MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 44921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004350	GGT	2	6	221955	221960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378743
5002	NC_004350	GCT	2	6	222060	222065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378743
5003	NC_004350	ATG	2	6	222115	222120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378743
5004	NC_004350	AAG	2	6	222151	222156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378743
5005	NC_004350	TCGAAA	2	12	222166	222177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24378743
5006	NC_004350	A	6	6	222175	222180	100 %	0 %	0 %	0 %	24378743
5007	NC_004350	ACGATG	2	12	222223	222234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24378743
5008	NC_004350	AAAT	2	8	222254	222261	75 %	25 %	0 %	0 %	24378743
5009	NC_004350	GCA	2	6	222310	222315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_004350	T	6	6	222341	222346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_004350	GTTT	2	8	222354	222361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_004350	TAA	2	6	222372	222377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_004350	AT	3	6	222429	222434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_004350	T	7	7	222446	222452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_004350	TAA	2	6	222457	222462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_004350	TGC	2	6	222518	222523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378744
5017	NC_004350	TGT	3	9	222542	222550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378744
5018	NC_004350	ATTT	2	8	222603	222610	25 %	75 %	0 %	0 %	24378744
5019	NC_004350	TTA	2	6	222659	222664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378744
5020	NC_004350	GAA	2	6	222687	222692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378744
5021	NC_004350	GTT	2	6	222705	222710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378744
5022	NC_004350	AATGA	2	10	222756	222765	60 %	20 %	20 %	0 %	24378744
5023	NC_004350	CTC	2	6	222799	222804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378744
5024	NC_004350	T	6	6	222828	222833	0 %	100 %	0 %	0 %	24378744
5025	NC_004350	AAG	2	6	223003	223008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378744
5026	NC_004350	TGG	3	9	223043	223051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378744
5027	NC_004350	GC	3	6	223131	223136	0 %	0 %	50 %	50 %	24378744
5028	NC_004350	ATG	2	6	223237	223242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378744
5029	NC_004350	TTGA	2	8	223302	223309	25 %	50 %	25 %	0 %	24378744
5030	NC_004350	TAT	2	6	223328	223333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378744
5031	NC_004350	CAG	2	6	223342	223347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378744
5032	NC_004350	AGC	2	6	223349	223354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378744
5033	NC_004350	GAA	2	6	223371	223376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378744
5034	NC_004350	GAT	2	6	223383	223388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378744
5035	NC_004350	TAT	2	6	223412	223417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378744
5036	NC_004350	TGG	2	6	223421	223426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378744
5037	NC_004350	AAT	2	6	223428	223433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378744
5038	NC_004350	GAA	2	6	223458	223463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378744
5039	NC_004350	TTAT	2	8	223471	223478	25 %	75 %	0 %	0 %	24378744
5040	NC_004350	ATT	2	6	223492	223497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378744
5041	NC_004350	TTG	2	6	223498	223503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378744
5042	NC_004350	ATG	2	6	223564	223569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378744
5043	NC_004350	AT	3	6	223586	223591	50 %	50 %	0 %	0 %	24378744
5044	NC_004350	ATT	2	6	223745	223750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378744
5045	NC_004350	A	6	6	223757	223762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_004350	A	6	6	223784	223789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_004350	T	7	7	223813	223819	0 %	100 %	0 %	0 %	24378745
5048	NC_004350	TGT	2	6	223868	223873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378745
5049	NC_004350	CAA	2	6	223878	223883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378745
5050	NC_004350	TAT	2	6	223892	223897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378745
5051	NC_004350	TGC	2	6	223973	223978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378745
5052	NC_004350	ATT	2	6	224010	224015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378745
5053	NC_004350	TTA	2	6	224102	224107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378745
5054	NC_004350	ATT	2	6	224192	224197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378745
5055	NC_004350	A	6	6	224202	224207	100 %	0 %	0 %	0 %	24378745
5056	NC_004350	GAA	2	6	224244	224249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378745
