MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	AG	3	6	1304	1309	50 %	0 %	50 %	0 %	24376232
2	NC_004349	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004349	AC	3	6	1986	1991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004349	TA	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004349	AT	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	24376233
6	NC_004349	CA	3	6	3264	3269	50 %	0 %	0 %	50 %	24376234
7	NC_004349	AT	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
8	NC_004349	TA	4	8	5011	5018	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
9	NC_004349	AT	4	8	5147	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	24376235
10	NC_004349	CA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	0 %	50 %	24376235
11	NC_004349	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	24376235
12	NC_004349	AC	3	6	7979	7984	50 %	0 %	0 %	50 %	24376239
13	NC_004349	TA	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004349	CA	3	6	9996	10001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004349	TG	3	6	10013	10018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004349	AC	4	8	10922	10929	50 %	0 %	0 %	50 %	24376243
17	NC_004349	CA	3	6	10949	10954	50 %	0 %	0 %	50 %	24376243
18	NC_004349	AG	3	6	11017	11022	50 %	0 %	50 %	0 %	24376243
19	NC_004349	CA	3	6	11340	11345	50 %	0 %	0 %	50 %	24376244
20	NC_004349	AC	3	6	11741	11746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004349	AC	3	6	11894	11899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004349	AT	3	6	12510	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004349	GC	3	6	14528	14533	0 %	0 %	50 %	50 %	24376247
24	NC_004349	TA	3	6	19487	19492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004349	TC	3	6	20402	20407	0 %	50 %	0 %	50 %	118725023
26	NC_004349	GA	3	6	21413	21418	50 %	0 %	50 %	0 %	118725024
27	NC_004349	GC	3	6	22694	22699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004349	CG	3	6	23248	23253	0 %	0 %	50 %	50 %	24376259
29	NC_004349	TG	3	6	24727	24732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004349	GT	3	6	24738	24743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004349	TC	3	6	29225	29230	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
32	NC_004349	AG	3	6	30964	30969	50 %	0 %	50 %	0 %	24376268
33	NC_004349	TG	3	6	31152	31157	0 %	50 %	50 %	0 %	24376269
34	NC_004349	AC	4	8	33547	33554	50 %	0 %	0 %	50 %	24376272
35	NC_004349	AC	3	6	33871	33876	50 %	0 %	0 %	50 %	118725028
36	NC_004349	CG	3	6	35089	35094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004349	AG	3	6	35754	35759	50 %	0 %	50 %	0 %	118725029
38	NC_004349	TA	3	6	36242	36247	50 %	50 %	0 %	0 %	24376276
39	NC_004349	GC	3	6	36735	36740	0 %	0 %	50 %	50 %	24376276
40	NC_004349	AT	4	8	37305	37312	50 %	50 %	0 %	0 %	24376276
41	NC_004349	TA	3	6	38301	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004349	TA	3	6	42272	42277	50 %	50 %	0 %	0 %	24376278
43	NC_004349	AT	3	6	42297	42302	50 %	50 %	0 %	0 %	24376278
44	NC_004349	TA	3	6	42460	42465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004349	AT	3	6	42676	42681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004349	AT	3	6	42773	42778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004349	GT	3	6	44178	44183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004349	TG	3	6	44909	44914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004349	GA	3	6	45336	45341	50 %	0 %	50 %	0 %	118725030
50	NC_004349	TG	3	6	46823	46828	0 %	50 %	50 %	0 %	24376285
51	NC_004349	GT	3	6	46926	46931	0 %	50 %	50 %	0 %	24376285
52	NC_004349	GC	3	6	48788	48793	0 %	0 %	50 %	50 %	24376287
53	NC_004349	GA	3	6	48891	48896	50 %	0 %	50 %	0 %	24376287
54	NC_004349	TA	3	6	49683	49688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004349	TA	3	6	50789	50794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004349	GA	3	6	53104	53109	50 %	0 %	50 %	0 %	118725032
57	NC_004349	GC	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004349	CT	3	6	55812	55817	0 %	50 %	0 %	50 %	24376296
59	NC_004349	CA	3	6	56380	56385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004349	GA	3	6	56725	56730	50 %	0 %	50 %	0 %	24376297
61	NC_004349	AG	3	6	58575	58580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004349	GT	3	6	59046	59051	0 %	50 %	50 %	0 %	24376300
63	NC_004349	CA	3	6	60173	60178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004349	GA	3	6	60657	60662	50 %	0 %	50 %	0 %	24376303
65	NC_004349	AT	3	6	61044	61049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004349	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004349	CA	3	6	61162	61167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_004349	CT	3	6	61761	61766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004349	TG	3	6	61944	61949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004349	TG	3	6	66566	66571	0 %	50 %	50 %	0 %	24376309
71	NC_004349	TC	3	6	66757	66762	0 %	50 %	0 %	50 %	24376309
72	NC_004349	AT	3	6	67030	67035	50 %	50 %	0 %	0 %	24376309
73	NC_004349	AC	3	6	68935	68940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004349	GA	3	6	69589	69594	50 %	0 %	50 %	0 %	118725035
