MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_004337	CCG	2	6	3177815	3177820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64502	NC_004337	CGCCC	2	10	3177832	3177841	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64503	NC_004337	GCA	2	6	3177881	3177886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64504	NC_004337	A	7	7	3177986	3177992	100 %	0 %	0 %	0 %	24114343
64505	NC_004337	TCGC	2	8	3178002	3178009	0 %	25 %	25 %	50 %	24114343
64506	NC_004337	A	7	7	3178064	3178070	100 %	0 %	0 %	0 %	24114343
64507	NC_004337	GCT	2	6	3178174	3178179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114343
64508	NC_004337	AGC	2	6	3178227	3178232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114343
64509	NC_004337	C	6	6	3178249	3178254	0 %	0 %	0 %	100 %	24114343
64510	NC_004337	ATC	2	6	3178354	3178359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64511	NC_004337	ATGA	2	8	3178366	3178373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64512	NC_004337	GAT	2	6	3178519	3178524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915321
64513	NC_004337	CA	3	6	3178561	3178566	50 %	0 %	0 %	50 %	344915321
64514	NC_004337	CAG	2	6	3178586	3178591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915321
64515	NC_004337	AGC	2	6	3178642	3178647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915321
64516	NC_004337	AGGA	2	8	3178680	3178687	50 %	0 %	50 %	0 %	344915321
64517	NC_004337	CTG	2	6	3178695	3178700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915321
64518	NC_004337	GCC	2	6	3178703	3178708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915321
64519	NC_004337	GTT	2	6	3178718	3178723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915321
64520	NC_004337	TGC	2	6	3178738	3178743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915321
64521	NC_004337	CTC	2	6	3178805	3178810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344915321
64522	NC_004337	AAG	2	6	3178812	3178817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915321
64523	NC_004337	A	6	6	3178837	3178842	100 %	0 %	0 %	0 %	344915321
64524	NC_004337	TGGA	2	8	3178954	3178961	25 %	25 %	50 %	0 %	24114345
64525	NC_004337	GCC	2	6	3178964	3178969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114345
64526	NC_004337	GTC	2	6	3178973	3178978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64527	NC_004337	TGA	2	6	3178983	3178988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114345
64528	NC_004337	TCG	2	6	3179046	3179051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64529	NC_004337	GCT	2	6	3179061	3179066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64530	NC_004337	CTG	2	6	3179162	3179167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64531	NC_004337	GAAA	2	8	3179208	3179215	75 %	0 %	25 %	0 %	24114345
64532	NC_004337	CTG	2	6	3179250	3179255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64533	NC_004337	GA	4	8	3179264	3179271	50 %	0 %	50 %	0 %	24114345
64534	NC_004337	CTG	2	6	3179295	3179300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64535	NC_004337	GCACT	2	10	3179311	3179320	20 %	20 %	20 %	40 %	24114345
64536	NC_004337	CGG	2	6	3179334	3179339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114345
64537	NC_004337	CGC	2	6	3179386	3179391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114345
64538	NC_004337	CGT	2	6	3179408	3179413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64539	NC_004337	AGTGG	2	10	3179418	3179427	20 %	20 %	60 %	0 %	24114345
64540	NC_004337	GAA	2	6	3179499	3179504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114345
64541	NC_004337	CGG	2	6	3179507	3179512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114345
64542	NC_004337	AG	3	6	3179541	3179546	50 %	0 %	50 %	0 %	24114345
64543	NC_004337	GCA	2	6	3179608	3179613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114345
64544	NC_004337	TCGC	2	8	3179676	3179683	0 %	25 %	25 %	50 %	24114345
64545	NC_004337	TGC	2	6	3179695	3179700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64546	NC_004337	ATG	2	6	3179720	3179725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64547	NC_004337	TTCCAT	2	12	3179750	3179761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	24114346
64548	NC_004337	TCCT	2	8	3179768	3179775	0 %	50 %	0 %	50 %	24114346
64549	NC_004337	GTG	2	6	3179793	3179798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114346
64550	NC_004337	A	6	6	3179996	3180001	100 %	0 %	0 %	0 %	24114346
64551	NC_004337	GTGAT	2	10	3180042	3180051	20 %	40 %	40 %	0 %	24114347
64552	NC_004337	GCTG	2	8	3180108	3180115	0 %	25 %	50 %	25 %	24114347
64553	NC_004337	GGA	2	6	3180138	3180143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24114347
64554	NC_004337	TCT	2	6	3180193	3180198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114347
64555	NC_004337	CTG	2	6	3180203	3180208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114347
64556	NC_004337	TGGC	2	8	3180241	3180248	0 %	25 %	50 %	25 %	24114347
64557	NC_004337	AATCTG	2	12	3180323	3180334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24114347
