MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004337	CGTT	2	8	540012	540019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11002	NC_004337	TTC	2	6	540033	540038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_004337	CCG	2	6	540104	540109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_004337	AGG	2	6	540112	540117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_004337	T	6	6	540170	540175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_004337	AAAT	2	8	540189	540196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_004337	T	6	6	540226	540231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_004337	AGC	2	6	540246	540251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_004337	AAT	2	6	540252	540257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004337	GCC	2	6	540338	540343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_004337	AGC	2	6	540374	540379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_004337	GCCT	2	8	540473	540480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_004337	TGA	2	6	540516	540521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_004337	TCG	2	6	540618	540623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_004337	GTT	2	6	540631	540636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_004337	TGGCGA	2	12	540646	540657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11017	NC_004337	ATC	3	9	540693	540701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_004337	GCC	2	6	540702	540707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_004337	CTGG	2	8	540766	540773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_004337	CGT	2	6	540887	540892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_004337	AG	3	6	541034	541039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_004337	GTT	2	6	541097	541102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111949
11023	NC_004337	CAC	2	6	541147	541152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111949
11024	NC_004337	AAG	2	6	541175	541180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111949
11025	NC_004337	TTC	2	6	541192	541197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111949
11026	NC_004337	TAA	2	6	541201	541206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111949
11027	NC_004337	CCG	2	6	541234	541239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111949
11028	NC_004337	CGA	2	6	541267	541272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111949
11029	NC_004337	A	7	7	541285	541291	100 %	0 %	0 %	0 %	24111949
11030	NC_004337	CAG	2	6	541420	541425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111950
11031	NC_004337	GACAG	2	10	541461	541470	40 %	0 %	40 %	20 %	24111950
11032	NC_004337	CTGG	2	8	541482	541489	0 %	25 %	50 %	25 %	24111950
11033	NC_004337	ACA	2	6	541545	541550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111950
11034	NC_004337	TGA	2	6	541577	541582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111950
11035	NC_004337	TGA	2	6	541695	541700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111950
11036	NC_004337	GGCT	2	8	541741	541748	0 %	25 %	50 %	25 %	24111950
11037	NC_004337	GTT	3	9	541759	541767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111950
11038	NC_004337	CTG	2	6	541840	541845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111950
11039	NC_004337	GGC	2	6	541856	541861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111950
11040	NC_004337	CAGT	2	8	541902	541909	25 %	25 %	25 %	25 %	24111950
11041	NC_004337	T	6	6	542007	542012	0 %	100 %	0 %	0 %	24111950
11042	NC_004337	GTT	2	6	542016	542021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111950
11043	NC_004337	GAA	2	6	542062	542067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111950
11044	NC_004337	TAT	2	6	542167	542172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111950
11045	NC_004337	T	7	7	542244	542250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_004337	GCA	2	6	542283	542288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_004337	GCC	2	6	542305	542310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_004337	CT	3	6	542425	542430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_004337	AATA	2	8	542520	542527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_004337	TAG	2	6	542539	542544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_004337	TA	3	6	542556	542561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_004337	ATT	2	6	542607	542612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111951
11053	NC_004337	AGA	2	6	542616	542621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111951
11054	NC_004337	TAT	2	6	542624	542629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111951
11055	NC_004337	GGT	2	6	542699	542704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111951
11056	NC_004337	ATTA	2	8	542757	542764	50 %	50 %	0 %	0 %	24111951
11057	NC_004337	GAAAT	2	10	542786	542795	60 %	20 %	20 %	0 %	24111951
11058	NC_004337	ATC	2	6	542835	542840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111951
11059	NC_004337	CTG	2	6	542846	542851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111951
11060	NC_004337	TTA	2	6	542926	542931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111951
11061	NC_004337	TTC	2	6	543039	543044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111951
11062	NC_004337	CTG	2	6	543053	543058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111951
11063	NC_004337	TAT	2	6	543125	543130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111951
11064	NC_004337	ATA	2	6	543160	543165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111951
11065	NC_004337	TTGT	2	8	543203	543210	0 %	75 %	25 %	0 %	24111951
