MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004337	GCA	2	6	122316	122321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2502	NC_004337	GACTG	2	10	122331	122340	20 %	20 %	40 %	20 %	24111558
2503	NC_004337	GTG	2	6	122365	122370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111558
2504	NC_004337	GAA	2	6	122381	122386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111558
2505	NC_004337	GCGT	2	8	122530	122537	0 %	25 %	50 %	25 %	24111558
2506	NC_004337	GC	3	6	122728	122733	0 %	0 %	50 %	50 %	24111558
2507	NC_004337	AGAGC	2	10	122741	122750	40 %	0 %	40 %	20 %	24111558
2508	NC_004337	CT	3	6	122757	122762	0 %	50 %	0 %	50 %	24111558
2509	NC_004337	TCGT	2	8	122776	122783	0 %	50 %	25 %	25 %	24111558
2510	NC_004337	GAA	2	6	122801	122806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111558
2511	NC_004337	ATC	2	6	122835	122840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111558
2512	NC_004337	CGA	2	6	122843	122848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2513	NC_004337	CAG	2	6	122910	122915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2514	NC_004337	AGA	2	6	122954	122959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111558
2515	NC_004337	CTGG	2	8	123014	123021	0 %	25 %	50 %	25 %	24111558
2516	NC_004337	GCG	2	6	123024	123029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111558
2517	NC_004337	GAT	2	6	123056	123061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111558
2518	NC_004337	GGC	2	6	123119	123124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111558
2519	NC_004337	CGG	2	6	123155	123160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111558
2520	NC_004337	ACC	2	6	123174	123179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111558
2521	NC_004337	GCA	2	6	123197	123202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2522	NC_004337	GCTTAC	2	12	123264	123275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24111558
2523	NC_004337	TAC	3	9	123339	123347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111558
2524	NC_004337	GCT	2	6	123464	123469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2525	NC_004337	CCT	2	6	123559	123564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111558
2526	NC_004337	TGC	2	6	123610	123615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2527	NC_004337	CG	3	6	123631	123636	0 %	0 %	50 %	50 %	24111558
2528	NC_004337	TGA	2	6	123655	123660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111558
2529	NC_004337	ACG	2	6	123661	123666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2530	NC_004337	GAC	2	6	123735	123740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2531	NC_004337	CAC	2	6	123798	123803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111558
2532	NC_004337	CTT	2	6	123817	123822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111558
2533	NC_004337	GCG	2	6	123834	123839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111558
2534	NC_004337	AAT	2	6	123955	123960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111559
2535	NC_004337	TGA	2	6	123994	123999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111559
2536	NC_004337	CCG	2	6	124185	124190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111559
2537	NC_004337	GCA	2	6	124196	124201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2538	NC_004337	AGA	2	6	124222	124227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2539	NC_004337	GAA	2	6	124228	124233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2540	NC_004337	AGC	2	6	124237	124242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2541	NC_004337	GCA	3	9	124247	124255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2542	NC_004337	GCG	2	6	124265	124270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111559
2543	NC_004337	CGA	2	6	124303	124308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2544	NC_004337	CGG	2	6	124521	124526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111559
2545	NC_004337	CAG	2	6	124563	124568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
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2548	NC_004337	CGT	2	6	124726	124731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2549	NC_004337	GCA	2	6	124856	124861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2550	NC_004337	CCG	2	6	124945	124950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111559
2551	NC_004337	AAG	2	6	125043	125048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2552	NC_004337	AGC	2	6	125065	125070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2553	NC_004337	CGG	2	6	125073	125078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111559
2554	NC_004337	GGT	2	6	125087	125092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111559
2555	NC_004337	TGC	2	6	125103	125108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2556	NC_004337	GAA	2	6	125147	125152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2557	NC_004337	TGA	2	6	125208	125213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111559
2558	NC_004337	CAG	2	6	125273	125278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2559	NC_004337	GAA	2	6	125282	125287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2560	NC_004337	GCG	2	6	125288	125293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111559
2561	NC_004337	TCA	2	6	125331	125336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111559
2562	NC_004337	TGC	2	6	125347	125352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2563	NC_004337	GAA	2	6	125416	125421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111559
2564	NC_004337	GTT	2	6	125465	125470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111559
2565	NC_004337	CAA	2	6	125488	125493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111559
