MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_004347	CAA	2	6	640263	640268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372205
11503	NC_004347	TGG	2	6	640436	640441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372205
11504	NC_004347	CGG	2	6	640448	640453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372205
11505	NC_004347	CTT	2	6	640454	640459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372205
11506	NC_004347	TGC	2	6	640505	640510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372205
11507	NC_004347	TTA	2	6	640648	640653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372205
11508	NC_004347	GTG	2	6	640657	640662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372205
11509	NC_004347	GATG	2	8	640664	640671	25 %	25 %	50 %	0 %	24372205
11510	NC_004347	TTC	2	6	640680	640685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372205
11511	NC_004347	GCGT	2	8	640693	640700	0 %	25 %	50 %	25 %	24372205
11512	NC_004347	GTTG	2	8	640789	640796	0 %	50 %	50 %	0 %	24372205
11513	NC_004347	TAAG	2	8	640838	640845	50 %	25 %	25 %	0 %	24372205
11514	NC_004347	TTG	2	6	640933	640938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_004347	AG	3	6	641027	641032	50 %	0 %	50 %	0 %	24372206
11516	NC_004347	GAT	2	6	641143	641148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372206
11517	NC_004347	CAAA	2	8	641220	641227	75 %	0 %	0 %	25 %	24372206
11518	NC_004347	AGC	2	6	641261	641266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372206
11519	NC_004347	AAT	2	6	641281	641286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372206
11520	NC_004347	CGC	2	6	641479	641484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372206
11521	NC_004347	TGA	2	6	641525	641530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372206
11522	NC_004347	CGC	2	6	641661	641666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372206
11523	NC_004347	ATA	2	6	641687	641692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372206
11524	NC_004347	GTG	2	6	641714	641719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372206
11525	NC_004347	TTG	2	6	641722	641727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372206
11526	NC_004347	AAG	2	6	641825	641830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372206
11527	NC_004347	ACG	2	6	641834	641839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372206
11528	NC_004347	TGG	2	6	642017	642022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372206
11529	NC_004347	ATT	2	6	642104	642109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372206
11530	NC_004347	AAG	2	6	642125	642130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372206
11531	NC_004347	CG	3	6	642280	642285	0 %	0 %	50 %	50 %	24372207
11532	NC_004347	TTA	2	6	642341	642346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372207
11533	NC_004347	AC	3	6	642378	642383	50 %	0 %	0 %	50 %	24372207
11534	NC_004347	CAC	2	6	642391	642396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372207
11535	NC_004347	ACA	2	6	642406	642411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372207
11536	NC_004347	GGT	2	6	642479	642484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372207
11537	NC_004347	GC	3	6	642537	642542	0 %	0 %	50 %	50 %	24372207
11538	NC_004347	TGA	2	6	642610	642615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372207
11539	NC_004347	CGA	2	6	642655	642660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372207
11540	NC_004347	CGG	2	6	642684	642689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372207
11541	NC_004347	G	7	7	642688	642694	0 %	0 %	100 %	0 %	24372207
11542	NC_004347	TTG	2	6	642710	642715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372207
11543	NC_004347	TTGAA	2	10	642717	642726	40 %	40 %	20 %	0 %	24372207
11544	NC_004347	TG	3	6	642755	642760	0 %	50 %	50 %	0 %	24372207
11545	NC_004347	TGT	2	6	642762	642767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372207
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11547	NC_004347	T	6	6	642830	642835	0 %	100 %	0 %	0 %	24372207
11548	NC_004347	ATTGCG	2	12	642850	642861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24372207
11549	NC_004347	TGGC	2	8	642924	642931	0 %	25 %	50 %	25 %	24372207
11550	NC_004347	CG	3	6	642960	642965	0 %	0 %	50 %	50 %	24372207
11551	NC_004347	TGG	2	6	643015	643020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372207
11552	NC_004347	GTT	2	6	643066	643071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372207
11553	NC_004347	CAA	2	6	643103	643108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372207
11554	NC_004347	TATTCA	2	12	643156	643167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11555	NC_004347	TAGC	2	8	643173	643180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_004347	T	7	7	643200	643206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_004347	TTG	2	6	643296	643301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_004347	TAA	2	6	643337	643342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_004347	AAGATA	2	12	643384	643395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_004347	TAAAAC	2	12	643426	643437	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11561	NC_004347	GAA	3	9	643445	643453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372208
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11563	NC_004347	CT	3	6	643678	643683	0 %	50 %	0 %	50 %	24372208
11564	NC_004347	TGA	2	6	643688	643693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372208
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11566	NC_004347	T	6	6	643885	643890	0 %	100 %	0 %	0 %	24372208
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11578	NC_004347	TGCTG	2	10	644762	644771	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11589	NC_004347	A	6	6	645394	645399	100 %	0 %	0 %	0 %	24372209
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11593	NC_004347	TGG	2	6	645561	645566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372209
11594	NC_004347	CGTG	2	8	645603	645610	0 %	25 %	50 %	25 %	24372209
11595	NC_004347	CTG	2	6	645619	645624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372209
11596	NC_004347	GAG	2	6	645766	645771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372209
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11601	NC_004347	GCC	2	6	645958	645963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372210
11602	NC_004347	GC	3	6	646203	646208	0 %	0 %	50 %	50 %	24372210
11603	NC_004347	TGC	2	6	646211	646216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372210
11604	NC_004347	TTGC	2	8	646300	646307	0 %	50 %	25 %	25 %	24372210
11605	NC_004347	GTG	2	6	646318	646323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372210
11606	NC_004347	ACTTA	2	10	646404	646413	40 %	40 %	0 %	20 %	24372210
11607	NC_004347	CAA	2	6	646513	646518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372210
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11617	NC_004347	TTC	2	6	647312	647317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_004347	GCT	2	6	647349	647354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11621	NC_004347	T	6	6	647451	647456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11623	NC_004347	A	6	6	647682	647687	100 %	0 %	0 %	0 %	24372211
11624	NC_004347	TGG	2	6	647752	647757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372211
11625	NC_004347	GCT	2	6	647888	647893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372211
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11627	NC_004347	ACC	2	6	647965	647970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372211
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11629	NC_004347	GGT	2	6	648042	648047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372211
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11975	NC_004347	GC	3	6	668585	668590	0 %	0 %	50 %	50 %	24372231
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11986	NC_004347	GCGAA	2	10	668946	668955	40 %	0 %	40 %	20 %	24372231
11987	NC_004347	CTAA	2	8	669166	669173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11988	NC_004347	GCTA	2	8	669296	669303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11989	NC_004347	CGC	2	6	669344	669349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11991	NC_004347	GCT	2	6	669435	669440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372232
11992	NC_004347	CT	3	6	669439	669444	0 %	50 %	0 %	50 %	24372232
11993	NC_004347	TGC	2	6	669474	669479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372232
11994	NC_004347	CAAA	2	8	669507	669514	75 %	0 %	0 %	25 %	24372232
11995	NC_004347	CCA	2	6	669573	669578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372232
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