MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004337	TGG	2	6	47668	47673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111493
1002	NC_004337	TTG	2	6	47713	47718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111493
1003	NC_004337	TGC	2	6	47782	47787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111493
1004	NC_004337	CGATGG	2	12	47806	47817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24111493
1005	NC_004337	GGCG	2	8	47828	47835	0 %	0 %	75 %	25 %	24111493
1006	NC_004337	CTG	2	6	47838	47843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111493
1007	NC_004337	TGC	2	6	47983	47988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111493
1008	NC_004337	TCA	3	9	47998	48006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111493
1009	NC_004337	GTT	2	6	48077	48082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111493
1010	NC_004337	AGGGC	2	10	48083	48092	20 %	0 %	60 %	20 %	24111493
1011	NC_004337	GCG	2	6	48120	48125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111493
1012	NC_004337	GCA	2	6	48192	48197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111493
1013	NC_004337	CTG	2	6	48207	48212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111493
1014	NC_004337	TCT	2	6	48237	48242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111493
1015	NC_004337	GGA	2	6	48245	48250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111493
1016	NC_004337	GAA	2	6	48276	48281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111493
1017	NC_004337	CG	3	6	48286	48291	0 %	0 %	50 %	50 %	24111493
1018	NC_004337	TGG	2	6	48361	48366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111493
1019	NC_004337	GGAT	2	8	48442	48449	25 %	25 %	50 %	0 %	24111493
1020	NC_004337	GCG	2	6	48468	48473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111493
1021	NC_004337	AACC	2	8	48512	48519	50 %	0 %	0 %	50 %	24111493
1022	NC_004337	ATT	2	6	48564	48569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111493
1023	NC_004337	GCCCGC	2	12	48570	48581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111493
1024	NC_004337	CAGG	2	8	48609	48616	25 %	0 %	50 %	25 %	24111493
1025	NC_004337	CCG	2	6	48728	48733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111493
1026	NC_004337	TGG	2	6	48748	48753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111493
1027	NC_004337	CG	3	6	48789	48794	0 %	0 %	50 %	50 %	24111493
1028	NC_004337	ATC	2	6	48831	48836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111493
1029	NC_004337	TGGC	2	8	48875	48882	0 %	25 %	50 %	25 %	24111493
1030	NC_004337	AGA	2	6	48890	48895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111493
1031	NC_004337	GAAAC	2	10	48930	48939	60 %	0 %	20 %	20 %	24111493
1032	NC_004337	TAA	2	6	48948	48953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111493
1033	NC_004337	TGTT	2	8	48985	48992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004337	GCG	2	6	49009	49014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004337	CAG	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_004337	CAT	2	6	49066	49071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_004337	CGA	2	6	49084	49089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_004337	T	7	7	49120	49126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_004337	GCG	2	6	49156	49161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479590
1040	NC_004337	CCTG	2	8	49209	49216	0 %	25 %	25 %	50 %	56479590
1041	NC_004337	TAAA	2	8	49247	49254	75 %	25 %	0 %	0 %	56479590
1042	NC_004337	GCC	2	6	49268	49273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479590
1043	NC_004337	AATC	2	8	49283	49290	50 %	25 %	0 %	25 %	56479590
1044	NC_004337	GTC	2	6	49292	49297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479590
1045	NC_004337	CAG	2	6	49326	49331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479590
1046	NC_004337	GCG	2	6	49387	49392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479590
1047	NC_004337	GGC	2	6	49423	49428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479590
1048	NC_004337	ACG	2	6	49562	49567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479590
1049	NC_004337	GCG	2	6	49611	49616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479590
1050	NC_004337	CGC	3	9	49704	49712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111495
1051	NC_004337	GCAG	2	8	49772	49779	25 %	0 %	50 %	25 %	24111495
1052	NC_004337	ACCC	2	8	49787	49794	25 %	0 %	0 %	75 %	24111495
1053	NC_004337	CAG	3	9	49795	49803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1054	NC_004337	TTC	2	6	49881	49886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111495
1055	NC_004337	CTT	2	6	49934	49939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111495
1056	NC_004337	AAGA	2	8	50085	50092	75 %	0 %	25 %	0 %	24111495
1057	NC_004337	CG	4	8	50129	50136	0 %	0 %	50 %	50 %	24111495
1058	NC_004337	GCG	2	6	50165	50170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111495
1059	NC_004337	TCG	2	6	50206	50211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1060	NC_004337	GCA	2	6	50216	50221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1061	NC_004337	AGC	2	6	50245	50250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1062	NC_004337	TCG	2	6	50251	50256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1063	NC_004337	CAG	2	6	50271	50276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1064	NC_004337	CAG	2	6	50328	50333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1065	NC_004337	CG	4	8	50417	50424	0 %	0 %	50 %	50 %	24111495
