MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 88180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004347	ATC	2	6	245495	245500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_004347	GAA	2	6	245522	245527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_004347	T	6	6	245540	245545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_004347	ATC	2	6	245613	245618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371828
4505	NC_004347	CTAC	2	8	245696	245703	25 %	25 %	0 %	50 %	24371828
4506	NC_004347	TC	3	6	245730	245735	0 %	50 %	0 %	50 %	24371828
4507	NC_004347	TAA	2	6	245743	245748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371828
4508	NC_004347	AGA	2	6	245896	245901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_004347	GA	3	6	245907	245912	50 %	0 %	50 %	0 %	24371829
4510	NC_004347	TAC	2	6	246064	246069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371829
4511	NC_004347	A	6	6	246077	246082	100 %	0 %	0 %	0 %	24371829
4512	NC_004347	GCG	2	6	246126	246131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371829
4513	NC_004347	GAAGGC	2	12	246176	246187	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	24371829
4514	NC_004347	TAAAGG	2	12	246259	246270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24371829
4515	NC_004347	AC	3	6	246317	246322	50 %	0 %	0 %	50 %	24371829
4516	NC_004347	TAC	2	6	246430	246435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371829
4517	NC_004347	ATC	2	6	246524	246529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371829
4518	NC_004347	GAG	2	6	246556	246561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_004347	TCA	2	6	246651	246656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371830
4520	NC_004347	CG	3	6	246681	246686	0 %	0 %	50 %	50 %	24371830
4521	NC_004347	GTG	2	6	246779	246784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371830
4522	NC_004347	TGGCG	2	10	246799	246808	0 %	20 %	60 %	20 %	24371830
4523	NC_004347	GCT	2	6	246823	246828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371830
4524	NC_004347	AAG	2	6	246859	246864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371830
4525	NC_004347	GC	3	6	246875	246880	0 %	0 %	50 %	50 %	24371830
4526	NC_004347	TCTG	2	8	246891	246898	0 %	50 %	25 %	25 %	24371830
4527	NC_004347	TGG	2	6	246920	246925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371830
4528	NC_004347	TTG	2	6	246926	246931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371830
4529	NC_004347	AGA	2	6	246996	247001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371830
4530	NC_004347	AGC	2	6	247044	247049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371830
4531	NC_004347	CTG	2	6	247133	247138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371830
4532	NC_004347	GAG	2	6	247156	247161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371830
4533	NC_004347	ATG	2	6	247170	247175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371830
4534	NC_004347	GAA	2	6	247182	247187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371831
4535	NC_004347	CTC	2	6	247210	247215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371831
4536	NC_004347	TGT	2	6	247259	247264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371831
4537	NC_004347	GCT	2	6	247305	247310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371831
4538	NC_004347	TGAAGT	2	12	247325	247336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371831
4539	NC_004347	TGG	2	6	247382	247387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371831
4540	NC_004347	GTC	2	6	247396	247401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371831
4541	NC_004347	A	6	6	247413	247418	100 %	0 %	0 %	0 %	24371831
4542	NC_004347	TCG	2	6	247456	247461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371831
4543	NC_004347	GCG	2	6	247462	247467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371831
4544	NC_004347	TTA	2	6	247499	247504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371832
4545	NC_004347	GTC	2	6	247526	247531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371832
4546	NC_004347	GTG	2	6	247546	247551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371832
4547	NC_004347	A	7	7	247596	247602	100 %	0 %	0 %	0 %	24371832
4548	NC_004347	GTG	2	6	247610	247615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371832
4549	NC_004347	TGG	2	6	247653	247658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371832
4550	NC_004347	AGC	2	6	247667	247672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371832
4551	NC_004347	CGT	2	6	247792	247797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371832
4552	NC_004347	TGC	2	6	247806	247811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371832
4553	NC_004347	TGT	2	6	247908	247913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371832
4554	NC_004347	CG	3	6	247953	247958	0 %	0 %	50 %	50 %	24371832
4555	NC_004347	GTT	2	6	247981	247986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371832
4556	NC_004347	GGT	3	9	248188	248196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371832
4557	NC_004347	TGG	2	6	248211	248216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371832
4558	NC_004347	GTA	2	6	248267	248272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371832
4559	NC_004347	CGT	3	9	248299	248307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371832
4560	NC_004347	AATA	2	8	248308	248315	75 %	25 %	0 %	0 %	24371832
4561	NC_004347	TC	3	6	248340	248345	0 %	50 %	0 %	50 %	24371833
4562	NC_004347	GAA	2	6	248378	248383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371833
4563	NC_004347	AAG	2	6	248412	248417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371833
4564	NC_004347	GTC	2	6	248491	248496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371833
4565	NC_004347	TGC	2	6	248579	248584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371833
4566	NC_004347	GAA	2	6	248597	248602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371833
4567	NC_004347	GGA	2	6	248614	248619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004347	CTCGT	2	10	248674	248683	0 %	40 %	20 %	40 %	24371834
4569	NC_004347	AAAG	2	8	248744	248751	75 %	0 %	25 %	0 %	24371834
4570	NC_004347	CCG	2	6	248752	248757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371834
4571	NC_004347	A	6	6	248766	248771	100 %	0 %	0 %	0 %	24371834
4572	NC_004347	TGA	2	6	248822	248827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371834