75	NC_004349	AC	3	6	71206	71211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004349	AT	3	6	71755	71760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004349	CT	3	6	74098	74103	0 %	50 %	0 %	50 %	24376315
78	NC_004349	GT	3	6	76049	76054	0 %	50 %	50 %	0 %	24376317
79	NC_004349	TA	3	6	76669	76674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004349	CT	3	6	77569	77574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004349	AC	3	6	78272	78277	50 %	0 %	0 %	50 %	24376319
82	NC_004349	CG	3	6	79075	79080	0 %	0 %	50 %	50 %	24376319
83	NC_004349	CT	3	6	79909	79914	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
84	NC_004349	CT	3	6	80100	80105	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
85	NC_004349	AT	3	6	80295	80300	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
86	NC_004349	AT	3	6	80398	80403	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
87	NC_004349	TC	3	6	82927	82932	0 %	50 %	0 %	50 %	118725036
88	NC_004349	CA	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	118725036
89	NC_004349	AG	3	6	86085	86090	50 %	0 %	50 %	0 %	24376324
90	NC_004349	GT	3	6	87474	87479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004349	AT	3	6	87617	87622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004349	TA	3	6	87809	87814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004349	CT	3	6	87952	87957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004349	TG	3	6	88492	88497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004349	AT	3	6	88644	88649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004349	TA	4	8	88691	88698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004349	AT	3	6	88799	88804	50 %	50 %	0 %	0 %	24376326
98	NC_004349	AT	3	6	89154	89159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004349	GA	3	6	89536	89541	50 %	0 %	50 %	0 %	24376327
100	NC_004349	TA	3	6	90100	90105	50 %	50 %	0 %	0 %	24376328
101	NC_004349	CT	3	6	90108	90113	0 %	50 %	0 %	50 %	24376328
102	NC_004349	AC	3	6	91364	91369	50 %	0 %	0 %	50 %	24376328
103	NC_004349	CT	3	6	91735	91740	0 %	50 %	0 %	50 %	24376328
104	NC_004349	GC	3	6	92480	92485	0 %	0 %	50 %	50 %	24376328
105	NC_004349	AC	3	6	95881	95886	50 %	0 %	0 %	50 %	24376329
106	NC_004349	CT	3	6	96252	96257	0 %	50 %	0 %	50 %	24376329
107	NC_004349	GC	3	6	96997	97002	0 %	0 %	50 %	50 %	24376329
108	NC_004349	TC	3	6	99829	99834	0 %	50 %	0 %	50 %	24376330
109	NC_004349	CG	3	6	100257	100262	0 %	0 %	50 %	50 %	24376330
110	NC_004349	AC	3	6	101804	101809	50 %	0 %	0 %	50 %	24376331
111	NC_004349	CT	3	6	102175	102180	0 %	50 %	0 %	50 %	24376331
112	NC_004349	GC	3	6	102920	102925	0 %	0 %	50 %	50 %	24376331
113	NC_004349	GT	3	6	106651	106656	0 %	50 %	50 %	0 %	24376334
114	NC_004349	CG	3	6	108513	108518	0 %	0 %	50 %	50 %	24376335
115	NC_004349	AT	3	6	109302	109307	50 %	50 %	0 %	0 %	24376337
116	NC_004349	TA	3	6	109333	109338	50 %	50 %	0 %	0 %	24376337
117	NC_004349	CT	3	6	110390	110395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_004349	TG	3	6	110423	110428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004349	TG	3	6	110814	110819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004349	AT	3	6	111294	111299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004349	AT	3	6	111348	111353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004349	GA	3	6	111774	111779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004349	GA	3	6	112200	112205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004349	AC	3	6	113014	113019	50 %	0 %	0 %	50 %	24376339
125	NC_004349	AG	3	6	114078	114083	50 %	0 %	50 %	0 %	24376340
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127	NC_004349	CT	3	6	117430	117435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004349	GC	3	6	117653	117658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004349	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004349	GC	4	8	120002	120009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004349	AT	3	6	120483	120488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004349	TG	3	6	121403	121408	0 %	50 %	50 %	0 %	118725039
133	NC_004349	AG	3	6	121779	121784	50 %	0 %	50 %	0 %	118725039
134	NC_004349	TA	3	6	122024	122029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004349	GT	3	6	124827	124832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004349	CA	3	6	126411	126416	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
137	NC_004349	AC	3	6	126650	126655	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
138	NC_004349	CA	3	6	128042	128047	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
139	NC_004349	AG	3	6	128123	128128	50 %	0 %	50 %	0 %	24376349
140	NC_004349	GT	3	6	128652	128657	0 %	50 %	50 %	0 %	24376349
141	NC_004349	GT	3	6	130981	130986	0 %	50 %	50 %	0 %	24376351
142	NC_004349	TC	3	6	134250	134255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004349	AT	3	6	134976	134981	50 %	50 %	0 %	0 %	118725049
144	NC_004349	AT	3	6	135643	135648	50 %	50 %	0 %	0 %	118725050
145	NC_004349	CT	3	6	136636	136641	0 %	50 %	0 %	50 %	24376357
146	NC_004349	AT	3	6	136825	136830	50 %	50 %	0 %	0 %	24376357
147	NC_004349	AC	3	6	139228	139233	50 %	0 %	0 %	50 %	24376359
148	NC_004349	CT	3	6	140096	140101	0 %	50 %	0 %	50 %	24376360
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.