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64559	NC_004337	GAT	2	6	3180466	3180471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114348
64560	NC_004337	TGA	2	6	3180540	3180545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114348
64561	NC_004337	TGA	2	6	3180552	3180557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114348
64562	NC_004337	CGA	2	6	3180636	3180641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114348
64563	NC_004337	GAAGGG	2	12	3180642	3180653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24114348
64564	NC_004337	CAGT	2	8	3180713	3180720	25 %	25 %	25 %	25 %	24114348
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64567	NC_004337	TGT	2	6	3181017	3181022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64568	NC_004337	CT	3	6	3181132	3181137	0 %	50 %	0 %	50 %	56480247
64569	NC_004337	CAT	2	6	3181144	3181149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480247
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64571	NC_004337	ATT	2	6	3181285	3181290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56480247
64572	NC_004337	TCC	2	6	3181322	3181327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64573	NC_004337	AT	3	6	3181416	3181421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64574	NC_004337	A	6	6	3181452	3181457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64575	NC_004337	TTA	3	9	3181501	3181509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64578	NC_004337	TTCCAT	2	12	3181641	3181652	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64579	NC_004337	TCCT	2	8	3181659	3181666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64580	NC_004337	GTG	2	6	3181684	3181689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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64582	NC_004337	GCTG	2	8	3181999	3182006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64583	NC_004337	GGA	2	6	3182029	3182034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64584	NC_004337	TCT	2	6	3182084	3182089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64585	NC_004337	CTG	2	6	3182094	3182099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64586	NC_004337	TGGC	2	8	3182132	3182139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64587	NC_004337	AATCTG	2	12	3182214	3182225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64588	NC_004337	ACA	2	6	3182228	3182233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64589	NC_004337	AAC	2	6	3182350	3182355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64590	NC_004337	AAG	2	6	3182356	3182361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64591	NC_004337	GAGCAG	2	12	3182376	3182387	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64592	NC_004337	CGT	3	9	3182445	3182453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64593	NC_004337	AGCAG	2	10	3182456	3182465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64594	NC_004337	CAG	3	9	3182577	3182585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64595	NC_004337	ATCG	2	8	3182612	3182619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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64601	NC_004337	GAAGCA	2	12	3182895	3182906	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64602	NC_004337	TGA	2	6	3182942	3182947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64603	NC_004337	TTG	2	6	3182976	3182981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64604	NC_004337	ATT	2	6	3183045	3183050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64605	NC_004337	G	6	6	3183107	3183112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64606	NC_004337	CT	4	8	3183145	3183152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64607	NC_004337	CA	3	6	3183158	3183163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64608	NC_004337	GGC	2	6	3183218	3183223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64609	NC_004337	CAA	2	6	3183244	3183249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64610	NC_004337	AAAT	2	8	3183270	3183277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64611	NC_004337	T	6	6	3183316	3183321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64612	NC_004337	TCA	2	6	3183433	3183438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64613	NC_004337	ATG	2	6	3183514	3183519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64614	NC_004337	TCA	2	6	3183527	3183532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64615	NC_004337	TGT	2	6	3183542	3183547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64616	NC_004337	TTA	2	6	3183567	3183572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64617	NC_004337	G	6	6	3183586	3183591	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64618	NC_004337	TCC	2	6	3183597	3183602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64619	NC_004337	CTTTA	2	10	3183616	3183625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64620	NC_004337	A	8	8	3183631	3183638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64622	NC_004337	T	6	6	3183692	3183697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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