MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 40352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004070	TTA	2	6	208644	208649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_004070	ACCA	2	8	208689	208696	50 %	0 %	0 %	50 %	21909715
4503	NC_004070	CT	3	6	208763	208768	0 %	50 %	0 %	50 %	21909715
4504	NC_004070	TAT	2	6	208785	208790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909715
4505	NC_004070	CTG	2	6	208795	208800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909715
4506	NC_004070	GCT	2	6	208807	208812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909715
4507	NC_004070	AAG	2	6	208814	208819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909715
4508	NC_004070	TAT	2	6	208899	208904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909715
4509	NC_004070	A	6	6	208906	208911	100 %	0 %	0 %	0 %	21909715
4510	NC_004070	CGC	2	6	208919	208924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21909715
4511	NC_004070	TTA	2	6	208934	208939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909715
4512	NC_004070	ATG	2	6	209021	209026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909715
4513	NC_004070	TGA	2	6	209106	209111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909715
4514	NC_004070	ACC	2	6	209152	209157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909715
4515	NC_004070	ATTC	2	8	209260	209267	25 %	50 %	0 %	25 %	21909715
4516	NC_004070	AGA	2	6	209271	209276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909715
4517	NC_004070	TTG	3	9	209312	209320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909715
4518	NC_004070	AC	3	6	209403	209408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_004070	A	7	7	209412	209418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_004070	GAA	2	6	209439	209444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909716
4521	NC_004070	AGC	2	6	209487	209492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909716
4522	NC_004070	TGG	2	6	209560	209565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909716
4523	NC_004070	GAA	2	6	209619	209624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909716
4524	NC_004070	ATTG	2	8	209625	209632	25 %	50 %	25 %	0 %	21909716
4525	NC_004070	A	7	7	209932	209938	100 %	0 %	0 %	0 %	21909716
4526	NC_004070	ACA	2	6	209983	209988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909716
4527	NC_004070	GAT	2	6	209989	209994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4528	NC_004070	TTCT	2	8	210042	210049	0 %	75 %	0 %	25 %	21909716
4529	NC_004070	GGT	2	6	210064	210069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909716
4530	NC_004070	CTT	2	6	210087	210092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909716
4531	NC_004070	TAG	2	6	210105	210110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4532	NC_004070	GAT	2	6	210148	210153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4533	NC_004070	ATG	2	6	210208	210213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4534	NC_004070	ACG	2	6	210227	210232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909716
4535	NC_004070	TCCCAT	2	12	210353	210364	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21909716
4536	NC_004070	GAT	2	6	210367	210372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4537	NC_004070	TAA	2	6	210417	210422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909716
4538	NC_004070	TGA	2	6	210474	210479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909716
4539	NC_004070	TGT	2	6	210501	210506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_004070	CTT	2	6	210533	210538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_004070	A	6	6	210569	210574	100 %	0 %	0 %	0 %	21909717
4542	NC_004070	TAC	2	6	210604	210609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909717
4543	NC_004070	TGA	2	6	210678	210683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909717
4544	NC_004070	AGA	2	6	210690	210695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909717
4545	NC_004070	A	7	7	210736	210742	100 %	0 %	0 %	0 %	21909717
4546	NC_004070	CTT	2	6	210768	210773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_004070	CCTTT	2	10	210809	210818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4548	NC_004070	T	6	6	210816	210821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_004070	GA	3	6	210824	210829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004070	GA	4	8	210877	210884	50 %	0 %	50 %	0 %	21909718
4551	NC_004070	CTCAT	2	10	210887	210896	20 %	40 %	0 %	40 %	21909718
4552	NC_004070	GAT	2	6	210949	210954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909718
4553	NC_004070	T	6	6	210973	210978	0 %	100 %	0 %	0 %	21909718
4554	NC_004070	ATT	2	6	210981	210986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4555	NC_004070	TTG	2	6	211005	211010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909718
4556	NC_004070	ATT	2	6	211076	211081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4557	NC_004070	TGT	2	6	211099	211104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909718
4558	NC_004070	TTTTC	2	10	211107	211116	0 %	80 %	0 %	20 %	21909718
4559	NC_004070	GGC	2	6	211126	211131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909718
4560	NC_004070	CGTT	2	8	211160	211167	0 %	50 %	25 %	25 %	21909718
4561	NC_004070	TTTC	2	8	211180	211187	0 %	75 %	0 %	25 %	21909718
4562	NC_004070	TGT	2	6	211192	211197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909718
4563	NC_004070	GGT	2	6	211219	211224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909718
4564	NC_004070	TAT	2	6	211339	211344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4565	NC_004070	TTA	2	6	211352	211357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4566	NC_004070	TAT	2	6	211378	211383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4567	NC_004070	TA	3	6	211386	211391	50 %	50 %	0 %	0 %	21909718
4568	NC_004070	TGC	2	6	211393	211398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909718
4569	NC_004070	CAA	2	6	211497	211502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909718
4570	NC_004070	TA	3	6	211506	211511	50 %	50 %	0 %	0 %	21909718
4571	NC_004070	AAC	2	6	211522	211527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909718
4572	NC_004070	TTCC	2	8	211534	211541	0 %	50 %	0 %	50 %	21909718
4573	NC_004070	ATT	2	6	211584	211589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909718
