MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004347	GAT	2	6	81792	81797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371669
1502	NC_004347	ATT	2	6	81808	81813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_004347	TCA	2	6	81901	81906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371670
1504	NC_004347	CCA	2	6	82005	82010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371670
1505	NC_004347	GCA	2	6	82125	82130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371670
1506	NC_004347	TCG	2	6	82166	82171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371670
1507	NC_004347	ATA	2	6	82175	82180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371670
1508	NC_004347	GCG	2	6	82252	82257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371670
1509	NC_004347	TGG	2	6	82299	82304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371670
1510	NC_004347	AT	3	6	82355	82360	50 %	50 %	0 %	0 %	24371670
1511	NC_004347	TGC	2	6	82415	82420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371670
1512	NC_004347	CAG	2	6	82486	82491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371670
1513	NC_004347	GGT	2	6	82513	82518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371670
1514	NC_004347	GTTG	2	8	82692	82699	0 %	50 %	50 %	0 %	24371671
1515	NC_004347	GGT	2	6	82707	82712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371671
1516	NC_004347	TAAA	2	8	82737	82744	75 %	25 %	0 %	0 %	24371671
1517	NC_004347	GGT	2	6	82924	82929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371671
1518	NC_004347	GGC	2	6	83008	83013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371671
1519	NC_004347	CA	3	6	83020	83025	50 %	0 %	0 %	50 %	24371671
1520	NC_004347	ATG	2	6	83030	83035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371671
1521	NC_004347	AGG	2	6	83069	83074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371671
1522	NC_004347	GATG	2	8	83108	83115	25 %	25 %	50 %	0 %	24371671
1523	NC_004347	TCT	2	6	83116	83121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371671
1524	NC_004347	GGC	2	6	83214	83219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371671
1525	NC_004347	TGA	2	6	83221	83226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371671
1526	NC_004347	GC	3	6	83245	83250	0 %	0 %	50 %	50 %	24371671
1527	NC_004347	TGGCA	2	10	83417	83426	20 %	20 %	40 %	20 %	24371671
1528	NC_004347	GCCGA	2	10	83479	83488	20 %	0 %	40 %	40 %	24371671
1529	NC_004347	TGC	2	6	83503	83508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371671
1530	NC_004347	GC	3	6	83632	83637	0 %	0 %	50 %	50 %	24371671
1531	NC_004347	ATCA	2	8	83817	83824	50 %	25 %	0 %	25 %	24371671
1532	NC_004347	GCT	2	6	83837	83842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371671
1533	NC_004347	TTG	2	6	83851	83856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371671
1534	NC_004347	GCC	2	6	83904	83909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371671
1535	NC_004347	CTT	2	6	83927	83932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371671
1536	NC_004347	T	6	6	83944	83949	0 %	100 %	0 %	0 %	24371671
1537	NC_004347	ACA	2	6	83962	83967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371671
1538	NC_004347	GTT	2	6	84079	84084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371671
1539	NC_004347	GGA	2	6	84085	84090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371671
1540	NC_004347	CGCAA	2	10	84207	84216	40 %	0 %	20 %	40 %	24371671
1541	NC_004347	TC	3	6	84253	84258	0 %	50 %	0 %	50 %	24371671
1542	NC_004347	GT	3	6	84291	84296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_004347	GT	3	6	84339	84344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_004347	CAG	2	6	84379	84384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371672
1545	NC_004347	GGC	2	6	84437	84442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371672
1546	NC_004347	TGG	2	6	84537	84542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371672
1547	NC_004347	GCC	2	6	84561	84566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371672
1548	NC_004347	TGC	2	6	84586	84591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371672
1549	NC_004347	TTG	2	6	84647	84652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371672
1550	NC_004347	CAAGC	2	10	84656	84665	40 %	0 %	20 %	40 %	24371672
1551	NC_004347	GCCT	2	8	84678	84685	0 %	25 %	25 %	50 %	24371672
1552	NC_004347	TGC	2	6	84690	84695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371672
1553	NC_004347	A	6	6	84824	84829	100 %	0 %	0 %	0 %	24371673
1554	NC_004347	TGG	2	6	84883	84888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371673
1555	NC_004347	TCA	2	6	85005	85010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371673
1556	NC_004347	GC	3	6	85076	85081	0 %	0 %	50 %	50 %	24371673
1557	NC_004347	GCTC	2	8	85139	85146	0 %	25 %	25 %	50 %	24371673
1558	NC_004347	GCT	2	6	85241	85246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371673
1559	NC_004347	CGG	2	6	85336	85341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371673
1560	NC_004347	TGT	2	6	85342	85347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371673
1561	NC_004347	GTT	2	6	85421	85426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371673
1562	NC_004347	GGC	2	6	85472	85477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371673
1563	NC_004347	TGG	2	6	85534	85539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371673
1564	NC_004347	AGCGA	2	10	85576	85585	40 %	0 %	40 %	20 %	24371673
1565	NC_004347	CAA	2	6	85668	85673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371674
