MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004337	TGA	2	6	168417	168422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479616
3502	NC_004337	TGG	2	6	168470	168475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479616
3503	NC_004337	CGG	2	6	168504	168509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479616
3504	NC_004337	TGCGGT	2	12	168580	168591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56479616
3505	NC_004337	TGT	2	6	168612	168617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_004337	TCT	2	6	168646	168651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_004337	CT	3	6	168650	168655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_004337	GCC	2	6	168711	168716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3509	NC_004337	CAT	2	6	168746	168751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111595
3510	NC_004337	TAA	2	6	168783	168788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111595
3511	NC_004337	CCG	2	6	168807	168812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3512	NC_004337	ATA	2	6	168813	168818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111595
3513	NC_004337	CGC	2	6	168889	168894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3514	NC_004337	TGGC	2	8	169034	169041	0 %	25 %	50 %	25 %	24111595
3515	NC_004337	TGT	2	6	169348	169353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111596
3516	NC_004337	ATA	2	6	169363	169368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111596
3517	NC_004337	GGTCC	2	10	169460	169469	0 %	20 %	40 %	40 %	24111596
3518	NC_004337	T	6	6	169650	169655	0 %	100 %	0 %	0 %	24111596
3519	NC_004337	CAG	2	6	169698	169703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111596
3520	NC_004337	GGA	2	6	169954	169959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111596
3521	NC_004337	GCT	2	6	169971	169976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111596
3522	NC_004337	CGG	2	6	169997	170002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111596
3523	NC_004337	TGA	2	6	170036	170041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111596
3524	NC_004337	CG	3	6	170042	170047	0 %	0 %	50 %	50 %	24111596
3525	NC_004337	GCG	2	6	170050	170055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111596
3526	NC_004337	ACA	2	6	170237	170242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111597
3527	NC_004337	TGA	2	6	170352	170357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111597
3528	NC_004337	CGC	2	6	170364	170369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111597
3529	NC_004337	CGT	2	6	170511	170516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3530	NC_004337	TAA	2	6	170592	170597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111597
3531	NC_004337	CAG	2	6	170623	170628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3532	NC_004337	CCG	2	6	170720	170725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111597
3533	NC_004337	GCA	2	6	170760	170765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3534	NC_004337	CTT	3	9	170772	170780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111597
3535	NC_004337	ATG	2	6	170792	170797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111597
3536	NC_004337	GATT	2	8	170900	170907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_004337	A	8	8	170912	170919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_004337	TCG	2	6	170930	170935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_004337	ATC	2	6	171006	171011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_004337	TCG	2	6	171026	171031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_004337	CAA	2	6	171036	171041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_004337	GCC	2	6	171072	171077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_004337	CAG	2	6	171111	171116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_004337	TTG	2	6	171217	171222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_004337	CCG	2	6	171255	171260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_004337	AGC	2	6	171278	171283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_004337	AGCC	2	8	171330	171337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_004337	CTGA	2	8	171339	171346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_004337	GGC	2	6	171362	171367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_004337	ACGGG	2	10	171377	171386	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_004337	GAA	2	6	171387	171392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_004337	GCG	2	6	171407	171412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_004337	GTG	2	6	171539	171544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_004337	TTA	2	6	171593	171598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_004337	GAA	2	6	171606	171611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_004337	CGA	2	6	171692	171697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004337	TG	3	6	171708	171713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_004337	AGC	2	6	171757	171762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_004337	ATC	2	6	171766	171771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_004337	TGG	2	6	171820	171825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_004337	T	6	6	171885	171890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_004337	TAAA	2	8	171913	171920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004337	CTGC	2	8	171957	171964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_004337	ATT	2	6	171992	171997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_004337	TCT	2	6	172022	172027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_004337	TA	3	6	172033	172038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_004337	AGC	2	6	172081	172086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_004337	ATT	2	6	172118	172123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004337	TTA	2	6	172140	172145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_004337	ATT	2	6	172316	172321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_004337	GCC	2	6	172328	172333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_004337	TGC	2	6	172334	172339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_004337	GACC	2	8	172359	172366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_004337	GAA	2	6	172496	172501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_004337	A	8	8	172546	172553	100 %	0 %	0 %	0 %	24111599
3576	NC_004337	CT	3	6	172606	172611	0 %	50 %	0 %	50 %	24111599
3577	NC_004337	CGG	2	6	172616	172621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3578	NC_004337	CTT	2	6	172628	172633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111599
3579	NC_004337	CAG	2	6	172648	172653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
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3581	NC_004337	CAG	2	6	172759	172764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3582	NC_004337	TTC	2	6	172765	172770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111599
3583	NC_004337	TGA	2	6	172773	172778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111599
3584	NC_004337	G	6	6	172830	172835	0 %	0 %	100 %	0 %	24111599
3585	NC_004337	GGC	3	9	172849	172857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3586	NC_004337	TCA	2	6	172892	172897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111599
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3589	NC_004337	GTT	2	6	172936	172941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111599
3590	NC_004337	A	6	6	173053	173058	100 %	0 %	0 %	0 %	24111599
3591	NC_004337	GGT	2	6	173251	173256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111599
3592	NC_004337	CGG	2	6	173316	173321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3593	NC_004337	ATCGGT	2	12	173326	173337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24111599
3594	NC_004337	TGG	2	6	173381	173386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111599
3595	NC_004337	TAT	2	6	173418	173423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111599
3596	NC_004337	TCC	2	6	173509	173514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111599
3597	NC_004337	GTGAT	2	10	173540	173549	20 %	40 %	40 %	0 %	24111599
3598	NC_004337	CAG	2	6	173574	173579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3599	NC_004337	GCA	2	6	173621	173626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
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3603	NC_004337	AAC	2	6	173782	173787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111599
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3605	NC_004337	GTGAT	2	10	173831	173840	20 %	40 %	40 %	0 %	24111599
3606	NC_004337	CAG	2	6	173854	173859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
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3609	NC_004337	TACGT	2	10	174076	174085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3610	NC_004337	GGA	2	6	174113	174118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_004337	TGGC	3	12	174123	174134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_004337	CAT	2	6	174181	174186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_004337	GCG	2	6	174234	174239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_004337	GTC	2	6	174299	174304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_004337	ATG	2	6	174461	174466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_004337	TTG	2	6	174491	174496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_004337	GAA	2	6	174518	174523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_004337	TGA	2	6	174528	174533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_004337	GATC	2	8	174591	174598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_004337	TCAA	2	8	174599	174606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_004337	GTG	2	6	174613	174618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_004337	TTG	2	6	174623	174628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_004337	ACA	2	6	174675	174680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_004337	TAA	2	6	174711	174716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_004337	TGG	2	6	174719	174724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_004337	TGG	2	6	174746	174751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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