4574	NC_004070	CT	3	6	211634	211639	0 %	50 %	0 %	50 %	21909718
4575	NC_004070	ATC	2	6	211691	211696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909718
4576	NC_004070	ATG	2	6	211725	211730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909718
4577	NC_004070	AGG	2	6	211740	211745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909718
4578	NC_004070	GAA	2	6	211756	211761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909719
4579	NC_004070	ACT	2	6	211790	211795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909719
4580	NC_004070	TGG	2	6	211898	211903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909719
4581	NC_004070	CTA	2	6	211914	211919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909719
4582	NC_004070	GGT	2	6	211990	211995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909719
4583	NC_004070	CCT	2	6	212019	212024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909719
4584	NC_004070	TGC	2	6	212092	212097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909719
4585	NC_004070	GTT	2	6	212117	212122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909719
4586	NC_004070	GGC	2	6	212173	212178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909719
4587	NC_004070	GATG	2	8	212276	212283	25 %	25 %	50 %	0 %	21909719
4588	NC_004070	ATT	2	6	212379	212384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909719
4589	NC_004070	CTA	2	6	212463	212468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909719
4590	NC_004070	TAAA	2	8	212587	212594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_004070	TTA	2	6	212625	212630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_004070	CATA	2	8	212640	212647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_004070	TTTG	2	8	212703	212710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_004070	A	6	6	212750	212755	100 %	0 %	0 %	0 %	21909720
4595	NC_004070	CT	4	8	212770	212777	0 %	50 %	0 %	50 %	21909720
4596	NC_004070	GCA	2	6	212810	212815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909720
4597	NC_004070	TTGTC	2	10	212847	212856	0 %	60 %	20 %	20 %	21909720
4598	NC_004070	TTG	2	6	212909	212914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909720
4599	NC_004070	TAC	2	6	212947	212952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909720
4600	NC_004070	ATT	2	6	212973	212978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909720
4601	NC_004070	TGG	2	6	213114	213119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909720
4602	NC_004070	CTG	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909720
4603	NC_004070	TTC	2	6	213212	213217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909720
4604	NC_004070	GTG	2	6	213239	213244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909720
4605	NC_004070	GCTA	2	8	213307	213314	25 %	25 %	25 %	25 %	21909720
4606	NC_004070	CTT	2	6	213365	213370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909720
4607	NC_004070	TAA	2	6	213385	213390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909720
4608	NC_004070	ATT	2	6	213442	213447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909721
4609	NC_004070	ATG	2	6	213467	213472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909721
4610	NC_004070	GTGC	2	8	213499	213506	0 %	25 %	50 %	25 %	21909721
4611	NC_004070	ATT	2	6	213646	213651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909721
4612	NC_004070	CAA	2	6	213666	213671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909721
4613	NC_004070	TATT	2	8	213744	213751	25 %	75 %	0 %	0 %	21909721
4614	NC_004070	ATT	2	6	213779	213784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909721
4615	NC_004070	GCT	2	6	213802	213807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909721
4616	NC_004070	CA	3	6	213811	213816	50 %	0 %	0 %	50 %	21909721
4617	NC_004070	ATC	2	6	213823	213828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909721
4618	NC_004070	TAA	2	6	213891	213896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909721
4619	NC_004070	AGG	2	6	214008	214013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909721
4620	NC_004070	TGC	3	9	214026	214034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909721
4621	NC_004070	TGG	2	6	214041	214046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909721
4622	NC_004070	ATT	2	6	214068	214073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909721
4623	NC_004070	AAGGCC	2	12	214114	214125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909721
4624	NC_004070	TTA	2	6	214190	214195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909721
4625	NC_004070	AAG	2	6	214196	214201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909721
4626	NC_004070	GCT	3	9	214291	214299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909721
4627	NC_004070	ATT	2	6	214358	214363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909722
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4631	NC_004070	TCT	2	6	214543	214548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909722
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4634	NC_004070	GTA	2	6	214802	214807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909722
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4645	NC_004070	AAT	2	6	215424	215429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909723
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4720	NC_004070	A	6	6	218987	218992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4733	NC_004070	TCT	2	6	219548	219553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485754
4734	NC_004070	CTTG	2	8	219569	219576	0 %	50 %	25 %	25 %	161485754
4735	NC_004070	TTA	2	6	219621	219626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161485754
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4742	NC_004070	CGT	2	6	220113	220118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485754
4743	NC_004070	A	6	6	220128	220133	100 %	0 %	0 %	0 %	161485754
4744	NC_004070	AAAG	2	8	220141	220148	75 %	0 %	25 %	0 %	161485754
4745	NC_004070	AGC	2	6	220193	220198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909728
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4747	NC_004070	GAA	2	6	220236	220241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909728
4748	NC_004070	ATGG	2	8	220272	220279	25 %	25 %	50 %	0 %	21909728
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