MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004337	GTGG	2	8	23839	23846	0 %	25 %	75 %	0 %	24111471
502	NC_004337	GGC	2	6	23889	23894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111471
503	NC_004337	ACG	2	6	23966	23971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111471
504	NC_004337	CTG	2	6	23975	23980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111471
505	NC_004337	CAG	2	6	23986	23991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111471
506	NC_004337	GCT	2	6	24053	24058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111471
507	NC_004337	CGGTGA	2	12	24132	24143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24111471
508	NC_004337	TGA	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111471
509	NC_004337	GCTG	2	8	24193	24200	0 %	25 %	50 %	25 %	24111472
510	NC_004337	TGG	2	6	24205	24210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111472
511	NC_004337	GCA	2	6	24235	24240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111472
512	NC_004337	TCC	2	6	24250	24255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111472
513	NC_004337	GCG	2	6	24327	24332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111472
514	NC_004337	GCG	2	6	24352	24357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111472
515	NC_004337	TGA	2	6	24415	24420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111472
516	NC_004337	ATT	2	6	24471	24476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111472
517	NC_004337	GGC	2	6	24477	24482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111472
518	NC_004337	GC	3	6	24481	24486	0 %	0 %	50 %	50 %	24111472
519	NC_004337	A	6	6	24645	24650	100 %	0 %	0 %	0 %	24111472
520	NC_004337	AAT	2	6	24652	24657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111472
521	NC_004337	CAA	2	6	24681	24686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004337	CCAT	2	8	24882	24889	25 %	25 %	0 %	50 %	24111473
523	NC_004337	CGG	2	6	24945	24950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111473
524	NC_004337	CGC	2	6	24989	24994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111473
525	NC_004337	GGT	2	6	25013	25018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111473
526	NC_004337	CAG	2	6	25040	25045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111473
527	NC_004337	GTT	2	6	25106	25111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111473
528	NC_004337	CGG	2	6	25123	25128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111473
529	NC_004337	TCG	2	6	25137	25142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111473
530	NC_004337	CGA	2	6	25312	25317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111474
531	NC_004337	CAC	2	6	25321	25326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111474
532	NC_004337	CAA	2	6	25342	25347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111474
533	NC_004337	CTG	2	6	25409	25414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111474
534	NC_004337	ACC	2	6	25436	25441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111474
535	NC_004337	GCG	2	6	25460	25465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111474
536	NC_004337	CCG	2	6	25504	25509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111474
537	NC_004337	ATGG	2	8	25565	25572	25 %	25 %	50 %	0 %	24111474
538	NC_004337	TTG	2	6	25768	25773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479587
539	NC_004337	AT	3	6	25803	25808	50 %	50 %	0 %	0 %	56479587
540	NC_004337	GTG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479587
541	NC_004337	GAA	2	6	26046	26051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479587
542	NC_004337	TG	3	6	26153	26158	0 %	50 %	50 %	0 %	56479587
543	NC_004337	TGG	2	6	26359	26364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479587
544	NC_004337	CTC	2	6	26378	26383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56479587
545	NC_004337	TTGA	2	8	26436	26443	25 %	50 %	25 %	0 %	56479587
546	NC_004337	TGG	2	6	26539	26544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479587
547	NC_004337	GCA	2	6	26552	26557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479587
548	NC_004337	GTG	3	9	26563	26571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479587
549	NC_004337	GAA	2	6	26595	26600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479587
550	NC_004337	AGC	2	6	26664	26669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004337	T	6	6	26706	26711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004337	GAA	2	6	26714	26719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004337	GCC	2	6	26780	26785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111476
554	NC_004337	TGA	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111476
555	NC_004337	CTG	2	6	26876	26881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111476
556	NC_004337	GCA	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111476
557	NC_004337	TGGC	2	8	26979	26986	0 %	25 %	50 %	25 %	24111476
558	NC_004337	TTG	2	6	26994	26999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111476
559	NC_004337	TGG	2	6	27081	27086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111476
560	NC_004337	TCG	2	6	27151	27156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111476
561	NC_004337	CTG	2	6	27177	27182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111476
562	NC_004337	CTGG	2	8	27439	27446	0 %	25 %	50 %	25 %	24111476
563	NC_004337	ACG	2	6	27518	27523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111476
564	NC_004337	GTGG	2	8	27604	27611	0 %	25 %	75 %	0 %	24111476