5057	NC_004350	CAAT	2	8	224319	224326	50 %	25 %	0 %	25 %	24378745
5058	NC_004350	TGC	2	6	224360	224365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378745
5059	NC_004350	TAAAAT	2	12	224387	224398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378745
5060	NC_004350	CTG	2	6	224404	224409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378745
5061	NC_004350	GCTGAG	2	12	224415	224426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24378745
5062	NC_004350	CAA	2	6	224457	224462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378745
5063	NC_004350	AGA	2	6	224531	224536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378745
5064	NC_004350	AGA	2	6	224642	224647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378745
5065	NC_004350	GAT	2	6	224683	224688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378745
5066	NC_004350	A	6	6	224724	224729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_004350	T	7	7	224762	224768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_004350	AGA	2	6	224792	224797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_004350	T	6	6	224806	224811	0 %	100 %	0 %	0 %	24378746
5070	NC_004350	TAAAA	2	10	224894	224903	80 %	20 %	0 %	0 %	24378746
5071	NC_004350	TG	3	6	224907	224912	0 %	50 %	50 %	0 %	24378746
5072	NC_004350	CTT	2	6	225085	225090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378746
5073	NC_004350	AAC	2	6	225158	225163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378746
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5075	NC_004350	A	6	6	225198	225203	100 %	0 %	0 %	0 %	24378746
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5080	NC_004350	AAG	2	6	225532	225537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378747
5081	NC_004350	AAG	2	6	225540	225545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378747
5082	NC_004350	GTTCAA	2	12	225560	225571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24378747
5083	NC_004350	AAT	2	6	225591	225596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378747
5084	NC_004350	AG	3	6	225623	225628	50 %	0 %	50 %	0 %	24378747
5085	NC_004350	GA	3	6	225642	225647	50 %	0 %	50 %	0 %	24378747
5086	NC_004350	AAT	2	6	225678	225683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378747
5087	NC_004350	A	7	7	225689	225695	100 %	0 %	0 %	0 %	24378747
5088	NC_004350	AACAAT	2	12	225705	225716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	24378747
5089	NC_004350	CAT	2	6	225729	225734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5090	NC_004350	AAC	2	6	225807	225812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378747
5091	NC_004350	TAC	2	6	225827	225832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5092	NC_004350	GTCTAA	2	12	225840	225851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24378747
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5094	NC_004350	TGC	2	6	225891	225896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378747
5095	NC_004350	AAG	2	6	225993	225998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378747
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5097	NC_004350	AAG	2	6	226036	226041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378747
5098	NC_004350	AAAG	2	8	226068	226075	75 %	0 %	25 %	0 %	24378747
5099	NC_004350	CAAAT	2	10	226110	226119	60 %	20 %	0 %	20 %	24378747
5100	NC_004350	GTTT	2	8	226123	226130	0 %	75 %	25 %	0 %	24378747
5101	NC_004350	GTTT	2	8	226144	226151	0 %	75 %	25 %	0 %	24378747
5102	NC_004350	CTTGAG	2	12	226217	226228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24378747
5103	NC_004350	CTTG	2	8	226273	226280	0 %	50 %	25 %	25 %	24378747
5104	NC_004350	T	6	6	226287	226292	0 %	100 %	0 %	0 %	24378747
5105	NC_004350	T	6	6	226455	226460	0 %	100 %	0 %	0 %	24378747
5106	NC_004350	AGC	2	6	226461	226466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378747
5107	NC_004350	CTA	2	6	226489	226494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5108	NC_004350	CAT	2	6	226505	226510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5109	NC_004350	TCA	2	6	226592	226597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5110	NC_004350	ATG	2	6	226603	226608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378747
5111	NC_004350	TAA	2	6	226653	226658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378747
5112	NC_004350	TAG	2	6	226662	226667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378747
5113	NC_004350	T	7	7	226671	226677	0 %	100 %	0 %	0 %	24378747
5114	NC_004350	TCA	2	6	226694	226699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378747
5115	NC_004350	ATT	2	6	226763	226768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378748
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5117	NC_004350	GT	3	6	226844	226849	0 %	50 %	50 %	0 %	24378748
5118	NC_004350	T	7	7	226874	226880	0 %	100 %	0 %	0 %	24378748
5119	NC_004350	TCC	2	6	227006	227011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378748
5120	NC_004350	TTA	2	6	227031	227036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378748
