MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004070	A	6	6	161158	161163	100 %	0 %	0 %	0 %	21909671
3502	NC_004070	TTGAA	2	10	161285	161294	40 %	40 %	20 %	0 %	21909671
3503	NC_004070	GCT	3	9	161326	161334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909671
3504	NC_004070	AGA	2	6	161346	161351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909671
3505	NC_004070	TCA	2	6	161360	161365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909671
3506	NC_004070	CT	3	6	161381	161386	0 %	50 %	0 %	50 %	21909671
3507	NC_004070	TCA	2	6	161453	161458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909671
3508	NC_004070	CAT	2	6	161466	161471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909671
3509	NC_004070	CGA	2	6	161486	161491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909671
3510	NC_004070	CTT	2	6	161506	161511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3511	NC_004070	ATC	2	6	161557	161562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909671
3512	NC_004070	CAA	3	9	161650	161658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909671
3513	NC_004070	A	6	6	161701	161706	100 %	0 %	0 %	0 %	21909671
3514	NC_004070	GAA	2	6	161707	161712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909671
3515	NC_004070	CTT	2	6	161739	161744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3516	NC_004070	TGT	2	6	161763	161768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909671
3517	NC_004070	AAGC	2	8	161878	161885	50 %	0 %	25 %	25 %	21909671
3518	NC_004070	TTC	2	6	161887	161892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3519	NC_004070	CT	3	6	161910	161915	0 %	50 %	0 %	50 %	21909671
3520	NC_004070	TGTT	2	8	161960	161967	0 %	75 %	25 %	0 %	21909671
3521	NC_004070	TTC	2	6	162060	162065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3522	NC_004070	CTT	2	6	162124	162129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3523	NC_004070	GTG	2	6	162218	162223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909671
3524	NC_004070	AGC	2	6	162231	162236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909671
3525	NC_004070	TAT	2	6	162261	162266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909671
3526	NC_004070	TGCTGT	2	12	162282	162293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21909671
3527	NC_004070	GGT	2	6	162313	162318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909671
3528	NC_004070	TTC	2	6	162341	162346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3529	NC_004070	TCT	2	6	162410	162415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909671
3530	NC_004070	TAC	2	6	162466	162471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909671
3531	NC_004070	AACAA	2	10	162522	162531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3532	NC_004070	TAA	2	6	162532	162537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004070	GGA	2	6	162547	162552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004070	A	6	6	162552	162557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_004070	TCAG	2	8	162661	162668	25 %	25 %	25 %	25 %	21909672
3536	NC_004070	CTT	2	6	162669	162674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909672
3537	NC_004070	TTGG	2	8	162773	162780	0 %	50 %	50 %	0 %	21909672
3538	NC_004070	GATG	2	8	162793	162800	25 %	25 %	50 %	0 %	21909672
3539	NC_004070	AAG	2	6	162825	162830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909672
3540	NC_004070	CTCTTT	2	12	162884	162895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_004070	GT	4	8	162920	162927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_004070	ACA	2	6	162986	162991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909673
3543	NC_004070	TGAT	2	8	163058	163065	25 %	50 %	25 %	0 %	21909673
3544	NC_004070	TAC	2	6	163087	163092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909673
3545	NC_004070	CAT	2	6	163098	163103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909673
3546	NC_004070	TTA	2	6	163128	163133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909673
3547	NC_004070	CA	3	6	163291	163296	50 %	0 %	0 %	50 %	21909673
3548	NC_004070	TGG	2	6	163355	163360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909673
3549	NC_004070	AGA	2	6	163395	163400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909673
3550	NC_004070	CTTA	2	8	163415	163422	25 %	50 %	0 %	25 %	21909673
3551	NC_004070	ATG	2	6	163473	163478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_004070	AGC	2	6	163599	163604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909674
3553	NC_004070	GTTT	2	8	163648	163655	0 %	75 %	25 %	0 %	21909674
3554	NC_004070	GTG	2	6	163775	163780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909674
3555	NC_004070	CGA	2	6	163808	163813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909674
3556	NC_004070	AGC	2	6	163827	163832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909674
3557	NC_004070	AAG	2	6	163847	163852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909674
3558	NC_004070	ACC	2	6	163952	163957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909674
3559	NC_004070	CTT	2	6	163972	163977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909674
3560	NC_004070	ATTG	2	8	164022	164029	25 %	50 %	25 %	0 %	21909674
3561	NC_004070	TGG	2	6	164055	164060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909674
3562	NC_004070	AGA	2	6	164139	164144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909674
