MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 2348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	ATTCA	2	10	1016	1025	40 %	40 %	0 %	20 %	27466919
2	NC_004461	ATAAA	2	10	3476	3485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004461	GTTAC	2	10	4395	4404	20 %	40 %	20 %	20 %	27466921
4	NC_004461	TGAAC	2	10	6886	6895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004461	CTATG	2	10	6987	6996	20 %	40 %	20 %	20 %	27466923
6	NC_004461	TGTTC	2	10	8586	8595	0 %	60 %	20 %	20 %	27466923
7	NC_004461	AAAAC	2	10	14687	14696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004461	AATAA	2	10	14765	14774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004461	TAGGG	2	10	15125	15134	20 %	20 %	60 %	0 %	27466927
10	NC_004461	AATTA	2	10	15957	15966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004461	TACGG	2	10	16292	16301	20 %	20 %	40 %	20 %	27466929
12	NC_004461	TAAAT	2	10	16411	16420	60 %	40 %	0 %	0 %	27466929
13	NC_004461	CTTTA	2	10	17294	17303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004461	ATGCA	2	10	17774	17783	40 %	20 %	20 %	20 %	27466930
15	NC_004461	ATAAA	2	10	20847	20856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004461	GACAA	2	10	22003	22012	60 %	0 %	20 %	20 %	27466933
17	NC_004461	TTTTA	2	10	24086	24095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004461	GCTAT	2	10	24242	24251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004461	AATTT	2	10	24956	24965	40 %	60 %	0 %	0 %	27466936
20	NC_004461	CAATG	2	10	27120	27129	40 %	20 %	20 %	20 %	27466937
21	NC_004461	GGCAA	2	10	29264	29273	40 %	0 %	40 %	20 %	27466939
22	NC_004461	GCGTG	2	10	29581	29590	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004461	TATAA	2	10	29978	29987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004461	GACGT	2	10	30001	30010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_004461	AATGA	2	10	31125	31134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004461	CATGG	2	10	34551	34560	20 %	20 %	40 %	20 %	27466943
27	NC_004461	CATTT	2	10	36419	36428	20 %	60 %	0 %	20 %	27466945
28	NC_004461	AAAGA	2	10	36852	36861	80 %	0 %	20 %	0 %	27466946
29	NC_004461	ATTGC	2	10	36959	36968	20 %	40 %	20 %	20 %	27466946
30	NC_004461	ATAAC	2	10	40224	40233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004461	ATTAA	2	10	41646	41655	60 %	40 %	0 %	0 %	27466953
32	NC_004461	ATTAT	2	10	41762	41771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004461	TGACA	2	10	41995	42004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004461	TCATT	2	10	42185	42194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004461	TTTGA	2	10	43965	43974	20 %	60 %	20 %	0 %	27466954
36	NC_004461	GTTTT	2	10	44048	44057	0 %	80 %	20 %	0 %	27466954
37	NC_004461	GTTTG	2	10	44678	44687	0 %	60 %	40 %	0 %	27466955
38	NC_004461	TTGCT	2	10	45006	45015	0 %	60 %	20 %	20 %	27466955
39	NC_004461	TATAT	2	10	49032	49041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004461	ATTAT	2	10	49144	49153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004461	TTATA	2	10	49314	49323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004461	AATCA	2	10	50135	50144	60 %	20 %	0 %	20 %	27466959
43	NC_004461	AAAAT	2	10	52849	52858	80 %	20 %	0 %	0 %	27466962
44	NC_004461	CATTT	2	10	54059	54068	20 %	60 %	0 %	20 %	27466965
45	NC_004461	AAAGA	2	10	54492	54501	80 %	0 %	20 %	0 %	27466966
46	NC_004461	ATTGC	2	10	54599	54608	20 %	40 %	20 %	20 %	27466966
47	NC_004461	GCTTA	2	10	55974	55983	20 %	40 %	20 %	20 %	27466969
48	NC_004461	ACTAC	2	10	56767	56776	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_004461	TCATT	2	10	56863	56872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004461	ATTCA	2	10	58919	58928	40 %	40 %	0 %	20 %	27466974
