MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004347	CAC	2	6	164532	164537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371757
3002	NC_004347	GAA	2	6	164544	164549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371757
3003	NC_004347	AAT	2	6	164590	164595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371757
3004	NC_004347	CA	3	6	164682	164687	50 %	0 %	0 %	50 %	24371757
3005	NC_004347	ATC	2	6	164692	164697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371757
3006	NC_004347	CA	3	6	164698	164703	50 %	0 %	0 %	50 %	24371757
3007	NC_004347	ACG	2	6	164713	164718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371757
3008	NC_004347	ATG	2	6	164734	164739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371757
3009	NC_004347	TTGG	2	8	164842	164849	0 %	50 %	50 %	0 %	24371757
3010	NC_004347	GCT	3	9	164919	164927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371757
3011	NC_004347	TGC	2	6	164966	164971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371757
3012	NC_004347	ATA	2	6	165010	165015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371757
3013	NC_004347	AAG	2	6	165016	165021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371757
3014	NC_004347	CCG	2	6	165047	165052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371757
3015	NC_004347	GCTG	2	8	165069	165076	0 %	25 %	50 %	25 %	24371757
3016	NC_004347	CAT	2	6	165177	165182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371757
3017	NC_004347	AAT	2	6	165201	165206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371757
3018	NC_004347	TAA	2	6	165240	165245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371757
3019	NC_004347	GCT	2	6	165313	165318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_004347	T	6	6	165354	165359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_004347	TA	3	6	165453	165458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_004347	TGA	2	6	165529	165534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004347	TTG	2	6	165550	165555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004347	ATT	2	6	165565	165570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004347	GATT	2	8	165652	165659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_004347	CAAAG	2	10	165682	165691	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_004347	GCATT	2	10	165697	165706	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_004347	GAC	2	6	165865	165870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371759
3029	NC_004347	ATT	2	6	165874	165879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371759
3030	NC_004347	TATT	2	8	165962	165969	25 %	75 %	0 %	0 %	24371759
3031	NC_004347	TTAT	2	8	165993	166000	25 %	75 %	0 %	0 %	24371759
3032	NC_004347	AGC	2	6	166008	166013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371759
3033	NC_004347	ATTT	2	8	166102	166109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004347	T	6	6	166111	166116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_004347	T	6	6	166118	166123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_004347	GTG	2	6	166180	166185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_004347	TAT	2	6	166223	166228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004347	TGC	2	6	166284	166289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371760
3039	NC_004347	A	6	6	166328	166333	100 %	0 %	0 %	0 %	24371760
3040	NC_004347	CAAT	2	8	166431	166438	50 %	25 %	0 %	25 %	24371760
3041	NC_004347	TGA	2	6	166461	166466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371760
3042	NC_004347	TGG	2	6	166470	166475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371760
3043	NC_004347	AGTCA	2	10	166504	166513	40 %	20 %	20 %	20 %	24371760
3044	NC_004347	CAAT	2	8	166557	166564	50 %	25 %	0 %	25 %	24371760
3045	NC_004347	AAT	2	6	166618	166623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
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3047	NC_004347	ATTGG	2	10	166702	166711	20 %	40 %	40 %	0 %	24371760
3048	NC_004347	ATAA	2	8	166720	166727	75 %	25 %	0 %	0 %	24371760
3049	NC_004347	TAA	2	6	166757	166762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
3050	NC_004347	AAT	2	6	166795	166800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
3051	NC_004347	ATT	2	6	166810	166815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371760
3052	NC_004347	AAT	2	6	166870	166875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
3053	NC_004347	CGCCA	2	10	166929	166938	20 %	0 %	20 %	60 %	24371760
3054	NC_004347	AC	3	6	166979	166984	50 %	0 %	0 %	50 %	24371760
3055	NC_004347	AAC	2	6	166985	166990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371760
3056	NC_004347	T	6	6	167084	167089	0 %	100 %	0 %	0 %	24371760
3057	NC_004347	TAA	2	6	167115	167120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
3058	NC_004347	TAAT	2	8	167136	167143	50 %	50 %	0 %	0 %	24371760
3059	NC_004347	GCTGAA	2	12	167147	167158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24371760
3060	NC_004347	A	6	6	167161	167166	100 %	0 %	0 %	0 %	24371760
3061	NC_004347	TGT	2	6	167169	167174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371760
3062	NC_004347	TGC	3	9	167197	167205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371760
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3064	NC_004347	AGC	2	6	167314	167319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371760
3065	NC_004347	A	6	6	167355	167360	100 %	0 %	0 %	0 %	24371760
3066	NC_004347	AGC	2	6	167447	167452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371760
3067	NC_004347	TAA	2	6	167493	167498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
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3069	NC_004347	GCC	2	6	167608	167613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371760
3070	NC_004347	ACC	2	6	167685	167690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371760
3071	NC_004347	ATA	2	6	167727	167732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371760
3072	NC_004347	CGG	2	6	167733	167738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371760
3073	NC_004347	ATT	2	6	167842	167847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_004347	TTA	2	6	167856	167861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_004347	TTAAT	2	10	167875	167884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_004347	TAA	2	6	167916	167921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_004347	ATT	2	6	167928	167933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_004347	AAC	2	6	167960	167965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_004347	T	6	6	168031	168036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_004347	CGC	2	6	168289	168294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371762
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3082	NC_004347	CCAG	2	8	168368	168375	25 %	0 %	25 %	50 %	24371762
3083	NC_004347	TCA	2	6	168418	168423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371762
3084	NC_004347	CTG	2	6	168442	168447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371762
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3087	NC_004347	AC	3	6	168598	168603	50 %	0 %	0 %	50 %	24371762
3088	NC_004347	TCT	2	6	168657	168662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371762
