MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 93738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004337	CT	3	6	221228	221233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_004337	CTC	2	6	221239	221244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_004337	CAGT	2	8	221257	221264	25 %	25 %	25 %	25 %	24111638
4504	NC_004337	ACTG	2	8	221271	221278	25 %	25 %	25 %	25 %	24111638
4505	NC_004337	CCCTTC	2	12	221338	221349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111638
4506	NC_004337	TCG	2	6	221350	221355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4507	NC_004337	TCA	2	6	221434	221439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111638
4508	NC_004337	TCA	2	6	221446	221451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111638
4509	NC_004337	ATC	2	6	221520	221525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111638
4510	NC_004337	TCC	2	6	221690	221695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111638
4511	NC_004337	CGTC	2	8	221710	221717	0 %	25 %	25 %	50 %	24111638
4512	NC_004337	CAG	2	6	221726	221731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4513	NC_004337	CAG	2	6	221762	221767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4514	NC_004337	T	6	6	221802	221807	0 %	100 %	0 %	0 %	24111638
4515	NC_004337	GAT	2	6	221839	221844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111638
4516	NC_004337	ATC	2	6	221898	221903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111638
4517	NC_004337	TAA	2	6	221955	221960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111638
4518	NC_004337	TTC	2	6	222033	222038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111638
4519	NC_004337	CAG	2	6	222062	222067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4520	NC_004337	AC	3	6	222187	222192	50 %	0 %	0 %	50 %	24111638
4521	NC_004337	CAG	2	6	222203	222208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4522	NC_004337	GCG	2	6	222232	222237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111638
4523	NC_004337	CGG	2	6	222276	222281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111638
4524	NC_004337	GCA	2	6	222352	222357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111638
4525	NC_004337	CAA	2	6	222415	222420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111638
4526	NC_004337	CAT	2	6	222431	222436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111638
4527	NC_004337	GGCAA	2	10	222482	222491	40 %	0 %	40 %	20 %	24111638
4528	NC_004337	GA	3	6	222493	222498	50 %	0 %	50 %	0 %	24111638
4529	NC_004337	CTC	2	6	222677	222682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111639
4530	NC_004337	CCA	2	6	222812	222817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111639
4531	NC_004337	TCG	2	6	223024	223029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111639
4532	NC_004337	TTTC	2	8	223159	223166	0 %	75 %	0 %	25 %	24111639
4533	NC_004337	TAA	2	6	223175	223180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111639
4534	NC_004337	GGA	2	6	223188	223193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111639
4535	NC_004337	TTAA	2	8	223237	223244	50 %	50 %	0 %	0 %	24111639
4536	NC_004337	GCA	2	6	223259	223264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111639
4537	NC_004337	CGA	2	6	223369	223374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111639
4538	NC_004337	CTT	2	6	223388	223393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111639
4539	NC_004337	TTGC	2	8	223484	223491	0 %	50 %	25 %	25 %	24111639
4540	NC_004337	CGA	2	6	223529	223534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111639
4541	NC_004337	TTC	2	6	223554	223559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111639
4542	NC_004337	ATTT	2	8	223611	223618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_004337	AAT	2	6	223668	223673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004337	A	6	6	223820	223825	100 %	0 %	0 %	0 %	24111640
4545	NC_004337	CCG	2	6	223875	223880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111640
4546	NC_004337	ACC	2	6	223910	223915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111640
4547	NC_004337	GCC	2	6	224094	224099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111640
4548	NC_004337	TGC	2	6	224119	224124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111640
4549	NC_004337	CGG	2	6	224155	224160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111640
4550	NC_004337	TGC	2	6	224175	224180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111640
4551	NC_004337	TGG	2	6	224266	224271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111640
4552	NC_004337	CAC	2	6	224352	224357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111640
4553	NC_004337	GAT	2	6	224466	224471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111640
4554	NC_004337	GCC	2	6	224491	224496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111640
4555	NC_004337	CG	3	6	224554	224559	0 %	0 %	50 %	50 %	24111640
4556	NC_004337	ATAA	2	8	224608	224615	75 %	25 %	0 %	0 %	24111640
4557	NC_004337	ACA	2	6	224674	224679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_004337	ACA	2	6	224696	224701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_004337	CCA	2	6	224707	224712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_004337	TGC	2	6	224875	224880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479624
4561	NC_004337	GGT	2	6	224896	224901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479624
