MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004116	TAA	2	6	269499	269504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536447
6002	NC_004116	T	6	6	269519	269524	0 %	100 %	0 %	0 %	22536447
6003	NC_004116	AG	3	6	269538	269543	50 %	0 %	50 %	0 %	22536447
6004	NC_004116	TAAA	2	8	269564	269571	75 %	25 %	0 %	0 %	22536447
6005	NC_004116	GAT	2	6	269599	269604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536447
6006	NC_004116	AT	4	8	269653	269660	50 %	50 %	0 %	0 %	22536447
6007	NC_004116	GAAA	2	8	269662	269669	75 %	0 %	25 %	0 %	22536447
6008	NC_004116	TTTCT	2	10	269672	269681	0 %	80 %	0 %	20 %	22536447
6009	NC_004116	AT	3	6	269708	269713	50 %	50 %	0 %	0 %	22536447
6010	NC_004116	AAT	2	6	269738	269743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536447
6011	NC_004116	ACTG	2	8	269799	269806	25 %	25 %	25 %	25 %	22536447
6012	NC_004116	TCC	2	6	269831	269836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536447
6013	NC_004116	TAGT	2	8	269857	269864	25 %	50 %	25 %	0 %	22536447
6014	NC_004116	TCT	2	6	269898	269903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536447
6015	NC_004116	TAA	2	6	269929	269934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536447
6016	NC_004116	TCT	2	6	269958	269963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536447
6017	NC_004116	ACTA	2	8	269972	269979	50 %	25 %	0 %	25 %	22536447
6018	NC_004116	CTTG	2	8	269982	269989	0 %	50 %	25 %	25 %	22536447
6019	NC_004116	TAA	2	6	270005	270010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536447
6020	NC_004116	TTA	2	6	270102	270107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_004116	TTC	2	6	270118	270123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_004116	T	6	6	270152	270157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_004116	AGT	2	6	270194	270199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536448
6024	NC_004116	TGT	2	6	270314	270319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536448
6025	NC_004116	TA	3	6	270325	270330	50 %	50 %	0 %	0 %	22536448
6026	NC_004116	AATTT	2	10	270399	270408	40 %	60 %	0 %	0 %	22536448
6027	NC_004116	T	7	7	270406	270412	0 %	100 %	0 %	0 %	22536448
6028	NC_004116	CATAAG	2	12	270420	270431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536448
6029	NC_004116	AGT	2	6	270560	270565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_004116	GAT	2	6	270616	270621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_004116	TCT	2	6	270622	270627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_004116	GTTT	2	8	270635	270642	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_004116	TAA	2	6	270663	270668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_004116	GAA	2	6	270672	270677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_004116	GAGT	2	8	270685	270692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_004116	A	6	6	270705	270710	100 %	0 %	0 %	0 %	22536449
6037	NC_004116	TAT	2	6	270734	270739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536449
6038	NC_004116	TTA	2	6	270741	270746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536449
6039	NC_004116	ACT	2	6	270789	270794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536449
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6041	NC_004116	ATT	2	6	270896	270901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536449
6042	NC_004116	TAAA	2	8	270922	270929	75 %	25 %	0 %	0 %	22536449
6043	NC_004116	TTC	2	6	270938	270943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536449
6044	NC_004116	A	6	6	270945	270950	100 %	0 %	0 %	0 %	22536449
6045	NC_004116	TAG	2	6	271039	271044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536449
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6049	NC_004116	AAT	2	6	271305	271310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536449
6050	NC_004116	CTA	2	6	271372	271377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536449
6051	NC_004116	T	6	6	271428	271433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_004116	TCA	2	6	271458	271463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_004116	GAA	2	6	271497	271502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_004116	AAGTG	2	10	271550	271559	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004116	TTCT	2	8	271579	271586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_004116	A	6	6	271608	271613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_004116	TA	3	6	271618	271623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_004116	G	6	6	271666	271671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_004116	AAG	2	6	271672	271677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_004116	ATT	2	6	271808	271813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536450
6061	NC_004116	TCTT	2	8	271942	271949	0 %	75 %	0 %	25 %	22536450
6062	NC_004116	AGA	2	6	271983	271988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536450
6063	NC_004116	AAG	2	6	272273	272278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536450
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6066	NC_004116	TCA	2	6	272418	272423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536450
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6069	NC_004116	TGT	2	6	272634	272639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536450
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6072	NC_004116	T	6	6	272897	272902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_004116	TGT	2	6	272910	272915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_004116	ATA	2	6	272919	272924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_004116	ATT	3	9	272951	272959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536451
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6078	NC_004116	A	6	6	273034	273039	100 %	0 %	0 %	0 %	22536451
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6083	NC_004116	TACA	2	8	273198	273205	50 %	25 %	0 %	25 %	22536451
