MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 28774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004350	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004350	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004350	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
4	NC_004350	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378533
5	NC_004350	GAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
6	NC_004350	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378533
7	NC_004350	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
8	NC_004350	TGA	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
9	NC_004350	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378533
10	NC_004350	GGA	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24378533
11	NC_004350	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
12	NC_004350	TGT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378533
13	NC_004350	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
14	NC_004350	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
15	NC_004350	AAG	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
16	NC_004350	ATA	3	9	915	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378533
17	NC_004350	CCT	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378533
18	NC_004350	TTA	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
19	NC_004350	GCA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378533
20	NC_004350	GAT	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
21	NC_004350	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378533
22	NC_004350	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004350	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004350	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004350	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004350	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004350	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378534
28	NC_004350	GAA	3	9	1888	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
29	NC_004350	CTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378534
30	NC_004350	TTA	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378534
31	NC_004350	GAA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
32	NC_004350	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378534
33	NC_004350	GTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378534
34	NC_004350	AAT	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378534
35	NC_004350	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378534
36	NC_004350	TGC	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378534
37	NC_004350	TCA	2	6	2290	2295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378534
38	NC_004350	GAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378534
39	NC_004350	GTC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378534
40	NC_004350	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378534
41	NC_004350	TTG	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378534
42	NC_004350	CAA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378534
43	NC_004350	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
44	NC_004350	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004350	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004350	GCT	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004350	GAC	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378535
48	NC_004350	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378535
49	NC_004350	ATG	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378535
50	NC_004350	GCC	2	6	3257	3262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24378535
51	NC_004350	TAT	2	6	3364	3369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004350	CAG	2	6	3471	3476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378536
53	NC_004350	CAA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378536
54	NC_004350	TGT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
55	NC_004350	ATG	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
56	NC_004350	TTG	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
57	NC_004350	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378536
58	NC_004350	TTC	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378536
59	NC_004350	AGA	2	6	4027	4032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
60	NC_004350	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
61	NC_004350	CAA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378536
62	NC_004350	GCA	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378536
63	NC_004350	GTT	3	9	4181	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
64	NC_004350	GAA	3	9	4205	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
65	NC_004350	TGA	3	9	4225	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
66	NC_004350	TTG	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
67	NC_004350	CAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24378536
68	NC_004350	ATG	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
69	NC_004350	AAG	2	6	4494	4499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
70	NC_004350	GAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
71	NC_004350	CTT	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004350	TTG	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378537
73	NC_004350	TTA	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378537
74	NC_004350	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378537
75	NC_004350	GAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378537
76	NC_004350	CTG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378537
77	NC_004350	CTA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
78	NC_004350	AGC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
79	NC_004350	AGC	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
80	NC_004350	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
81	NC_004350	TGA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
82	NC_004350	GCA	3	9	5489	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
83	NC_004350	TTG	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378538
84	NC_004350	AGC	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
85	NC_004350	GAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
86	NC_004350	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
87	NC_004350	TGA	2	6	5908	5913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
88	NC_004350	ATC	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
89	NC_004350	TTA	2	6	5970	5975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
90	NC_004350	TCA	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
91	NC_004350	GAT	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
92	NC_004350	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
93	NC_004350	AGA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
94	NC_004350	TAA	2	6	6244	6249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378538
95	NC_004350	TGA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
96	NC_004350	CAG	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
97	NC_004350	TGA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
98	NC_004350	CGT	3	9	6644	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378538
99	NC_004350	TGT	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378538
100	NC_004350	ATT	2	6	6786	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
101	NC_004350	ATG	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
102	NC_004350	TGA	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
103	NC_004350	TGA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
104	NC_004350	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
105	NC_004350	AAG	2	6	7095	7100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
106	NC_004350	TCT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378538
107	NC_004350	GCT	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378538
108	NC_004350	ATG	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
109	NC_004350	CAA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378538
110	NC_004350	ATG	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
111	NC_004350	ATT	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
112	NC_004350	TGA	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
113	NC_004350	TAT	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
114	NC_004350	ACA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378538
115	NC_004350	GTG	2	6	7842	7847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378538
116	NC_004350	ACA	2	6	7868	7873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378538
117	NC_004350	ATC	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
118	NC_004350	GTG	2	6	8124	8129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378538
119	NC_004350	TTA	2	6	8198	8203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
120	NC_004350	GAA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
121	NC_004350	GCA	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
122	NC_004350	CAA	2	6	8292	8297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378538
123	NC_004350	TGA	2	6	8308	8313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
124	NC_004350	GAT	2	6	8465	8470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
125	NC_004350	AGT	3	9	8506	8514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
126	NC_004350	ATT	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
127	NC_004350	AGA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
128	NC_004350	GAA	2	6	8695	8700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
129	NC_004350	TTA	2	6	8727	8732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004350	TGT	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004350	TAT	2	6	8884	8889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378539
132	NC_004350	TAA	2	6	9007	9012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378539
133	NC_004350	ATT	2	6	9013	9018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378539
134	NC_004350	ATA	2	6	9083	9088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378539
135	NC_004350	TAA	2	6	9137	9142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378540
136	NC_004350	ATG	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378540
137	NC_004350	GAA	4	12	9180	9191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378540
138	NC_004350	TAT	2	6	9233	9238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378540
139	NC_004350	TAT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378540
140	NC_004350	GAT	2	6	9387	9392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378540
141	NC_004350	ATT	3	9	9424	9432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378540
142	NC_004350	TTA	2	6	9468	9473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378540
143	NC_004350	AAT	2	6	9478	9483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378540
144	NC_004350	TGA	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378541
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146	NC_004350	GAA	2	6	9572	9577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378541
147	NC_004350	AGG	2	6	9600	9605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24378541
148	NC_004350	TTA	2	6	9666	9671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378542
149	NC_004350	CTG	2	6	9753	9758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378542
150	NC_004350	TTA	2	6	9816	9821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378542
151	NC_004350	TTC	2	6	9906	9911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378542
152	NC_004350	TAA	2	6	10162	10167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378542
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155	NC_004350	CAG	2	6	10584	10589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378542
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159	NC_004350	ATC	2	6	10789	10794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378542
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164	NC_004350	CTG	2	6	11090	11095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378543
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171	NC_004350	TAT	3	9	11877	11885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378543
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224	NC_004350	TTA	2	6	14727	14732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_004350	GGC	2	6	16907	16912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_004350	ATA	2	6	17055	17060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_004350	ATT	2	6	17064	17069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_004350	TAG	2	6	17105	17110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_004350	CGA	2	6	17160	17165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_004350	GCA	2	6	17234	17239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_004350	TGT	2	6	17320	17325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_004350	AGT	2	6	27972	27977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378552
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402	NC_004350	TCA	2	6	28344	28349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378552
403	NC_004350	ACC	2	6	28369	28374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24378552
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