MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004337	ATGCC	2	10	194800	194809	20 %	20 %	20 %	40 %	56479621
4002	NC_004337	TTG	2	6	194877	194882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479621
4003	NC_004337	GTG	2	6	194893	194898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479621
4004	NC_004337	GTG	2	6	194976	194981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479621
4005	NC_004337	CGC	2	6	195000	195005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479621
4006	NC_004337	TGGA	2	8	195061	195068	25 %	25 %	50 %	0 %	56479621
4007	NC_004337	ACT	2	6	195104	195109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479621
4008	NC_004337	TGG	3	9	195157	195165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479621
4009	NC_004337	CTG	2	6	195240	195245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479621
4010	NC_004337	AG	3	6	195252	195257	50 %	0 %	50 %	0 %	56479621
4011	NC_004337	GCG	2	6	195306	195311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479621
4012	NC_004337	CAG	2	6	195378	195383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479621
4013	NC_004337	GGC	2	6	195407	195412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479621
4014	NC_004337	GTC	2	6	195515	195520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111618
4015	NC_004337	GC	3	6	195545	195550	0 %	0 %	50 %	50 %	24111618
4016	NC_004337	CG	3	6	195650	195655	0 %	0 %	50 %	50 %	24111618
4017	NC_004337	CGA	2	6	195670	195675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111618
4018	NC_004337	TTC	2	6	195684	195689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111618
4019	NC_004337	TTGA	2	8	195752	195759	25 %	50 %	25 %	0 %	24111618
4020	NC_004337	GGC	2	6	195877	195882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111618
4021	NC_004337	CAT	2	6	195980	195985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111618
4022	NC_004337	ACT	2	6	196110	196115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
4023	NC_004337	GAT	2	6	196117	196122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
4024	NC_004337	ACCGC	2	10	196139	196148	20 %	0 %	20 %	60 %	24111619
4025	NC_004337	A	6	6	196153	196158	100 %	0 %	0 %	0 %	24111619
4026	NC_004337	GGC	3	9	196159	196167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4027	NC_004337	TCG	2	6	196263	196268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4028	NC_004337	CTG	2	6	196295	196300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4029	NC_004337	TGA	2	6	196303	196308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
4030	NC_004337	GGC	2	6	196330	196335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4031	NC_004337	GCC	2	6	196400	196405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111619
4032	NC_004337	ATC	2	6	196412	196417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
4033	NC_004337	CTT	2	6	196457	196462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111619
4034	NC_004337	CGG	2	6	196465	196470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4035	NC_004337	GC	3	6	196512	196517	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
4036	NC_004337	GT	3	6	196528	196533	0 %	50 %	50 %	0 %	24111619
4037	NC_004337	GAA	2	6	196544	196549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4038	NC_004337	GAA	2	6	196601	196606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4039	NC_004337	CGG	2	6	196620	196625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4040	NC_004337	GC	3	6	196640	196645	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
4041	NC_004337	CGT	2	6	196654	196659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4042	NC_004337	CAG	2	6	196687	196692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4043	NC_004337	ACG	2	6	196728	196733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4044	NC_004337	CGA	2	6	196744	196749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4045	NC_004337	CGC	2	6	196773	196778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111619
4046	NC_004337	AT	3	6	196783	196788	50 %	50 %	0 %	0 %	24111619
4047	NC_004337	TG	3	6	196806	196811	0 %	50 %	50 %	0 %	24111619
4048	NC_004337	GTAAC	2	10	196869	196878	40 %	20 %	20 %	20 %	24111619
4049	NC_004337	AAG	2	6	196959	196964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4050	NC_004337	GAA	2	6	197003	197008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4051	NC_004337	CGC	2	6	197018	197023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111619
4052	NC_004337	TGG	2	6	197175	197180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
4053	NC_004337	CTG	2	6	197225	197230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4054	NC_004337	GGC	2	6	197377	197382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4055	NC_004337	CCCG	2	8	197458	197465	0 %	0 %	25 %	75 %	24111619
4056	NC_004337	AGCCG	2	10	197497	197506	20 %	0 %	40 %	40 %	24111619
4057	NC_004337	GAA	2	6	197534	197539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4058	NC_004337	GC	3	6	197561	197566	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
4059	NC_004337	GGTGG	2	10	197606	197615	0 %	20 %	80 %	0 %	24111619
4060	NC_004337	CAT	2	6	197758	197763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
