MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004116	TA	3	6	135152	135157	50 %	50 %	0 %	0 %	22536310
3002	NC_004116	ATG	2	6	135203	135208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536310
3003	NC_004116	GCT	2	6	135229	135234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536310
3004	NC_004116	GCA	2	6	135253	135258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536310
3005	NC_004116	ATAA	2	8	135318	135325	75 %	25 %	0 %	0 %	22536310
3006	NC_004116	A	6	6	135345	135350	100 %	0 %	0 %	0 %	22536311
3007	NC_004116	GGT	2	6	135364	135369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536311
3008	NC_004116	AGT	2	6	135379	135384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536311
3009	NC_004116	ATCA	2	8	135414	135421	50 %	25 %	0 %	25 %	22536311
3010	NC_004116	TATGA	2	10	135445	135454	40 %	40 %	20 %	0 %	22536311
3011	NC_004116	ATT	2	6	135496	135501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536311
3012	NC_004116	AAG	3	9	135506	135514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536311
3013	NC_004116	AG	3	6	135612	135617	50 %	0 %	50 %	0 %	22536311
3014	NC_004116	TTA	2	6	135619	135624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536311
3015	NC_004116	ATG	2	6	135730	135735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536311
3016	NC_004116	AAC	2	6	135756	135761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536311
3017	NC_004116	ACA	2	6	135819	135824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536311
3018	NC_004116	CAT	2	6	135847	135852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536311
3019	NC_004116	AC	3	6	135912	135917	50 %	0 %	0 %	50 %	22536311
3020	NC_004116	GCT	3	9	135937	135945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536311
3021	NC_004116	TTA	2	6	135991	135996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536311
3022	NC_004116	ATG	2	6	136084	136089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536311
3023	NC_004116	GAA	2	6	136108	136113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536311
3024	NC_004116	TCA	2	6	136145	136150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536311
3025	NC_004116	ATC	2	6	136176	136181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536311
3026	NC_004116	TAT	2	6	136182	136187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536311
3027	NC_004116	AATT	2	8	136217	136224	50 %	50 %	0 %	0 %	22536311
3028	NC_004116	ATTT	2	8	136253	136260	25 %	75 %	0 %	0 %	22536311
3029	NC_004116	AAG	2	6	136313	136318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536311
3030	NC_004116	AAG	2	6	136322	136327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536311
3031	NC_004116	ATG	2	6	136414	136419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536311
3032	NC_004116	ATT	2	6	136463	136468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536311
3033	NC_004116	CAG	2	6	136634	136639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536311
3034	NC_004116	GAA	2	6	136646	136651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536311
3035	NC_004116	AGG	2	6	136659	136664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536311
3036	NC_004116	A	6	6	136684	136689	100 %	0 %	0 %	0 %	22536311
3037	NC_004116	A	6	6	136739	136744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004116	A	6	6	136785	136790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_004116	T	6	6	136797	136802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_004116	A	6	6	136844	136849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_004116	AGG	2	6	136855	136860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_004116	AAT	2	6	136865	136870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536312
3043	NC_004116	CAG	2	6	136882	136887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536312
3044	NC_004116	AGC	2	6	136901	136906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536312
3045	NC_004116	ACAA	2	8	136941	136948	75 %	0 %	0 %	25 %	22536312
3046	NC_004116	GC	3	6	136973	136978	0 %	0 %	50 %	50 %	22536312
3047	NC_004116	A	6	6	136989	136994	100 %	0 %	0 %	0 %	22536312
3048	NC_004116	GGT	2	6	137040	137045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536312
3049	NC_004116	AAC	2	6	137059	137064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536312
3050	NC_004116	GAT	2	6	137136	137141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536312
3051	NC_004116	GAA	2	6	137205	137210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3052	NC_004116	GTT	2	6	137232	137237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536312
3053	NC_004116	GGT	2	6	137289	137294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536312
3054	NC_004116	GAA	2	6	137295	137300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3055	NC_004116	CTT	2	6	137372	137377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536312
3056	NC_004116	GAA	2	6	137447	137452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3057	NC_004116	GGT	2	6	137493	137498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536312
3058	NC_004116	TGA	2	6	137510	137515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536312
3059	NC_004116	AAG	2	6	137524	137529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3060	NC_004116	GTTAAC	2	12	137553	137564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536312
3061	NC_004116	GAA	2	6	137642	137647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3062	NC_004116	A	6	6	137646	137651	100 %	0 %	0 %	0 %	22536312
3063	NC_004116	GAA	2	6	137709	137714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536312
