MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004337	CCA	2	6	296734	296739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111719
6002	NC_004337	CCA	2	6	296743	296748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111719
6003	NC_004337	TGT	2	6	296808	296813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111719
6004	NC_004337	TCCGCC	2	12	296862	296873	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	24111719
6005	NC_004337	CAC	2	6	296957	296962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111719
6006	NC_004337	TGG	2	6	297021	297026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111719
6007	NC_004337	CGC	3	9	297077	297085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111719
6008	NC_004337	AGC	2	6	297093	297098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111719
6009	NC_004337	AGGGA	2	10	297099	297108	40 %	0 %	60 %	0 %	24111719
6010	NC_004337	CCA	2	6	297115	297120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111719
6011	NC_004337	TCA	2	6	297136	297141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111719
6012	NC_004337	GGC	2	6	297158	297163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111719
6013	NC_004337	CGC	3	9	297202	297210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111719
6014	NC_004337	ATC	3	9	297228	297236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111719
6015	NC_004337	TGCGCC	2	12	297327	297338	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24111719
6016	NC_004337	GAC	2	6	297449	297454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111719
6017	NC_004337	CGC	2	6	297506	297511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479639
6018	NC_004337	GGT	2	6	297537	297542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479639
6019	NC_004337	TAAA	2	8	297556	297563	75 %	25 %	0 %	0 %	56479639
6020	NC_004337	A	6	6	297621	297626	100 %	0 %	0 %	0 %	56479639
6021	NC_004337	GCT	2	6	297653	297658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479639
6022	NC_004337	GAA	3	9	297659	297667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479639
6023	NC_004337	TGGAGA	2	12	297742	297753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	56479639
6024	NC_004337	GAC	2	6	297786	297791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479639
6025	NC_004337	GC	3	6	297820	297825	0 %	0 %	50 %	50 %	56479639
6026	NC_004337	TGG	2	6	297853	297858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479639
6027	NC_004337	ATT	3	9	297894	297902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479639
6028	NC_004337	CGATG	2	10	297914	297923	20 %	20 %	40 %	20 %	56479639
6029	NC_004337	ACA	2	6	297943	297948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479639
6030	NC_004337	CG	3	6	297969	297974	0 %	0 %	50 %	50 %	56479639
6031	NC_004337	TCG	2	6	297983	297988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479639
6032	NC_004337	TGC	2	6	298054	298059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479639
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6034	NC_004337	GTG	2	6	298170	298175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479639
6035	NC_004337	AGC	2	6	298201	298206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479639
6036	NC_004337	TCAT	2	8	298313	298320	25 %	50 %	0 %	25 %	24111721
6037	NC_004337	CTATTG	2	12	298385	298396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	24111721
6038	NC_004337	G	6	6	298415	298420	0 %	0 %	100 %	0 %	24111721
6039	NC_004337	CG	3	6	298443	298448	0 %	0 %	50 %	50 %	24111721
6040	NC_004337	CGTA	2	8	298458	298465	25 %	25 %	25 %	25 %	24111721
6041	NC_004337	AAG	2	6	298541	298546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111721
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6043	NC_004337	A	6	6	298838	298843	100 %	0 %	0 %	0 %	24111721
6044	NC_004337	CGG	2	6	298865	298870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111721
6045	NC_004337	TCA	2	6	299061	299066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111721
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6048	NC_004337	ACC	2	6	299194	299199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111721
6049	NC_004337	CG	3	6	299247	299252	0 %	0 %	50 %	50 %	24111721
6050	NC_004337	CGC	2	6	299269	299274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111721
6051	NC_004337	GGCG	2	8	299275	299282	0 %	0 %	75 %	25 %	24111721
6052	NC_004337	TGG	2	6	299294	299299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111721
6053	NC_004337	ATG	2	6	299355	299360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111721
6054	NC_004337	TAT	2	6	299366	299371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004337	ATT	2	6	299388	299393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_004337	TTCT	2	8	299498	299505	0 %	75 %	0 %	25 %	24111722
6057	NC_004337	AAT	2	6	299506	299511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111722
6058	NC_004337	TGCT	2	8	299564	299571	0 %	50 %	25 %	25 %	24111722
6059	NC_004337	GC	3	6	299599	299604	0 %	0 %	50 %	50 %	24111722
6060	NC_004337	TGC	2	6	299616	299621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111722
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6062	NC_004337	GAT	3	9	299674	299682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111722
6063	NC_004337	CAAAA	2	10	299717	299726	80 %	0 %	0 %	20 %	24111723
6064	NC_004337	CAG	2	6	299746	299751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111723
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6083	NC_004337	AGC	3	9	300496	300504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111724
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6087	NC_004337	T	7	7	300695	300701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_004337	T	6	6	300732	300737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004337	AAT	2	6	300751	300756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_004337	GCTG	2	8	301140	301147	0 %	25 %	50 %	25 %	56479640
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6106	NC_004337	TGA	2	6	301564	301569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479640
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6108	NC_004337	AAC	2	6	301776	301781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479640
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6110	NC_004337	GTG	2	6	301826	301831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479640
6111	NC_004337	ATTA	2	8	301851	301858	50 %	50 %	0 %	0 %	56479640
6112	NC_004337	CG	3	6	301866	301871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_004337	A	6	6	301909	301914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_004337	GAT	2	6	301916	301921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_004337	CTC	2	6	301934	301939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_004337	GAA	2	6	301953	301958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_004337	TGT	2	6	301959	301964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_004337	AAG	2	6	301999	302004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_004337	GAAACA	2	12	302037	302048	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6120	NC_004337	TGA	2	6	302216	302221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_004337	TCG	2	6	302262	302267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_004337	CGG	2	6	302302	302307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_004337	TCAG	2	8	302348	302355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_004337	CAGC	2	8	302360	302367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_004337	CAG	2	6	302415	302420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_004337	GCG	2	6	302453	302458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_004337	CGA	2	6	302493	302498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_004337	GCA	2	6	302572	302577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6135	NC_004337	GCCA	2	8	302885	302892	25 %	0 %	25 %	50 %	24111727
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6241	NC_004337	TGG	2	6	308737	308742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479642
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6248	NC_004337	TGCG	2	8	309079	309086	0 %	25 %	50 %	25 %	56479642
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