MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 48304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004116	ATT	2	6	227031	227036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536391
5002	NC_004116	GTATT	2	10	227048	227057	20 %	60 %	20 %	0 %	22536391
5003	NC_004116	AAC	2	6	227099	227104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536391
5004	NC_004116	AAG	2	6	227108	227113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536391
5005	NC_004116	CTG	2	6	227138	227143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536391
5006	NC_004116	TGAT	2	8	227217	227224	25 %	50 %	25 %	0 %	22536391
5007	NC_004116	TTAA	2	8	227378	227385	50 %	50 %	0 %	0 %	22536392
5008	NC_004116	AGA	2	6	227395	227400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536392
5009	NC_004116	TGA	2	6	227413	227418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536392
5010	NC_004116	ATT	2	6	227483	227488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536392
5011	NC_004116	GTG	2	6	227575	227580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536392
5012	NC_004116	AG	3	6	227609	227614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_004116	CT	3	6	227623	227628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_004116	T	6	6	227628	227633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_004116	TTG	2	6	227650	227655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_004116	ATA	2	6	227700	227705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536393
5017	NC_004116	AGA	2	6	227731	227736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536393
5018	NC_004116	AG	3	6	227773	227778	50 %	0 %	50 %	0 %	22536393
5019	NC_004116	TAA	2	6	227797	227802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536393
5020	NC_004116	A	8	8	227865	227872	100 %	0 %	0 %	0 %	22536393
5021	NC_004116	A	7	7	227894	227900	100 %	0 %	0 %	0 %	22536393
5022	NC_004116	TGG	2	6	227920	227925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536393
5023	NC_004116	GAA	2	6	228005	228010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536393
5024	NC_004116	GACC	2	8	228040	228047	25 %	0 %	25 %	50 %	22536393
5025	NC_004116	TTCTA	2	10	228061	228070	20 %	60 %	0 %	20 %	22536393
5026	NC_004116	TAT	2	6	228100	228105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536393
5027	NC_004116	ATA	2	6	228339	228344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536393
5028	NC_004116	A	6	6	228460	228465	100 %	0 %	0 %	0 %	22536393
5029	NC_004116	AGA	2	6	228546	228551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536394
5030	NC_004116	ATT	2	6	228610	228615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536394
5031	NC_004116	GAG	2	6	228691	228696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536394
5032	NC_004116	AGC	2	6	228726	228731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536394
5033	NC_004116	AATC	2	8	228742	228749	50 %	25 %	0 %	25 %	22536394
5034	NC_004116	ATG	2	6	228929	228934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536394
5035	NC_004116	AAC	2	6	228935	228940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536394
5036	NC_004116	T	6	6	228957	228962	0 %	100 %	0 %	0 %	22536394
5037	NC_004116	AGCC	2	8	228992	228999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_004116	T	7	7	229005	229011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_004116	ATA	2	6	229015	229020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_004116	ACT	2	6	229026	229031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_004116	AAATAA	2	12	229041	229052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_004116	A	6	6	229195	229200	100 %	0 %	0 %	0 %	22536395
5043	NC_004116	CTT	2	6	229211	229216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536395
5044	NC_004116	ACA	2	6	229248	229253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536395
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5046	NC_004116	T	6	6	229285	229290	0 %	100 %	0 %	0 %	22536395
5047	NC_004116	AAG	2	6	229486	229491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536395
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5049	NC_004116	A	6	6	229516	229521	100 %	0 %	0 %	0 %	22536395
5050	NC_004116	A	6	6	229701	229706	100 %	0 %	0 %	0 %	22536395
5051	NC_004116	CAA	2	6	229732	229737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536395
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5053	NC_004116	GA	3	6	229777	229782	50 %	0 %	50 %	0 %	22536395
5054	NC_004116	TTA	2	6	229812	229817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536395
5055	NC_004116	GAA	2	6	229833	229838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536395
5056	NC_004116	TTA	2	6	229840	229845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536395
5057	NC_004116	GAA	2	6	229914	229919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536395
5058	NC_004116	ATG	2	6	229993	229998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_004116	TAG	2	6	230015	230020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_004116	TAT	2	6	230027	230032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_004116	A	6	6	230033	230038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_004116	ACA	3	9	230071	230079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536396
5063	NC_004116	TAA	2	6	230157	230162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536396
5064	NC_004116	GT	3	6	230168	230173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_004116	TAA	2	6	230186	230191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_004116	TTTA	2	8	230199	230206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_004116	TCTAA	2	10	230232	230241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5068	NC_004116	TC	3	6	230248	230253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_004116	TGA	2	6	230261	230266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_004116	TTG	2	6	230286	230291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536397
5071	NC_004116	GAT	2	6	230377	230382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536397
5072	NC_004116	TAC	2	6	230434	230439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_004116	TAT	2	6	230508	230513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_004116	GCC	2	6	230558	230563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_004116	GAT	2	6	230624	230629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_004116	ATAAA	2	10	230650	230659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_004116	AACAA	2	10	230812	230821	80 %	0 %	0 %	20 %	22536398
5078	NC_004116	GTT	2	6	230863	230868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536398
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5082	NC_004116	CACAC	2	10	230946	230955	40 %	0 %	0 %	60 %	22536398
5083	NC_004116	A	6	6	231013	231018	100 %	0 %	0 %	0 %	22536398
5084	NC_004116	CTA	2	6	231033	231038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536398
5085	NC_004116	CACT	2	8	231039	231046	25 %	25 %	0 %	50 %	22536398
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5088	NC_004116	TTGA	2	8	231112	231119	25 %	50 %	25 %	0 %	22536398
