MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004070	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004070	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_004070	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004070	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004070	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_004070	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004070	C	6	6	21806	21811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_004070	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004070	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004070	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_004070	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_004070	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_004070	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_004070	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004070	T	6	6	22338	22343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004070	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_004070	T	6	6	22776	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004070	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_004070	AGA	2	6	22944	22949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_004070	AAAT	2	8	23021	23028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004070	AG	3	6	23072	23077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004070	GGC	2	6	23104	23109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_004070	ACCT	2	8	23195	23202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_004070	AG	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004070	CGA	2	6	23349	23354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_004070	GCA	2	6	23423	23428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_004070	CGC	2	6	23470	23475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_004070	GTGA	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004070	TGT	2	6	23509	23514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004070	AGA	2	6	23518	23523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004070	ATG	2	6	23524	23529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004070	CCA	2	6	23545	23550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_004070	TAAC	2	8	23559	23566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_004070	CAG	2	6	23592	23597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004070	AGCG	2	8	23647	23654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_004070	T	6	6	23662	23667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004070	AT	3	6	23776	23781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_004070	GGA	2	6	23782	23787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004070	CT	3	6	23807	23812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_004070	GAA	2	6	24046	24051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004070	GGT	2	6	24120	24125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004070	GTC	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004070	TCGTG	2	10	24143	24152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_004070	CAT	2	6	24202	24207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004070	TAA	2	6	24237	24242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004070	GGA	2	6	24246	24251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004070	ATC	2	6	24270	24275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_004070	AC	3	6	24297	24302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_004070	TGGT	2	8	24312	24319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004070	CGC	2	6	24436	24441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_004070	AC	3	6	24466	24471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_004070	CAC	2	6	24481	24486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_004070	AGCC	2	8	24529	24536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_004070	GAT	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004070	CCT	2	6	24608	24613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_004070	AGG	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004070	CTA	2	6	24753	24758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_004070	TG	3	6	24821	24826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004070	CA	3	6	24832	24837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_004070	AGCG	2	8	24875	24882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_004070	TA	3	6	24896	24901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004070	ATT	2	6	24995	25000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004070	TAA	2	6	25001	25006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004070	A	8	8	25019	25026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004070	TAA	2	6	25033	25038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004070	GTTAA	2	10	25040	25049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004070	GAA	2	6	25086	25091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004070	ACG	2	6	25103	25108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_004070	GTAA	2	8	25126	25133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004070	ACTA	2	8	25168	25175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_004070	GAAG	2	8	25208	25215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004070	TAG	2	6	25274	25279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004070	GCGA	2	8	25282	25289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_004070	AGG	2	6	25296	25301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004070	AGA	2	6	25362	25367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004070	AG	3	6	25390	25395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004070	GGA	2	6	25478	25483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004070	CT	3	6	25504	25509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_004070	GGGAG	2	10	25559	25568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004070	ACA	2	6	25596	25601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004070	ATG	2	6	25663	25668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004070	TGT	2	6	25733	25738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004070	GGA	2	6	25796	25801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004070	TC	3	6	25882	25887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_004070	ATC	2	6	26003	26008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_004070	ACC	2	6	26061	26066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_004070	AGC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004070	ATTC	2	8	26148	26155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_004070	TG	3	6	26272	26277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004070	AAG	2	6	26278	26283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004070	GAG	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004070	GA	3	6	26423	26428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004070	TA	3	6	26477	26482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004070	CTAA	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_004070	TAG	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004070	GA	3	6	26719	26724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004070	CT	3	6	26834	26839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_004070	GAT	2	6	26852	26857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004070	AGG	2	6	26897	26902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_004070	GA	3	6	27041	27046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004070	TAGG	2	8	27159	27166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004070	GTT	2	6	27203	27208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004070	TAC	2	6	27213	27218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004070	CCT	2	6	27301	27306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_004070	TTGG	2	8	27342	27349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004070	AATC	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_004070	GGT	2	6	27437	27442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_004070	TCG	2	6	27552	27557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004070	CGT	2	6	27632	27637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004070	AGGGA	2	10	27770	27779	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004070	C	6	6	27808	27813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
613	NC_004070	GA	3	6	27856	27861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004070	AGTGTA	2	12	27883	27894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004070	ACTAAT	2	12	27911	27922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
616	NC_004070	CAG	2	6	28073	28078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004070	GCTTA	2	10	28136	28145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
618	NC_004070	AC	3	6	28149	28154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_004070	AGT	2	6	28330	28335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_004070	T	6	6	28340	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004070	CGT	2	6	28670	28675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004070	T	6	6	28778	28783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004070	CTC	2	6	28849	28854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_004070	CGC	2	6	29015	29020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_004070	TAT	2	6	29021	29026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004070	ATT	2	6	29131	29136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004070	GGA	2	6	29139	29144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004070	GCGT	2	8	29198	29205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_004070	TCC	2	6	29222	29227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_004070	TCG	2	6	29262	29267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004070	GTT	2	6	29326	29331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004070	CGG	2	6	29379	29384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004070	TGT	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004070	GGT	2	6	29536	29541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004070	GGT	2	6	29571	29576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004070	AT	4	8	29595	29602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004070	TAAA	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004070	AGA	2	6	29763	29768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_004070	T	10	10	29780	29789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_004070	ATT	2	6	29831	29836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_004070	ACT	2	6	29864	29869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_004070	GTT	2	6	29909	29914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_004070	AAT	2	6	30039	30044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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