4573	NC_004347	GA	3	6	248958	248963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_004347	TGC	2	6	249230	249235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371835
4575	NC_004347	CTGG	2	8	249246	249253	0 %	25 %	50 %	25 %	24371835
4576	NC_004347	AGTT	2	8	249307	249314	25 %	50 %	25 %	0 %	24371835
4577	NC_004347	CG	3	6	249360	249365	0 %	0 %	50 %	50 %	24371835
4578	NC_004347	GC	3	6	249453	249458	0 %	0 %	50 %	50 %	24371835
4579	NC_004347	CA	3	6	249492	249497	50 %	0 %	0 %	50 %	24371835
4580	NC_004347	TGC	2	6	249598	249603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371835
4581	NC_004347	CAG	2	6	249624	249629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371835
4582	NC_004347	TGC	2	6	249672	249677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371836
4583	NC_004347	CGT	2	6	249818	249823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371836
4584	NC_004347	GTAAAG	2	12	249918	249929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24371836
4585	NC_004347	GCT	2	6	250028	250033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371836
4586	NC_004347	AGCG	2	8	250086	250093	25 %	0 %	50 %	25 %	24371837
4587	NC_004347	GAA	2	6	250114	250119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371837
4588	NC_004347	ACT	2	6	250131	250136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371837
4589	NC_004347	CTG	2	6	250141	250146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371837
4590	NC_004347	GACTCA	2	12	250191	250202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24371837
4591	NC_004347	GC	3	6	250231	250236	0 %	0 %	50 %	50 %	24371837
4592	NC_004347	ATT	2	6	250246	250251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371837
4593	NC_004347	CAA	2	6	250313	250318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371838
4594	NC_004347	GTC	2	6	250462	250467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371838
4595	NC_004347	AGT	2	6	250502	250507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371838
4596	NC_004347	GTTT	2	8	250563	250570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_004347	T	6	6	250568	250573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_004347	GTA	2	6	250672	250677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_004347	GCG	2	6	250738	250743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371839
4600	NC_004347	TCG	2	6	250784	250789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371839
4601	NC_004347	CAT	2	6	250808	250813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371839
4602	NC_004347	AAG	2	6	250828	250833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371839
4603	NC_004347	GAA	2	6	250853	250858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371839
4604	NC_004347	GGT	2	6	250877	250882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371839
4605	NC_004347	CGT	2	6	250905	250910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371839
4606	NC_004347	AAC	3	9	250959	250967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371839
4607	NC_004347	CGT	2	6	251093	251098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371840
4608	NC_004347	TTG	2	6	251181	251186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371840
4609	NC_004347	GGT	2	6	251243	251248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371840
4610	NC_004347	TTG	2	6	251250	251255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371840
4611	NC_004347	AGAA	2	8	251256	251263	75 %	0 %	25 %	0 %	24371840
4612	NC_004347	A	6	6	251348	251353	100 %	0 %	0 %	0 %	24371840
4613	NC_004347	TGT	2	6	251437	251442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371841
4614	NC_004347	A	6	6	251543	251548	100 %	0 %	0 %	0 %	24371841
4615	NC_004347	AGT	2	6	251599	251604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371841
4616	NC_004347	GCGT	2	8	251796	251803	0 %	25 %	50 %	25 %	24371841
4617	NC_004347	TGA	2	6	251890	251895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371841
4618	NC_004347	GC	3	6	252023	252028	0 %	0 %	50 %	50 %	24371842
4619	NC_004347	ATT	2	6	252042	252047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371842
4620	NC_004347	CTT	2	6	252058	252063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371842
4621	NC_004347	TGA	2	6	252065	252070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371842
4622	NC_004347	GTG	2	6	252223	252228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371842
4623	NC_004347	GCT	2	6	252339	252344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371843
4624	NC_004347	AGA	2	6	252407	252412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371843
4625	NC_004347	AAGCC	2	10	252445	252454	40 %	0 %	20 %	40 %	24371843
4626	NC_004347	TGA	2	6	252613	252618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371843
4627	NC_004347	GCC	2	6	252627	252632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371843
4628	NC_004347	CAA	2	6	252798	252803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371844
4629	NC_004347	TGT	2	6	252813	252818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371844
4630	NC_004347	TTCC	2	8	252841	252848	0 %	50 %	0 %	50 %	24371844
4631	NC_004347	ACA	2	6	252886	252891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371844
4632	NC_004347	ACA	2	6	252905	252910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371844
4633	NC_004347	GTT	2	6	252913	252918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371844
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4635	NC_004347	TCG	2	6	252980	252985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371844
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4637	NC_004347	GCT	2	6	253120	253125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371844
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4647	NC_004347	GCT	2	6	253538	253543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371845
4648	NC_004347	TGC	2	6	253552	253557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371845
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4650	NC_004347	AGT	2	6	253666	253671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371846
4651	NC_004347	AGT	2	6	253708	253713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371846
4652	NC_004347	CGGCTA	2	12	253735	253746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24371846
4653	NC_004347	GC	3	6	253754	253759	0 %	0 %	50 %	50 %	24371846
4654	NC_004347	CAG	2	6	253767	253772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371846
4655	NC_004347	CGT	2	6	253799	253804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371846
