MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 2871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004349	GAA	2	6	53319	53324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725032
1002	NC_004349	AAGG	2	8	53332	53339	50 %	0 %	50 %	0 %	118725032
1003	NC_004349	TCGT	2	8	53360	53367	0 %	50 %	25 %	25 %	118725032
1004	NC_004349	GAC	2	6	53421	53426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725032
1005	NC_004349	GTGAC	2	10	53510	53519	20 %	20 %	40 %	20 %	118725032
1006	NC_004349	TAA	2	6	53639	53644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118725032
1007	NC_004349	GCT	2	6	53730	53735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725032
1008	NC_004349	GTT	2	6	53794	53799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725032
1009	NC_004349	CAAC	2	8	53848	53855	50 %	0 %	0 %	50 %	118725032
1010	NC_004349	TAA	2	6	53925	53930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118725032
1011	NC_004349	GC	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_004349	CGA	2	6	54169	54174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_004349	CTG	2	6	54309	54314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_004349	TGT	2	6	54507	54512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376294
1015	NC_004349	AATG	2	8	54514	54521	50 %	25 %	25 %	0 %	24376294
1016	NC_004349	A	6	6	54618	54623	100 %	0 %	0 %	0 %	24376294
1017	NC_004349	ATTC	2	8	54632	54639	25 %	50 %	0 %	25 %	24376294
1018	NC_004349	GCGA	2	8	54761	54768	25 %	0 %	50 %	25 %	24376294
1019	NC_004349	TGAT	2	8	54817	54824	25 %	50 %	25 %	0 %	24376294
1020	NC_004349	GCA	2	6	54842	54847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376294
1021	NC_004349	GGC	2	6	55002	55007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376294
1022	NC_004349	AGC	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376294
1023	NC_004349	AAC	2	6	55106	55111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376294
1024	NC_004349	TAT	2	6	55176	55181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376294
1025	NC_004349	TTA	2	6	55256	55261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376294
1026	NC_004349	T	6	6	55362	55367	0 %	100 %	0 %	0 %	24376294
1027	NC_004349	AGT	2	6	55426	55431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004349	AAG	2	6	55500	55505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_004349	AAT	2	6	55514	55519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004349	TCG	2	6	55565	55570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376295
1031	NC_004349	GCT	2	6	55582	55587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376295
1032	NC_004349	GCG	2	6	55602	55607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376295
1033	NC_004349	GCA	2	6	55654	55659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376295
1034	NC_004349	ATG	2	6	55752	55757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376295
1035	NC_004349	CTT	2	6	55769	55774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376295
1036	NC_004349	CT	3	6	55812	55817	0 %	50 %	0 %	50 %	24376296
1037	NC_004349	TTAGTT	2	12	55837	55848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	24376296
1038	NC_004349	TTC	2	6	55856	55861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376296
1039	NC_004349	CCA	2	6	55998	56003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376296
1040	NC_004349	ATA	2	6	56013	56018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376296
1041	NC_004349	TCA	2	6	56070	56075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376296
1042	NC_004349	CAA	2	6	56116	56121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376296
1043	NC_004349	ACC	2	6	56157	56162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_004349	TTG	2	6	56222	56227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004349	ACT	2	6	56304	56309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_004349	TAAT	2	8	56322	56329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004349	TCA	2	6	56376	56381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_004349	CA	3	6	56380	56385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_004349	TAT	2	6	56473	56478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004349	CAG	2	6	56542	56547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004349	TGC	2	6	56575	56580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376297
1052	NC_004349	GCG	2	6	56608	56613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376297
1053	NC_004349	GA	3	6	56725	56730	50 %	0 %	50 %	0 %	24376297
1054	NC_004349	ATC	2	6	56751	56756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376297
1055	NC_004349	CAG	2	6	56784	56789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376297
1056	NC_004349	GCC	2	6	56835	56840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376297
1057	NC_004349	GGT	2	6	56841	56846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376297
1058	NC_004349	CTG	2	6	56936	56941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376297
1059	NC_004349	CTCTAC	2	12	56991	57002	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	24376297
1060	NC_004349	GTTG	2	8	57102	57109	0 %	50 %	50 %	0 %	24376297
1061	NC_004349	CCA	2	6	57179	57184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376297
1062	NC_004349	T	6	6	57202	57207	0 %	100 %	0 %	0 %	24376297
1063	NC_004349	CAG	2	6	57249	57254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376297
1064	NC_004349	AAT	2	6	57256	57261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376297
