MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 25867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004070	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004070	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004070	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909537
4	NC_004070	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
5	NC_004070	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
6	NC_004070	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909537
7	NC_004070	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
8	NC_004070	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909537
9	NC_004070	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909537
10	NC_004070	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909537
11	NC_004070	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
12	NC_004070	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909537
13	NC_004070	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909537
14	NC_004070	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
15	NC_004070	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909537
16	NC_004070	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
17	NC_004070	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
18	NC_004070	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909537
19	NC_004070	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909537
20	NC_004070	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909537
21	NC_004070	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004070	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004070	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004070	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004070	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
26	NC_004070	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909538
27	NC_004070	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
28	NC_004070	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
29	NC_004070	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909538
30	NC_004070	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909538
31	NC_004070	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909538
32	NC_004070	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
33	NC_004070	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
34	NC_004070	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909538
35	NC_004070	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909538
36	NC_004070	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909538
37	NC_004070	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909538
38	NC_004070	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
39	NC_004070	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909538
40	NC_004070	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909538
41	NC_004070	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004070	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004070	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909539
44	NC_004070	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004070	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004070	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004070	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004070	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004070	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
50	NC_004070	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909540
51	NC_004070	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
52	NC_004070	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909540
53	NC_004070	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909540
54	NC_004070	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
55	NC_004070	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
56	NC_004070	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
57	NC_004070	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
58	NC_004070	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909540
59	NC_004070	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
60	NC_004070	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909540
61	NC_004070	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909540
62	NC_004070	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
63	NC_004070	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
64	NC_004070	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
65	NC_004070	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909540
66	NC_004070	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909540
67	NC_004070	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004070	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909541
69	NC_004070	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909541
70	NC_004070	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909541
71	NC_004070	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909541
72	NC_004070	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909541
73	NC_004070	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909541
74	NC_004070	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909541
75	NC_004070	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909541
76	NC_004070	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909541
77	NC_004070	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909541
78	NC_004070	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909541
79	NC_004070	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004070	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004070	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
82	NC_004070	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
83	NC_004070	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
84	NC_004070	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
85	NC_004070	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909542
86	NC_004070	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
87	NC_004070	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
88	NC_004070	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
89	NC_004070	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
90	NC_004070	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
91	NC_004070	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
92	NC_004070	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
93	NC_004070	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909542
94	NC_004070	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909542
95	NC_004070	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909542
96	NC_004070	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
97	NC_004070	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909542
98	NC_004070	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
99	NC_004070	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909542
100	NC_004070	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909542
101	NC_004070	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
102	NC_004070	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
103	NC_004070	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
104	NC_004070	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
105	NC_004070	TGA	3	9	7048	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
106	NC_004070	AGA	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
107	NC_004070	TAG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
108	NC_004070	CAG	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909542
109	NC_004070	GTA	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
110	NC_004070	ATT	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
111	NC_004070	AAC	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909542
112	NC_004070	AAT	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909542
113	NC_004070	GGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909542
114	NC_004070	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
115	NC_004070	ATC	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909542
116	NC_004070	GAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
117	NC_004070	GAG	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909542
