MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_004347	CCG	2	6	26294	26299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371621
503	NC_004347	AG	3	6	26386	26391	50 %	0 %	50 %	0 %	24371621
504	NC_004347	CAT	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371621
505	NC_004347	CGA	2	6	26445	26450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371621
506	NC_004347	TTG	2	6	26497	26502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371621
507	NC_004347	TTGC	2	8	26643	26650	0 %	50 %	25 %	25 %	24371621
508	NC_004347	ATT	2	6	26680	26685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004347	T	6	6	26684	26689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004347	CT	3	6	26703	26708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_004347	CAG	2	6	26715	26720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_004347	CAT	2	6	26728	26733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_004347	TG	3	6	26743	26748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004347	ACA	2	6	26776	26781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_004347	TGG	2	6	26886	26891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004347	TAA	2	6	26910	26915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004347	ATTT	2	8	26935	26942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004347	TAT	2	6	27034	27039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004347	TCAT	2	8	27046	27053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_004347	CGA	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371622
521	NC_004347	TCG	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371622
522	NC_004347	CA	3	6	27181	27186	50 %	0 %	0 %	50 %	24371622
523	NC_004347	ATTA	2	8	27204	27211	50 %	50 %	0 %	0 %	24371622
524	NC_004347	CTG	2	6	27269	27274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371622
525	NC_004347	TGG	2	6	27277	27282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371622
526	NC_004347	ATT	2	6	27419	27424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371622
527	NC_004347	TGA	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371622
528	NC_004347	CAC	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371622
529	NC_004347	CCAA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	0 %	50 %	24371622
530	NC_004347	TCA	2	6	27602	27607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371622
531	NC_004347	GGC	2	6	27608	27613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371622
532	NC_004347	GCGA	2	8	27636	27643	25 %	0 %	50 %	25 %	24371622
533	NC_004347	CAG	3	9	27654	27662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371622
534	NC_004347	ATT	2	6	27711	27716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371622
535	NC_004347	GCG	2	6	27732	27737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371622
536	NC_004347	GC	3	6	27774	27779	0 %	0 %	50 %	50 %	24371622
537	NC_004347	GAA	2	6	27857	27862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371622
538	NC_004347	TGAT	2	8	27910	27917	25 %	50 %	25 %	0 %	24371622
539	NC_004347	ATG	2	6	27918	27923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371622
540	NC_004347	CTT	2	6	28049	28054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371622
541	NC_004347	ATG	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371622
542	NC_004347	GGC	2	6	28101	28106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371622
543	NC_004347	TGA	2	6	28115	28120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371622
544	NC_004347	TGA	2	6	28289	28294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371622
545	NC_004347	CGG	2	6	28307	28312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371622
546	NC_004347	AGA	3	9	28445	28453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371623
547	NC_004347	TACT	2	8	28519	28526	25 %	50 %	0 %	25 %	24371623
548	NC_004347	GCCA	2	8	28551	28558	25 %	0 %	25 %	50 %	24371623
549	NC_004347	TGA	2	6	28616	28621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371623
550	NC_004347	CTG	2	6	28630	28635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371623
551	NC_004347	GTC	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371623
552	NC_004347	GTG	2	6	28701	28706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371623
553	NC_004347	TAC	2	6	28710	28715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371623
554	NC_004347	GTGC	2	8	28746	28753	0 %	25 %	50 %	25 %	24371623
555	NC_004347	GCA	2	6	28871	28876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371623
556	NC_004347	ACA	3	9	28943	28951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371623
557	NC_004347	AAT	2	6	29078	29083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004347	ATA	2	6	29111	29116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371624
559	NC_004347	TGC	2	6	29157	29162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371624
560	NC_004347	GGC	2	6	29195	29200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371624
561	NC_004347	T	6	6	29222	29227	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
562	NC_004347	TTAT	2	8	29234	29241	25 %	75 %	0 %	0 %	24371624
563	NC_004347	CGC	2	6	29267	29272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371624
564	NC_004347	AGG	2	6	29277	29282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371624
565	NC_004347	TCG	2	6	29310	29315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371624
566	NC_004347	TCT	2	6	29361	29366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371624
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568	NC_004347	T	7	7	29398	29404	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
569	NC_004347	ACC	2	6	29423	29428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371624
570	NC_004347	ATTTT	2	10	29474	29483	20 %	80 %	0 %	0 %	24371624
571	NC_004347	TGC	2	6	29493	29498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371624
572	NC_004347	ATC	2	6	29519	29524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371624
573	NC_004347	ATCT	2	8	29657	29664	25 %	50 %	0 %	25 %	24371624
574	NC_004347	TTGG	2	8	29695	29702	0 %	50 %	50 %	0 %	24371624
575	NC_004347	CCATCG	2	12	29745	29756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	24371624
