MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004337	ATG	2	6	145779	145784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111575
3002	NC_004337	CAG	2	6	145830	145835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111575
3003	NC_004337	AGG	2	6	145843	145848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111575
3004	NC_004337	TCT	2	6	145871	145876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111575
3005	NC_004337	TAA	2	6	145997	146002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004337	TGT	2	6	146055	146060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111576
3007	NC_004337	GGC	2	6	146086	146091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111576
3008	NC_004337	ATC	2	6	146161	146166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111576
3009	NC_004337	TTCA	2	8	146182	146189	25 %	50 %	0 %	25 %	24111576
3010	NC_004337	TAA	2	6	146208	146213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111576
3011	NC_004337	GTT	2	6	146295	146300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111576
3012	NC_004337	CCG	2	6	146301	146306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111576
3013	NC_004337	GC	3	6	146348	146353	0 %	0 %	50 %	50 %	24111576
3014	NC_004337	CGC	2	6	146499	146504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111576
3015	NC_004337	GTTT	2	8	146634	146641	0 %	75 %	25 %	0 %	24111576
3016	NC_004337	TCC	2	6	146654	146659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111576
3017	NC_004337	GAC	3	9	146728	146736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111576
3018	NC_004337	TCG	2	6	146759	146764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111576
3019	NC_004337	TAG	2	6	146799	146804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111576
3020	NC_004337	GGC	2	6	146838	146843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111576
3021	NC_004337	GCA	2	6	146856	146861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111576
3022	NC_004337	TTC	2	6	146913	146918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111577
3023	NC_004337	CG	3	6	146967	146972	0 %	0 %	50 %	50 %	24111577
3024	NC_004337	CCG	2	6	147022	147027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111577
3025	NC_004337	CGT	2	6	147041	147046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111577
3026	NC_004337	ACCAAT	2	12	147084	147095	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24111577
3027	NC_004337	CCAGCA	2	12	147152	147163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	24111577
3028	NC_004337	AGT	2	6	147202	147207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111577
3029	NC_004337	TCGC	2	8	147211	147218	0 %	25 %	25 %	50 %	24111577
3030	NC_004337	ACTG	2	8	147262	147269	25 %	25 %	25 %	25 %	24111577
3031	NC_004337	GCG	2	6	147391	147396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111577
3032	NC_004337	GCAG	2	8	147452	147459	25 %	0 %	50 %	25 %	24111577
3033	NC_004337	CGG	2	6	147479	147484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111577
3034	NC_004337	TCA	2	6	147586	147591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111577
3035	NC_004337	TGAAG	2	10	147664	147673	40 %	20 %	40 %	0 %	24111577
3036	NC_004337	TGG	2	6	147677	147682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111577
3037	NC_004337	ATG	2	6	147708	147713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004337	TGG	2	6	147744	147749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_004337	ACCGC	2	10	147769	147778	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3040	NC_004337	GAT	2	6	147781	147786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_004337	GCGGT	2	10	147788	147797	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_004337	TTA	2	6	147802	147807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_004337	TGG	2	6	147831	147836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_004337	TGT	2	6	147875	147880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_004337	CTC	2	6	147936	147941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_004337	TGT	2	6	147943	147948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_004337	TGC	2	6	148066	148071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_004337	TTG	2	6	148125	148130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_004337	TGC	2	6	148136	148141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_004337	ATG	2	6	148161	148166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_004337	TTCCAT	2	12	148191	148202	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_004337	TCCT	2	8	148209	148216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_004337	GTG	2	6	148234	148239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004337	A	6	6	148437	148442	100 %	0 %	0 %	0 %	24111579
3055	NC_004337	GTGAT	2	10	148483	148492	20 %	40 %	40 %	0 %	24111579
3056	NC_004337	GCTG	2	8	148549	148556	0 %	25 %	50 %	25 %	24111579
3057	NC_004337	GGA	2	6	148579	148584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111579
3058	NC_004337	TCT	2	6	148634	148639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111579
3059	NC_004337	CTG	2	6	148644	148649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111579
3060	NC_004337	TGGC	2	8	148682	148689	0 %	25 %	50 %	25 %	24111579
3061	NC_004337	AATCTG	2	12	148764	148775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24111579
3062	NC_004337	ACA	2	6	148778	148783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111579
3063	NC_004337	TAT	2	6	148933	148938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_004337	TTA	2	6	148969	148974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_004337	AG	3	6	148980	148985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004337	ATAA	2	8	149022	149029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004337	TGTA	2	8	149061	149068	25 %	50 %	25 %	0 %	24111580
