	25673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894927
574	NC_004606	AAGC	2	8	25674	25681	50 %	0 %	25 %	25 %	28894927
575	NC_004606	GAA	2	6	25731	25736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894927
576	NC_004606	CAA	2	6	25758	25763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894927
577	NC_004606	CTGCAA	2	12	25777	25788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28894927
578	NC_004606	AAG	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894927
579	NC_004606	GCT	3	9	25863	25871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894927
580	NC_004606	GCT	2	6	25893	25898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894927
581	NC_004606	CAA	2	6	25926	25931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894927
582	NC_004606	GCA	2	6	25932	25937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894927
583	NC_004606	AGC	2	6	25946	25951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894927
584	NC_004606	CAC	2	6	25972	25977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894927
585	NC_004606	AGT	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894927
586	NC_004606	CAT	2	6	26062	26067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894927
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588	NC_004606	AAT	2	6	26139	26144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894927
589	NC_004606	TGG	2	6	26153	26158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894927
590	NC_004606	AGC	2	6	26180	26185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894927
591	NC_004606	TGG	2	6	26240	26245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894927
592	NC_004606	ACC	2	6	26338	26343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894927
593	NC_004606	TGGT	2	8	26345	26352	0 %	50 %	50 %	0 %	28894927
594	NC_004606	ATTT	2	8	26372	26379	25 %	75 %	0 %	0 %	28894927
595	NC_004606	ATT	2	6	26394	26399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004606	GTT	2	6	26412	26417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004606	ATT	2	6	26430	26435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004606	AG	3	6	26484	26489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004606	TATAA	2	10	26511	26520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004606	TA	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004606	AT	3	6	26546	26551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004606	GGA	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_004606	GAA	2	6	26781	26786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894928
605	NC_004606	TCA	2	6	26798	26803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894928
606	NC_004606	A	6	6	26896	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	28894928
607	NC_004606	TAC	2	6	26919	26924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894928
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613	NC_004606	TCC	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28894928
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617	NC_004606	TGAT	2	8	27319	27326	25 %	50 %	25 %	0 %	28894928
618	NC_004606	GCA	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894928
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620	NC_004606	ATA	2	6	27430	27435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894928
621	NC_004606	ATT	2	6	27549	27554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894928
622	NC_004606	ATA	2	6	27623	27628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004606	ATTA	2	8	27674	27681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004606	TAA	2	6	27721	27726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004606	AAC	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004606	ACG	2	6	27778	27783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_004606	TGC	2	6	28087	28092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894929
632	NC_004606	A	7	7	28136	28142	100 %	0 %	0 %	0 %	28894929
633	NC_004606	TTGAT	2	10	28146	28155	20 %	60 %	20 %	0 %	28894929
634	NC_004606	ATT	2	6	28317	28322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894929
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