3563	NC_004070	CTG	2	6	164147	164152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909674
3564	NC_004070	GCG	2	6	164155	164160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909674
3565	NC_004070	TGA	2	6	164314	164319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909675
3566	NC_004070	GC	3	6	164336	164341	0 %	0 %	50 %	50 %	21909675
3567	NC_004070	GAA	2	6	164357	164362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909675
3568	NC_004070	TGA	2	6	164487	164492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909675
3569	NC_004070	GAA	2	6	164564	164569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909675
3570	NC_004070	GAA	2	6	164630	164635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909675
3571	NC_004070	TG	3	6	164897	164902	0 %	50 %	50 %	0 %	21909675
3572	NC_004070	T	6	6	164953	164958	0 %	100 %	0 %	0 %	21909675
3573	NC_004070	GGA	2	6	164992	164997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909675
3574	NC_004070	GCT	2	6	165005	165010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909675
3575	NC_004070	AAG	2	6	165015	165020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909675
3576	NC_004070	ATA	2	6	165064	165069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909675
3577	NC_004070	TCA	2	6	165196	165201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909676
3578	NC_004070	TGG	2	6	165244	165249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909676
3579	NC_004070	CTT	2	6	165292	165297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909676
3580	NC_004070	CACT	2	8	165359	165366	25 %	25 %	0 %	50 %	21909676
3581	NC_004070	CAGG	2	8	165390	165397	25 %	0 %	50 %	25 %	21909676
3582	NC_004070	GCTC	2	8	165459	165466	0 %	25 %	25 %	50 %	21909676
3583	NC_004070	TC	3	6	165465	165470	0 %	50 %	0 %	50 %	21909676
3584	NC_004070	AGA	2	6	165524	165529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909676
3585	NC_004070	GTG	2	6	165573	165578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909676
3586	NC_004070	AGA	2	6	165644	165649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909676
3587	NC_004070	AATC	2	8	165680	165687	50 %	25 %	0 %	25 %	21909676
3588	NC_004070	ATT	2	6	165727	165732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909676
3589	NC_004070	TTA	2	6	165755	165760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909676
3590	NC_004070	TTA	2	6	165788	165793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_004070	TGT	2	6	165920	165925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_004070	GGTGTT	2	12	165950	165961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_004070	TTA	2	6	166004	166009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_004070	GGAT	2	8	166067	166074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_004070	AG	3	6	166079	166084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_004070	ATG	2	6	166098	166103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3597	NC_004070	CGT	2	6	166200	166205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909677
3598	NC_004070	TTA	2	6	166211	166216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909677
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3600	NC_004070	CGG	2	6	166297	166302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909677
3601	NC_004070	GCT	2	6	166311	166316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909677
3602	NC_004070	TTA	3	9	166323	166331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909677
3603	NC_004070	GAA	2	6	166332	166337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909677
3604	NC_004070	TGA	2	6	166367	166372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3605	NC_004070	GAC	2	6	166378	166383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909677
3606	NC_004070	ATG	2	6	166447	166452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3607	NC_004070	CTGA	2	8	166479	166486	25 %	25 %	25 %	25 %	21909677
3608	NC_004070	GAA	2	6	166494	166499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909677
3609	NC_004070	ACAA	2	8	166507	166514	75 %	0 %	0 %	25 %	21909677
3610	NC_004070	ATT	2	6	166552	166557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909677
3611	NC_004070	AT	3	6	166642	166647	50 %	50 %	0 %	0 %	21909677
3612	NC_004070	AGCT	2	8	166739	166746	25 %	25 %	25 %	25 %	21909677
3613	NC_004070	ATTTG	2	10	166870	166879	20 %	60 %	20 %	0 %	21909677
3614	NC_004070	AG	3	6	166917	166922	50 %	0 %	50 %	0 %	21909677
3615	NC_004070	GAT	2	6	166950	166955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3616	NC_004070	GATGTT	2	12	166976	166987	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21909677
3617	NC_004070	AGATCA	2	12	167000	167011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21909677
3618	NC_004070	ATG	2	6	167032	167037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3619	NC_004070	GAC	2	6	167129	167134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909677
3620	NC_004070	T	7	7	167173	167179	0 %	100 %	0 %	0 %	21909677
3621	NC_004070	GAA	2	6	167217	167222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909677
3622	NC_004070	GAT	2	6	167289	167294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909677
3623	NC_004070	AAT	2	6	167337	167342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909677
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3625	NC_004070	TTG	2	6	167509	167514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909677
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