MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004347	GCT	2	6	53793	53798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371647
1002	NC_004347	AAT	2	6	53827	53832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371647
1003	NC_004347	CGAC	2	8	53840	53847	25 %	0 %	25 %	50 %	24371647
1004	NC_004347	ATTGTG	2	12	53851	53862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24371647
1005	NC_004347	TGA	2	6	53929	53934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371647
1006	NC_004347	ATG	2	6	54013	54018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371647
1007	NC_004347	ATG	2	6	54070	54075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371647
1008	NC_004347	CAAAGC	2	12	54104	54115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24371647
1009	NC_004347	TGA	2	6	54420	54425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004347	TTA	2	6	54453	54458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561722
1011	NC_004347	ATCACC	2	12	54646	54657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414561722
1012	NC_004347	ACC	2	6	54696	54701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561722
1013	NC_004347	CG	3	6	54708	54713	0 %	0 %	50 %	50 %	414561722
1014	NC_004347	CAC	2	6	54756	54761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561722
1015	NC_004347	GCC	2	6	54825	54830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561722
1016	NC_004347	CAA	2	6	54887	54892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561722
1017	NC_004347	GTT	2	6	54923	54928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1018	NC_004347	TTG	2	6	55023	55028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1019	NC_004347	TGCT	2	8	55057	55064	0 %	50 %	25 %	25 %	414561722
1020	NC_004347	TCA	2	6	55084	55089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561722
1021	NC_004347	TTGT	2	8	55100	55107	0 %	75 %	25 %	0 %	414561722
1022	NC_004347	TTG	2	6	55138	55143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1023	NC_004347	TGG	2	6	55175	55180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561722
1024	NC_004347	CTG	2	6	55188	55193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561722
1025	NC_004347	CAT	2	6	55200	55205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561722
1026	NC_004347	GTT	2	6	55247	55252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1027	NC_004347	CTT	2	6	55295	55300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561722
1028	NC_004347	GTT	2	6	55304	55309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1029	NC_004347	TAT	2	6	55325	55330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561722
1030	NC_004347	GGC	3	9	55371	55379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561722
1031	NC_004347	CTT	2	6	55388	55393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561722
1032	NC_004347	GC	3	6	55448	55453	0 %	0 %	50 %	50 %	414561722
1033	NC_004347	TGT	2	6	55456	55461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561722
1034	NC_004347	TGGA	2	8	55477	55484	25 %	25 %	50 %	0 %	414561722
1035	NC_004347	CAT	2	6	55539	55544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561722
1036	NC_004347	AAT	2	6	55554	55559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561722
1037	NC_004347	AAC	2	6	55595	55600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371649
1038	NC_004347	CTG	2	6	55638	55643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371649
1039	NC_004347	TTG	2	6	55671	55676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371649
1040	NC_004347	TGG	2	6	55710	55715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371649
1041	NC_004347	CAA	2	6	55725	55730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371649
1042	NC_004347	TCG	2	6	55784	55789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371649
1043	NC_004347	TAA	2	6	55821	55826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371649
1044	NC_004347	TG	3	6	55921	55926	0 %	50 %	50 %	0 %	24371649
1045	NC_004347	CGC	2	6	55987	55992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371649
1046	NC_004347	AACT	2	8	55993	56000	50 %	25 %	0 %	25 %	24371649
1047	NC_004347	TCC	2	6	56078	56083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371649
1048	NC_004347	CCG	2	6	56105	56110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371649
1049	NC_004347	GAA	3	9	56113	56121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371649
1050	NC_004347	CGG	2	6	56244	56249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371649
1051	NC_004347	GGC	2	6	56467	56472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371649
1052	NC_004347	GAT	2	6	56590	56595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371649
1053	NC_004347	GTA	2	6	56621	56626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371649
1054	NC_004347	ATC	2	6	56632	56637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371649
1055	NC_004347	GCACC	2	10	56805	56814	20 %	0 %	20 %	60 %	24371649
1056	NC_004347	CTG	2	6	56826	56831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371649
1057	NC_004347	CAA	2	6	57112	57117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371649
1058	NC_004347	GTC	2	6	57137	57142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371649
1059	NC_004347	TAC	2	6	57199	57204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_004347	GGGCT	2	10	57302	57311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_004347	CTG	2	6	57334	57339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004347	AT	3	6	57417	57422	50 %	50 %	0 %	0 %	24371650
