MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_004116	ATT	2	6	2147350	2147355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48003	NC_004116	TTA	2	6	2147420	2147425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48004	NC_004116	TTA	2	6	2147459	2147464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48005	NC_004116	TTA	2	6	2147482	2147487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48006	NC_004116	ATCA	2	8	2147537	2147544	50 %	25 %	0 %	25 %	22538300
48007	NC_004116	TATT	2	8	2147588	2147595	25 %	75 %	0 %	0 %	22538300
48008	NC_004116	TCT	2	6	2147615	2147620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538300
48009	NC_004116	A	6	6	2147632	2147637	100 %	0 %	0 %	0 %	22538300
48010	NC_004116	ATT	2	6	2147670	2147675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48011	NC_004116	CTTG	2	8	2147851	2147858	0 %	50 %	25 %	25 %	22538300
48012	NC_004116	GCA	2	6	2147869	2147874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538300
48013	NC_004116	GCT	2	6	2147890	2147895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22538300
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48015	NC_004116	CAAT	2	8	2147948	2147955	50 %	25 %	0 %	25 %	22538300
48016	NC_004116	CA	3	6	2148009	2148014	50 %	0 %	0 %	50 %	22538300
48017	NC_004116	CAT	2	6	2148044	2148049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538300
48018	NC_004116	TGG	2	6	2148192	2148197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22538300
48019	NC_004116	TTAC	2	8	2148204	2148211	25 %	50 %	0 %	25 %	22538300
48020	NC_004116	A	6	6	2148299	2148304	100 %	0 %	0 %	0 %	22538300
48021	NC_004116	TTA	2	6	2148334	2148339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48022	NC_004116	TAT	2	6	2148342	2148347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538300
48023	NC_004116	TGC	2	6	2148375	2148380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22538300
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48025	NC_004116	CAA	2	6	2148495	2148500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538301
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48027	NC_004116	ATG	2	6	2148553	2148558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538301
48028	NC_004116	AGCA	2	8	2148607	2148614	50 %	0 %	25 %	25 %	22538301
48029	NC_004116	GAAG	2	8	2148672	2148679	50 %	0 %	50 %	0 %	22538301
48030	NC_004116	CAA	2	6	2148802	2148807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538301
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48039	NC_004116	AT	3	6	2149208	2149213	50 %	50 %	0 %	0 %	22538301
48040	NC_004116	TTG	2	6	2149273	2149278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538301
48041	NC_004116	TAT	2	6	2149301	2149306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538301
48042	NC_004116	TTG	2	6	2149360	2149365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538301
48043	NC_004116	TACA	2	8	2149391	2149398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48044	NC_004116	TTA	2	6	2149403	2149408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48045	NC_004116	TAA	2	6	2149432	2149437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48046	NC_004116	AG	3	6	2149439	2149444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48047	NC_004116	AT	3	6	2149449	2149454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48048	NC_004116	CT	3	6	2149459	2149464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48049	NC_004116	TAT	2	6	2149467	2149472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48050	NC_004116	AT	3	6	2149478	2149483	50 %	50 %	0 %	0 %	22538302
48051	NC_004116	GTTTT	2	10	2149665	2149674	0 %	80 %	20 %	0 %	22538302
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48053	NC_004116	T	6	6	2149840	2149845	0 %	100 %	0 %	0 %	22538302
48054	NC_004116	ATC	2	6	2149861	2149866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538302
48055	NC_004116	ATT	2	6	2149882	2149887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538302
48056	NC_004116	GAC	2	6	2149929	2149934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538302
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48058	NC_004116	CAT	2	6	2149941	2149946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538302
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48060	NC_004116	CTG	2	6	2150124	2150129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22538302
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48063	NC_004116	AAT	2	6	2150298	2150303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538302
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48067	NC_004116	CTAC	2	8	2150438	2150445	25 %	25 %	0 %	50 %	22538302
48068	NC_004116	TTATC	2	10	2150548	2150557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48069	NC_004116	TTA	2	6	2150604	2150609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48091	NC_004116	CTT	2	6	2151323	2151328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48092	NC_004116	TAT	2	6	2151330	2151335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48093	NC_004116	TAT	2	6	2151345	2151350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48094	NC_004116	TTTCT	2	10	2151392	2151401	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48095	NC_004116	ATA	2	6	2151434	2151439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48096	NC_004116	TAA	3	9	2151442	2151450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48097	NC_004116	ATAAA	2	10	2151457	2151466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48098	NC_004116	ATT	2	6	2151490	2151495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48099	NC_004116	TTA	3	9	2151523	2151531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48102	NC_004116	CTTT	2	8	2151622	2151629	0 %	75 %	0 %	25 %	22538304
48103	NC_004116	G	7	7	2151650	2151656	0 %	0 %	100 %	0 %	22538304
48104	NC_004116	AGTT	2	8	2151671	2151678	25 %	50 %	25 %	0 %	22538304
48105	NC_004116	TTGG	2	8	2151691	2151698	0 %	50 %	50 %	0 %	22538304
48106	NC_004116	T	7	7	2151707	2151713	0 %	100 %	0 %	0 %	22538304
48107	NC_004116	CTT	2	6	2151741	2151746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538304
48108	NC_004116	AAAC	2	8	2151765	2151772	75 %	0 %	0 %	25 %	22538304
48109	NC_004116	TTA	2	6	2151814	2151819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538304
48110	NC_004116	CTC	2	6	2151858	2151863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22538304
48111	NC_004116	GCA	2	6	2151864	2151869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538304
48112	NC_004116	T	6	6	2151910	2151915	0 %	100 %	0 %	0 %	22538304
48113	NC_004116	TGG	2	6	2151932	2151937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22538304
48114	NC_004116	ATTG	2	8	2152001	2152008	25 %	50 %	25 %	0 %	22538304
48115	NC_004116	TTG	2	6	2152024	2152029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538304
48116	NC_004116	TAT	2	6	2152067	2152072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538304
48117	NC_004116	TAT	2	6	2152094	2152099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538304
48118	NC_004116	A	6	6	2152162	2152167	100 %	0 %	0 %	0 %	22538304
48119	NC_004116	AT	3	6	2152175	2152180	50 %	50 %	0 %	0 %	22538304
48120	NC_004116	AATCA	2	10	2152242	2152251	60 %	20 %	0 %	20 %	22538304
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.