565	NC_004337	TCAT	2	8	27663	27670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_004337	TCCC	2	8	27693	27700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
567	NC_004337	TGGC	2	8	27734	27741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_004337	ATG	2	6	27808	27813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111477
569	NC_004337	G	6	6	27843	27848	0 %	0 %	100 %	0 %	24111477
570	NC_004337	GCC	2	6	27856	27861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111477
571	NC_004337	GGC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111477
572	NC_004337	GCG	2	6	27906	27911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111477
573	NC_004337	TCT	2	6	27927	27932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111477
574	NC_004337	GCTG	2	8	27956	27963	0 %	25 %	50 %	25 %	24111477
575	NC_004337	GAT	2	6	28014	28019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111477
576	NC_004337	GCA	2	6	28082	28087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111477
577	NC_004337	CGC	3	9	28151	28159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111477
578	NC_004337	GCC	2	6	28179	28184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111477
579	NC_004337	GCT	2	6	28217	28222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111477
580	NC_004337	AGC	2	6	28229	28234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111477
581	NC_004337	ATT	2	6	28266	28271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111477
582	NC_004337	CAT	2	6	28278	28283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111477
583	NC_004337	CGTG	2	8	28433	28440	0 %	25 %	50 %	25 %	24111477
584	NC_004337	AAT	2	6	28614	28619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111477
585	NC_004337	TAT	2	6	28638	28643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004337	ATTTA	2	10	28660	28669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004337	TCT	2	6	28759	28764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004337	TGT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004337	TCT	2	6	28835	28840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004337	TGC	2	6	28841	28846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_004337	GAT	2	6	28871	28876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004337	CATG	2	8	28903	28910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_004337	ATA	2	6	28920	28925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004337	A	6	6	28927	28932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004337	GCC	2	6	28975	28980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_004337	TCG	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_004337	TCA	2	6	29025	29030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_004337	AGTG	2	8	29053	29060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004337	CGG	2	6	29154	29159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479588
600	NC_004337	TCCT	2	8	29215	29222	0 %	50 %	0 %	50 %	56479588
601	NC_004337	CTTA	2	8	29243	29250	25 %	50 %	0 %	25 %	56479588
602	NC_004337	GAA	2	6	29288	29293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479588
603	NC_004337	TCT	2	6	29294	29299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479588
604	NC_004337	CT	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	56479588
605	NC_004337	GCG	2	6	29498	29503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479588
606	NC_004337	CG	3	6	29522	29527	0 %	0 %	50 %	50 %	56479588
607	NC_004337	ACC	2	6	29567	29572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479588
608	NC_004337	CGG	2	6	29614	29619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479588
609	NC_004337	A	6	6	29633	29638	100 %	0 %	0 %	0 %	56479588
610	NC_004337	CGT	2	6	29659	29664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479588
611	NC_004337	TGG	2	6	29706	29711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479588
612	NC_004337	TCA	2	6	29893	29898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479588
613	NC_004337	GCT	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479588
614	NC_004337	CAC	2	6	29948	29953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479588
615	NC_004337	GGC	2	6	29954	29959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479588
616	NC_004337	GTG	2	6	29990	29995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479588
617	NC_004337	CATCG	2	10	30101	30110	20 %	20 %	20 %	40 %	56479588
618	NC_004337	AGCC	2	8	30145	30152	25 %	0 %	25 %	50 %	56479588
619	NC_004337	ACG	2	6	30162	30167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479588
620	NC_004337	GTT	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479588
621	NC_004337	ACT	2	6	30326	30331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
622	NC_004337	GC	3	6	30335	30340	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
623	NC_004337	CAT	2	6	30405	30410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
624	NC_004337	GACC	2	8	30411	30418	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
625	NC_004337	ATT	2	6	30475	30480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111479
626	NC_004337	TGC	2	6	30503	30508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
627	NC_004337	GC	3	6	30539	30544	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
628	NC_004337	AGA	2	6	30624	30629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
629	NC_004337	CCG	2	6	30630	30635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111479
630	NC_004337	GAA	2	6	30654	30659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
631	NC_004337	CG	3	6	30675	30680	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
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