11066	NC_004337	TGT	2	6	543258	543263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111951
11067	NC_004337	GAAT	2	8	543290	543297	50 %	25 %	25 %	0 %	24111951
11068	NC_004337	AT	3	6	543358	543363	50 %	50 %	0 %	0 %	24111951
11069	NC_004337	CAG	2	6	543371	543376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111951
11070	NC_004337	AAG	2	6	543420	543425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111951
11071	NC_004337	ACT	2	6	543467	543472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_004337	TTC	2	6	543486	543491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_004337	T	6	6	543516	543521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_004337	GTAT	2	8	543524	543531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_004337	T	7	7	543546	543552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_004337	T	6	6	543619	543624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_004337	CCAT	2	8	543656	543663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_004337	TATT	2	8	543675	543682	25 %	75 %	0 %	0 %	344915228
11079	NC_004337	ATAG	2	8	543758	543765	50 %	25 %	25 %	0 %	344915228
11080	NC_004337	TTG	2	6	543887	543892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915228
11081	NC_004337	GCT	2	6	543930	543935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915228
11082	NC_004337	CAAC	2	8	543964	543971	50 %	0 %	0 %	50 %	344915228
11083	NC_004337	GC	3	6	544010	544015	0 %	0 %	50 %	50 %	344915228
11084	NC_004337	CTG	2	6	544016	544021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915228
11085	NC_004337	T	6	6	544085	544090	0 %	100 %	0 %	0 %	344915228
11086	NC_004337	GAG	2	6	544097	544102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344915228
11087	NC_004337	GT	3	6	544171	544176	0 %	50 %	50 %	0 %	344915228
11088	NC_004337	TCC	2	6	544292	544297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344915228
11089	NC_004337	TGA	2	6	544315	544320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915228
11090	NC_004337	GAAG	2	8	544356	544363	50 %	0 %	50 %	0 %	344915228
11091	NC_004337	T	6	6	544410	544415	0 %	100 %	0 %	0 %	344915228
11092	NC_004337	TCAG	2	8	544434	544441	25 %	25 %	25 %	25 %	344915228
11093	NC_004337	GTT	2	6	544540	544545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_004337	GCAG	2	8	544573	544580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11095	NC_004337	CGC	2	6	544650	544655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_004337	GGA	2	6	544779	544784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_004337	TCT	4	12	544895	544906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111953
11098	NC_004337	ACTTT	2	10	544916	544925	20 %	60 %	0 %	20 %	24111953
11099	NC_004337	CCGA	2	8	544933	544940	25 %	0 %	25 %	50 %	24111953
11100	NC_004337	GAA	2	6	544966	544971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111953
11101	NC_004337	CAG	2	6	545040	545045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111953
11102	NC_004337	GAT	2	6	545076	545081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111953
11103	NC_004337	ACA	2	6	545117	545122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111953
11104	NC_004337	GTT	2	6	545161	545166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111953
11105	NC_004337	ATC	2	6	545179	545184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111953
11106	NC_004337	CTG	2	6	545233	545238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111953
11107	NC_004337	AGC	2	6	545250	545255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111953
11108	NC_004337	AAG	2	6	545303	545308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111953
11109	NC_004337	TGGT	2	8	545339	545346	0 %	50 %	50 %	0 %	24111953
11110	NC_004337	GCG	2	6	545380	545385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_004337	ACTT	2	8	545411	545418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_004337	TTC	2	6	545489	545494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_004337	TGC	2	6	545498	545503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_004337	TTC	2	6	545515	545520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_004337	ATG	2	6	545529	545534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_004337	ATG	3	9	545570	545578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111954
11117	NC_004337	ACTCA	2	10	545621	545630	40 %	20 %	0 %	40 %	24111954
11118	NC_004337	AGA	2	6	545758	545763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111954
11119	NC_004337	GGT	2	6	545891	545896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111954
11120	NC_004337	AAG	2	6	545907	545912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111954
11121	NC_004337	CTG	2	6	545921	545926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111954
11122	NC_004337	CT	3	6	545978	545983	0 %	50 %	0 %	50 %	24111954
11123	NC_004337	GTG	2	6	546002	546007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111954
11124	NC_004337	TGA	2	6	546021	546026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111954
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11126	NC_004337	AGA	2	6	546211	546216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111954
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11360	NC_004337	T	6	6	557920	557925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11361	NC_004337	TAAT	2	8	558001	558008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11497	NC_004337	CAG	2	6	565397	565402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
11498	NC_004337	TTCT	2	8	565450	565457	0 %	75 %	0 %	25 %	24111971
11499	NC_004337	GCA	2	6	565517	565522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
11500	NC_004337	AC	3	6	565550	565555	50 %	0 %	0 %	50 %	24111971

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