1063	NC_004347	T	6	6	57427	57432	0 %	100 %	0 %	0 %	24371650
1064	NC_004347	TGGG	2	8	57460	57467	0 %	25 %	75 %	0 %	24371650
1065	NC_004347	TTTG	2	8	57468	57475	0 %	75 %	25 %	0 %	24371650
1066	NC_004347	TCA	2	6	57531	57536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371650
1067	NC_004347	TAT	2	6	57546	57551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371650
1068	NC_004347	ATG	2	6	57593	57598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371650
1069	NC_004347	TTG	2	6	57617	57622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371650
1070	NC_004347	AAT	2	6	57655	57660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371650
1071	NC_004347	GGT	2	6	57787	57792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371650
1072	NC_004347	GGCA	2	8	57803	57810	25 %	0 %	50 %	25 %	24371650
1073	NC_004347	CGG	2	6	57849	57854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_004347	TGC	2	6	57868	57873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_004347	TCA	2	6	57902	57907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_004347	AGCC	2	8	58055	58062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_004347	GATAG	2	10	58085	58094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004347	AAC	2	6	58127	58132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371652
1079	NC_004347	TTTC	2	8	58175	58182	0 %	75 %	0 %	25 %	24371652
1080	NC_004347	AAGTT	2	10	58229	58238	40 %	40 %	20 %	0 %	24371652
1081	NC_004347	TGACTG	2	12	58298	58309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24371652
1082	NC_004347	CGG	2	6	58317	58322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371652
1083	NC_004347	TG	3	6	58337	58342	0 %	50 %	50 %	0 %	24371652
1084	NC_004347	AGCA	2	8	58349	58356	50 %	0 %	25 %	25 %	24371652
1085	NC_004347	TCT	2	6	58361	58366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371652
1086	NC_004347	CTGA	2	8	58378	58385	25 %	25 %	25 %	25 %	24371652
1087	NC_004347	CTCA	2	8	58397	58404	25 %	25 %	0 %	50 %	24371652
1088	NC_004347	CAA	2	6	58537	58542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371652
1089	NC_004347	AGCCGC	2	12	58548	58559	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24371652
1090	NC_004347	GAA	2	6	58561	58566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371652
1091	NC_004347	GGGC	2	8	58614	58621	0 %	0 %	75 %	25 %	24371653
1092	NC_004347	TTG	2	6	58673	58678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371653
1093	NC_004347	GCC	2	6	58799	58804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371653
1094	NC_004347	TTG	2	6	58871	58876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371653
1095	NC_004347	TGC	2	6	58935	58940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371653
1096	NC_004347	TGC	2	6	59088	59093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371653
1097	NC_004347	ACG	2	6	59124	59129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371653
1098	NC_004347	GGC	2	6	59150	59155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371653
1099	NC_004347	CCG	2	6	59359	59364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371653
1100	NC_004347	AAG	2	6	59451	59456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371653
1101	NC_004347	AG	3	6	59567	59572	50 %	0 %	50 %	0 %	24371653
1102	NC_004347	TGA	2	6	59611	59616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004347	T	6	6	59660	59665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004347	AAG	2	6	59685	59690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004347	TCC	2	6	59740	59745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_004347	ATCGCC	2	12	59787	59798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_004347	GCA	2	6	59811	59816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_004347	GAT	2	6	59910	59915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004347	CAT	2	6	59961	59966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561723
1110	NC_004347	ATT	2	6	59973	59978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561723
1111	NC_004347	TG	3	6	60004	60009	0 %	50 %	50 %	0 %	414561723
1112	NC_004347	CAG	2	6	60016	60021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561723
1113	NC_004347	TCA	2	6	60082	60087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561723
1114	NC_004347	GGC	2	6	60093	60098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561723
1115	NC_004347	GCA	2	6	60191	60196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561723
1116	NC_004347	GTT	2	6	60254	60259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561723
1117	NC_004347	TGC	2	6	60292	60297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561723
1118	NC_004347	CGAATG	2	12	60302	60313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414561723
1119	NC_004347	GGCG	2	8	60314	60321	0 %	0 %	75 %	25 %	414561723
1120	NC_004347	GGCC	2	8	60368	60375	0 %	0 %	50 %	50 %	414561723
1121	NC_004347	CGG	2	6	60434	60439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561723
1122	NC_004347	GGCG	2	8	60701	60708	0 %	0 %	75 %	25 %	414561723
1123	NC_004347	AATC	2	8	60719	60726	50 %	25 %	0 %	25 %	414561723
1124	NC_004347	CAA	2	6	60762	60767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561723
1125	NC_004347	TGG	2	6	60829	60834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561723
1126	NC_004347	TGA	2	6	60845	60850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561723
1127	NC_004347	CAA	2	6	60860	60865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561723
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