MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004070	TTG	2	6	138163	138168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909651
3002	NC_004070	CCA	2	6	138177	138182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909651
3003	NC_004070	TTTATT	2	12	138207	138218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21909651
3004	NC_004070	T	6	6	138294	138299	0 %	100 %	0 %	0 %	21909651
3005	NC_004070	GGA	2	6	138318	138323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909651
3006	NC_004070	ATGTCA	2	12	138358	138369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21909651
3007	NC_004070	GAA	2	6	138372	138377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909651
3008	NC_004070	GGA	2	6	138386	138391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909651
3009	NC_004070	ATT	2	6	138416	138421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909652
3010	NC_004070	TGG	2	6	138432	138437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909652
3011	NC_004070	TTC	2	6	138442	138447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909652
3012	NC_004070	GGT	2	6	138514	138519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909652
3013	NC_004070	AGA	2	6	138543	138548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909652
3014	NC_004070	TTG	2	6	138707	138712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909652
3015	NC_004070	AGC	2	6	138807	138812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909652
3016	NC_004070	GTC	2	6	138844	138849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909652
3017	NC_004070	TAAA	2	8	138863	138870	75 %	25 %	0 %	0 %	21909652
3018	NC_004070	A	6	6	138904	138909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004070	AAG	2	6	138997	139002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909653
3020	NC_004070	AAAGC	2	10	139083	139092	60 %	0 %	20 %	20 %	21909653
3021	NC_004070	GCA	3	9	139136	139144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909653
3022	NC_004070	AAGA	2	8	139156	139163	75 %	0 %	25 %	0 %	21909653
3023	NC_004070	CTA	2	6	139170	139175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909653
3024	NC_004070	CTT	2	6	139213	139218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909653
3025	NC_004070	GAA	3	9	139245	139253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909653
3026	NC_004070	T	6	6	139259	139264	0 %	100 %	0 %	0 %	21909653
3027	NC_004070	A	6	6	139318	139323	100 %	0 %	0 %	0 %	21909653
3028	NC_004070	AGTTC	2	10	139333	139342	20 %	40 %	20 %	20 %	21909653
3029	NC_004070	GCTGA	2	10	139353	139362	20 %	20 %	40 %	20 %	21909653
3030	NC_004070	ATT	2	6	139450	139455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909653
3031	NC_004070	GTT	2	6	139479	139484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909653
3032	NC_004070	AGA	2	6	139487	139492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909653
3033	NC_004070	CAT	2	6	139502	139507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909653
3034	NC_004070	T	6	6	139516	139521	0 %	100 %	0 %	0 %	21909653
3035	NC_004070	AGG	2	6	139531	139536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909653
3036	NC_004070	ACT	2	6	139572	139577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909654
3037	NC_004070	ACA	2	6	139644	139649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909654
3038	NC_004070	CAGT	2	8	139671	139678	25 %	25 %	25 %	25 %	21909654
3039	NC_004070	ATCT	2	8	139724	139731	25 %	50 %	0 %	25 %	21909654
3040	NC_004070	ATT	2	6	139799	139804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909654
3041	NC_004070	GTT	2	6	139838	139843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909654
3042	NC_004070	AAAGCT	2	12	139845	139856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21909654
3043	NC_004070	TTA	2	6	139878	139883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909654
3044	NC_004070	TGG	2	6	139906	139911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909654
3045	NC_004070	TGA	2	6	139943	139948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909654
3046	NC_004070	GGT	2	6	139961	139966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909654
3047	NC_004070	CAA	2	6	140097	140102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909654
3048	NC_004070	TGAT	2	8	140116	140123	25 %	50 %	25 %	0 %	21909654
3049	NC_004070	ATG	2	6	140181	140186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909654
3050	NC_004070	TTA	2	6	140190	140195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909654
3051	NC_004070	TGA	2	6	140198	140203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909654
3052	NC_004070	GAT	2	6	140241	140246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909654
3053	NC_004070	TGA	2	6	140254	140259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909654
3054	NC_004070	TTG	2	6	140362	140367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909654
