MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004347	AGC	2	6	272716	272721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_004347	CAT	2	6	272722	272727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_004347	AAAG	2	8	272730	272737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_004347	AGTCG	2	10	272752	272761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5005	NC_004347	ACC	2	6	272794	272799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_004347	TGAAGG	2	12	272857	272868	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_004347	GA	3	6	273069	273074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_004347	AGGCT	2	10	273081	273090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5009	NC_004347	GCG	2	6	273094	273099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_004347	GGT	2	6	273118	273123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_004347	TGA	2	6	273169	273174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_004347	AGT	2	6	273194	273199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_004347	TCT	2	6	273222	273227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_004347	TAG	2	6	273239	273244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_004347	GGT	2	6	273268	273273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_004347	GA	3	6	273298	273303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_004347	TGA	2	6	273367	273372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_004347	CT	3	6	273379	273384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_004347	ATTG	2	8	273501	273508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_004347	CGG	2	6	273549	273554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_004347	ATG	2	6	273625	273630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_004347	GTC	2	6	273806	273811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_004347	ACC	2	6	273820	273825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_004347	TGG	2	6	273880	273885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_004347	TCC	2	6	273906	273911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_004347	GGA	2	6	273923	273928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_004347	GACA	2	8	274000	274007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_004347	GGT	2	6	274043	274048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_004347	CGG	2	6	274130	274135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_004347	TCA	2	6	274158	274163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_004347	CGT	2	6	274238	274243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_004347	GAT	2	6	274278	274283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_004347	GAAC	2	8	274320	274327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_004347	GT	3	6	274491	274496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_004347	TCC	2	6	274601	274606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_004347	AAG	2	6	274649	274654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_004347	TAA	2	6	274680	274685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_004347	AGC	2	6	274713	274718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_004347	ATCCC	2	10	274788	274797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5040	NC_004347	TAAA	2	8	274876	274883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_004347	A	6	6	274885	274890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_004347	T	6	6	274914	274919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_004347	T	6	6	274929	274934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_004347	CCA	2	6	274953	274958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_004347	AT	3	6	274968	274973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_004347	C	8	8	275095	275102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5047	NC_004347	AGC	2	6	275135	275140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_004347	TGT	2	6	275142	275147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_004347	TTC	2	6	275160	275165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_004347	TTAC	2	8	275218	275225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_004347	ATG	2	6	275261	275266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371870
5052	NC_004347	GAT	2	6	275275	275280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371870
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5054	NC_004347	TTG	2	6	275313	275318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371870
5055	NC_004347	TGC	2	6	275326	275331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371870
5056	NC_004347	ATG	2	6	275348	275353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371870
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5058	NC_004347	GAT	2	6	275483	275488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371870
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5061	NC_004347	TGC	2	6	275619	275624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371870
5062	NC_004347	TGG	2	6	275640	275645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371870
5063	NC_004347	GTT	2	6	275698	275703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371870
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5078	NC_004347	A	7	7	276624	276630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_004347	CGC	2	6	277201	277206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561743
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5099	NC_004347	GGC	2	6	277774	277779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561743
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5108	NC_004347	AACT	2	8	278134	278141	50 %	25 %	0 %	25 %	414561743
5109	NC_004347	CTGAGT	2	12	278196	278207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414561743
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5112	NC_004347	GAC	2	6	278682	278687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561743
5113	NC_004347	TA	3	6	278748	278753	50 %	50 %	0 %	0 %	414561743
5114	NC_004347	CT	3	6	278780	278785	0 %	50 %	0 %	50 %	414561743
5115	NC_004347	TTG	2	6	278912	278917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561743
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5372	NC_004347	G	7	7	293459	293465	0 %	0 %	100 %	0 %	24371883
5373	NC_004347	CAG	2	6	293472	293477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371883
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5375	NC_004347	CAA	2	6	293674	293679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5376	NC_004347	TGC	2	6	293920	293925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371884
5377	NC_004347	GAA	2	6	294006	294011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371884
5378	NC_004347	CCG	2	6	294017	294022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371884
5379	NC_004347	TCTG	2	8	294047	294054	0 %	50 %	25 %	25 %	24371884
5380	NC_004347	TGG	3	9	294080	294088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371884
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5401	NC_004347	GCCAT	2	10	295110	295119	20 %	20 %	20 %	40 %	24371885
5402	NC_004347	TGC	2	6	295183	295188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371885
5403	NC_004347	GATT	2	8	295209	295216	25 %	50 %	25 %	0 %	24371885
5404	NC_004347	TGTC	2	8	295228	295235	0 %	50 %	25 %	25 %	24371885
5405	NC_004347	CTG	2	6	295429	295434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371885
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5407	NC_004347	CAT	2	6	295517	295522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371886
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5442	NC_004347	AT	3	6	297139	297144	50 %	50 %	0 %	0 %	24371887
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5450	NC_004347	A	6	6	297338	297343	100 %	0 %	0 %	0 %	24371887
5451	NC_004347	AAAG	2	8	297379	297386	75 %	0 %	25 %	0 %	24371887
5452	NC_004347	GC	3	6	297391	297396	0 %	0 %	50 %	50 %	24371887
5453	NC_004347	GTGAT	2	10	297447	297456	20 %	40 %	40 %	0 %	24371887
5454	NC_004347	GAT	2	6	297533	297538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371887
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5484	NC_004347	GCGCC	2	10	299450	299459	0 %	0 %	40 %	60 %	24371891
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5496	NC_004347	GCG	2	6	300211	300216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371892
5497	NC_004347	GCA	2	6	300260	300265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371892
5498	NC_004347	TGAGC	2	10	300308	300317	20 %	20 %	40 %	20 %	24371892
5499	NC_004347	CAA	2	6	300356	300361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371892
5500	NC_004347	GGC	2	6	300398	300403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371892

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