51	NC_004461	TTCTT	2	10	59248	59257	0 %	80 %	0 %	20 %	27466974
52	NC_004461	TTTGT	2	10	59970	59979	0 %	80 %	20 %	0 %	27466974
53	NC_004461	TTATT	2	10	60360	60369	20 %	80 %	0 %	0 %	27466975
54	NC_004461	CACTT	2	10	60628	60637	20 %	40 %	0 %	40 %	27466975
55	NC_004461	TGTGA	2	10	61288	61297	20 %	40 %	40 %	0 %	27466975
56	NC_004461	GAAAA	2	10	62773	62782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004461	ATGTT	2	10	62791	62800	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004461	CAAAA	2	10	63268	63277	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004461	TTGAA	2	10	63388	63397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004461	GAAGG	2	10	63654	63663	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004461	AAAAT	2	10	65261	65270	80 %	20 %	0 %	0 %	27466980
62	NC_004461	TAATG	2	10	65607	65616	40 %	40 %	20 %	0 %	27466980
63	NC_004461	GATTA	2	10	66878	66887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004461	ATTTT	2	10	69214	69223	20 %	80 %	0 %	0 %	27466987
65	NC_004461	ATTTT	2	10	69595	69604	20 %	80 %	0 %	0 %	27466987
66	NC_004461	AAATA	2	10	73212	73221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004461	TTGAA	2	10	76156	76165	40 %	40 %	20 %	0 %	27466994
68	NC_004461	TTGTA	2	10	76502	76511	20 %	60 %	20 %	0 %	27466994
69	NC_004461	TTTAG	2	10	77456	77465	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004461	ATCCT	2	10	78510	78519	20 %	40 %	0 %	40 %	27466995
71	NC_004461	TTCCA	2	10	79002	79011	20 %	40 %	0 %	40 %	27466995
72	NC_004461	AATTT	2	10	79513	79522	40 %	60 %	0 %	0 %	27466996
73	NC_004461	GCTTT	2	10	80375	80384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004461	ATGTG	2	10	80427	80436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004461	TAAAG	2	10	82734	82743	60 %	20 %	20 %	0 %	27466998
76	NC_004461	AAAAG	2	10	83612	83621	80 %	0 %	20 %	0 %	27466999
77	NC_004461	TCAAG	2	10	84395	84404	40 %	20 %	20 %	20 %	27467001
78	NC_004461	TCGGT	2	10	87458	87467	0 %	40 %	40 %	20 %	27467004
79	NC_004461	TGCAA	2	10	88460	88469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004461	TAAAT	2	10	90381	90390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004461	TTATT	2	10	90716	90725	20 %	80 %	0 %	0 %	27467010
82	NC_004461	ATTAC	2	10	91435	91444	40 %	40 %	0 %	20 %	27467011
83	NC_004461	TTTCT	2	10	91809	91818	0 %	80 %	0 %	20 %	27467011
84	NC_004461	AGAAA	2	10	92547	92556	80 %	0 %	20 %	0 %	27467012
85	NC_004461	TATTT	2	10	92870	92879	20 %	80 %	0 %	0 %	27467013
86	NC_004461	AAATT	2	10	95028	95037	60 %	40 %	0 %	0 %	27467015
87	NC_004461	ATCAA	2	10	95939	95948	60 %	20 %	0 %	20 %	27467016
88	NC_004461	TTAAT	2	10	96088	96097	40 %	60 %	0 %	0 %	27467016
89	NC_004461	TAAAA	2	10	96188	96197	80 %	20 %	0 %	0 %	27467016
90	NC_004461	ACTGT	2	10	96899	96908	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004461	TGAAA	2	10	97106	97115	60 %	20 %	20 %	0 %	27467018
92	NC_004461	AAATC	2	10	97589	97598	60 %	20 %	0 %	20 %	27467019
93	NC_004461	TTTTC	2	10	98218	98227	0 %	80 %	0 %	20 %	27467020
94	NC_004461	TAATC	2	10	100901	100910	40 %	40 %	0 %	20 %	27467023
95	NC_004461	CTTAT	2	10	103660	103669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_004461	TAAGA	2	10	104154	104163	60 %	20 %	20 %	0 %	27467025
97	NC_004461	CTATT	2	10	104770	104779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004461	AGAAA	2	10	105526	105535	80 %	0 %	20 %	0 %	27467027
99	NC_004461	TTCTT	2	10	106687	106696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004461	ACAAA	2	10	106872	106881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_004461	TCTTT	2	10	107915	107924	0 %	80 %	0 %	20 %	27467030