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6090	NC_004116	ATT	2	6	273449	273454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536451
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6092	NC_004116	T	6	6	273518	273523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_004116	AAG	2	6	273540	273545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_004116	TCA	2	6	273552	273557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_004116	T	7	7	273562	273568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_004116	TAA	2	6	273653	273658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_004116	GGT	2	6	273705	273710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_004116	TTG	2	6	273750	273755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_004116	TAA	2	6	273774	273779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_004116	AAG	2	6	273787	273792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_004116	ATG	2	6	273797	273802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536452
6102	NC_004116	ATT	2	6	273827	273832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536452
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6106	NC_004116	CAT	2	6	274031	274036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536452
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6108	NC_004116	ATGGA	2	10	274206	274215	40 %	20 %	40 %	0 %	22536452
6109	NC_004116	CAA	2	6	274238	274243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536452
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6111	NC_004116	CA	3	6	274530	274535	50 %	0 %	0 %	50 %	22536452
6112	NC_004116	TTA	2	6	274544	274549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536452
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6115	NC_004116	A	6	6	274649	274654	100 %	0 %	0 %	0 %	22536452
6116	NC_004116	AC	3	6	274718	274723	50 %	0 %	0 %	50 %	22536453
6117	NC_004116	TAC	2	6	274880	274885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536453
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6120	NC_004116	TATT	2	8	275157	275164	25 %	75 %	0 %	0 %	22536453
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6122	NC_004116	TGA	2	6	275238	275243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536453
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6126	NC_004116	TGT	2	6	275409	275414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536454
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6253	NC_004116	TGG	2	6	280941	280946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536458
6254	NC_004116	TAT	2	6	280992	280997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536458
6255	NC_004116	AGG	2	6	281064	281069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536458
6256	NC_004116	ATT	2	6	281193	281198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536458
6257	NC_004116	CAGAAG	2	12	281219	281230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22536458
6258	NC_004116	TCACT	2	10	281254	281263	20 %	40 %	0 %	40 %	22536458
6259	NC_004116	TCT	2	6	281303	281308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536458
6260	NC_004116	GA	3	6	281337	281342	50 %	0 %	50 %	0 %	22536458
6261	NC_004116	TGA	2	6	281373	281378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536458
6262	NC_004116	GAA	3	9	281425	281433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536458
6263	NC_004116	ATA	2	6	281490	281495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_004116	CT	3	6	281527	281532	0 %	50 %	0 %	50 %	22536459
6265	NC_004116	GTT	2	6	281565	281570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536459
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6267	NC_004116	TGGA	2	8	281597	281604	25 %	25 %	50 %	0 %	22536459
6268	NC_004116	ATT	2	6	281760	281765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536459
6269	NC_004116	CTT	2	6	281784	281789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536459
6270	NC_004116	T	6	6	281891	281896	0 %	100 %	0 %	0 %	22536459
6271	NC_004116	TACT	2	8	281926	281933	25 %	50 %	0 %	25 %	22536459
6272	NC_004116	AAC	2	6	282026	282031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536459
6273	NC_004116	GAA	2	6	282095	282100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536459
6274	NC_004116	TAG	2	6	282139	282144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536459
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6277	NC_004116	T	6	6	282232	282237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6278	NC_004116	CTT	2	6	282258	282263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6279	NC_004116	TAA	2	6	282270	282275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6280	NC_004116	TAAA	2	8	282298	282305	75 %	25 %	0 %	0 %	22536460
6281	NC_004116	CTT	2	6	282325	282330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536460
6282	NC_004116	TGAT	2	8	282391	282398	25 %	50 %	25 %	0 %	22536460
6283	NC_004116	TAT	2	6	282441	282446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536460
6284	NC_004116	CAGA	2	8	282483	282490	50 %	0 %	25 %	25 %	22536460
6285	NC_004116	AGA	3	9	282488	282496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536460
6286	NC_004116	TAA	2	6	282548	282553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536460
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6289	NC_004116	TAT	2	6	282594	282599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536460
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6292	NC_004116	ATC	2	6	282756	282761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536460
6293	NC_004116	AAGA	2	8	282823	282830	75 %	0 %	25 %	0 %	22536460
6294	NC_004116	CCTT	2	8	282863	282870	0 %	50 %	0 %	50 %	22536460
6295	NC_004116	T	6	6	282902	282907	0 %	100 %	0 %	0 %	22536460
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6305	NC_004116	TTAA	2	8	283179	283186	50 %	50 %	0 %	0 %	22536460
