MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 2871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004349	TGA	2	6	82803	82808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004349	AACA	2	8	82873	82880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_004349	TC	3	6	82927	82932	0 %	50 %	0 %	50 %	118725036
1504	NC_004349	TCA	2	6	82997	83002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725036
1505	NC_004349	GGC	2	6	83033	83038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725036
1506	NC_004349	ATT	2	6	83091	83096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725036
1507	NC_004349	GCT	2	6	83154	83159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1508	NC_004349	TGG	2	6	83186	83191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725036
1509	NC_004349	TAC	2	6	83294	83299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725036
1510	NC_004349	CA	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	118725036
1511	NC_004349	TGAA	2	8	83330	83337	50 %	25 %	25 %	0 %	118725036
1512	NC_004349	AGC	2	6	83420	83425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1513	NC_004349	GTC	2	6	83525	83530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1514	NC_004349	ACA	2	6	83638	83643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725036
1515	NC_004349	AGA	2	6	83775	83780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725036
1516	NC_004349	GCG	2	6	83845	83850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725036
1517	NC_004349	ATT	2	6	83877	83882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725036
1518	NC_004349	TGG	2	6	83899	83904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725036
1519	NC_004349	CAA	2	6	83981	83986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725036
1520	NC_004349	CTG	2	6	84004	84009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1521	NC_004349	CAG	2	6	84035	84040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1522	NC_004349	TGC	2	6	84054	84059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1523	NC_004349	GAA	2	6	84060	84065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725036
1524	NC_004349	GTT	2	6	84092	84097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725036
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1526	NC_004349	CATT	2	8	84571	84578	25 %	50 %	0 %	25 %	24376323
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1528	NC_004349	TAT	2	6	84719	84724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376323
1529	NC_004349	TGAT	2	8	84750	84757	25 %	50 %	25 %	0 %	24376323
1530	NC_004349	TGA	2	6	84778	84783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376323
1531	NC_004349	T	6	6	84799	84804	0 %	100 %	0 %	0 %	24376323
1532	NC_004349	ATCA	2	8	84815	84822	50 %	25 %	0 %	25 %	24376323
1533	NC_004349	GGT	2	6	84841	84846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376323
1534	NC_004349	TGC	2	6	84868	84873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376323
1535	NC_004349	AAT	2	6	84956	84961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376323
1536	NC_004349	CTGG	2	8	85042	85049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_004349	ATG	2	6	85099	85104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_004349	T	8	8	85364	85371	0 %	100 %	0 %	0 %	24376324
1539	NC_004349	TTCT	2	8	85373	85380	0 %	75 %	0 %	25 %	24376324
1540	NC_004349	GTT	2	6	85411	85416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376324
1541	NC_004349	TTCG	2	8	85475	85482	0 %	50 %	25 %	25 %	24376324
1542	NC_004349	CTTG	2	8	85503	85510	0 %	50 %	25 %	25 %	24376324
1543	NC_004349	TGA	2	6	85547	85552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376324
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1547	NC_004349	TTA	2	6	85676	85681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376324
1548	NC_004349	CAGA	2	8	85788	85795	50 %	0 %	25 %	25 %	24376324
1549	NC_004349	GAA	2	6	85813	85818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376324
1550	NC_004349	T	6	6	85933	85938	0 %	100 %	0 %	0 %	24376324
1551	NC_004349	GTG	2	6	85939	85944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376324
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1559	NC_004349	CTG	2	6	86408	86413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376324
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1564	NC_004349	GAT	3	9	86688	86696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376324
1565	NC_004349	GCAAG	2	10	86708	86717	40 %	0 %	40 %	20 %	24376324
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1568	NC_004349	ATGGCA	2	12	86890	86901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24376324
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1573	NC_004349	TCTAT	2	10	87265	87274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1574	NC_004349	TTAT	2	8	87363	87370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_004349	TGA	2	6	87423	87428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_004349	A	6	6	87761	87766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_004349	CAT	2	6	87959	87964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_004349	TAT	2	6	88385	88390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004349	TTA	2	6	88391	88396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004349	TGG	2	6	88409	88414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_004349	TG	3	6	88492	88497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_004349	GATG	2	8	88527	88534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_004349	T	6	6	88553	88558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_004349	ATG	2	6	88571	88576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_004349	ATG	2	6	88590	88595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_004349	TAG	2	6	88610	88615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_004349	AT	3	6	88644	88649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004349	TA	4	8	88691	88698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004349	AAT	2	6	88699	88704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_004349	AT	3	6	88799	88804	50 %	50 %	0 %	0 %	24376326
1616	NC_004349	ATGCA	2	10	88819	88828	40 %	20 %	20 %	20 %	24376326
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1621	NC_004349	TTG	2	6	89027	89032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376326
1622	NC_004349	A	7	7	89079	89085	100 %	0 %	0 %	0 %	24376326
1623	NC_004349	ACTA	2	8	89140	89147	50 %	25 %	0 %	25 %	24376326
1624	NC_004349	AT	3	6	89154	89159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_004349	A	9	9	89301	89309	100 %	0 %	0 %	0 %	24376327
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1631	NC_004349	TTA	2	6	89426	89431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376327
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