5089	NC_004116	TTG	2	6	231188	231193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536398
5090	NC_004116	TGC	2	6	231210	231215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536398
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5092	NC_004116	TA	3	6	231270	231275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_004116	GCACAA	2	12	231279	231290	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22536399
5094	NC_004116	CGTT	2	8	231329	231336	0 %	50 %	25 %	25 %	22536399
5095	NC_004116	CAAT	2	8	231361	231368	50 %	25 %	0 %	25 %	22536399
5096	NC_004116	A	6	6	231369	231374	100 %	0 %	0 %	0 %	22536399
5097	NC_004116	AGA	2	6	231380	231385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536399
5098	NC_004116	CAAC	2	8	231419	231426	50 %	0 %	0 %	50 %	22536399
5099	NC_004116	GGT	2	6	231480	231485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536399
5100	NC_004116	CTT	2	6	231582	231587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536399
5101	NC_004116	A	6	6	231615	231620	100 %	0 %	0 %	0 %	22536399
5102	NC_004116	T	7	7	231722	231728	0 %	100 %	0 %	0 %	22536400
5103	NC_004116	T	6	6	231733	231738	0 %	100 %	0 %	0 %	22536400
5104	NC_004116	T	6	6	231751	231756	0 %	100 %	0 %	0 %	22536400
5105	NC_004116	T	6	6	231785	231790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_004116	TGAC	2	8	231828	231835	25 %	25 %	25 %	25 %	22536401
5107	NC_004116	TCT	2	6	231839	231844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536401
5108	NC_004116	AGT	2	6	231847	231852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536401
5109	NC_004116	ACT	2	6	231886	231891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536401
5110	NC_004116	ATC	2	6	231941	231946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536401
5111	NC_004116	GTT	2	6	232024	232029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536401
5112	NC_004116	CTTTT	2	10	232129	232138	0 %	80 %	0 %	20 %	22536401
5113	NC_004116	TCTT	2	8	232194	232201	0 %	75 %	0 %	25 %	22536401
5114	NC_004116	TGA	2	6	232584	232589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536401
5115	NC_004116	GTT	2	6	232685	232690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536401
5116	NC_004116	TGA	2	6	232761	232766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536401
5117	NC_004116	T	6	6	232921	232926	0 %	100 %	0 %	0 %	22536401
5118	NC_004116	TAT	2	6	233013	233018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536402
5119	NC_004116	T	7	7	233018	233024	0 %	100 %	0 %	0 %	22536402
5120	NC_004116	TC	3	6	233036	233041	0 %	50 %	0 %	50 %	22536402
5121	NC_004116	CTT	2	6	233047	233052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536402
5122	NC_004116	TCA	2	6	233094	233099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536402
5123	NC_004116	T	6	6	233119	233124	0 %	100 %	0 %	0 %	22536402
5124	NC_004116	T	7	7	233173	233179	0 %	100 %	0 %	0 %	22536402
5125	NC_004116	AAT	2	6	233212	233217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536402
5126	NC_004116	A	7	7	233246	233252	100 %	0 %	0 %	0 %	22536402
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5128	NC_004116	TTG	2	6	233275	233280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536402
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5138	NC_004116	T	6	6	233575	233580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_004116	A	7	7	239020	239026	100 %	0 %	0 %	0 %	22536411
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5257	NC_004116	AAT	2	6	239165	239170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536411
5258	NC_004116	A	6	6	239191	239196	100 %	0 %	0 %	0 %	22536411
5259	NC_004116	TGA	2	6	239281	239286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536411
5260	NC_004116	AGA	2	6	239287	239292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536411
5261	NC_004116	AC	3	6	239340	239345	50 %	0 %	0 %	50 %	22536411
5262	NC_004116	ATC	2	6	239358	239363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536411
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5264	NC_004116	GAA	2	6	239454	239459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_004116	ATTC	2	8	239488	239495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5266	NC_004116	A	6	6	239496	239501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_004116	CCT	2	6	239533	239538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5268	NC_004116	TTGA	2	8	239594	239601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_004116	TTGT	2	8	239626	239633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_004116	CTA	2	6	239666	239671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_004116	TTTA	2	8	240386	240393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_004116	A	7	7	240410	240416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_004116	A	7	7	240423	240429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_004116	ATTG	2	8	240435	240442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5287	NC_004116	T	6	6	240547	240552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_004116	AAT	2	6	240590	240595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_004116	T	6	6	240710	240715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_004116	TAT	2	6	240798	240803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_004116	A	7	7	240850	240856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5292	NC_004116	ATG	2	6	240867	240872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536414
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5305	NC_004116	GAT	2	6	241231	241236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_004116	TTTAT	2	10	243762	243771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_004116	T	6	6	243788	243793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_004116	TTG	2	6	243858	243863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_004116	AT	3	6	243894	243899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_004116	A	7	7	243926	243932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_004116	AT	3	6	243965	243970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_004116	TA	3	6	243974	243979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_004116	T	6	6	244020	244025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5378	NC_004116	ACT	2	6	244102	244107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5379	NC_004116	AGATG	2	10	244137	244146	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_004116	A	7	7	244169	244175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_004116	ATG	2	6	244182	244187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536421
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5383	NC_004116	AGA	2	6	244271	244276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536421
5384	NC_004116	TGATA	2	10	244282	244291	40 %	40 %	20 %	0 %	22536421
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5386	NC_004116	AT	3	6	244326	244331	50 %	50 %	0 %	0 %	22536422
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