MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_004337	TA	3	6	3151937	3151942	50 %	50 %	0 %	0 %	56480238
64002	NC_004337	GCC	2	6	3151947	3151952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480238
64003	NC_004337	AGG	2	6	3152052	3152057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64004	NC_004337	TTA	2	6	3152079	3152084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64005	NC_004337	GCAA	2	8	3152131	3152138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64006	NC_004337	CCG	2	6	3152202	3152207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915319
64007	NC_004337	GAA	2	6	3152222	3152227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915319
64008	NC_004337	AGA	2	6	3152266	3152271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915319
64009	NC_004337	TCA	2	6	3152277	3152282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915319
64010	NC_004337	ACG	2	6	3152298	3152303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915319
64011	NC_004337	A	6	6	3152342	3152347	100 %	0 %	0 %	0 %	344915319
64012	NC_004337	TGAT	2	8	3152505	3152512	25 %	50 %	25 %	0 %	344915319
64013	NC_004337	CAA	2	6	3152564	3152569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915319
64014	NC_004337	AC	3	6	3152594	3152599	50 %	0 %	0 %	50 %	344915319
64015	NC_004337	AGG	2	6	3152635	3152640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344915319
64016	NC_004337	TGG	2	6	3152739	3152744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915319
64017	NC_004337	CGG	2	6	3152881	3152886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915319
64018	NC_004337	CCCG	2	8	3152962	3152969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64019	NC_004337	CAT	3	9	3153009	3153017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64020	NC_004337	AAC	2	6	3153041	3153046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64021	NC_004337	ATA	2	6	3153096	3153101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480240
64022	NC_004337	AGC	2	6	3153113	3153118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480240
64023	NC_004337	CCT	2	6	3153147	3153152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56480240
64024	NC_004337	AACA	2	8	3153166	3153173	75 %	0 %	0 %	25 %	56480240
64025	NC_004337	TGGC	2	8	3153311	3153318	0 %	25 %	50 %	25 %	56480240
64026	NC_004337	ATGCCG	2	12	3153403	3153414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56480240
64027	NC_004337	GAT	2	6	3153438	3153443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480240
64028	NC_004337	AAAGA	2	10	3153444	3153453	80 %	0 %	20 %	0 %	56480240
64029	NC_004337	CA	3	6	3153455	3153460	50 %	0 %	0 %	50 %	56480240
64030	NC_004337	TGG	2	6	3153472	3153477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480240
64031	NC_004337	TGA	2	6	3153500	3153505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480240
64032	NC_004337	A	6	6	3153556	3153561	100 %	0 %	0 %	0 %	56480240
64033	NC_004337	AGAA	2	8	3153586	3153593	75 %	0 %	25 %	0 %	56480240
64034	NC_004337	TTG	2	6	3153607	3153612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480240
64035	NC_004337	GTGG	2	8	3153656	3153663	0 %	25 %	75 %	0 %	56480240
64036	NC_004337	ACC	2	6	3153705	3153710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480240
64037	NC_004337	AAT	2	6	3153723	3153728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480240
64038	NC_004337	ATTT	2	8	3153758	3153765	25 %	75 %	0 %	0 %	56480240
64039	NC_004337	TGA	2	6	3153812	3153817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480240
64040	NC_004337	CCG	2	6	3153838	3153843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480240
64041	NC_004337	CCGC	2	8	3153847	3153854	0 %	0 %	25 %	75 %	56480240
64042	NC_004337	CAA	2	6	3153884	3153889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480240
64043	NC_004337	AAGAGC	2	12	3153892	3153903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56480240
64044	NC_004337	GCG	2	6	3153914	3153919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480240
64045	NC_004337	CCG	2	6	3153994	3153999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480240
64046	NC_004337	AATA	2	8	3154045	3154052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64047	NC_004337	TGT	2	6	3154093	3154098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114320
64048	NC_004337	TGCT	2	8	3154109	3154116	0 %	50 %	25 %	25 %	24114320
64049	NC_004337	TCAA	2	8	3154143	3154150	50 %	25 %	0 %	25 %	24114320
64050	NC_004337	TGC	2	6	3154231	3154236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114320
64051	NC_004337	GCT	2	6	3154299	3154304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114320
64052	NC_004337	A	7	7	3154326	3154332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64053	NC_004337	GCA	2	6	3154339	3154344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64054	NC_004337	T	8	8	3154361	3154368	0 %	100 %	0 %	0 %	532141291
64055	NC_004337	CCG	2	6	3154378	3154383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141291
64056	NC_004337	TTC	2	6	3154395	3154400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532141291
64057	NC_004337	GAC	2	6	3154431	3154436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64058	NC_004337	T	7	7	3154439	3154445	0 %	100 %	0 %	0 %	532141291
64059	NC_004337	CGA	2	6	3154521	3154526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64060	NC_004337	CAA	2	6	3154655	3154660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532141291
64061	NC_004337	ACG	2	6	3154673	3154678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64062	NC_004337	T	6	6	3154739	3154744	0 %	100 %	0 %	0 %	532141291
64063	NC_004337	TGG	2	6	3154759	3154764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532141291
64064	NC_004337	GCG	2	6	3154777	3154782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141291
64065	NC_004337	TCA	2	6	3154857	3154862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141291
64066	NC_004337	CCTG	2	8	3154914	3154921	0 %	25 %	25 %	50 %	532141291
64067	NC_004337	TCA	2	6	3154978	3154983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141291