6306	NC_004116	TAT	2	6	283287	283292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536460
6307	NC_004116	ATTG	2	8	283391	283398	25 %	50 %	25 %	0 %	22536460
6308	NC_004116	A	6	6	283405	283410	100 %	0 %	0 %	0 %	22536460
6309	NC_004116	AGC	2	6	283574	283579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536460
6310	NC_004116	AAAG	2	8	283634	283641	75 %	0 %	25 %	0 %	22536461
6311	NC_004116	CTTT	2	8	283661	283668	0 %	75 %	0 %	25 %	22536461
6312	NC_004116	T	6	6	283666	283671	0 %	100 %	0 %	0 %	22536461
6313	NC_004116	CTC	2	6	283680	283685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536461
6314	NC_004116	TTA	2	6	283709	283714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536461
6315	NC_004116	AT	3	6	283747	283752	50 %	50 %	0 %	0 %	22536461
6316	NC_004116	AAT	2	6	283754	283759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536461
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6320	NC_004116	TGA	2	6	283872	283877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536461
6321	NC_004116	TTTA	2	8	283909	283916	25 %	75 %	0 %	0 %	22536461
6322	NC_004116	TGA	2	6	284053	284058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536461
6323	NC_004116	TAT	2	6	284078	284083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536461
6324	NC_004116	ATT	2	6	284086	284091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536461
6325	NC_004116	TTAGAC	2	12	284138	284149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536461
6326	NC_004116	TCA	2	6	284203	284208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536461
6327	NC_004116	TCA	2	6	284236	284241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536461
6328	NC_004116	A	6	6	284259	284264	100 %	0 %	0 %	0 %	22536461
6329	NC_004116	CAAT	2	8	284427	284434	50 %	25 %	0 %	25 %	22536461
6330	NC_004116	CAT	2	6	284446	284451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536461
6331	NC_004116	ATT	2	6	284468	284473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536461
6332	NC_004116	ATC	2	6	284492	284497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536461
6333	NC_004116	ATCAG	2	10	284533	284542	40 %	20 %	20 %	20 %	22536461
6334	NC_004116	TA	3	6	284565	284570	50 %	50 %	0 %	0 %	22536461
6335	NC_004116	ATT	3	9	284574	284582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536461
6336	NC_004116	AAC	2	6	284607	284612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536461
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6338	NC_004116	CAT	2	6	284666	284671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536461
6339	NC_004116	AGA	2	6	284679	284684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536461
6340	NC_004116	AGA	2	6	284719	284724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536461
6341	NC_004116	GTT	2	6	284727	284732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536461
6342	NC_004116	TTG	2	6	284750	284755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536461
6343	NC_004116	A	6	6	284784	284789	100 %	0 %	0 %	0 %	22536461
6344	NC_004116	TTG	2	6	284840	284845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536461
6345	NC_004116	ACA	2	6	284860	284865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536461
6346	NC_004116	TAA	2	6	284875	284880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536461
6347	NC_004116	TTAT	2	8	284928	284935	25 %	75 %	0 %	0 %	22536461
6348	NC_004116	TAA	2	6	284980	284985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536461
6349	NC_004116	TTAT	2	8	285024	285031	25 %	75 %	0 %	0 %	22536461
6350	NC_004116	GTT	2	6	285139	285144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6351	NC_004116	AGC	2	6	285233	285238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536462
6352	NC_004116	CTT	2	6	285384	285389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536462
6353	NC_004116	TGA	2	6	285428	285433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536462
6354	NC_004116	CAA	2	6	285508	285513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536462
6355	NC_004116	GCT	2	6	285576	285581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536462
6356	NC_004116	TAA	2	6	285587	285592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536462
6357	NC_004116	GTT	2	6	285643	285648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536462
6358	NC_004116	AAG	2	6	285667	285672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536462
6359	NC_004116	CTT	2	6	285714	285719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536462
6360	NC_004116	AGA	2	6	285770	285775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536462
6361	NC_004116	TGC	2	6	285848	285853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536462
6362	NC_004116	GCT	2	6	285864	285869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536462
6363	NC_004116	ACCA	2	8	285887	285894	50 %	0 %	0 %	50 %	22536462
6364	NC_004116	TAT	2	6	285911	285916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536462
6365	NC_004116	AAG	2	6	285993	285998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536462
6366	NC_004116	TATG	2	8	286002	286009	25 %	50 %	25 %	0 %	22536462
6367	NC_004116	CTG	2	6	286033	286038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536462
6368	NC_004116	GTG	2	6	286075	286080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536462
6369	NC_004116	AGA	2	6	286088	286093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536462
6370	NC_004116	AAG	2	6	286156	286161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536462
6371	NC_004116	TCA	2	6	286212	286217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536462
6372	NC_004116	CAA	2	6	286239	286244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536462
6373	NC_004116	CAA	2	6	286251	286256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536462
6374	NC_004116	CAG	2	6	286291	286296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536462
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