4656	NC_004347	GTTGA	2	10	253817	253826	20 %	40 %	40 %	0 %	24371846
4657	NC_004347	GTC	2	6	253857	253862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371846
4658	NC_004347	TAT	2	6	253909	253914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371846
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4662	NC_004347	CAA	2	6	254251	254256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371847
4663	NC_004347	CTA	2	6	254260	254265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371847
4664	NC_004347	GGA	2	6	254278	254283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371847
4665	NC_004347	GCGGTG	2	12	254415	254426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	24371848
4666	NC_004347	GGT	2	6	254444	254449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371848
4667	NC_004347	TCGCG	2	10	254492	254501	0 %	20 %	40 %	40 %	24371848
4668	NC_004347	TTA	2	6	254589	254594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371848
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4670	NC_004347	AAT	2	6	254721	254726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371848
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4676	NC_004347	A	7	7	255069	255075	100 %	0 %	0 %	0 %	24371849
4677	NC_004347	GTCG	2	8	255122	255129	0 %	25 %	50 %	25 %	24371849
4678	NC_004347	TTG	2	6	255196	255201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371849
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4680	NC_004347	TTG	3	9	255381	255389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371849
4681	NC_004347	CGT	2	6	255447	255452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371849
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4683	NC_004347	AAAT	2	8	255526	255533	75 %	25 %	0 %	0 %	24371849
4684	NC_004347	CCA	2	6	255549	255554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371849
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4687	NC_004347	GCA	2	6	255690	255695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371849
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4689	NC_004347	TTC	2	6	255702	255707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371849
4690	NC_004347	TCT	2	6	255712	255717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371849
4691	NC_004347	CAG	2	6	255748	255753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371849
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4694	NC_004347	TGA	2	6	255829	255834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371849
4695	NC_004347	ACT	2	6	255938	255943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371849
4696	NC_004347	ATG	2	6	255993	255998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371849
4697	NC_004347	TGA	2	6	256018	256023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371849
4698	NC_004347	TGA	2	6	256088	256093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4699	NC_004347	GAA	2	6	256115	256120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371850
4700	NC_004347	GAA	2	6	256494	256499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371851
4701	NC_004347	TAG	2	6	256513	256518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371851
4702	NC_004347	CGT	2	6	256530	256535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371851
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4704	NC_004347	TCG	2	6	256595	256600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371851
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4707	NC_004347	CGTA	2	8	256729	256736	25 %	25 %	25 %	25 %	24371852
4708	NC_004347	ATGGC	2	10	256749	256758	20 %	20 %	40 %	20 %	24371852
4709	NC_004347	CTT	2	6	256770	256775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371852
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4715	NC_004347	A	6	6	256933	256938	100 %	0 %	0 %	0 %	24371852
4716	NC_004347	GTCCAG	2	12	256959	256970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24371852
4717	NC_004347	GTC	2	6	257058	257063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371852
4718	NC_004347	CGT	2	6	257075	257080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371852
4719	NC_004347	CAAGCT	2	12	257138	257149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24371853
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4722	NC_004347	GT	3	6	257314	257319	0 %	50 %	50 %	0 %	24371853
4723	NC_004347	ACT	2	6	257338	257343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371853
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4726	NC_004347	ATG	2	6	257536	257541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371853
4727	NC_004347	GCT	2	6	257601	257606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371853
4728	NC_004347	TCG	2	6	257716	257721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371853
4729	NC_004347	TAAG	2	8	257732	257739	50 %	25 %	25 %	0 %	24371853
4730	NC_004347	AACA	2	8	257743	257750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4731	NC_004347	AG	3	6	257751	257756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4732	NC_004347	GTC	2	6	257906	257911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371854
4733	NC_004347	CAG	2	6	257966	257971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
4734	NC_004347	AAGG	2	8	257973	257980	50 %	0 %	50 %	0 %	24371854
4735	NC_004347	AAG	2	6	257986	257991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371854
4736	NC_004347	GCA	2	6	258096	258101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
4737	NC_004347	ATG	2	6	258112	258117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371854
4738	NC_004347	CGTGGT	2	12	258201	258212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24371854
4739	NC_004347	CAGA	2	8	258237	258244	50 %	0 %	25 %	25 %	24371854
4740	NC_004347	GAT	2	6	258249	258254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371854
4741	NC_004347	CTT	2	6	258283	258288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371854
4742	NC_004347	AGC	2	6	258323	258328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
4743	NC_004347	CGT	2	6	258411	258416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371854
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4745	NC_004347	AGA	2	6	258488	258493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371854
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4999	NC_004347	CGTC	2	8	272607	272614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5000	NC_004347	AAC	2	6	272626	272631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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