118	NC_004070	ATT	2	6	8200	8205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
119	NC_004070	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
120	NC_004070	AAT	2	6	8501	8506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909542
121	NC_004070	CTT	2	6	8532	8537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909542
122	NC_004070	ATT	2	6	8559	8564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
123	NC_004070	AGA	2	6	8668	8673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
124	NC_004070	ATA	2	6	8737	8742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909542
125	NC_004070	AAC	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004070	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004070	TTA	2	6	8936	8941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909543
128	NC_004070	CGT	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909543
129	NC_004070	AAG	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909543
130	NC_004070	GAA	2	6	9163	9168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909543
131	NC_004070	AAT	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909544
132	NC_004070	GAA	4	12	9230	9241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909544
133	NC_004070	ATG	2	6	9284	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909544
134	NC_004070	GGT	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909544
135	NC_004070	GAT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909544
136	NC_004070	ATG	3	9	9529	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909544
137	NC_004070	AGA	2	6	9624	9629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004070	ATT	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
139	NC_004070	CTT	2	6	10106	10111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909545
140	NC_004070	TTA	2	6	10170	10175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
141	NC_004070	TGA	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909545
142	NC_004070	AAG	2	6	10205	10210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909545
143	NC_004070	ATA	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909545
144	NC_004070	ATT	2	6	10280	10285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
145	NC_004070	CAC	2	6	10373	10378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909545
146	NC_004070	ATA	2	6	10511	10516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909545
147	NC_004070	CAA	2	6	10555	10560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909545
148	NC_004070	TTA	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
149	NC_004070	TCA	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909545
150	NC_004070	AGC	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909545
151	NC_004070	TTA	2	6	10675	10680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
152	NC_004070	ATG	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909545
153	NC_004070	ATC	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909545
154	NC_004070	ATT	2	6	10735	10740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
155	NC_004070	CAA	2	6	10768	10773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909545
156	NC_004070	TAT	2	6	10848	10853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909545
157	NC_004070	ATG	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909545
158	NC_004070	TGG	2	6	11033	11038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004070	AGA	2	6	11147	11152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909546
160	NC_004070	AGC	2	6	11231	11236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909546
161	NC_004070	TAT	2	6	11267	11272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
162	NC_004070	GAT	2	6	11316	11321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909546
163	NC_004070	TGA	2	6	11338	11343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909546
164	NC_004070	TTC	2	6	11477	11482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909546
165	NC_004070	ATT	2	6	11524	11529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
166	NC_004070	TAC	2	6	11636	11641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909546
167	NC_004070	ATT	2	6	11701	11706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
168	NC_004070	ATT	2	6	11753	11758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
169	NC_004070	TAT	3	9	11787	11795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
170	NC_004070	TAT	2	6	11808	11813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
171	NC_004070	ATT	2	6	11920	11925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
172	NC_004070	TAT	2	6	12110	12115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909546
173	NC_004070	TAA	2	6	12155	12160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909546
174	NC_004070	ATT	2	6	12286	12291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909547
175	NC_004070	GTA	2	6	12436	12441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909547
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177	NC_004070	GTG	2	6	12470	12475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909547
178	NC_004070	TTG	2	6	12530	12535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909547
179	NC_004070	ATT	2	6	12541	12546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909547
180	NC_004070	GTT	2	6	12646	12651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909547
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182	NC_004070	ATA	2	6	12812	12817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909548
183	NC_004070	AAT	2	6	12820	12825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909548
184	NC_004070	TGA	2	6	12857	12862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909548
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186	NC_004070	TCA	2	6	12872	12877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909548
187	NC_004070	GTA	2	6	12995	13000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909548
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189	NC_004070	CTT	2	6	13215	13220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909548
190	NC_004070	TGC	2	6	13248	13253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909548
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218	NC_004070	AAT	2	6	14994	14999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_004070	AGA	2	6	15000	15005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
220	NC_004070	AGA	2	6	15008	15013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
221	NC_004070	TAG	2	6	15076	15081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
222	NC_004070	GCT	2	6	15245	15250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909549
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241	NC_004070	ATA	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_004070	TAA	2	6	16830	16835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_004070	AGT	2	6	16884	16889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_004070	AAG	2	6	16919	16924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_004070	GGC	2	6	17102	17107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_004070	CGC	2	6	17468	17473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
249	NC_004070	TGT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_004070	AGA	2	6	17516	17521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_004070	ATG	2	6	17522	17527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_004070	CCA	2	6	17543	17548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_004070	CAG	2	6	17590	17595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_004070	GGA	2	6	17780	17785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_004070	GTC	2	6	18132	18137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_004070	CAT	2	6	18200	18205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_004070	TAA	2	6	18235	18240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_004070	GGA	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_004070	ATC	2	6	18268	18273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_004070	CAC	2	6	18479	18484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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