3068	NC_004337	TTC	2	6	149149	149154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111580
3069	NC_004337	GCGT	2	8	149228	149235	0 %	25 %	50 %	25 %	24111580
3070	NC_004337	GGGC	2	8	149312	149319	0 %	0 %	75 %	25 %	24111580
3071	NC_004337	CGG	2	6	149336	149341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111580
3072	NC_004337	GAA	2	6	149395	149400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111580
3073	NC_004337	GCA	2	6	149446	149451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111580
3074	NC_004337	TGC	2	6	149480	149485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111580
3075	NC_004337	ACG	2	6	149522	149527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3076	NC_004337	GAC	2	6	149545	149550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3077	NC_004337	ACG	3	9	149555	149563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3078	NC_004337	TTC	2	6	149573	149578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915212
3079	NC_004337	TGG	2	6	149609	149614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915212
3080	NC_004337	CCA	2	6	149636	149641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915212
3081	NC_004337	CAG	2	6	149729	149734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3082	NC_004337	GAC	2	6	149755	149760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3083	NC_004337	GCAACT	2	12	149770	149781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344915212
3084	NC_004337	CGT	2	6	149801	149806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3085	NC_004337	CGT	2	6	149851	149856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3086	NC_004337	CGT	2	6	149875	149880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3087	NC_004337	TCT	2	6	149908	149913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915212
3088	NC_004337	CAG	2	6	149924	149929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3089	NC_004337	GGC	2	6	149945	149950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915212
3090	NC_004337	TTC	2	6	150003	150008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915212
3091	NC_004337	GAT	2	6	150094	150099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915212
3092	NC_004337	CA	3	6	150103	150108	50 %	0 %	0 %	50 %	344915212
3093	NC_004337	TTC	2	6	150158	150163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915212
3094	NC_004337	CAG	2	6	150191	150196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3095	NC_004337	GCGAG	2	10	150201	150210	20 %	0 %	60 %	20 %	344915212
3096	NC_004337	GGC	2	6	150254	150259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915212
3097	NC_004337	CG	3	6	150269	150274	0 %	0 %	50 %	50 %	344915212
3098	NC_004337	ACC	2	6	150356	150361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915212
3099	NC_004337	ACGG	2	8	150371	150378	25 %	0 %	50 %	25 %	344915212
3100	NC_004337	TCT	2	6	150435	150440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915212
3101	NC_004337	TGT	2	6	150457	150462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915212
3102	NC_004337	GCA	2	6	150466	150471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3103	NC_004337	GTG	2	6	150524	150529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915212
3104	NC_004337	GGC	2	6	150604	150609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915212
3105	NC_004337	GGCGT	2	10	150639	150648	0 %	20 %	60 %	20 %	344915212
3106	NC_004337	CGC	3	9	150700	150708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915212
3107	NC_004337	CCAG	2	8	150712	150719	25 %	0 %	25 %	50 %	344915212
3108	NC_004337	TTG	2	6	150735	150740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915212
3109	NC_004337	TGC	2	6	150795	150800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915212
3110	NC_004337	CAT	2	6	150927	150932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_004337	A	7	7	150940	150946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004337	CGG	2	6	151014	151019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915213
3113	NC_004337	CTGA	2	8	151041	151048	25 %	25 %	25 %	25 %	344915213
3114	NC_004337	CTGC	2	8	151086	151093	0 %	25 %	25 %	50 %	344915213
3115	NC_004337	ATCAG	2	10	151277	151286	40 %	20 %	20 %	20 %	344915213
3116	NC_004337	ATC	2	6	151321	151326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915213
3117	NC_004337	AAC	2	6	151352	151357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915213
3118	NC_004337	ATGA	2	8	151369	151376	50 %	25 %	25 %	0 %	344915213
3119	NC_004337	TCG	2	6	151400	151405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915213
3120	NC_004337	AAT	2	6	151411	151416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915213
3121	NC_004337	GCA	2	6	151422	151427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915213
3122	NC_004337	TGC	2	6	151451	151456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915213
3123	NC_004337	GCG	2	6	151472	151477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915213
3124	NC_004337	ATG	2	6	151489	151494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915213
3125	NC_004337	CGT	2	6	151512	151517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915213
3126	NC_004337	TAA	2	6	151562	151567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915213
3127	NC_004337	CGT	2	6	151611	151616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915213
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3132	NC_004337	TG	3	6	151847	151852	0 %	50 %	50 %	0 %	344915213