4562	NC_004337	CAC	2	6	224974	224979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479624
4563	NC_004337	ATG	2	6	225063	225068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479624
4564	NC_004337	GCA	2	6	225074	225079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479624
4565	NC_004337	GTGAA	2	10	225084	225093	40 %	20 %	40 %	0 %	56479624
4566	NC_004337	GAT	2	6	225118	225123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479624
4567	NC_004337	TAATT	2	10	225268	225277	40 %	60 %	0 %	0 %	56479624
4568	NC_004337	TAG	2	6	225339	225344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479624
4569	NC_004337	ATC	2	6	225431	225436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479624
4570	NC_004337	ATAA	2	8	225460	225467	75 %	25 %	0 %	0 %	56479624
4571	NC_004337	A	6	6	225466	225471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_004337	TAT	2	6	225497	225502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_004337	TGT	3	9	225525	225533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479625
4574	NC_004337	AAC	2	6	225542	225547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479625
4575	NC_004337	TGT	2	6	225681	225686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479625
4576	NC_004337	CTG	2	6	225757	225762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479625
4577	NC_004337	GCG	2	6	225846	225851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479625
4578	NC_004337	TTG	2	6	225854	225859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479625
4579	NC_004337	CAG	2	6	225879	225884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479625
4580	NC_004337	GA	3	6	225901	225906	50 %	0 %	50 %	0 %	56479625
4581	NC_004337	CTT	2	6	225928	225933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479625
4582	NC_004337	CGC	2	6	226263	226268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479625
4583	NC_004337	GTC	3	9	226297	226305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479625
4584	NC_004337	CAT	2	6	226327	226332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479625
4585	NC_004337	GTT	2	6	226346	226351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479625
4586	NC_004337	CAA	2	6	226356	226361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479625
4587	NC_004337	CG	3	6	226370	226375	0 %	0 %	50 %	50 %	56479625
4588	NC_004337	GTA	3	9	226494	226502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479625
4589	NC_004337	T	6	6	226525	226530	0 %	100 %	0 %	0 %	56479625
4590	NC_004337	TTTCTG	2	12	226609	226620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56479625
4591	NC_004337	TCG	2	6	226661	226666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479625
4592	NC_004337	TCCA	2	8	226715	226722	25 %	25 %	0 %	50 %	56479625
4593	NC_004337	TGC	2	6	226744	226749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479625
4594	NC_004337	GTGC	2	8	226779	226786	0 %	25 %	50 %	25 %	56479625
4595	NC_004337	TG	4	8	226857	226864	0 %	50 %	50 %	0 %	56479625
4596	NC_004337	GAC	2	6	226882	226887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_004337	TCTT	2	8	226939	226946	0 %	75 %	0 %	25 %	24111643
4598	NC_004337	GTT	2	6	226976	226981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111643
4599	NC_004337	AAT	2	6	226984	226989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111643
4600	NC_004337	TTC	2	6	226992	226997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111643
4601	NC_004337	ATTA	2	8	227007	227014	50 %	50 %	0 %	0 %	24111643
4602	NC_004337	A	7	7	227035	227041	100 %	0 %	0 %	0 %	24111643
4603	NC_004337	T	6	6	227089	227094	0 %	100 %	0 %	0 %	24111643
4604	NC_004337	ATA	2	6	227118	227123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111643
4605	NC_004337	TGAT	2	8	227241	227248	25 %	50 %	25 %	0 %	24111643
4606	NC_004337	AAC	2	6	227272	227277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111643
4607	NC_004337	CACC	2	8	227284	227291	25 %	0 %	0 %	75 %	24111643
4608	NC_004337	CGC	2	6	227306	227311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111643
4609	NC_004337	TGT	2	6	227427	227432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111643
4610	NC_004337	CCA	2	6	227486	227491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111643
4611	NC_004337	CGC	2	6	227501	227506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111643
4612	NC_004337	GTG	2	6	227517	227522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111643
4613	NC_004337	TGG	2	6	227524	227529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111643
4614	NC_004337	TCA	2	6	227626	227631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111643
4615	NC_004337	TCA	2	6	227653	227658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111643
4616	NC_004337	TGA	2	6	227716	227721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111644
4617	NC_004337	TCA	2	6	227906	227911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111644
4618	NC_004337	GTG	2	6	228020	228025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111644
4619	NC_004337	TTA	2	6	228042	228047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111644
4620	NC_004337	TGAT	2	8	228067	228074	25 %	50 %	25 %	0 %	24111644
4621	NC_004337	TGGC	2	8	228077	228084	0 %	25 %	50 %	25 %	24111644
4622	NC_004337	ACTGG	2	10	228194	228203	20 %	20 %	40 %	20 %	24111644
4623	NC_004337	CT	3	6	228204	228209	0 %	50 %	0 %	50 %	24111644
4624	NC_004337	TTG	2	6	228210	228215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111644
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