MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004347	GCG	2	6	111394	111399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371701
2002	NC_004347	TGCCA	2	10	111402	111411	20 %	20 %	20 %	40 %	24371701
2003	NC_004347	ATGA	2	8	111427	111434	50 %	25 %	25 %	0 %	24371701
2004	NC_004347	GGC	2	6	111441	111446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371701
2005	NC_004347	AC	3	6	111564	111569	50 %	0 %	0 %	50 %	24371701
2006	NC_004347	GTGG	2	8	111786	111793	0 %	25 %	75 %	0 %	24371702
2007	NC_004347	GTT	2	6	111812	111817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371702
2008	NC_004347	GAATG	2	10	111867	111876	40 %	20 %	40 %	0 %	24371702
2009	NC_004347	GTTC	2	8	111895	111902	0 %	50 %	25 %	25 %	24371702
2010	NC_004347	TGA	2	6	111952	111957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371702
2011	NC_004347	ACTC	2	8	112002	112009	25 %	25 %	0 %	50 %	24371702
2012	NC_004347	GCTT	2	8	112035	112042	0 %	50 %	25 %	25 %	24371702
2013	NC_004347	TGCC	2	8	112139	112146	0 %	25 %	25 %	50 %	24371702
2014	NC_004347	ACA	2	6	112177	112182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371702
2015	NC_004347	CG	3	6	112279	112284	0 %	0 %	50 %	50 %	24371702
2016	NC_004347	GTGG	2	8	112371	112378	0 %	25 %	75 %	0 %	24371702
2017	NC_004347	TGA	2	6	112390	112395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371702
2018	NC_004347	ATG	2	6	112402	112407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371702
2019	NC_004347	TGTC	2	8	112456	112463	0 %	50 %	25 %	25 %	24371702
2020	NC_004347	CTT	2	6	112506	112511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371702
2021	NC_004347	GCT	2	6	112518	112523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371702
2022	NC_004347	GTCG	2	8	112548	112555	0 %	25 %	50 %	25 %	24371702
2023	NC_004347	AAG	2	6	112612	112617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371702
2024	NC_004347	AGG	2	6	112618	112623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371702
2025	NC_004347	AGCA	2	8	112634	112641	50 %	0 %	25 %	25 %	24371702
2026	NC_004347	CAAG	2	8	112645	112652	50 %	0 %	25 %	25 %	24371703
2027	NC_004347	CTT	2	6	112741	112746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371703
2028	NC_004347	CCT	2	6	112752	112757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371703
2029	NC_004347	TGATGT	2	12	112842	112853	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24371703
2030	NC_004347	TTA	2	6	112861	112866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371703
2031	NC_004347	CCA	2	6	112867	112872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371703
2032	NC_004347	CAA	2	6	112873	112878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371703
2033	NC_004347	GATGT	2	10	112919	112928	20 %	40 %	40 %	0 %	24371703
2034	NC_004347	A	6	6	112941	112946	100 %	0 %	0 %	0 %	24371703
2035	NC_004347	TCA	2	6	113034	113039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371703
2036	NC_004347	TGG	2	6	113079	113084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371703
2037	NC_004347	TGC	2	6	113097	113102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371703
2038	NC_004347	GTG	2	6	113212	113217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371703
2039	NC_004347	CAT	2	6	113225	113230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371703
2040	NC_004347	CGC	2	6	113315	113320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371704
2041	NC_004347	CGC	2	6	113405	113410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371704
2042	NC_004347	ACT	2	6	113417	113422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371704
2043	NC_004347	GCC	2	6	113432	113437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371704
2044	NC_004347	GGC	2	6	113463	113468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371704
2045	NC_004347	GCT	2	6	113487	113492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2046	NC_004347	CTG	2	6	113563	113568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2047	NC_004347	CAA	2	6	113569	113574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371704
2048	NC_004347	CTG	2	6	113587	113592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2049	NC_004347	GGTG	2	8	113598	113605	0 %	25 %	75 %	0 %	24371704
2050	NC_004347	TGC	2	6	113621	113626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2051	NC_004347	GCA	2	6	113637	113642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2052	NC_004347	AAC	2	6	113651	113656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371704
2053	NC_004347	GC	3	6	113707	113712	0 %	0 %	50 %	50 %	24371704
2054	NC_004347	GTTT	2	8	113717	113724	0 %	75 %	25 %	0 %	24371704
2055	NC_004347	GCG	2	6	113731	113736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371704
2056	NC_004347	GCA	2	6	113802	113807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2057	NC_004347	TCG	2	6	113852	113857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2058	NC_004347	TG	3	6	113897	113902	0 %	50 %	50 %	0 %	24371704
2059	NC_004347	GAC	2	6	113958	113963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2060	NC_004347	CGA	2	6	114012	114017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2061	NC_004347	GAT	2	6	114036	114041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371704
2062	NC_004347	GATG	2	8	114063	114070	25 %	25 %	50 %	0 %	24371704
2063	NC_004347	GAC	2	6	114079	114084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2064	NC_004347	TGC	2	6	114152	114157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371704
2065	NC_004347	TCG	2	6	114198	114203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_004347	GAT	2	6	114228	114233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_004347	ATG	2	6	114238	114243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371705
2068	NC_004347	CG	3	6	114277	114282	0 %	0 %	50 %	50 %	24371705
2069	NC_004347	TGC	2	6	114329	114334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371705
2070	NC_004347	GCG	2	6	114361	114366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371705
2071	NC_004347	GCG	2	6	114411	114416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371705
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2087	NC_004347	TATCA	2	10	114946	114955	40 %	40 %	0 %	20 %	24371705
2088	NC_004347	CCG	2	6	114965	114970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371705
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2090	NC_004347	C	6	6	115088	115093	0 %	0 %	0 %	100 %	24371705
2091	NC_004347	CTC	2	6	115144	115149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371705
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2094	NC_004347	GCG	2	6	115252	115257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371705
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2106	NC_004347	GCT	2	6	116048	116053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561729
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2108	NC_004347	AGC	2	6	116158	116163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561729
2109	NC_004347	CAG	2	6	116186	116191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561729
2110	NC_004347	TG	3	6	116238	116243	0 %	50 %	50 %	0 %	414561729
2111	NC_004347	GT	5	10	116269	116278	0 %	50 %	50 %	0 %	414561729
2112	NC_004347	GTA	2	6	116475	116480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561729
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2114	NC_004347	GCT	3	9	116624	116632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561729
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2117	NC_004347	GCTCA	2	10	116766	116775	20 %	20 %	20 %	40 %	414561729
2118	NC_004347	TGA	2	6	116828	116833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561729
2119	NC_004347	GCC	2	6	116871	116876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561729
2120	NC_004347	CAG	2	6	116949	116954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561729
2121	NC_004347	GCA	2	6	117161	117166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561729
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2123	NC_004347	GCA	2	6	117197	117202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561729
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2232	NC_004347	GCA	2	6	122723	122728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371712
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2374	NC_004347	CGT	2	6	131235	131240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561731
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2493	NC_004347	GGAA	2	8	137192	137199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_004347	CA	3	6	137285	137290	50 %	0 %	0 %	50 %	24371730
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2498	NC_004347	CG	3	6	137411	137416	0 %	0 %	50 %	50 %	24371730
2499	NC_004347	GTG	2	6	137444	137449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371730
2500	NC_004347	ATG	2	6	137495	137500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371730

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