MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004337	GTT	2	6	246738	246743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111667
5002	NC_004337	CTG	2	6	246795	246800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111667
5003	NC_004337	TTC	2	6	246837	246842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111667
5004	NC_004337	AAC	2	6	246852	246857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111667
5005	NC_004337	AC	3	6	246976	246981	50 %	0 %	0 %	50 %	24111667
5006	NC_004337	CAG	2	6	246986	246991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111667
5007	NC_004337	GCG	2	6	246999	247004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111667
5008	NC_004337	ACA	2	6	247005	247010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111667
5009	NC_004337	ACA	2	6	247015	247020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111667
5010	NC_004337	TTC	2	6	247035	247040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111667
5011	NC_004337	GCG	2	6	247104	247109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111667
5012	NC_004337	TGA	2	6	247146	247151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111667
5013	NC_004337	CAA	2	6	247225	247230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479631
5014	NC_004337	GGC	2	6	247295	247300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479631
5015	NC_004337	ACC	2	6	247421	247426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479631
5016	NC_004337	GAA	2	6	247568	247573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479631
5017	NC_004337	GCG	2	6	247640	247645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111669
5018	NC_004337	GCA	2	6	247708	247713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5019	NC_004337	TGC	2	6	247728	247733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5020	NC_004337	CAG	2	6	247747	247752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5021	NC_004337	GGCA	2	8	247847	247854	25 %	0 %	50 %	25 %	24111669
5022	NC_004337	GCAGG	2	10	247894	247903	20 %	0 %	60 %	20 %	24111669
5023	NC_004337	TGC	3	9	247920	247928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5024	NC_004337	ACA	2	6	248030	248035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111669
5025	NC_004337	CAA	2	6	248097	248102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111669
5026	NC_004337	AGC	2	6	248107	248112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5027	NC_004337	GCT	2	6	248140	248145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111669
5028	NC_004337	GTT	2	6	248289	248294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111669
5029	NC_004337	CGG	2	6	248331	248336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111670
5030	NC_004337	TTG	2	6	248338	248343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111670
5031	NC_004337	CGG	2	6	248352	248357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111670
5032	NC_004337	CAG	2	6	248500	248505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5033	NC_004337	AGAA	2	8	248525	248532	75 %	0 %	25 %	0 %	24111670
5034	NC_004337	CAG	2	6	248536	248541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5035	NC_004337	CCAGA	2	10	248605	248614	40 %	0 %	20 %	40 %	24111670
5036	NC_004337	TGA	2	6	248646	248651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111670
5037	NC_004337	AGC	2	6	248654	248659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5038	NC_004337	GCAAT	2	10	248716	248725	40 %	20 %	20 %	20 %	24111670
5039	NC_004337	AAC	2	6	248737	248742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111670
5040	NC_004337	CCG	2	6	248936	248941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111670
5041	NC_004337	CAG	2	6	248995	249000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5042	NC_004337	AAAC	2	8	249020	249027	75 %	0 %	0 %	25 %	24111670
5043	NC_004337	AAC	2	6	249034	249039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111670
5044	NC_004337	CAG	2	6	249068	249073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5045	NC_004337	AGC	2	6	249114	249119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5046	NC_004337	CAA	2	6	249120	249125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111670
5047	NC_004337	CAG	2	6	249127	249132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5048	NC_004337	GCA	2	6	249135	249140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5049	NC_004337	AGC	2	6	249143	249148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5050	NC_004337	ATG	2	6	249158	249163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111670
5051	NC_004337	GAG	2	6	249436	249441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111670
5052	NC_004337	TCG	2	6	249447	249452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5053	NC_004337	AGC	2	6	249572	249577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111670
5054	NC_004337	TGA	2	6	249701	249706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479632
5055	NC_004337	TCT	2	6	249727	249732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479632
5056	NC_004337	CCG	2	6	249755	249760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479632
5057	NC_004337	GC	4	8	249857	249864	0 %	0 %	50 %	50 %	56479632
5058	NC_004337	CAG	2	6	249883	249888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5059	NC_004337	CT	3	6	249906	249911	0 %	50 %	0 %	50 %	56479632
5060	NC_004337	ACG	2	6	249923	249928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5061	NC_004337	GTG	2	6	249956	249961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479632