5121	NC_004350	CAA	2	6	227053	227058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378748
5122	NC_004350	A	6	6	227120	227125	100 %	0 %	0 %	0 %	24378748
5123	NC_004350	ATG	2	6	227216	227221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378748
5124	NC_004350	TTCCA	2	10	227255	227264	20 %	40 %	0 %	40 %	24378748
5125	NC_004350	AAT	2	6	227318	227323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378748
5126	NC_004350	TGA	2	6	227367	227372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378748
5127	NC_004350	T	6	6	227379	227384	0 %	100 %	0 %	0 %	24378748
5128	NC_004350	CTT	2	6	227422	227427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_004350	A	6	6	227431	227436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_004350	AGTG	3	12	227440	227451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_004350	CTTA	2	8	227452	227459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_004350	TCAC	2	8	227486	227493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_004350	CTT	2	6	227569	227574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_004350	T	6	6	227628	227633	0 %	100 %	0 %	0 %	24378749
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5141	NC_004350	ATG	2	6	227970	227975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378749
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5145	NC_004350	CCT	2	6	228210	228215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5146	NC_004350	TCTTT	2	10	228298	228307	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5147	NC_004350	TAATCT	2	12	228358	228369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5151	NC_004350	ATT	2	6	228439	228444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_004350	A	6	6	228465	228470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_004350	A	6	6	228512	228517	100 %	0 %	0 %	0 %	24378750
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5201	NC_004350	AGA	2	6	230801	230806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5225	NC_004350	ATA	2	6	232073	232078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378752
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5237	NC_004350	TCT	2	6	232473	232478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378752
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5240	NC_004350	TTA	2	6	232574	232579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378752
5241	NC_004350	ATT	2	6	232637	232642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378752
5242	NC_004350	GGC	2	6	232789	232794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378752
5243	NC_004350	GCG	2	6	232799	232804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378752
5244	NC_004350	CGGAGG	2	12	232815	232826	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	24378752
5245	NC_004350	GGC	2	6	232834	232839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378752
5246	NC_004350	AAGTA	2	10	232862	232871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_004350	AAG	2	6	232884	232889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_004350	TAAA	2	8	232890	232897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_004350	TGT	2	6	232910	232915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378753
5250	NC_004350	T	6	6	232915	232920	0 %	100 %	0 %	0 %	24378753
5251	NC_004350	TAT	2	6	232935	232940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378753
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5378	NC_004350	AGA	2	6	238336	238341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378758
5379	NC_004350	TTA	2	6	238374	238379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378758
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5390	NC_004350	GCA	2	6	239009	239014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378758
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5434	NC_004350	TAG	2	6	241180	241185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5455	NC_004350	GCTG	2	8	242185	242192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5487	NC_004350	TCA	2	6	243528	243533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378762
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5489	NC_004350	AGAGA	2	10	243601	243610	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5490	NC_004350	T	6	6	243621	243626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_004350	ATTT	2	8	243677	243684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_004350	AT	3	6	243685	243690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_004350	T	6	6	243720	243725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_004350	TAAAA	2	10	243762	243771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_004350	ATT	2	6	243795	243800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_004350	CAG	2	6	243883	243888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378763
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5499	NC_004350	TGA	2	6	244046	244051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378763
5500	NC_004350	A	6	6	244080	244085	100 %	0 %	0 %	0 %	24378763

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