1066	NC_004337	GCA	2	6	50480	50485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111495
1067	NC_004337	AAC	2	6	50504	50509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111495
1068	NC_004337	AATG	2	8	50549	50556	50 %	25 %	25 %	0 %	24111496
1069	NC_004337	GCCATT	2	12	50754	50765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24111496
1070	NC_004337	CAA	2	6	50787	50792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111496
1071	NC_004337	AACGT	2	10	50841	50850	40 %	20 %	20 %	20 %	24111496
1072	NC_004337	AC	3	6	50901	50906	50 %	0 %	0 %	50 %	24111496
1073	NC_004337	ATC	2	6	50920	50925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111496
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1076	NC_004337	ACG	2	6	51174	51179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111497
1077	NC_004337	GTG	3	9	51196	51204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111497
1078	NC_004337	CGG	2	6	51215	51220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111497
1079	NC_004337	CAC	2	6	51314	51319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111497
1080	NC_004337	CTG	2	6	51479	51484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111497
1081	NC_004337	GCC	2	6	51531	51536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111497
1082	NC_004337	GCC	2	6	51600	51605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111497
1083	NC_004337	TGG	2	6	51729	51734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111497
1084	NC_004337	ATT	2	6	51740	51745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111497
1085	NC_004337	TAA	2	6	51789	51794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111498
1086	NC_004337	CGGCGT	2	12	51954	51965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24111498
1087	NC_004337	GGCA	2	8	51997	52004	25 %	0 %	50 %	25 %	24111498
1088	NC_004337	TCG	2	6	52040	52045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111498
1089	NC_004337	AAT	2	6	52054	52059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111498
1090	NC_004337	CGT	2	6	52240	52245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111498
1091	NC_004337	TTC	2	6	52264	52269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111498
1092	NC_004337	CAT	2	6	52279	52284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111498
1093	NC_004337	CAC	2	6	52285	52290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111498
1094	NC_004337	T	6	6	52291	52296	0 %	100 %	0 %	0 %	24111498
1095	NC_004337	CGT	2	6	52350	52355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111498
1096	NC_004337	GCA	2	6	52391	52396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111498
1097	NC_004337	CCA	2	6	52440	52445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111498
1098	NC_004337	CGGT	2	8	52598	52605	0 %	25 %	50 %	25 %	24111498
1099	NC_004337	AAC	2	6	52627	52632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111498
1100	NC_004337	CGG	2	6	52689	52694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111498
1101	NC_004337	GTT	2	6	52769	52774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111499
1102	NC_004337	TGC	2	6	52788	52793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1103	NC_004337	TTC	2	6	52794	52799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111499
1104	NC_004337	TCA	2	6	52814	52819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111499
1105	NC_004337	CAG	2	6	52878	52883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1106	NC_004337	GCA	2	6	53053	53058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1107	NC_004337	CAG	2	6	53084	53089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1108	NC_004337	GTCA	2	8	53121	53128	25 %	25 %	25 %	25 %	24111499
1109	NC_004337	CAG	2	6	53145	53150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1110	NC_004337	CGC	2	6	53195	53200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111499
1111	NC_004337	CAA	2	6	53252	53257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111499
1112	NC_004337	TTC	2	6	53266	53271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111499
1113	NC_004337	CCCCA	2	10	53320	53329	20 %	0 %	0 %	80 %	24111499
1114	NC_004337	GCC	2	6	53334	53339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111499
1115	NC_004337	CTG	2	6	53349	53354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1116	NC_004337	GC	4	8	53419	53426	0 %	0 %	50 %	50 %	24111499
1117	NC_004337	CGT	2	6	53513	53518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1118	NC_004337	CTG	2	6	53532	53537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1119	NC_004337	CGA	2	6	53575	53580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111499
1120	NC_004337	GTT	2	6	53589	53594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111499
1121	NC_004337	ATC	2	6	53611	53616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111499
1122	NC_004337	TGT	2	6	53696	53701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111499
1123	NC_004337	GCT	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
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1127	NC_004337	GCT	2	6	53843	53848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111499
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1249	NC_004337	CCA	2	6	59738	59743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111503
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