64068	NC_004337	CTT	2	6	3154999	3155004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532141291
64069	NC_004337	CCG	2	6	3155034	3155039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141291
64070	NC_004337	T	7	7	3155119	3155125	0 %	100 %	0 %	0 %	532141291
64071	NC_004337	TCG	2	6	3155164	3155169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64072	NC_004337	AAT	2	6	3155378	3155383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532141291
64073	NC_004337	AGAA	2	8	3155410	3155417	75 %	0 %	25 %	0 %	532141291
64074	NC_004337	GCC	2	6	3155420	3155425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141291
64075	NC_004337	AGC	2	6	3155428	3155433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
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64077	NC_004337	GTG	2	6	3155639	3155644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532141291
64078	NC_004337	GCA	2	6	3155704	3155709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64079	NC_004337	T	6	6	3155719	3155724	0 %	100 %	0 %	0 %	532141291
64080	NC_004337	CCAG	2	8	3155885	3155892	25 %	0 %	25 %	50 %	532141291
64081	NC_004337	CCA	2	6	3155980	3155985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532141291
64082	NC_004337	GAACG	2	10	3156037	3156046	40 %	0 %	40 %	20 %	532141291
64083	NC_004337	CCG	2	6	3156105	3156110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141291
64084	NC_004337	CAT	3	9	3156211	3156219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141291
64085	NC_004337	CGG	2	6	3156235	3156240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141291
64086	NC_004337	ATC	2	6	3156252	3156257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141291
64087	NC_004337	CAG	2	6	3156271	3156276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64088	NC_004337	A	6	6	3156284	3156289	100 %	0 %	0 %	0 %	532141291
64089	NC_004337	GTC	2	6	3156317	3156322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64090	NC_004337	TGC	2	6	3156325	3156330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141291
64091	NC_004337	GAT	2	6	3156347	3156352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141291
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64094	NC_004337	A	7	7	3156605	3156611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64095	NC_004337	CTC	2	6	3156676	3156681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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64097	NC_004337	CG	3	6	3156940	3156945	0 %	0 %	50 %	50 %	24114322
64098	NC_004337	TGC	2	6	3156971	3156976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114322
64099	NC_004337	TCA	2	6	3157028	3157033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114322
64100	NC_004337	GCA	2	6	3157086	3157091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114322
64101	NC_004337	CTGT	2	8	3157106	3157113	0 %	50 %	25 %	25 %	24114322
64102	NC_004337	AAG	2	6	3157184	3157189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114322
64103	NC_004337	CAA	2	6	3157203	3157208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114322
64104	NC_004337	CGC	2	6	3157213	3157218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114322
64105	NC_004337	CAC	2	6	3157221	3157226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114322
64106	NC_004337	CCA	2	6	3157260	3157265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114322
64107	NC_004337	GCG	2	6	3157273	3157278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114322
64108	NC_004337	GCAG	2	8	3157319	3157326	25 %	0 %	50 %	25 %	24114322
64109	NC_004337	CGA	2	6	3157388	3157393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114322
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64111	NC_004337	CAG	2	6	3157471	3157476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114322
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64118	NC_004337	TCG	2	6	3157853	3157858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114322
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64217	NC_004337	CTG	2	6	3162868	3162873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480242
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64219	NC_004337	TTA	2	6	3162889	3162894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64220	NC_004337	AAC	2	6	3162939	3162944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64221	NC_004337	A	7	7	3162955	3162961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64222	NC_004337	ACA	2	6	3162990	3162995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64223	NC_004337	GCA	2	6	3163006	3163011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64224	NC_004337	A	6	6	3163033	3163038	100 %	0 %	0 %	0 %	24114327
64225	NC_004337	AGA	2	6	3163055	3163060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114327
64226	NC_004337	GTC	2	6	3163135	3163140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114327
64227	NC_004337	ATG	2	6	3163171	3163176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114327
64228	NC_004337	ATGG	2	8	3163206	3163213	25 %	25 %	50 %	0 %	24114327
64229	NC_004337	GA	3	6	3163237	3163242	50 %	0 %	50 %	0 %	24114327
64230	NC_004337	CG	3	6	3163274	3163279	0 %	0 %	50 %	50 %	24114327
64231	NC_004337	CGC	2	6	3163361	3163366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114327
64232	NC_004337	GGCCA	2	10	3163398	3163407	20 %	0 %	40 %	40 %	24114327
64233	NC_004337	GCTG	2	8	3163463	3163470	0 %	25 %	50 %	25 %	24114327
64234	NC_004337	CTG	2	6	3163506	3163511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114327
64235	NC_004337	GTGCAT	2	12	3163611	3163622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24114327
64236	NC_004337	GAAAT	2	10	3163691	3163700	60 %	20 %	20 %	0 %	24114327
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64238	NC_004337	AAAC	2	8	3163793	3163800	75 %	0 %	0 %	25 %	24114328
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64474	NC_004337	GGC	2	6	3176299	3176304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480246
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