4061	NC_004337	GAT	2	6	197779	197784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
4062	NC_004337	CAA	2	6	197785	197790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111619
4063	NC_004337	GCG	2	6	197791	197796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
4064	NC_004337	GAA	2	6	197800	197805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111619
4065	NC_004337	CGC	2	6	197827	197832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111619
4066	NC_004337	TGC	2	6	197865	197870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
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4069	NC_004337	TGG	2	6	197970	197975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
4070	NC_004337	TGG	2	6	198009	198014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
4071	NC_004337	GCA	2	6	198073	198078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
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4078	NC_004337	ACA	2	6	198444	198449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111619
4079	NC_004337	GGT	2	6	198457	198462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
4080	NC_004337	TGG	2	6	198468	198473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
4081	NC_004337	CCA	2	6	198506	198511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111619
4082	NC_004337	ACG	3	9	198546	198554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
4083	NC_004337	CAT	2	6	198613	198618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
4084	NC_004337	TAA	2	6	198628	198633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111619
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4087	NC_004337	CG	3	6	198752	198757	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
4088	NC_004337	TGA	2	6	198762	198767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
4089	NC_004337	GGT	2	6	198910	198915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
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4092	NC_004337	CG	3	6	199075	199080	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
4093	NC_004337	GGC	2	6	199140	199145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
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4095	NC_004337	TGA	2	6	199237	199242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
4096	NC_004337	TGA	2	6	199348	199353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
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4099	NC_004337	TC	3	6	199476	199481	0 %	50 %	0 %	50 %	24111619
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4103	NC_004337	TGA	2	6	199813	199818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
4104	NC_004337	CTGG	2	8	199829	199836	0 %	25 %	50 %	25 %	24111620
4105	NC_004337	TCG	2	6	199866	199871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
4106	NC_004337	GTC	2	6	199893	199898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
4107	NC_004337	TGA	2	6	199902	199907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
4108	NC_004337	TCA	2	6	199915	199920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
4109	NC_004337	A	6	6	199941	199946	100 %	0 %	0 %	0 %	24111620
4110	NC_004337	ATC	2	6	200033	200038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
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4122	NC_004337	TGA	2	6	200502	200507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
4123	NC_004337	T	6	6	200563	200568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004337	AAGG	2	8	200597	200604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_004337	AGG	2	6	200612	200617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004337	CAT	2	6	200628	200633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111621
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4130	NC_004337	TCA	2	6	200867	200872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111621
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4133	NC_004337	CGC	2	6	201008	201013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111621
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4137	NC_004337	T	6	6	201129	201134	0 %	100 %	0 %	0 %	24111621
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4238	NC_004337	A	6	6	206219	206224	100 %	0 %	0 %	0 %	24111628
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4369	NC_004337	ACCA	2	8	213156	213163	50 %	0 %	0 %	50 %	24111635
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4487	NC_004337	TAT	2	6	220312	220317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4492	NC_004337	GCT	2	6	220760	220765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111637
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4494	NC_004337	TGC	2	6	220841	220846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111637
4495	NC_004337	ACCA	2	8	220869	220876	50 %	0 %	0 %	50 %	24111637
4496	NC_004337	CT	3	6	220884	220889	0 %	50 %	0 %	50 %	24111637
4497	NC_004337	CTT	2	6	221080	221085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111637
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4499	NC_004337	A	6	6	221151	221156	100 %	0 %	0 %	0 %	24111637
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