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3145	NC_004337	TTAC	2	8	152548	152555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3156	NC_004337	GT	3	6	153068	153073	0 %	50 %	50 %	0 %	24111584
3157	NC_004337	A	6	6	153206	153211	100 %	0 %	0 %	0 %	24111584
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3223	NC_004337	GGTT	2	8	156313	156320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_004337	TCTCCC	2	12	156322	156333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3226	NC_004337	TCACCC	2	12	156373	156384	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3229	NC_004337	AGA	2	6	156458	156463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_004337	CAAA	2	8	156564	156571	75 %	0 %	0 %	25 %	56479613
3231	NC_004337	CGT	3	9	156580	156588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479613
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3238	NC_004337	A	6	6	156773	156778	100 %	0 %	0 %	0 %	56479613
3239	NC_004337	GCT	2	6	156885	156890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479613
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3243	NC_004337	GTGC	2	8	157012	157019	0 %	25 %	50 %	25 %	56479613
3244	NC_004337	ATC	2	6	157040	157045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479613
3245	NC_004337	AAC	2	6	157069	157074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479613
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3248	NC_004337	GTTT	2	8	157145	157152	0 %	75 %	25 %	0 %	56479613
3249	NC_004337	TGG	2	6	157181	157186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479613
3250	NC_004337	AGA	2	6	157203	157208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479613
3251	NC_004337	ATG	2	6	157226	157231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479613
3252	NC_004337	AGCG	2	8	157345	157352	25 %	0 %	50 %	25 %	56479613
3253	NC_004337	CGAA	2	8	157370	157377	50 %	0 %	25 %	25 %	56479613
3254	NC_004337	CG	3	6	157401	157406	0 %	0 %	50 %	50 %	56479613
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3361	NC_004337	CTG	2	6	162497	162502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479615
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3363	NC_004337	AACCT	2	10	162609	162618	40 %	20 %	0 %	40 %	56479615
3364	NC_004337	CTG	2	6	162623	162628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479615
3365	NC_004337	CGT	2	6	162642	162647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479615
3366	NC_004337	TGGTC	2	10	162651	162660	0 %	40 %	40 %	20 %	56479615
3367	NC_004337	TCA	2	6	162677	162682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479615
3368	NC_004337	GCA	2	6	162840	162845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479615
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3370	NC_004337	CTG	2	6	162884	162889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479615
3371	NC_004337	ACG	2	6	162890	162895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479615
3372	NC_004337	CCG	2	6	163011	163016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479615
3373	NC_004337	ATCG	2	8	163022	163029	25 %	25 %	25 %	25 %	56479615
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3383	NC_004337	CAC	2	6	163554	163559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111591
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3442	NC_004337	ACG	2	6	165698	165703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111592
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3450	NC_004337	TGCC	2	8	165913	165920	0 %	25 %	25 %	50 %	24111592
3451	NC_004337	CGA	2	6	165928	165933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111592
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3455	NC_004337	TCG	2	6	166180	166185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111592
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3457	NC_004337	CGG	2	6	166300	166305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111592
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3462	NC_004337	CG	3	6	166800	166805	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
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3467	NC_004337	CTG	2	6	166973	166978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
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3476	NC_004337	CGC	2	6	167336	167341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111593
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3478	NC_004337	TATT	2	8	167414	167421	25 %	75 %	0 %	0 %	24111593
3479	NC_004337	TTGA	2	8	167473	167480	25 %	50 %	25 %	0 %	24111593
3480	NC_004337	TAT	2	6	167538	167543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111593
3481	NC_004337	TAA	2	6	167568	167573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111593
3482	NC_004337	TGC	2	6	167597	167602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3483	NC_004337	CGG	2	6	167613	167618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3484	NC_004337	G	6	6	167643	167648	0 %	0 %	100 %	0 %	24111593
3485	NC_004337	TG	3	6	167663	167668	0 %	50 %	50 %	0 %	24111593
3486	NC_004337	GCG	2	6	167702	167707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3487	NC_004337	TCG	2	6	167771	167776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3488	NC_004337	ACC	2	6	167788	167793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111593
3489	NC_004337	GC	3	6	167813	167818	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
3490	NC_004337	GGC	2	6	167955	167960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3491	NC_004337	CG	3	6	167968	167973	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
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3493	NC_004337	ATT	2	6	168037	168042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111593
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