3089	NC_004347	GCT	2	6	168716	168721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371762
3090	NC_004347	CGC	2	6	168865	168870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371762
3091	NC_004347	GGT	2	6	168929	168934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371762
3092	NC_004347	GAA	2	6	168956	168961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371762
3093	NC_004347	GTG	2	6	168966	168971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371762
3094	NC_004347	AAC	2	6	169092	169097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371762
3095	NC_004347	CCG	2	6	169126	169131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371762
3096	NC_004347	TGA	2	6	169183	169188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371762
3097	NC_004347	GTTT	2	8	169201	169208	0 %	75 %	25 %	0 %	24371762
3098	NC_004347	TTC	2	6	169220	169225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371762
3099	NC_004347	GAT	2	6	169229	169234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371762
3100	NC_004347	GTC	2	6	169275	169280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371762
3101	NC_004347	CTGG	2	8	169288	169295	0 %	25 %	50 %	25 %	24371762
3102	NC_004347	CGC	2	6	169537	169542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371762
3103	NC_004347	ATCC	2	8	169600	169607	25 %	25 %	0 %	50 %	24371762
3104	NC_004347	T	7	7	169648	169654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_004347	ATCG	2	8	169655	169662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_004347	TTTA	2	8	169678	169685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_004347	TATCC	2	10	169724	169733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3108	NC_004347	A	7	7	169769	169775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_004347	TTAC	2	8	169810	169817	25 %	50 %	0 %	25 %	24371763
3110	NC_004347	TTGCA	2	10	169885	169894	20 %	40 %	20 %	20 %	24371763
3111	NC_004347	TCT	2	6	169923	169928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371763
3112	NC_004347	CTT	3	9	170038	170046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371763
3113	NC_004347	AAT	2	6	170088	170093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371763
3114	NC_004347	TCC	2	6	170094	170099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371763
3115	NC_004347	TCT	2	6	170151	170156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371763
3116	NC_004347	CAG	2	6	170185	170190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371763
3117	NC_004347	AGT	2	6	170248	170253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371763
3118	NC_004347	GGC	2	6	170264	170269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371763
3119	NC_004347	TAA	2	6	170332	170337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371763
3120	NC_004347	CAT	2	6	170374	170379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371763
3121	NC_004347	GCT	2	6	170416	170421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371763
3122	NC_004347	TTG	2	6	170427	170432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371763
3123	NC_004347	TAA	2	6	170513	170518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371763
3124	NC_004347	GCC	2	6	170526	170531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371763
3125	NC_004347	GCA	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371763
3126	NC_004347	GGA	2	6	170562	170567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371763
3127	NC_004347	CAC	2	6	170620	170625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371763
3128	NC_004347	TCG	2	6	170727	170732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371764
3129	NC_004347	T	6	6	170736	170741	0 %	100 %	0 %	0 %	24371764
3130	NC_004347	ATT	2	6	170766	170771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371764
3131	NC_004347	GGC	2	6	170823	170828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371764
3132	NC_004347	T	7	7	170883	170889	0 %	100 %	0 %	0 %	24371764
3133	NC_004347	CCG	2	6	170992	170997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371764
3134	NC_004347	GTC	2	6	171078	171083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371764
3135	NC_004347	TAA	2	6	171140	171145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_004347	GTG	2	6	171179	171184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_004347	GTT	2	6	171259	171264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_004347	TTA	2	6	171356	171361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371765
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3140	NC_004347	TCT	2	6	171488	171493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371765
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3143	NC_004347	CCG	2	6	171693	171698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371765
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3149	NC_004347	GCTG	2	8	171970	171977	0 %	25 %	50 %	25 %	24371765
3150	NC_004347	AAGC	2	8	172103	172110	50 %	0 %	25 %	25 %	24371765
3151	NC_004347	TGA	2	6	172164	172169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371765
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3153	NC_004347	GAAA	2	8	172289	172296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_004347	AAT	2	6	172297	172302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371766
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3157	NC_004347	TTTG	2	8	172373	172380	0 %	75 %	25 %	0 %	24371766
3158	NC_004347	TTG	2	6	172437	172442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371766
3159	NC_004347	CAA	2	6	172476	172481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371766
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3161	NC_004347	TGC	2	6	172554	172559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371766
3162	NC_004347	TCG	2	6	172578	172583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371766
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3164	NC_004347	CAATGA	2	12	172651	172662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24371766
3165	NC_004347	TGA	2	6	172675	172680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371766
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3200	NC_004347	AAAACA	2	12	174387	174398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	24371766
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3231	NC_004347	GCA	2	6	176262	176267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371768
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3241	NC_004347	GAGT	2	8	176774	176781	25 %	25 %	50 %	0 %	24371768
3242	NC_004347	CG	3	6	176796	176801	0 %	0 %	50 %	50 %	24371768
3243	NC_004347	GCGT	2	8	176891	176898	0 %	25 %	50 %	25 %	24371768
3244	NC_004347	GCG	2	6	176899	176904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371768
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3247	NC_004347	GGAA	2	8	176931	176938	50 %	0 %	50 %	0 %	24371768
3248	NC_004347	GAT	2	6	176982	176987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371768
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3370	NC_004347	GGAT	2	8	182827	182834	25 %	25 %	50 %	0 %	24371776
3371	NC_004347	GC	3	6	183058	183063	0 %	0 %	50 %	50 %	24371777
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