102	NC_004461	AATTA	2	10	108471	108480	60 %	40 %	0 %	0 %	27467030
103	NC_004461	GTGCT	2	10	108982	108991	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004461	TTGAT	2	10	109212	109221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004461	GAATG	2	10	109319	109328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004461	GATAT	2	10	110920	110929	40 %	40 %	20 %	0 %	27467032
107	NC_004461	TACTA	2	10	114162	114171	40 %	40 %	0 %	20 %	27467037
108	NC_004461	GACGT	2	10	114808	114817	20 %	20 %	40 %	20 %	27467038
109	NC_004461	TCATT	2	10	117072	117081	20 %	60 %	0 %	20 %	27467040
110	NC_004461	AAAAT	2	10	117218	117227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004461	GAAAA	2	10	122743	122752	80 %	0 %	20 %	0 %	27467045
112	NC_004461	GAATG	2	10	123668	123677	40 %	20 %	40 %	0 %	27467045
113	NC_004461	AAAGT	2	10	123788	123797	60 %	20 %	20 %	0 %	27467046
114	NC_004461	GGCCA	2	10	125424	125433	20 %	0 %	40 %	40 %	27467047
115	NC_004461	TTTGA	2	10	126748	126757	20 %	60 %	20 %	0 %	27467048
116	NC_004461	TGTTT	2	10	127074	127083	0 %	80 %	20 %	0 %	27467049
117	NC_004461	TCAAG	2	10	127663	127672	40 %	20 %	20 %	20 %	27467051
118	NC_004461	AATTA	2	10	128506	128515	60 %	40 %	0 %	0 %	27467052
119	NC_004461	AATTA	2	10	130155	130164	60 %	40 %	0 %	0 %	27467054
120	NC_004461	TTTAT	2	10	133820	133829	20 %	80 %	0 %	0 %	27467058
121	NC_004461	TAAAA	2	10	134723	134732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004461	GATAT	2	10	136536	136545	40 %	40 %	20 %	0 %	27467062
123	NC_004461	ATAAA	2	10	136724	136733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004461	GATAT	2	10	137635	137644	40 %	40 %	20 %	0 %	27467063
125	NC_004461	ATGTT	2	10	138052	138061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004461	GAAAA	2	10	138335	138344	80 %	0 %	20 %	0 %	27467064
127	NC_004461	GCTTT	2	10	140866	140875	0 %	60 %	20 %	20 %	27467066
128	NC_004461	CAAAT	2	10	142096	142105	60 %	20 %	0 %	20 %	27467067
129	NC_004461	ATTTT	2	10	142995	143004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004461	TTTTG	2	10	143461	143470	0 %	80 %	20 %	0 %	27467070
131	NC_004461	ATTTA	2	10	144498	144507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004461	TTTTG	2	10	147863	147872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004461	GATTT	2	10	149877	149886	20 %	60 %	20 %	0 %	27467079
134	NC_004461	GTTTT	2	10	150286	150295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004461	TTTCA	2	10	150650	150659	20 %	60 %	0 %	20 %	27467080
136	NC_004461	ATACA	2	10	151355	151364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004461	TATCA	2	10	154143	154152	40 %	40 %	0 %	20 %	27467084
138	NC_004461	TTGAG	2	10	156086	156095	20 %	40 %	40 %	0 %	27467085
139	NC_004461	TTTGT	2	10	157868	157877	0 %	80 %	20 %	0 %	27467086
140	NC_004461	TATAT	2	10	158609	158618	40 %	60 %	0 %	0 %	27467086
141	NC_004461	TTGAA	2	10	158950	158959	40 %	40 %	20 %	0 %	27467086
142	NC_004461	AATTT	2	10	159135	159144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004461	ATTAT	2	10	160479	160488	40 %	60 %	0 %	0 %	27467088
144	NC_004461	AATGC	2	10	160846	160855	40 %	20 %	20 %	20 %	27467088
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146	NC_004461	ATATA	2	10	162330	162339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_004461	GTATA	2	10	296830	296839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_004461	TAAAA	2	10	297963	297972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_004461	ATTAA	2	10	300269	300278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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