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Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 2771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003384	CCT	2	6	43	48	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_003384	TCC	2	6	119	124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_003384	TCA	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003384	AAT	2	6	322	327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003384	CAG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003384	AGC	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003384	CCG	2	6	371	376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_003384	GGC	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003384	TTC	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003384	GTT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003384	AAT	2	6	551	556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003384	AAG	2	6	651	656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003384	GGA	2	6	699	704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003384	CAG	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003384	TTC	2	6	769	774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466426
16	NC_003384	CAG	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466426
17	NC_003384	ACG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466426
18	NC_003384	TGA	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466426
19	NC_003384	TGG	2	6	951	956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466426
20	NC_003384	CAT	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466426
21	NC_003384	ACG	2	6	1057	1062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_003384	GCC	2	6	1102	1107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_003384	GGT	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003384	AAT	2	6	1345	1350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003384	GCG	2	6	1391	1396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466427
26	NC_003384	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003384	AAC	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003384	TAA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003384	TGC	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466428
30	NC_003384	CAC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466428
31	NC_003384	CAG	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466428
32	NC_003384	CAA	2	6	2166	2171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466428
33	NC_003384	CGG	2	6	2465	2470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466429
34	NC_003384	CAC	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466429
35	NC_003384	AGG	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466429
36	NC_003384	CAT	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003384	GCA	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_003384	TTC	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466430
39	NC_003384	CGG	2	6	2838	2843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466430
40	NC_003384	ACC	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466430
41	NC_003384	TGA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466430
42	NC_003384	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466430
43	NC_003384	GCA	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
44	NC_003384	TCG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
45	NC_003384	CAG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
46	NC_003384	GAC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466430
47	NC_003384	AGA	3	9	3407	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466430
48	NC_003384	CGT	3	9	3434	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
49	NC_003384	TCG	3	9	3532	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466430
50	NC_003384	TGA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466431
51	NC_003384	CTG	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466431
52	NC_003384	CGG	2	6	4283	4288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466431
53	NC_003384	CCT	2	6	4347	4352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_003384	ATC	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466432
55	NC_003384	CCG	2	6	4491	4496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466432
56	NC_003384	CAT	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466432
57	NC_003384	ATT	2	6	4568	4573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466432
58	NC_003384	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466433
59	NC_003384	TTC	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466433
60	NC_003384	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003384	TTG	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765045
62	NC_003384	ACG	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
63	NC_003384	CCG	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765045
64	NC_003384	CGA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
65	NC_003384	GAG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32765045
66	NC_003384	TCA	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32765045
67	NC_003384	CGA	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765045
68	NC_003384	CGG	2	6	5318	5323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765045
69	NC_003384	ACA	3	9	5599	5607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466435
70	NC_003384	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466435
71	NC_003384	ATC	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466436
72	NC_003384	GCC	2	6	5947	5952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
73	NC_003384	CCT	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466436
74	NC_003384	TCA	3	9	5981	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466436
75	NC_003384	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466436
76	NC_003384	GAG	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466436
77	NC_003384	CCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
78	NC_003384	CCG	2	6	6261	6266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466436
79	NC_003384	TTC	2	6	6274	6279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466436
80	NC_003384	GAG	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466436
81	NC_003384	CAG	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466437
82	NC_003384	GAC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466437
83	NC_003384	GGT	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466437
84	NC_003384	TTA	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466437
85	NC_003384	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003384	TTA	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003384	GCT	2	6	6850	6855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466438
88	NC_003384	AGC	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466438
89	NC_003384	TCA	2	6	7400	7405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466439
90	NC_003384	GGC	2	6	7443	7448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466439
91	NC_003384	TTC	2	6	7481	7486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466439
92	NC_003384	GAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466439
93	NC_003384	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466439
94	NC_003384	TGG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466439
95	NC_003384	AAT	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466440
96	NC_003384	TAT	2	6	7862	7867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466440
97	NC_003384	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466440
98	NC_003384	ATC	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466440
99	NC_003384	CAC	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466441
100	NC_003384	CCA	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466441
101	NC_003384	ACT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466441
102	NC_003384	CAT	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466441
103	NC_003384	TAA	2	6	8372	8377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466442
104	NC_003384	CAG	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466442
105	NC_003384	CAG	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466442
106	NC_003384	CCA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466442
107	NC_003384	TTG	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466442
108	NC_003384	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466442
109	NC_003384	TTA	2	6	8988	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003384	ATT	2	6	9002	9007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466443
111	NC_003384	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466443
112	NC_003384	GGC	2	6	9125	9130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466443
113	NC_003384	CAT	2	6	9446	9451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466443
114	NC_003384	GAG	2	6	9468	9473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466443
115	NC_003384	TCG	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466444
116	NC_003384	AGG	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466444
117	NC_003384	GAC	2	6	9899	9904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466445
118	NC_003384	ACA	2	6	9995	10000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466445
119	NC_003384	TCA	2	6	10173	10178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466445
120	NC_003384	GCT	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466445
121	NC_003384	TGT	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466445
122	NC_003384	CCA	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466445
123	NC_003384	CCG	2	6	10487	10492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466445
124	NC_003384	TCA	2	6	10533	10538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466445
125	NC_003384	GTG	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003384	CCG	2	6	10757	10762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466446
127	NC_003384	GCA	3	9	10862	10870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466446
128	NC_003384	GGT	2	6	10906	10911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466446
129	NC_003384	AAT	2	6	10944	10949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003384	AAT	2	6	10999	11004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003384	TTC	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466447
132	NC_003384	CAA	2	6	11291	11296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466447
133	NC_003384	CAA	2	6	11372	11377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466447
134	NC_003384	AAG	2	6	11382	11387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466447
135	NC_003384	TTA	2	6	11407	11412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466447
136	NC_003384	TTA	3	9	11509	11517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003384	ACA	2	6	11580	11585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_003384	TGG	2	6	11655	11660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003384	CAG	2	6	11669	11674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765046
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264	NC_003384	GGT	2	6	20441	20446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466457
265	NC_003384	ATT	3	9	20524	20532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466457
266	NC_003384	GCC	2	6	20537	20542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466457
267	NC_003384	TTA	2	6	20550	20555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_003384	ATT	3	9	20570	20578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_003384	TTA	2	6	20640	20645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_003384	CAA	2	6	20729	20734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466458
271	NC_003384	TTA	2	6	20735	20740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466458
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392	NC_003384	GAA	2	6	32100	32105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466472
393	NC_003384	TGT	2	6	32115	32120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466472
394	NC_003384	GGT	2	6	32154	32159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466472
395	NC_003384	ACG	2	6	32195	32200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466472
396	NC_003384	AGG	2	6	32423	32428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466472
397	NC_003384	TAG	2	6	32479	32484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466472
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400	NC_003384	TCA	2	6	32764	32769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466472
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421	NC_003384	TAA	2	6	33941	33946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_003384	TTC	2	6	34042	34047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466473
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500	NC_003384	TGC	2	6	40677	40682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466480

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