3064	NC_004116	CAAA	2	8	137737	137744	75 %	0 %	0 %	25 %	22536312
3065	NC_004116	ATA	2	6	137764	137769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004116	T	7	7	137794	137800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004116	TTA	2	6	137816	137821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_004116	GTT	2	6	137887	137892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536313
3069	NC_004116	CTT	2	6	137896	137901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536313
3070	NC_004116	TTCT	2	8	137923	137930	0 %	75 %	0 %	25 %	22536313
3071	NC_004116	AAT	2	6	137948	137953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536313
3072	NC_004116	GTA	2	6	138004	138009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536313
3073	NC_004116	T	6	6	138080	138085	0 %	100 %	0 %	0 %	22536313
3074	NC_004116	A	6	6	138089	138094	100 %	0 %	0 %	0 %	22536313
3075	NC_004116	CTT	2	6	138121	138126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536313
3076	NC_004116	TTC	2	6	138140	138145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536313
3077	NC_004116	ACC	2	6	138236	138241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536313
3078	NC_004116	GAT	2	6	138417	138422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536313
3079	NC_004116	CGT	2	6	138439	138444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536313
3080	NC_004116	CTT	2	6	138448	138453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536313
3081	NC_004116	CTT	2	6	138487	138492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536313
3082	NC_004116	ATCA	2	8	138614	138621	50 %	25 %	0 %	25 %	22536313
3083	NC_004116	ATC	2	6	138665	138670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536313
3084	NC_004116	CCT	2	6	138758	138763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_004116	ATT	2	6	138767	138772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_004116	TAT	2	6	138779	138784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_004116	GAAA	2	8	138793	138800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_004116	A	6	6	138810	138815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004116	GAAG	2	8	138823	138830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_004116	TTA	2	6	138837	138842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_004116	A	6	6	138844	138849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_004116	AGA	2	6	138905	138910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_004116	AGG	2	6	138974	138979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004116	AAC	2	6	139035	139040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536314
3095	NC_004116	CAAA	2	8	139059	139066	75 %	0 %	0 %	25 %	22536314
3096	NC_004116	AAACC	2	10	139077	139086	60 %	0 %	0 %	40 %	22536314
3097	NC_004116	A	7	7	139121	139127	100 %	0 %	0 %	0 %	22536314
3098	NC_004116	TAA	2	6	139176	139181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536314
3099	NC_004116	T	7	7	139201	139207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_004116	T	7	7	139246	139252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_004116	AAT	2	6	139255	139260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_004116	ATAGA	2	10	139272	139281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_004116	GTA	2	6	139301	139306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_004116	CT	3	6	139349	139354	0 %	50 %	0 %	50 %	22536315
3105	NC_004116	GTT	2	6	139406	139411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536315
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3107	NC_004116	GTA	2	6	139514	139519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536315
3108	NC_004116	A	6	6	139567	139572	100 %	0 %	0 %	0 %	22536315
3109	NC_004116	CTG	2	6	139620	139625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536315
3110	NC_004116	CGA	2	6	139853	139858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536316
3111	NC_004116	TTCT	2	8	139880	139887	0 %	75 %	0 %	25 %	22536316
3112	NC_004116	ATT	2	6	139938	139943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536316
3113	NC_004116	AGA	2	6	139974	139979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3114	NC_004116	GCT	2	6	140095	140100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536316
3115	NC_004116	A	7	7	140103	140109	100 %	0 %	0 %	0 %	22536316
3116	NC_004116	GAA	2	6	140113	140118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3117	NC_004116	TGA	2	6	140121	140126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536316
3118	NC_004116	GC	3	6	140142	140147	0 %	0 %	50 %	50 %	22536316
3119	NC_004116	GTT	2	6	140218	140223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536316
3120	NC_004116	TGG	2	6	140229	140234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536316
3121	NC_004116	TTTA	2	8	140248	140255	25 %	75 %	0 %	0 %	22536316
3122	NC_004116	ACTG	2	8	140274	140281	25 %	25 %	25 %	25 %	22536316
3123	NC_004116	AT	3	6	140286	140291	50 %	50 %	0 %	0 %	22536316
3124	NC_004116	AGA	2	6	140298	140303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3125	NC_004116	CAA	2	6	140321	140326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536316
3126	NC_004116	GTA	2	6	140362	140367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536316
3127	NC_004116	AGA	2	6	140382	140387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3128	NC_004116	TGGT	2	8	140417	140424	0 %	50 %	50 %	0 %	22536316
3129	NC_004116	GAA	2	6	140464	140469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3130	NC_004116	GTT	2	6	140509	140514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536316
