MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 2871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004349	ATG	2	6	111389	111394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_004349	TCA	2	6	111482	111487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_004349	CTT	2	6	111658	111663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_004349	GA	3	6	111774	111779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_004349	TGT	2	6	111799	111804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_004349	GCC	2	6	111837	111842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_004349	CAT	2	6	111927	111932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_004349	TGT	2	6	111944	111949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_004349	TCA	2	6	111977	111982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_004349	C	6	6	112028	112033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2011	NC_004349	GTT	2	6	112169	112174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_004349	GA	3	6	112200	112205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_004349	TGC	2	6	112216	112221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_004349	CAT	2	6	112295	112300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_004349	TGT	2	6	112330	112335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_004349	TTC	2	6	112376	112381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_004349	CAA	2	6	112545	112550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_004349	GATA	2	8	112555	112562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_004349	AGG	2	6	112618	112623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_004349	CATCA	2	10	112630	112639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2021	NC_004349	ACA	2	6	112666	112671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_004349	CGG	2	6	112677	112682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_004349	ATT	2	6	112769	112774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_004349	T	6	6	112773	112778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_004349	ATT	2	6	112779	112784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_004349	A	7	7	112785	112791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_004349	ATTTT	2	10	112797	112806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_004349	AC	3	6	113014	113019	50 %	0 %	0 %	50 %	24376339
2029	NC_004349	TTAG	2	8	113093	113100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_004349	A	6	6	113112	113117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_004349	ACC	2	6	113226	113231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_004349	CCG	2	6	113303	113308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_004349	CGA	2	6	113314	113319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_004349	GAA	2	6	113347	113352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_004349	A	7	7	113364	113370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_004349	CAT	2	6	113422	113427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_004349	GGA	2	6	113492	113497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376340
2038	NC_004349	TGG	2	6	113571	113576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376340
2039	NC_004349	GTG	2	6	113711	113716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376340
2040	NC_004349	AGC	2	6	113717	113722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376340
2041	NC_004349	TGT	2	6	113724	113729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376340
2042	NC_004349	ATT	2	6	113863	113868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376340
2043	NC_004349	TTA	2	6	113917	113922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376340
2044	NC_004349	CTG	2	6	113945	113950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376340
2045	NC_004349	TTCA	2	8	113963	113970	25 %	50 %	0 %	25 %	24376340
2046	NC_004349	GAGT	2	8	114003	114010	25 %	25 %	50 %	0 %	24376340
2047	NC_004349	AG	3	6	114078	114083	50 %	0 %	50 %	0 %	24376340
2048	NC_004349	TTTC	2	8	114084	114091	0 %	75 %	0 %	25 %	24376340
2049	NC_004349	CTG	2	6	114094	114099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376340
2050	NC_004349	GAC	2	6	114139	114144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376340
2051	NC_004349	GATG	2	8	114150	114157	25 %	25 %	50 %	0 %	24376340
2052	NC_004349	ATG	2	6	114209	114214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376340
2053	NC_004349	GTC	2	6	114263	114268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376340
2054	NC_004349	AGT	2	6	114275	114280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376340
2055	NC_004349	TAT	2	6	114291	114296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_004349	TCA	2	6	114333	114338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_004349	T	6	6	114364	114369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_004349	T	6	6	114373	114378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_004349	A	7	7	114404	114410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_004349	A	8	8	114413	114420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_004349	AAAT	2	8	114526	114533	75 %	25 %	0 %	0 %	24376341
2062	NC_004349	CAA	2	6	114621	114626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376341
2063	NC_004349	TTTGGT	2	12	114651	114662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376341
2064	NC_004349	AAT	2	6	114743	114748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376341
2065	NC_004349	CTT	2	6	114845	114850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376341
2066	NC_004349	T	6	6	114901	114906	0 %	100 %	0 %	0 %	24376341
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2068	NC_004349	T	6	6	115123	115128	0 %	100 %	0 %	0 %	24376341
2069	NC_004349	GCT	2	6	115247	115252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376341
2070	NC_004349	ACTG	2	8	115293	115300	25 %	25 %	25 %	25 %	24376341
2071	NC_004349	CATA	2	8	115322	115329	50 %	25 %	0 %	25 %	24376341
2072	NC_004349	CGGA	2	8	115490	115497	25 %	0 %	50 %	25 %	24376341
2073	NC_004349	TGC	2	6	115558	115563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376341
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2075	NC_004349	GCT	2	6	115956	115961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_004349	GAA	2	6	115997	116002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_004349	TAT	2	6	116063	116068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2080	NC_004349	ATA	2	6	116183	116188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118725038
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2082	NC_004349	GCTATA	2	12	116310	116321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118725038
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2085	NC_004349	TTG	2	6	116389	116394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725038
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2092	NC_004349	AAAT	2	8	116620	116627	75 %	25 %	0 %	0 %	24376343
2093	NC_004349	ATT	2	6	116681	116686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376343
2094	NC_004349	T	6	6	116685	116690	0 %	100 %	0 %	0 %	24376343
2095	NC_004349	A	7	7	116752	116758	100 %	0 %	0 %	0 %	24376343
2096	NC_004349	CAA	2	6	116816	116821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376343
2097	NC_004349	ATCTC	2	10	116831	116840	20 %	40 %	0 %	40 %	24376343
2098	NC_004349	T	6	6	116861	116866	0 %	100 %	0 %	0 %	24376343
2099	NC_004349	A	6	6	116870	116875	100 %	0 %	0 %	0 %	24376343
2100	NC_004349	TTA	2	6	116877	116882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376343
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2102	NC_004349	GCT	2	6	117139	117144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_004349	CTGAT	2	10	117227	117236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2104	NC_004349	TGT	2	6	117326	117331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_004349	GAA	2	6	117423	117428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_004349	CT	3	6	117430	117435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2107	NC_004349	AGC	2	6	117452	117457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_004349	GTT	3	9	117485	117493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_004349	T	7	7	117492	117498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_004349	T	6	6	117560	117565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_004349	CGA	2	6	117575	117580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_004349	AAC	2	6	117581	117586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_004349	GC	3	6	117653	117658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_004349	CAG	2	6	117758	117763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_004349	GCT	2	6	117819	117824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_004349	TCA	2	6	117952	117957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_004349	ATA	2	6	118015	118020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_004349	TCT	2	6	118049	118054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_004349	AACT	2	8	118134	118141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2120	NC_004349	CAG	2	6	118163	118168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_004349	GTG	2	6	118233	118238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_004349	GATCA	2	10	118252	118261	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2123	NC_004349	TGAT	2	8	118291	118298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_004349	TGA	2	6	118319	118324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_004349	T	7	7	118340	118346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_004349	ATCA	2	8	118356	118363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2127	NC_004349	GTC	2	6	118383	118388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_004349	TTC	2	6	118461	118466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_004349	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2131	NC_004349	ATT	2	6	118611	118616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2133	NC_004349	TAT	2	6	118852	118857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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