2566	NC_004337	CAT	2	6	125500	125505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111559
2567	NC_004337	TGA	2	6	125523	125528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111559
2568	NC_004337	CGG	2	6	125605	125610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111559
2569	NC_004337	TAC	2	6	125617	125622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111559
2570	NC_004337	TGC	2	6	125727	125732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111559
2571	NC_004337	TC	4	8	125738	125745	0 %	50 %	0 %	50 %	24111559
2572	NC_004337	ACC	2	6	125751	125756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111559
2573	NC_004337	CAT	2	6	125794	125799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111559
2574	NC_004337	AAC	2	6	125801	125806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111559
2575	NC_004337	GTAA	2	8	125836	125843	50 %	25 %	25 %	0 %	24111559
2576	NC_004337	CGGC	2	8	125858	125865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_004337	T	6	6	125866	125871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_004337	TTA	2	6	125898	125903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_004337	TGT	2	6	125929	125934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_004337	GGT	3	9	125983	125991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_004337	GCA	2	6	126029	126034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_004337	TAAG	2	8	126069	126076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_004337	CGC	2	6	126103	126108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_004337	GAC	2	6	126121	126126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_004337	CCG	2	6	126135	126140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_004337	AT	3	6	126148	126153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_004337	ATG	2	6	126161	126166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479605
2588	NC_004337	ACA	2	6	126276	126281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479605
2589	NC_004337	CTG	2	6	126329	126334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2590	NC_004337	GAA	2	6	126353	126358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479605
2591	NC_004337	GCTG	2	8	126367	126374	0 %	25 %	50 %	25 %	56479605
2592	NC_004337	ATCA	2	8	126443	126450	50 %	25 %	0 %	25 %	56479605
2593	NC_004337	GGT	2	6	126458	126463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479605
2594	NC_004337	CTGG	2	8	126464	126471	0 %	25 %	50 %	25 %	56479605
2595	NC_004337	CAAAGT	2	12	126487	126498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56479605
2596	NC_004337	AAG	2	6	126678	126683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479605
2597	NC_004337	CTG	2	6	126695	126700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2598	NC_004337	ATC	2	6	126716	126721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479605
2599	NC_004337	CCG	2	6	126879	126884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479605
2600	NC_004337	AGA	2	6	126895	126900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479605
2601	NC_004337	A	6	6	126926	126931	100 %	0 %	0 %	0 %	56479605
2602	NC_004337	ACG	2	6	126954	126959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2603	NC_004337	GAC	2	6	127031	127036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2604	NC_004337	TCG	2	6	127104	127109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2605	NC_004337	CA	3	6	127125	127130	50 %	0 %	0 %	50 %	56479605
2606	NC_004337	ACT	2	6	127182	127187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479605
2607	NC_004337	CTGA	2	8	127247	127254	25 %	25 %	25 %	25 %	56479605
2608	NC_004337	AAG	2	6	127257	127262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479605
2609	NC_004337	GCT	2	6	127307	127312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2610	NC_004337	GGT	2	6	127391	127396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479605
2611	NC_004337	TTG	2	6	127401	127406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479605
2612	NC_004337	CGG	2	6	127414	127419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479605
2613	NC_004337	GCT	2	6	127423	127428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479605
2614	NC_004337	GGC	2	6	127525	127530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479605
2615	NC_004337	GAA	3	9	127576	127584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479605
2616	NC_004337	A	6	6	127618	127623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_004337	CGC	2	6	127635	127640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_004337	T	7	7	127641	127647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_004337	TCT	2	6	127671	127676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_004337	AG	3	6	127689	127694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_004337	CTG	2	6	127706	127711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_004337	GGC	2	6	127766	127771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_004337	GTT	2	6	127802	127807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_004337	GGCG	2	8	127832	127839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2744	NC_004337	CAGCG	2	10	133090	133099	20 %	0 %	40 %	40 %	24111563
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2755	NC_004337	TCT	2	6	133841	133846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2774	NC_004337	TCG	2	6	134537	134542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111564
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2783	NC_004337	AATGCC	2	12	134887	134898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24111565
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3000	NC_004337	GGGA	2	8	145766	145773	25 %	0 %	75 %	0 %	24111575

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