3055	NC_004070	ATTT	2	8	140383	140390	25 %	75 %	0 %	0 %	21909654
3056	NC_004070	A	6	6	140462	140467	100 %	0 %	0 %	0 %	21909654
3057	NC_004070	GCT	2	6	140484	140489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909654
3058	NC_004070	GAT	2	6	140605	140610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909655
3059	NC_004070	TAA	2	6	140631	140636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909655
3060	NC_004070	TAT	2	6	140689	140694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909655
3061	NC_004070	AGA	2	6	140704	140709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909655
3062	NC_004070	TGC	2	6	140713	140718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909655
3063	NC_004070	CTCA	2	8	140735	140742	25 %	25 %	0 %	50 %	21909655
3064	NC_004070	CAG	2	6	140763	140768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909655
3065	NC_004070	TCA	2	6	140785	140790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909655
3066	NC_004070	TGA	2	6	140922	140927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004070	AGC	2	6	140957	140962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_004070	TTAG	2	8	141025	141032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_004070	A	6	6	141043	141048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_004070	AGG	2	6	141052	141057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_004070	ATA	2	6	141079	141084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485755
3072	NC_004070	TTG	2	6	141101	141106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485755
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3074	NC_004070	ATT	2	6	141178	141183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161485755
3075	NC_004070	AGT	2	6	141252	141257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485755
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3079	NC_004070	AAG	2	6	141446	141451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485755
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3087	NC_004070	TCC	2	6	142239	142244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161485755
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3090	NC_004070	AGA	2	6	142476	142481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485755
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3092	NC_004070	GGA	2	6	142557	142562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161485755
3093	NC_004070	CTTT	2	8	142672	142679	0 %	75 %	0 %	25 %	161485755
3094	NC_004070	ATCGC	2	10	142727	142736	20 %	20 %	20 %	40 %	161485755
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3099	NC_004070	TGA	2	6	142889	142894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909657
3100	NC_004070	TTG	2	6	142895	142900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909657
3101	NC_004070	AGA	2	6	143091	143096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909657
3102	NC_004070	TCGT	2	8	143267	143274	0 %	50 %	25 %	25 %	21909657
3103	NC_004070	T	6	6	143291	143296	0 %	100 %	0 %	0 %	21909657
3104	NC_004070	TGA	2	6	143364	143369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909657
3105	NC_004070	ATGA	2	8	143428	143435	50 %	25 %	25 %	0 %	21909657
3106	NC_004070	GATC	2	8	143458	143465	25 %	25 %	25 %	25 %	21909657
3107	NC_004070	TTTA	2	8	143469	143476	25 %	75 %	0 %	0 %	21909657
3108	NC_004070	ACA	2	6	143533	143538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909657
3109	NC_004070	TCA	2	6	143579	143584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909657
3110	NC_004070	ATT	2	6	143600	143605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909657
3111	NC_004070	TC	3	6	143685	143690	0 %	50 %	0 %	50 %	21909657
3112	NC_004070	A	6	6	143725	143730	100 %	0 %	0 %	0 %	21909657
3113	NC_004070	AGA	2	6	143766	143771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909657
3114	NC_004070	ACCC	2	8	143779	143786	25 %	0 %	0 %	75 %	21909657
3115	NC_004070	ATT	2	6	143824	143829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909657
3116	NC_004070	TA	3	6	143843	143848	50 %	50 %	0 %	0 %	21909657
3117	NC_004070	TGC	2	6	143940	143945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909657
3118	NC_004070	TGT	2	6	144003	144008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909657
3119	NC_004070	GAA	3	9	144070	144078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909657
3120	NC_004070	GAA	2	6	144115	144120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909657
3121	NC_004070	TTGGG	2	10	144130	144139	0 %	40 %	60 %	0 %	21909657
3122	NC_004070	TTG	2	6	144142	144147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909657
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3124	NC_004070	TTG	2	6	144239	144244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909657
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