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578	NC_004347	CAATT	2	10	29937	29946	40 %	40 %	0 %	20 %	24371624
579	NC_004347	T	7	7	29965	29971	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
580	NC_004347	GAA	2	6	30008	30013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371624
581	NC_004347	ACC	2	6	30053	30058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371624
582	NC_004347	ATT	2	6	30094	30099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371624
583	NC_004347	TTA	2	6	30110	30115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371624
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587	NC_004347	TTG	3	9	30188	30196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371624
588	NC_004347	TTCGA	2	10	30244	30253	20 %	40 %	20 %	20 %	24371624
589	NC_004347	T	7	7	30302	30308	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
590	NC_004347	GCTT	2	8	30395	30402	0 %	50 %	25 %	25 %	24371624
591	NC_004347	TGG	2	6	30477	30482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371624
592	NC_004347	GCTAT	2	10	30485	30494	20 %	40 %	20 %	20 %	24371624
593	NC_004347	TTG	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371624
594	NC_004347	TAA	2	6	30568	30573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371625
595	NC_004347	GCGG	2	8	30635	30642	0 %	0 %	75 %	25 %	24371625
596	NC_004347	ATTG	2	8	30710	30717	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
597	NC_004347	T	7	7	30806	30812	0 %	100 %	0 %	0 %	24371625
598	NC_004347	TGG	2	6	30823	30828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371625
599	NC_004347	GATT	2	8	30932	30939	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
600	NC_004347	GACT	2	8	31292	31299	25 %	25 %	25 %	25 %	24371626
601	NC_004347	TCAC	2	8	31460	31467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_004347	GAT	2	6	31609	31614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004347	GAG	2	6	31687	31692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371627
604	NC_004347	TGG	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371627
605	NC_004347	T	6	6	31898	31903	0 %	100 %	0 %	0 %	24371627
606	NC_004347	T	6	6	31913	31918	0 %	100 %	0 %	0 %	24371627
607	NC_004347	AATA	2	8	31968	31975	75 %	25 %	0 %	0 %	24371627
608	NC_004347	ATT	2	6	32025	32030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371627
609	NC_004347	CTG	2	6	32175	32180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371627
610	NC_004347	TAA	2	6	32208	32213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371627
611	NC_004347	TGCT	2	8	32238	32245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_004347	AG	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
613	NC_004347	AAT	2	6	32381	32386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371628
614	NC_004347	CGG	2	6	32416	32421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371628
615	NC_004347	CAA	2	6	32485	32490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371628
616	NC_004347	AT	3	6	32499	32504	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
617	NC_004347	AGC	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
618	NC_004347	AGCG	2	8	32523	32530	25 %	0 %	50 %	25 %	24371628
619	NC_004347	GTT	2	6	32555	32560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371628
620	NC_004347	AGC	2	6	32674	32679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
621	NC_004347	AGCGC	2	10	32794	32803	20 %	0 %	40 %	40 %	24371628
622	NC_004347	AAAC	2	8	32857	32864	75 %	0 %	0 %	25 %	24371628
623	NC_004347	AAG	2	6	32877	32882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371628
624	NC_004347	ATC	2	6	32928	32933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371628
625	NC_004347	CAG	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
626	NC_004347	ACC	2	6	32957	32962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
627	NC_004347	TGC	2	6	32963	32968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371628
628	NC_004347	ACA	2	6	32976	32981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371628
629	NC_004347	CGC	2	6	33008	33013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371628
630	NC_004347	ACC	2	6	33038	33043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
631	NC_004347	GA	3	6	33048	33053	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
632	NC_004347	AT	3	6	33133	33138	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
633	NC_004347	A	6	6	33143	33148	100 %	0 %	0 %	0 %	24371628
634	NC_004347	TG	3	6	33168	33173	0 %	50 %	50 %	0 %	24371628
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647	NC_004347	CGATAT	2	12	34044	34055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24371629
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649	NC_004347	CTT	2	6	34108	34113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
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711	NC_004347	ACAG	2	8	37618	37625	50 %	0 %	25 %	25 %	24371632
712	NC_004347	CTT	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371632
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718	NC_004347	AAG	2	6	37911	37916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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740	NC_004347	C	6	6	39442	39447	0 %	0 %	0 %	100 %	414561720
741	NC_004347	TG	3	6	39448	39453	0 %	50 %	50 %	0 %	414561720
742	NC_004347	TTGT	2	8	39454	39461	0 %	75 %	25 %	0 %	414561720
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745	NC_004347	GA	4	8	39558	39565	50 %	0 %	50 %	0 %	414561720
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750	NC_004347	ATT	2	6	39805	39810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561720
751	NC_004347	TCTT	2	8	39816	39823	0 %	75 %	0 %	25 %	414561720
752	NC_004347	TGG	2	6	39930	39935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561720
753	NC_004347	TCA	2	6	39939	39944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561720
754	NC_004347	TTA	2	6	39958	39963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561720
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759	NC_004347	GGT	2	6	40231	40236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561720
760	NC_004347	TGA	2	6	40325	40330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371635
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