1566	NC_004347	TGC	2	6	85701	85706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371674
1567	NC_004347	ATT	2	6	85753	85758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371674
1568	NC_004347	GTC	2	6	85763	85768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371674
1569	NC_004347	CTG	2	6	85845	85850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371674
1570	NC_004347	GT	3	6	85953	85958	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
1571	NC_004347	TGT	2	6	86052	86057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1572	NC_004347	CTC	2	6	86083	86088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371674
1573	NC_004347	TGT	2	6	86163	86168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1574	NC_004347	GC	3	6	86225	86230	0 %	0 %	50 %	50 %	24371674
1575	NC_004347	GT	3	6	86232	86237	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
1576	NC_004347	T	6	6	86333	86338	0 %	100 %	0 %	0 %	24371674
1577	NC_004347	TTG	2	6	86366	86371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1578	NC_004347	TG	3	6	86456	86461	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
1579	NC_004347	AGCG	2	8	86496	86503	25 %	0 %	50 %	25 %	24371674
1580	NC_004347	CG	3	6	86502	86507	0 %	0 %	50 %	50 %	24371674
1581	NC_004347	TGT	2	6	86520	86525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1582	NC_004347	GCA	2	6	86578	86583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371674
1583	NC_004347	TTG	2	6	86588	86593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1584	NC_004347	TCA	2	6	86598	86603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371674
1585	NC_004347	GT	3	6	86610	86615	0 %	50 %	50 %	0 %	24371674
1586	NC_004347	TTA	2	6	86631	86636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371674
1587	NC_004347	GTT	2	6	86724	86729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371674
1588	NC_004347	GCC	2	6	86733	86738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371674
1589	NC_004347	TGG	2	6	86766	86771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371674
1590	NC_004347	GCA	2	6	86812	86817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371674
1591	NC_004347	TTA	2	6	86840	86845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371674
1592	NC_004347	TGC	2	6	87017	87022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_004347	CAG	2	6	87097	87102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1594	NC_004347	AGG	2	6	87119	87124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561725
1595	NC_004347	GGCA	2	8	87176	87183	25 %	0 %	50 %	25 %	414561725
1596	NC_004347	TGA	2	6	87186	87191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561725
1597	NC_004347	TGC	3	9	87378	87386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1598	NC_004347	CGA	2	6	87402	87407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1599	NC_004347	GAT	2	6	87595	87600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561725
1600	NC_004347	TGTGC	2	10	87780	87789	0 %	40 %	40 %	20 %	414561725
1601	NC_004347	GTG	2	6	87871	87876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561725
1602	NC_004347	A	6	6	87943	87948	100 %	0 %	0 %	0 %	414561725
1603	NC_004347	TGC	2	6	88116	88121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1604	NC_004347	TCTT	2	8	88141	88148	0 %	75 %	0 %	25 %	414561725
1605	NC_004347	AAAC	2	8	88193	88200	75 %	0 %	0 %	25 %	414561725
1606	NC_004347	GAC	2	6	88288	88293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1607	NC_004347	TTA	2	6	88329	88334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561725
1608	NC_004347	CTG	3	9	88352	88360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1609	NC_004347	ATTT	2	8	88418	88425	25 %	75 %	0 %	0 %	414561725
1610	NC_004347	ACCG	2	8	88429	88436	25 %	0 %	25 %	50 %	414561725
1611	NC_004347	TC	3	6	88588	88593	0 %	50 %	0 %	50 %	414561725
1612	NC_004347	AAC	2	6	88676	88681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561725
1613	NC_004347	CAG	2	6	88696	88701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1614	NC_004347	CTG	2	6	88738	88743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561725
1615	NC_004347	AAAT	2	8	88829	88836	75 %	25 %	0 %	0 %	414561725
1616	NC_004347	AAT	2	6	88846	88851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561725
1617	NC_004347	T	6	6	88893	88898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_004347	TCG	2	6	89009	89014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371676
1619	NC_004347	TG	3	6	89017	89022	0 %	50 %	50 %	0 %	24371676
1620	NC_004347	CTG	2	6	89023	89028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371676
1621	NC_004347	TCT	2	6	89046	89051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371676
1622	NC_004347	CTG	2	6	89065	89070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371676
1623	NC_004347	CAG	2	6	89154	89159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371676
1624	NC_004347	CGA	2	6	89204	89209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371676
1625	NC_004347	T	6	6	89236	89241	0 %	100 %	0 %	0 %	24371676
1626	NC_004347	TGA	2	6	89372	89377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371676
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1762	NC_004347	CAT	2	6	97845	97850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1881	NC_004347	GAGT	2	8	104767	104774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1999	NC_004347	ACTC	2	8	111347	111354	25 %	25 %	0 %	50 %	24371701
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