5062	NC_004337	TGA	2	6	249996	250001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479632
5063	NC_004337	GC	3	6	250053	250058	0 %	0 %	50 %	50 %	56479632
5064	NC_004337	AAC	2	6	250093	250098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479632
5065	NC_004337	AAT	2	6	250165	250170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479632
5066	NC_004337	AGC	2	6	250187	250192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5067	NC_004337	CAG	2	6	250204	250209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5068	NC_004337	CAA	2	6	250252	250257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479632
5069	NC_004337	AAT	2	6	250273	250278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479632
5070	NC_004337	GAA	2	6	250291	250296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479632
5071	NC_004337	CAT	2	6	250298	250303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479632
5072	NC_004337	CAA	2	6	250309	250314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479632
5073	NC_004337	TGG	2	6	250332	250337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479632
5074	NC_004337	TCAG	2	8	250433	250440	25 %	25 %	25 %	25 %	56479632
5075	NC_004337	G	6	6	250447	250452	0 %	0 %	100 %	0 %	56479632
5076	NC_004337	GAT	2	6	250465	250470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479632
5077	NC_004337	AGAC	2	8	250485	250492	50 %	0 %	25 %	25 %	56479632
5078	NC_004337	TC	3	6	250579	250584	0 %	50 %	0 %	50 %	56479632
5079	NC_004337	GTG	2	6	250682	250687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479632
5080	NC_004337	GTG	2	6	250691	250696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479632
5081	NC_004337	AG	3	6	250733	250738	50 %	0 %	50 %	0 %	56479632
5082	NC_004337	GCA	2	6	250786	250791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5083	NC_004337	CGA	2	6	250853	250858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479632
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5085	NC_004337	A	6	6	250895	250900	100 %	0 %	0 %	0 %	56479632
5086	NC_004337	TGA	2	6	250923	250928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479632
5087	NC_004337	CTG	2	6	250964	250969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479632
5088	NC_004337	AGCA	2	8	251036	251043	50 %	0 %	25 %	25 %	56479632
5089	NC_004337	GAA	2	6	251192	251197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479632
5090	NC_004337	TGA	2	6	251207	251212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479632
5091	NC_004337	CAA	2	6	251282	251287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479632
5092	NC_004337	AGA	2	6	251310	251315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479632
5093	NC_004337	AG	3	6	251351	251356	50 %	0 %	50 %	0 %	56479632
5094	NC_004337	TCCT	2	8	251384	251391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_004337	TAA	2	6	251417	251422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_004337	CAC	2	6	251690	251695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111672
5097	NC_004337	A	6	6	251814	251819	100 %	0 %	0 %	0 %	24111672
5098	NC_004337	CTG	2	6	251828	251833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_004337	CAT	2	6	251924	251929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_004337	GAA	2	6	251971	251976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_004337	GTT	2	6	252036	252041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_004337	TTAC	2	8	252224	252231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_004337	TCA	2	6	252266	252271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_004337	GTAT	2	8	252411	252418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_004337	AC	3	6	252428	252433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_004337	GTGG	2	8	252591	252598	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_004337	CGA	2	6	252613	252618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_004337	GCAGAA	2	12	252649	252660	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5109	NC_004337	TTA	2	6	252666	252671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_004337	GAT	2	6	252688	252693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_004337	GGC	2	6	252759	252764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111674
5112	NC_004337	AGGC	2	8	252772	252779	25 %	0 %	50 %	25 %	24111674
5113	NC_004337	TTA	2	6	252790	252795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111674
5114	NC_004337	ATC	2	6	252798	252803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111674
5115	NC_004337	TTG	2	6	252816	252821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111674
5116	NC_004337	ATT	2	6	252831	252836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111674
5117	NC_004337	TGC	2	6	252853	252858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111674
5118	NC_004337	T	6	6	252872	252877	0 %	100 %	0 %	0 %	24111674
5119	NC_004337	TTC	2	6	252898	252903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111674
5120	NC_004337	CTG	2	6	252960	252965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111674
5121	NC_004337	AGG	2	6	252971	252976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111674
5122	NC_004337	TGT	3	9	252985	252993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111674
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5124	NC_004337	GGT	2	6	253023	253028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111674
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5378	NC_004337	T	6	6	266291	266296	0 %	100 %	0 %	0 %	344915217
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