MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 2871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004349	G	6	6	27759	27764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004349	GAT	2	6	27768	27773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725025
503	NC_004349	ATA	2	6	27830	27835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118725025
504	NC_004349	AGCA	2	8	27905	27912	50 %	0 %	25 %	25 %	118725025
505	NC_004349	GCG	2	6	28065	28070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_004349	CGC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_004349	CGG	2	6	28131	28136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_004349	GCT	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004349	TGA	2	6	28197	28202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004349	TCGG	2	8	28218	28225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_004349	TCGCT	2	10	28231	28240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_004349	GCAA	2	8	28267	28274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_004349	TTA	2	6	28404	28409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725026
514	NC_004349	TTG	2	6	28477	28482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725026
515	NC_004349	CAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725026
516	NC_004349	AGC	2	6	28599	28604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725026
517	NC_004349	TTA	2	6	28690	28695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725026
518	NC_004349	CAC	2	6	28772	28777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725026
519	NC_004349	GTCAC	2	10	28815	28824	20 %	20 %	20 %	40 %	118725026
520	NC_004349	GTC	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725026
521	NC_004349	ACGA	2	8	28967	28974	50 %	0 %	25 %	25 %	118725026
522	NC_004349	CCTT	2	8	28995	29002	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
523	NC_004349	TTC	2	6	29010	29015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725026
524	NC_004349	TGA	2	6	29200	29205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725026
525	NC_004349	TC	3	6	29225	29230	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
526	NC_004349	AAG	2	6	29234	29239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725026
527	NC_004349	T	6	6	29249	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	118725026
528	NC_004349	TTTC	2	8	29259	29266	0 %	75 %	0 %	25 %	118725026
529	NC_004349	TCA	2	6	29309	29314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725026
530	NC_004349	TTG	2	6	29341	29346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725026
531	NC_004349	TTCC	2	8	29362	29369	0 %	50 %	0 %	50 %	118725026
532	NC_004349	T	6	6	29491	29496	0 %	100 %	0 %	0 %	118725026
533	NC_004349	TGAT	2	8	29644	29651	25 %	50 %	25 %	0 %	118725027
534	NC_004349	GAA	2	6	29721	29726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725027
535	NC_004349	ACC	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118725027
536	NC_004349	ACA	2	6	29845	29850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725027
537	NC_004349	AAGC	2	8	29894	29901	50 %	0 %	25 %	25 %	118725027
538	NC_004349	GCG	2	6	29931	29936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725027
539	NC_004349	CAAA	2	8	29944	29951	75 %	0 %	0 %	25 %	118725027
540	NC_004349	GTC	2	6	29960	29965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725027
541	NC_004349	CTT	2	6	29977	29982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725027
542	NC_004349	GCAA	2	8	30084	30091	50 %	0 %	25 %	25 %	118725027
543	NC_004349	A	6	6	30090	30095	100 %	0 %	0 %	0 %	118725027
544	NC_004349	TTA	2	6	30101	30106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725027
545	NC_004349	GAT	2	6	30150	30155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725027
546	NC_004349	GACG	2	8	30254	30261	25 %	0 %	50 %	25 %	118725027
547	NC_004349	GAA	2	6	30315	30320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725027
548	NC_004349	TGA	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725027
549	NC_004349	A	6	6	30557	30562	100 %	0 %	0 %	0 %	118725027
550	NC_004349	G	6	6	30679	30684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004349	T	6	6	30699	30704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004349	T	6	6	30712	30717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004349	TTC	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004349	A	6	6	30737	30742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004349	AGG	2	6	30820	30825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004349	A	7	7	30852	30858	100 %	0 %	0 %	0 %	24376268
557	NC_004349	GCT	2	6	30916	30921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376268
558	NC_004349	AG	3	6	30964	30969	50 %	0 %	50 %	0 %	24376268
559	NC_004349	TAA	2	6	30978	30983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376268
560	NC_004349	AAG	3	9	31004	31012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376268
561	NC_004349	GACG	2	8	31056	31063	25 %	0 %	50 %	25 %	24376268
562	NC_004349	TTGA	2	8	31101	31108	25 %	50 %	25 %	0 %	24376269
563	NC_004349	TAA	2	6	31136	31141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376269
564	NC_004349	TG	3	6	31152	31157	0 %	50 %	50 %	0 %	24376269
565	NC_004349	TGA	2	6	31169	31174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376269
566	NC_004349	TTA	2	6	31198	31203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376269