1065	NC_004349	TAA	2	6	57276	57281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004349	ATT	2	6	57393	57398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004349	A	6	6	57441	57446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_004349	ATG	2	6	57496	57501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004349	A	7	7	57548	57554	100 %	0 %	0 %	0 %	118725033
1070	NC_004349	CTGA	2	8	57579	57586	25 %	25 %	25 %	25 %	118725033
1071	NC_004349	CTT	2	6	57612	57617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725033
1072	NC_004349	TCA	2	6	57769	57774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725033
1073	NC_004349	TTC	2	6	57780	57785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725033
1074	NC_004349	ACA	2	6	57806	57811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725033
1075	NC_004349	TCAA	2	8	57814	57821	50 %	25 %	0 %	25 %	118725033
1076	NC_004349	TTTG	2	8	57825	57832	0 %	75 %	25 %	0 %	118725033
1077	NC_004349	ATC	2	6	57840	57845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725033
1078	NC_004349	TAATGC	2	12	57861	57872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118725033
1079	NC_004349	GTC	2	6	57882	57887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725033
1080	NC_004349	GTAG	2	8	57952	57959	25 %	25 %	50 %	0 %	118725033
1081	NC_004349	TCAG	2	8	57993	58000	25 %	25 %	25 %	25 %	24376299
1082	NC_004349	CCA	2	6	58106	58111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376299
1083	NC_004349	ATC	2	6	58160	58165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376299
1084	NC_004349	CAT	2	6	58246	58251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376299
1085	NC_004349	AGT	2	6	58316	58321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004349	GTT	2	6	58368	58373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004349	AAC	2	6	58424	58429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_004349	CTG	2	6	58495	58500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_004349	AG	3	6	58575	58580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004349	AAAT	2	8	58689	58696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_004349	TTC	2	6	58730	58735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376300
1092	NC_004349	TTG	2	6	58814	58819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376300
1093	NC_004349	TTC	2	6	58841	58846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376300
1094	NC_004349	GCG	2	6	58920	58925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376300
1095	NC_004349	GT	3	6	59046	59051	0 %	50 %	50 %	0 %	24376300
1096	NC_004349	AAAT	2	8	59083	59090	75 %	25 %	0 %	0 %	24376300
1097	NC_004349	TCC	2	6	59097	59102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24376300
1098	NC_004349	ATTT	3	12	59583	59594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004349	T	6	6	59619	59624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004349	TAT	2	6	59676	59681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004349	T	6	6	59707	59712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004349	GTT	2	6	59736	59741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004349	CTT	2	6	59767	59772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_004349	CAA	2	6	59778	59783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_004349	T	6	6	59785	59790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004349	ATC	2	6	59824	59829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_004349	T	7	7	59853	59859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004349	TCA	2	6	59884	59889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376302
1109	NC_004349	CATTC	2	10	59932	59941	20 %	40 %	0 %	40 %	24376302
1110	NC_004349	GCA	2	6	59958	59963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376302
1111	NC_004349	AGT	2	6	60033	60038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376302
1112	NC_004349	AGTT	2	8	60067	60074	25 %	50 %	25 %	0 %	24376302
1113	NC_004349	TAA	2	6	60085	60090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376302
1114	NC_004349	CA	3	6	60173	60178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_004349	CATC	2	8	60199	60206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_004349	CCG	2	6	60241	60246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_004349	AATT	2	8	60252	60259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004349	ATTA	2	8	60274	60281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004349	TGG	2	6	60303	60308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004349	CTT	2	6	60342	60347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376303
1121	NC_004349	CTT	2	6	60373	60378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376303
1122	NC_004349	TTG	2	6	60443	60448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376303
1123	NC_004349	T	6	6	60468	60473	0 %	100 %	0 %	0 %	24376303
1124	NC_004349	TCCC	2	8	60510	60517	0 %	25 %	0 %	75 %	24376303
1125	NC_004349	CTTT	2	8	60525	60532	0 %	75 %	0 %	25 %	24376303
1126	NC_004349	CGG	3	9	60548	60556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376303
1127	NC_004349	AGC	2	6	60583	60588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376303
1128	NC_004349	CAT	3	9	60598	60606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376303
1129	NC_004349	ATC	2	6	60623	60628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376303
1130	NC_004349	GA	3	6	60657	60662	50 %	0 %	50 %	0 %	24376303
1131	NC_004349	GCA	2	6	60717	60722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376303
1132	NC_004349	ATG	2	6	60782	60787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376303
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1138	NC_004349	CAT	2	6	61133	61138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_004349	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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