3131	NC_004116	ATG	3	9	140516	140524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536316
3132	NC_004116	GTTCAT	2	12	140536	140547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536316
3133	NC_004116	AGA	2	6	140550	140555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
3134	NC_004116	AAG	2	6	140573	140578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536316
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3136	NC_004116	GTTGAA	2	12	140653	140664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536316
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3139	NC_004116	ATC	2	6	140758	140763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536316
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3146	NC_004116	AAGC	2	8	141223	141230	50 %	0 %	25 %	25 %	22536316
3147	NC_004116	CCA	2	6	141291	141296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536316
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3149	NC_004116	ATAAA	2	10	141343	141352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_004116	A	6	6	141350	141355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_004116	GA	3	6	141360	141365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_004116	T	6	6	141375	141380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_004116	ATG	2	6	141484	141489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536317
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3183	NC_004116	A	7	7	142631	142637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3184	NC_004116	TTG	2	6	142655	142660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3186	NC_004116	ATCA	2	8	142695	142702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3187	NC_004116	TAA	2	6	142707	142712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3188	NC_004116	AT	3	6	142721	142726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3189	NC_004116	TTA	2	6	142734	142739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3190	NC_004116	ATGA	2	8	142777	142784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3191	NC_004116	A	7	7	142832	142838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3192	NC_004116	CGAT	2	8	142839	142846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3193	NC_004116	ATT	2	6	142875	142880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3194	NC_004116	TGAA	2	8	142892	142899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3195	NC_004116	GTTAA	2	10	142925	142934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3196	NC_004116	TTTA	2	8	142946	142953	25 %	75 %	0 %	0 %	22536319
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3202	NC_004116	AT	3	6	143354	143359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_004116	TTAAAA	2	12	143377	143388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3205	NC_004116	A	6	6	143492	143497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3239	NC_004116	AAG	2	6	145047	145052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536321
3240	NC_004116	T	7	7	145065	145071	0 %	100 %	0 %	0 %	22536321
3241	NC_004116	T	6	6	145073	145078	0 %	100 %	0 %	0 %	22536321
3242	NC_004116	ATC	2	6	145098	145103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536321
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3247	NC_004116	TTGAT	2	10	145383	145392	20 %	60 %	20 %	0 %	22536321
3248	NC_004116	TTG	2	6	145418	145423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536321
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3250	NC_004116	GTA	2	6	145514	145519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536321
3251	NC_004116	T	6	6	145541	145546	0 %	100 %	0 %	0 %	22536321
3252	NC_004116	TTC	2	6	145550	145555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536321
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3254	NC_004116	TTTTG	2	10	145625	145634	0 %	80 %	20 %	0 %	22536321
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3369	NC_004116	GTT	2	6	150584	150589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536325
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3373	NC_004116	T	6	6	150835	150840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_004116	ATT	2	6	150885	150890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3375	NC_004116	AATAT	2	10	150894	150903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_004116	TCT	2	6	150924	150929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3377	NC_004116	TGC	2	6	151077	151082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536326
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3380	NC_004116	CAG	2	6	151157	151162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536326
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3466	NC_004116	TAG	2	6	154773	154778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3491	NC_004116	ACA	2	6	155804	155809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536330
3492	NC_004116	GAT	2	6	155828	155833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536330
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3495	NC_004116	A	6	6	155937	155942	100 %	0 %	0 %	0 %	22536330
3496	NC_004116	GATG	2	8	155975	155982	25 %	25 %	50 %	0 %	22536330
3497	NC_004116	ATACC	2	10	155998	156007	40 %	20 %	0 %	40 %	22536330
3498	NC_004116	TAC	2	6	156084	156089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536330
3499	NC_004116	TGA	2	6	156091	156096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536330
3500	NC_004116	TTG	2	6	156145	156150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536330

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