567	NC_004349	A	7	7	31322	31328	100 %	0 %	0 %	0 %	24376269
568	NC_004349	GTT	2	6	31371	31376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376269
569	NC_004349	A	6	6	31425	31430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004349	GTG	2	6	31431	31436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004349	T	6	6	31487	31492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004349	TTTA	2	8	31550	31557	25 %	75 %	0 %	0 %	24376270
573	NC_004349	TAC	2	6	31589	31594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376270
574	NC_004349	TTTCG	2	10	31610	31619	0 %	60 %	20 %	20 %	24376270
575	NC_004349	A	6	6	31708	31713	100 %	0 %	0 %	0 %	24376270
576	NC_004349	CAAT	2	8	31798	31805	50 %	25 %	0 %	25 %	24376270
577	NC_004349	TCT	2	6	31809	31814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376270
578	NC_004349	GAT	2	6	31857	31862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376270
579	NC_004349	A	6	6	31887	31892	100 %	0 %	0 %	0 %	24376270
580	NC_004349	GGT	2	6	31910	31915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376270
581	NC_004349	TGAA	2	8	31924	31931	50 %	25 %	25 %	0 %	24376270
582	NC_004349	GTG	2	6	31987	31992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376270
583	NC_004349	ACCA	2	8	32100	32107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_004349	ATT	2	6	32112	32117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376271
585	NC_004349	GCC	2	6	32134	32139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376271
586	NC_004349	T	8	8	32171	32178	0 %	100 %	0 %	0 %	24376271
587	NC_004349	GCC	2	6	32220	32225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376271
588	NC_004349	A	6	6	32247	32252	100 %	0 %	0 %	0 %	24376271
589	NC_004349	A	6	6	32258	32263	100 %	0 %	0 %	0 %	24376271
590	NC_004349	CAGAC	2	10	32318	32327	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
591	NC_004349	GTT	2	6	32352	32357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004349	T	6	6	32396	32401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004349	T	6	6	32421	32426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004349	ACA	2	6	32513	32518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376272
595	NC_004349	GATA	2	8	32525	32532	50 %	25 %	25 %	0 %	24376272
596	NC_004349	CAC	2	6	32542	32547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376272
597	NC_004349	T	7	7	32585	32591	0 %	100 %	0 %	0 %	24376272
598	NC_004349	TTA	2	6	32621	32626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376272
599	NC_004349	CGTT	2	8	32627	32634	0 %	50 %	25 %	25 %	24376272
600	NC_004349	TGA	2	6	32693	32698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376272
601	NC_004349	CGTTA	2	10	32731	32740	20 %	40 %	20 %	20 %	24376272
602	NC_004349	GTG	2	6	32745	32750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376272
603	NC_004349	CCCT	2	8	32763	32770	0 %	25 %	0 %	75 %	24376272
604	NC_004349	T	6	6	32796	32801	0 %	100 %	0 %	0 %	24376272
605	NC_004349	ACA	2	6	32912	32917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376272
606	NC_004349	ATGC	2	8	32940	32947	25 %	25 %	25 %	25 %	24376272
607	NC_004349	TTG	2	6	32970	32975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376272
608	NC_004349	GTT	2	6	32978	32983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376272
609	NC_004349	ATG	2	6	32991	32996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376272
610	NC_004349	TTAT	2	8	33083	33090	25 %	75 %	0 %	0 %	24376272
611	NC_004349	GAA	2	6	33096	33101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376272
612	NC_004349	T	6	6	33340	33345	0 %	100 %	0 %	0 %	24376272
613	NC_004349	ATCA	2	8	33349	33356	50 %	25 %	0 %	25 %	24376272
614	NC_004349	GGC	2	6	33397	33402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376272
615	NC_004349	ATG	2	6	33427	33432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376272
616	NC_004349	TTA	2	6	33510	33515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376272
617	NC_004349	TGCCT	2	10	33521	33530	0 %	40 %	20 %	40 %	24376272
618	NC_004349	AAC	2	6	33533	33538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376272
619	NC_004349	AC	4	8	33547	33554	50 %	0 %	0 %	50 %	24376272
620	NC_004349	GGC	2	6	33578	33583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376272
621	NC_004349	TTA	2	6	33753	33758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725028
622	NC_004349	GCC	2	6	33759	33764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118725028
623	NC_004349	ACACGC	2	12	33779	33790	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118725028
624	NC_004349	AC	3	6	33871	33876	50 %	0 %	0 %	50 %	118725028
625	NC_004349	C	6	6	33897	33902	0 %	0 %	0 %	100 %	118725028
626	NC_004349	TGTT	2	8	33912	33919	0 %	75 %	25 %	0 %	118725028
627	NC_004349	AACA	2	8	33921	33928	75 %	0 %	0 %	25 %	118725028
628	NC_004349	GAT	2	6	33937	33942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725028
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630	NC_004349	CAAAA	2	10	34187	34196	80 %	0 %	0 %	20 %	118725028
631	NC_004349	TGA	2	6	34255	34260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725028
632	NC_004349	CGG	2	6	34273	34278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725028
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634	NC_004349	TGG	2	6	34632	34637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725028
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