MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004337	GCG	3	9	98104	98112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479599
2003	NC_004337	GGT	2	6	98158	98163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479599
2004	NC_004337	CAT	2	6	98190	98195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479599
2005	NC_004337	GCTG	2	8	98371	98378	0 %	25 %	50 %	25 %	24111535
2006	NC_004337	GGC	2	6	98568	98573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111535
2007	NC_004337	GGT	2	6	98589	98594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111535
2008	NC_004337	TGGC	2	8	98667	98674	0 %	25 %	50 %	25 %	24111535
2009	NC_004337	GTG	2	6	98730	98735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111535
2010	NC_004337	GCA	2	6	98777	98782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111535
2011	NC_004337	GT	3	6	98812	98817	0 %	50 %	50 %	0 %	24111535
2012	NC_004337	GTGG	2	8	98823	98830	0 %	25 %	75 %	0 %	24111535
2013	NC_004337	TGC	2	6	98873	98878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111535
2014	NC_004337	CAA	2	6	98928	98933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111535
2015	NC_004337	GCA	2	6	98969	98974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111535
2016	NC_004337	TGA	2	6	98993	98998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111535
2017	NC_004337	GGC	3	9	99002	99010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111535
2018	NC_004337	GTC	2	6	99027	99032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111535
2019	NC_004337	CGC	2	6	99068	99073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111535
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2021	NC_004337	AGC	2	6	99175	99180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111535
2022	NC_004337	GGT	2	6	99220	99225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111535
2023	NC_004337	TTA	2	6	99237	99242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111535
2024	NC_004337	CGAG	2	8	99287	99294	25 %	0 %	50 %	25 %	24111535
2025	NC_004337	AAG	2	6	99362	99367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_004337	GAAT	2	8	99381	99388	50 %	25 %	25 %	0 %	24111536
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2029	NC_004337	ATCAG	2	10	99513	99522	40 %	20 %	20 %	20 %	24111536
2030	NC_004337	GCA	2	6	99553	99558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111536
2031	NC_004337	CGA	2	6	99576	99581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111536
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2035	NC_004337	GCTG	2	8	99715	99722	0 %	25 %	50 %	25 %	24111536
2036	NC_004337	CGG	2	6	99838	99843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111536
2037	NC_004337	GCG	2	6	99854	99859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111536
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2039	NC_004337	TACC	2	8	99985	99992	25 %	25 %	0 %	50 %	24111536
2040	NC_004337	TTA	2	6	100023	100028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111536
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2043	NC_004337	CGTG	2	8	100153	100160	0 %	25 %	50 %	25 %	24111536
2044	NC_004337	AGA	2	6	100162	100167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111536
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2048	NC_004337	TGCGGT	2	12	100279	100290	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24111536
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2055	NC_004337	CG	3	6	100542	100547	0 %	0 %	50 %	50 %	24111536
2056	NC_004337	ATG	2	6	100554	100559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111536
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2063	NC_004337	AGT	2	6	101318	101323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111537
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2068	NC_004337	TGA	2	6	101504	101509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111537
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2087	NC_004337	GAAG	2	8	102336	102343	50 %	0 %	50 %	0 %	24111538
2088	NC_004337	CG	3	6	102354	102359	0 %	0 %	50 %	50 %	24111538
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2109	NC_004337	GCGCA	2	10	103609	103618	20 %	0 %	40 %	40 %	24111539
2110	NC_004337	GC	3	6	103675	103680	0 %	0 %	50 %	50 %	24111539
2111	NC_004337	TAT	2	6	103722	103727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111539
2112	NC_004337	CGG	2	6	103732	103737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111539
2113	NC_004337	CGA	2	6	103875	103880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_004337	GA	3	6	103913	103918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_004337	TCGGCG	2	12	103969	103980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479600
2116	NC_004337	GCG	4	12	103978	103989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479600
2117	NC_004337	TTC	2	6	104037	104042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479600
2118	NC_004337	GGCGCT	2	12	104127	104138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479600
2119	NC_004337	TGA	2	6	104165	104170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479600
2120	NC_004337	TGCG	2	8	104185	104192	0 %	25 %	50 %	25 %	56479600
2121	NC_004337	TGC	2	6	104222	104227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2122	NC_004337	GTG	2	6	104236	104241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479600
2123	NC_004337	GCA	2	6	104256	104261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2124	NC_004337	GTC	2	6	104265	104270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2125	NC_004337	GTC	2	6	104310	104315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2126	NC_004337	AAG	2	6	104340	104345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479600
2127	NC_004337	CT	3	6	104396	104401	0 %	50 %	0 %	50 %	56479600
2128	NC_004337	CTG	2	6	104424	104429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2129	NC_004337	CTG	2	6	104454	104459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2130	NC_004337	TGA	2	6	104536	104541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479600
2131	NC_004337	ATG	2	6	104592	104597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479600
2132	NC_004337	TGGCG	2	10	104603	104612	0 %	20 %	60 %	20 %	56479600
2133	NC_004337	GAA	2	6	104631	104636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479600
2134	NC_004337	GCT	2	6	104637	104642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
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2136	NC_004337	GCT	2	6	104663	104668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2137	NC_004337	GC	4	8	104689	104696	0 %	0 %	50 %	50 %	56479600
2138	NC_004337	CGG	2	6	104716	104721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479600
2139	NC_004337	GGTA	2	8	104753	104760	25 %	25 %	50 %	0 %	56479600
2140	NC_004337	ATGA	2	8	104826	104833	50 %	25 %	25 %	0 %	56479600
2141	NC_004337	GTT	2	6	104850	104855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479600
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2143	NC_004337	CAG	2	6	104940	104945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479600
2144	NC_004337	AGT	2	6	104990	104995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479600
2145	NC_004337	CGTA	2	8	105053	105060	25 %	25 %	25 %	25 %	56479600
2146	NC_004337	CCG	2	6	105121	105126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2147	NC_004337	ATA	2	6	105167	105172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2148	NC_004337	GAT	2	6	105174	105179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111541
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2152	NC_004337	TGC	2	6	105417	105422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111541
2153	NC_004337	CTG	2	6	105514	105519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111541
2154	NC_004337	CGA	2	6	105534	105539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111541
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2162	NC_004337	CT	3	6	106137	106142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2163	NC_004337	T	9	9	106163	106171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2164	NC_004337	A	6	6	106190	106195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_004337	TTA	2	6	106383	106388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344915209
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2172	NC_004337	TTA	2	6	106859	106864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_004337	TAT	2	6	106893	106898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111543
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2179	NC_004337	CTGC	2	8	107236	107243	0 %	25 %	25 %	50 %	24111543
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2231	NC_004337	A	6	6	109567	109572	100 %	0 %	0 %	0 %	24111543
2232	NC_004337	T	6	6	109642	109647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_004337	GGTA	2	8	109682	109689	25 %	25 %	50 %	0 %	24111544
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2247	NC_004337	GTTT	2	8	110548	110555	0 %	75 %	25 %	0 %	24111547
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2374	NC_004337	GGC	2	6	116902	116907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479602
2375	NC_004337	CAC	2	6	116974	116979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2376	NC_004337	TGT	2	6	116998	117003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111554
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2495	NC_004337	TGGGTC	2	12	121864	121875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24111558
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2497	NC_004337	GCTG	2	8	122136	122143	0 %	25 %	50 %	25 %	24111558
2498	NC_004337	CTG	2	6	122184	122189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111558
2499	NC_004337	TGA	2	6	122221	122226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111558
2500	NC_004337	CTT	2	6	122291	122296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111558

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